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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8608#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 927 fasta sequence
[CCGCCGACAGTCAAGGAAG-G--TCACTTGTGGTTGTGAGAAGGATAAGCATTACTTAAACGAGGAAAAATGGTAGTTCATATCATTTTCGCTATTCTACTTGCATGCGTTAGCAGAGGTAGTGCAAGTCCAATAGATCATCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGTCGATGGATCGGATGCAGAGGAGAATGCGGCACCGTATCAGGTTTCACTGCAGATTGATGGTAACAGCACATGCAGTGGATCGATAGTCGGTGATCGATGGATATTGACAGCAGAGCACTGTGTGCCATTGTTACAATTTTTCTCCGAACGATCTAACAACACTCGTGTTGTAGCAGGCACAAATGATTTGAAAAAGGGCGGCACACCATATTTTATAGATCGCTTTTTTAACTACGACAATTGCTCAACGATGCTAGTGCAT-ACATTTATGTTTAATTCAACGCCTAATGATATCGCGTTAATACGTTTAACAACGCCGTTGAAATTCAACGAGC-GGGTAAAAAAGATTGAATTCACGACAGAAACTGTGCCGGAAAATGCTACACTTACACTGACAGGATGGGGACAAATGAGAAAT-GGGACGAGTCCTGCTAAGCTGCAAACCATCAATGCGCCCTCCATAGGGATTGATCATTGTCGGGCTATTTATAATGAAACGTATCTTAATGACGGCACAATTTGTAGTCTATCAAAACGGGGCG-AAGGAGCATGCATGGGCGATTCT-GGTGGCCCTGTGACATGG-AAAGGAAAACTGGTCGGTATATTCAAAGCAGTACACAAAAAAGGGTGCGGTGAGGGATTTCCAGATGTCCACACAAATGTTGCCTACTACTACGAATGGGTAAAGGATACTATTGCCAACAATAGCGTTTAAAAATAGGAATTGAACCGATCAGAAGCAAGGTTTTAAATATAT]
[+] EMBL BM589083 [CCGCCGACAGTCAAGGAAG G TCACTTGTGGTTGTGAGAAGGATAAGCATTACTTAAACGAGGAAAAATGGTAGTTCATATCATTTTCGCTATTCTACTTGCATGCGTTAGCAGAGGTAGTGCAAGTCCAATAGATCATCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGTCGATGGATCGGATGCAGAGGAGAATGCGGCACCGTATCAGGTTTCACTGCAGATTGATGGTAACAGCACATGCAGTGGATCGATAGTCGGTGATCGATGGATATTGACAGCAGAGCACTGTGTGCCATTGTTACAATTTTTCTCCGAACGATCTAACAACACTCGTGTTGTAGCAGGCACAAATGATTTGAAAAAGGGCGGCACACCATATTTTATAGATCGCTTTTTTAACTACGACAATTGCTCAACGATGCTAGTGCAT ACATTTATGTTTAATTCAACGCCTAATGATATCGCGTTAATACGTTTAACAACGCCGTTGAAATTCAACCAGCGGGGTAAAAAAGATTGAATTCACGACAGAAACTGT ]
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[+] EMBL CNS09Q21 [ tCGACAGTCAAGGAAG G TCACTTGTGGTTGTGAGAAGGATAAGCATTACTTAAACGAGGAAAAATGGTAGTTCATATCATTTTCGCTATTCTACTTGCATGCGTTAGAGGAGGTAGTGCAAGTCCAATAGATCATCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGTCGATGGATCGGATGCAGAGGAGAATGCGGCACCGTATCAGGTTTCACTGCAGATTGATGGTAACAGCACATGCAGTGGATCGATAGTCGGTGATCGATGGATATTGACAGCAGAGCACTGTGTGCCATTGTTACAATTTTTCTCCGAACGATCTAACAACACTCGTGTTGTAGCAGGCACAAATGATTTGAAAAAGGGCGGCACACCGTATTTTATAGATCGCTTTTTTAACTACGACAATTGCTCAACAATGCTAGTGCAT AAAATTATGTTTAATTTTCCGCCTAATGATATCGCGTTAATACGTTTAACAACGCCGTTGAAATTCAACGAGC GGGTAAAAAAGATTGAGTTCACGGCAGAAACTGTGCCGGAAAATGCTACACTTACACTGACAGGATGGGGAGAGATGAGAAATGGGGACGATACCTACTAAGCTGCAAACCATCAATGCGCCCTCCATAGGGATTGATCGTTGTCGGGCTATTTATAATGAAATCTTGGTGAATAACGGCACAATTTGTAGTCTATCAAAACGGGGCG AAGGAGCATGCATGGGCGATTCT GGTGGCCCTGTGACATGG AAAGGAAAACTGGTCGGTATATTCAAAGCAGTACACAAAAAAGGGTGCGGTGAGGGATTTCCAGATGTCCACACAAATGTTGCCTACTACTACGAATGGGTAAAGGATACTATTGCCAACAATAGCGTTTAAAAATAGGAATTGAACCGATCAGAAGCAAGGTTTTAAATAT ]
[+] EMBL BM629307 [ ccgGTCAAGGAAG G TCACTTGTGGTTGTGAGAAGGATAAGCATTACTTAAACGAGGAAAAATGGTAGTTCATATCATTTTCGCTATTCTACTTGCATGCGTTAGCAGAGGTAGTGCAAGTCCAATAGATCATCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGTCGATGGATCGGATGCAGAGGAGAATGCGGCACCGTATCAGGTTTCACTGCAGATTGATGGTAACAGCACATGCAGTGGATCGATAGTCGGTGATCGATGGATATTGACAGCAGAGCACTGTGTGCCATTGTTACAATTTTTCTCCGAACGATCTAACAACACTCGTGTTGTAGCAGGCACAAATGATTTGAAAAAGGGCGGCACACCGTATTTTATAGATCGCTTTTTTAACTACGACAATTGCTCAACAATGCTAGTGCAT AAAATTATGTTTAATTTTCCGCCTAATGATATCGCGTTAATACGTTTAACAACGCCGTTGAAATTCAACGAGC GGGTAAAAAAGATTGAGTTCACGGCAGAAACTGTGCCGGAAAATGCTACACTTACACTGACAGGATGGGGAGAGATGAAAAAT GGGACGATACCTACTAAGC ]
[+] EMBL BM641843 [ ccgctAGGAAG C TCACTTGTGGTTGTGAGAAGGATAAGCATTACTTAAACGAGGAAAAATGGTAGTTCATATCATTTTCGCAATTCTACTTGCATGCGTTAGCAGAGGTAGTGCAAGTCCAATAGATCATCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGT ]
[+] EMBL BM651529 [ ccg c TCACTTGTGGTTGTGAGAAGGATAAGCATTACTTAAGCGAGGAAAAATGGTAGTGCATATAATTTTCGCGATTCTACTAGCATGCGTTAGCAGAGGTAGTACAAGTCCAATAGATCACCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGTCGATGAATCGGATGCAGAGGAGAATGCGGCACCGTATCAGGTTTCACTGCAGATTGATGGTAACAGCACATGCAGTGGATCGATAGTCGGTGATCGATGGATATTGACAGCAGAGCACTGTGTGCCATTGTTACAATTTTTCTCCGAACGATCTAACAACACTCGTGTTGTAGCAGGCACAAATGATTTGAAAAAGGGCGGCACACCATATTTTATAGATCGCTTTTTTAACTACGACAATTGCTCAACGATGCTAGTGCAT ACATTTATGTTTAATTCAACGCCTAATGATATCGCGTTAATACGTTTAACAACGCCGTTGAAATTCAACGAGC GGGTAAAAAAGATTGAATTCACGACAGAAACTGTGCCGGAAAATGCTACACTTACACTGACAGGATGGGGACAAATGAGAAAT GGGACGAGTCCTGCTAAGCTGCAAACCATCAATGCGCCCTCCATTGGGATTGATCATTGTCGGGCTATTTATAATGAAACGTATCTTAATGACGGCACAATTTGTAGTCTATCAAAACGGGGCG AAGGAG ]
[+] EMBL BM642524 [ ccgTTGTGGTTGTGAGAAGGATAAGCATTACTTAAACGAGGAAAAATGGTAGTTCATATCATTTTCGCTATTCTACTTGCATGCGTTAGCAGAGGTAGTGCAAGTCCAATAGATCATCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGTCGATGGATCGGATGCAGAGGAGAATGCGGCACCGTATCAGGTTTCACTGCAGATTGATGGTAACAGCACATGCAGTGGATCGATAGTCGGTGATCGATGGATATTGACAGCAGAGCACTGTGTGCCATTGTTACAATTTTTCTCCGAACGATCTAACAACACTCGTGTTGTAGCAGGCACAAATGATTTGAAAAAGGGCGGCACACCGTATTTTATAGATCGCTTTTTTAACTACGACAATTGCTCAACAATGCTAGTGCAT AAAATTATGTTTAATTTTCCGCCTAATGATATCGCGTTAATACGTTTAACAACGCCGTTGAAATTCAACGAGC GGGTAAAAAAGATTGAGTTCACGGCAGAAACTGTGCCGGAAAATGCTACACTTACACTGACAGGATGGGGAGAGATGAGAAAT GGGACGATACCTACTAAGCTGCAAACCATCAATGCGCCCTCCATAGGGATTGA ]
[+] EMBL AF203336 [ AAACGAGGAAAAATGGTAGTTCATATCATTTTCGCTATTCTACTTGCATGCGTTAGCAGAGGTAGTGCAAGTCCAATAGATCATCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGTCGATGGATCGGATGCAGAGGAGAATGCGGCACCGTATCAGGTTTCACTGCAGATTGATGGTAACAGCACATGCAGTGGATCGATAGTCGGTGATCGATGGATATTGACAGCAGAGCACTGTGTGCCATTGTTACAATTTTTCTCCGAACGATCTAACAACACTCGTGTTGTAGCAGGCACAAATGATTTGAAAAAGGGCGGCACACCATATTTTATAGATCGCTTTTCTAACTACGACAATTGCTCAACGATGCTAGTGCAT ACATTTATGTTTAATTCAACGCCTAATGATATCGCGTTAATACGTTTAACAACGCCGTTGAAATTCAACGAGC GGGTAAAAAAGATTGAATTCACGACAGAAACTGTGCCGGAAAATGCTACACTTACACTGACAGGATGGGGACAAATGAGAAAT GGGACGAG ]
[+] EMBL BX625498 [ TTTCGCTATTCTACTTGCATGCGTTAGCAGAGGTAGTGCAAGTCCAATAGATCATCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGTCGATGGATCGGATGCAGAGGAGAATGCGGCACCGTATCAGGTTTCACTGCAGATTGATGGTAACAGCACATGCAGTGGATCGATAGTCGGTGATCGATGGATATTGACAGCAGAGCACTGTGTGCCATTGTTACAATTTTTCTCCGAACGATCTAACAACACTCGTGTTGTAGCAGGCACAAATGATTTGAAAAAGGGCGGCACACCATATTTTATAGATCGCTTTTTTAACTACGACAATTGCTCAACGATGCTAGTGCAT ACATTTATGTTTAATTCAACGCCTAATGATATCGCGTTAATACGTTTAACAACGCCGTTGAAATTCAACCAGC GGGTAAAAAAGATTGAATTCACGACAGAAACTGTGCCGGAAAATGCTACACTTACACTGACAGGATGGGGACAAATGAGAAAT GGGACGAGTCCTGCTAAGCTGCAAACCATCAATGCGCCCTCCATTAGGATTGATCATTGTCGGGCTATTTATAATGAAACGTATCTTAATGACGGCACAATTTGTAGTCTATCAAAACGGGGCG AAGGAGCATGTATGGGAGATTCTGGGTGGNCCTGTGACATGG AAAGGAAAACTGGTCGGTATATTCNAAGCAGT ]
[+] EMBL BX622466 [ CATGCGTTAGCAGAGGTAGTGCAAGTCCAATAGATCATCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGTCGATGGATCGGATGCAGAGGAGAATGCGGCACCGTATCAGGTTTCACTGCAGATTGATGGTAACAGCACATGCAGTGGATCGATAGTCGGTGATCGATGGATATTGACAGCAGAGCACTGTGTGCCATTGTTACAATTTTTCTCCGAACGATCTAACAACACTCGTGTTGTAGCAGGCACAAATGATTTGAAAAAGGGCGGCACACCATATTTTATAGATCGCTTTTTTAACTACGACAATTGCTCAACGATGCTAGTGCAT ACATTTATGTTTAATTCAACGCCTAATGATATCGCGTTAATACGTTTAACAACGCCGTTGAAATTCAACCAGC GGGTAAAAAAGATTGAATTCACGACAGAAACTGTGCCGGAAAATGCTACACTTACACTGACAGGATGGGGACAAATGAGAAAT GGGACGAGTCCTGCTAAGCTGCAAACCATCAATGCGCCCTCCATTAGGATTGATCATTGTCGGGCTATTTATAATGAAACGTATCTTAATGACGGCACAATTTGTAGTCTATCAAAACGGGGCGAAAGGAGCATGTATGGGAGATTCT GGTGGGCCTGTGACATGGAAAAGGAAAACTGGTCGGTATA ]
[-] EMBL CNS09Q22 [ TTAGCAGAGGTAGTGCAAGTCCAATAGATCATCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGTCGATGGATCGGATGCAGAGGAGAATGCGGCACCGTATCAGGTTTCACTGCAGATTGATGGTAACAGCACATGCAGTGGATCGATAGTCGGTGATCGATGGATATTGACAGCAGAGCACTGTGTGCCATTGTTACAATTTTTCTCCGAACGATCTAACAAAACTCGTGTTGTAGCAGGCACAAATGATTTGAAAAAGGGCGGCACACCGTATTTTATAGATCGCTTTTTTAACTACGACAATTGCTCAACAATGCTAGTGCATAAAAATTATGTTTAATTTTCCGCCTAATGATATCGCGTTAATACGTTTAACAACGCCGTTGAAATTCAACGAGC GGGTAAAAAAGATTGAGTTCACGGCAGAAACTGTGCCGGAAAATGCTACACTTACACTGACAGGATGGGGAGAGATGAGAAAT GGGACGATACCTACTAAGCTGCAAACCATCAATGCGCCCTCCATAGGGATTGATCGTTGTCGGGCTATTTATAATGAAATCTTGGTGAATAACGGCACAATTTGTAGTCTATCAAAACGGGGCG AAGGAGCATGCATGGGCGATTCT GGTGGCCCTGTGACATGG AAAGGAAAACTGGTCGGTATATTCAAAGCAGTACACAAAAAAGGGTGCGGTGAGGGATTTCCAGATGTCCACACAAATGTTGCCTACTACTACGAATGGGTAAAGGATACTATTGCCAACAATAGCGTTTAAAAATAGGAATTGAACCGATCAGAAGCAAGGTTTTAAATATAT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||