These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8608#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 927 fasta sequence [CCGCCGACAGTCAAGGAAG-G--TCACTTGTGGTTGTGAGAAGGATAAGCATTACTTAAACGAGGAAAAATGGTAGTTCATATCATTTTCGCTATTCTACTTGCATGCGTTAGCAGAGGTAGTGCAAGTCCAATAGATCATCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGTCGATGGATCGGATGCAGAGGAGAATGCGGCACCGTATCAGGTTTCACTGCAGATTGATGGTAACAGCACATGCAGTGGATCGATAGTCGGTGATCGATGGATATTGACAGCAGAGCACTGTGTGCCATTGTTACAATTTTTCTCCGAACGATCTAACAACACTCGTGTTGTAGCAGGCACAAATGATTTGAAAAAGGGCGGCACACCATATTTTATAGATCGCTTTTTTAACTACGACAATTGCTCAACGATGCTAGTGCAT-ACATTTATGTTTAATTCAACGCCTAATGATATCGCGTTAATACGTTTAACAACGCCGTTGAAATTCAACGAGC-GGGTAAAAAAGATTGAATTCACGACAGAAACTGTGCCGGAAAATGCTACACTTACACTGACAGGATGGGGACAAATGAGAAAT-GGGACGAGTCCTGCTAAGCTGCAAACCATCAATGCGCCCTCCATAGGGATTGATCATTGTCGGGCTATTTATAATGAAACGTATCTTAATGACGGCACAATTTGTAGTCTATCAAAACGGGGCG-AAGGAGCATGCATGGGCGATTCT-GGTGGCCCTGTGACATGG-AAAGGAAAACTGGTCGGTATATTCAAAGCAGTACACAAAAAAGGGTGCGGTGAGGGATTTCCAGATGTCCACACAAATGTTGCCTACTACTACGAATGGGTAAAGGATACTATTGCCAACAATAGCGTTTAAAAATAGGAATTGAACCGATCAGAAGCAAGGTTTTAAATATAT] [+] EMBL BM589083 [CCGCCGACAGTCAAGGAAG G TCACTTGTGGTTGTGAGAAGGATAAGCATTACTTAAACGAGGAAAAATGGTAGTTCATATCATTTTCGCTATTCTACTTGCATGCGTTAGCAGAGGTAGTGCAAGTCCAATAGATCATCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGTCGATGGATCGGATGCAGAGGAGAATGCGGCACCGTATCAGGTTTCACTGCAGATTGATGGTAACAGCACATGCAGTGGATCGATAGTCGGTGATCGATGGATATTGACAGCAGAGCACTGTGTGCCATTGTTACAATTTTTCTCCGAACGATCTAACAACACTCGTGTTGTAGCAGGCACAAATGATTTGAAAAAGGGCGGCACACCATATTTTATAGATCGCTTTTTTAACTACGACAATTGCTCAACGATGCTAGTGCAT ACATTTATGTTTAATTCAACGCCTAATGATATCGCGTTAATACGTTTAACAACGCCGTTGAAATTCAACCAGCGGGGTAAAAAAGATTGAATTCACGACAGAAACTGT ] [+] EMBL BM597676 [ CCG 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CNS09Q22 [ TTAGCAGAGGTAGTGCAAGTCCAATAGATCATCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGTCGATGGATCGGATGCAGAGGAGAATGCGGCACCGTATCAGGTTTCACTGCAGATTGATGGTAACAGCACATGCAGTGGATCGATAGTCGGTGATCGATGGATATTGACAGCAGAGCACTGTGTGCCATTGTTACAATTTTTCTCCGAACGATCTAACAAAACTCGTGTTGTAGCAGGCACAAATGATTTGAAAAAGGGCGGCACACCGTATTTTATAGATCGCTTTTTTAACTACGACAATTGCTCAACAATGCTAGTGCATAAAAATTATGTTTAATTTTCCGCCTAATGATATCGCGTTAATACGTTTAACAACGCCGTTGAAATTCAACGAGC GGGTAAAAAAGATTGAGTTCACGGCAGAAACTGTGCCGGAAAATGCTACACTTACACTGACAGGATGGGGAGAGATGAGAAAT GGGACGATACCTACTAAGCTGCAAACCATCAATGCGCCCTCCATAGGGATTGATCGTTGTCGGGCTATTTATAATGAAATCTTGGTGAATAACGGCACAATTTGTAGTCTATCAAAACGGGGCG AAGGAGCATGCATGGGCGATTCT GGTGGCCCTGTGACATGG AAAGGAAAACTGGTCGGTATATTCAAAGCAGTACACAAAAAAGGGTGCGGTGAGGGATTTCCAGATGTCCACACAAATGTTGCCTACTACTACGAATGGGTAAAGGATACTATTGCCAACAATAGCGTTTAAAAATAGGAATTGAACCGATCAGAAGCAAGGTTTTAAATATAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||