Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Anopheles gambiae
cluster # 8608 cluster # 8608       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8608#0 length = 927 sequences # 11  

consensusID : consensus_8608#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 927
fasta sequence
                              [CCGCCGACAGTCAAGGAAG-G--TCACTTGTGGTTGTGAGAAGGATAAGCATTACTTAAACGAGGAAAAATGGTAGTTCATATCATTTTCGCTATTCTACTTGCATGCGTTAGCAGAGGTAGTGCAAGTCCAATAGATCATCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGTCGATGGATCGGATGCAGAGGAGAATGCGGCACCGTATCAGGTTTCACTGCAGATTGATGGTAACAGCACATGCAGTGGATCGATAGTCGGTGATCGATGGATATTGACAGCAGAGCACTGTGTGCCATTGTTACAATTTTTCTCCGAACGATCTAACAACACTCGTGTTGTAGCAGGCACAAATGATTTGAAAAAGGGCGGCACACCATATTTTATAGATCGCTTTTTTAACTACGACAATTGCTCAACGATGCTAGTGCAT-ACATTTATGTTTAATTCAACGCCTAATGATATCGCGTTAATACGTTTAACAACGCCGTTGAAATTCAACGAGC-GGGTAAAAAAGATTGAATTCACGACAGAAACTGTGCCGGAAAATGCTACACTTACACTGACAGGATGGGGACAAATGAGAAAT-GGGACGAGTCCTGCTAAGCTGCAAACCATCAATGCGCCCTCCATAGGGATTGATCATTGTCGGGCTATTTATAATGAAACGTATCTTAATGACGGCACAATTTGTAGTCTATCAAAACGGGGCG-AAGGAGCATGCATGGGCGATTCT-GGTGGCCCTGTGACATGG-AAAGGAAAACTGGTCGGTATATTCAAAGCAGTACACAAAAAAGGGTGCGGTGAGGGATTTCCAGATGTCCACACAAATGTTGCCTACTACTACGAATGGGTAAAGGATACTATTGCCAACAATAGCGTTTAAAAATAGGAATTGAACCGATCAGAAGCAAGGTTTTAAATATAT]

[+] EMBL BM589083             [CCGCCGACAGTCAAGGAAG G  TCACTTGTGGTTGTGAGAAGGATAAGCATTACTTAAACGAGGAAAAATGGTAGTTCATATCATTTTCGCTATTCTACTTGCATGCGTTAGCAGAGGTAGTGCAAGTCCAATAGATCATCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGTCGATGGATCGGATGCAGAGGAGAATGCGGCACCGTATCAGGTTTCACTGCAGATTGATGGTAACAGCACATGCAGTGGATCGATAGTCGGTGATCGATGGATATTGACAGCAGAGCACTGTGTGCCATTGTTACAATTTTTCTCCGAACGATCTAACAACACTCGTGTTGTAGCAGGCACAAATGATTTGAAAAAGGGCGGCACACCATATTTTATAGATCGCTTTTTTAACTACGACAATTGCTCAACGATGCTAGTGCAT ACATTTATGTTTAATTCAACGCCTAATGATATCGCGTTAATACGTTTAACAACGCCGTTGAAATTCAACCAGCGGGGTAAAAAAGATTGAATTCACGACAGAAACTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BM597676             [   CCG CAGTCTAGGAAGTGTCTCACTTGTGGTTGTGAGAAGGATAAGCATTACTTAAGCGAGGAAAAATGGTAGTGCATATAATTTTCGCGATTCTACTAGCATGCGTTAGCAGAGGTAGTACAAGTCCAATAGATCACCCGATATCTCCCTTCGCTGGTAACTACATTGTCGATGAATCGGATGCAGAGGAGAATGCGGCACCGTATCAGGTTTCACTGCAGATTGATGGTAACAGCACATGCAGTGGATCGATAGTCGGTGATCGATGGATATTGACAGCAGAGCACTGTGTGCCATTGTTACAATTTTTCTCCGAACGATCTAACAACACTCGTGTTGTAGCAGGCACAAATGATTTGAAAAAGGGCGGCACACCATATTTTATAGATCGCTTTTTTAACTACGACAATTGCTCAACGATGCTAGTGCAT ACATTTATGTTTAATTCAACGCCTAATGATATCGCGTTAATACGTTTAACAACGCCGTTGAAATTCAACGAGC GGGTAAAAAAGATTGAATTCACGACAGAAACTGTGCCGGAAAATGCTACACTTACACTGACAGGATGGGGACAAATGAGAAAT GGGACGAGTCCTGCTAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CNS09Q21             [   tCGACAGTCAAGGAAG G  TCACTTGTGGTTGTGAGAAGGATAAGCATTACTTAAACGAGGAAAAATGGTAGTTCATATCATTTTCGCTATTCTACTTGCATGCGTTAGAGGAGGTAGTGCAAGTCCAATAGATCATCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGTCGATGGATCGGATGCAGAGGAGAATGCGGCACCGTATCAGGTTTCACTGCAGATTGATGGTAACAGCACATGCAGTGGATCGATAGTCGGTGATCGATGGATATTGACAGCAGAGCACTGTGTGCCATTGTTACAATTTTTCTCCGAACGATCTAACAACACTCGTGTTGTAGCAGGCACAAATGATTTGAAAAAGGGCGGCACACCGTATTTTATAGATCGCTTTTTTAACTACGACAATTGCTCAACAATGCTAGTGCAT AAAATTATGTTTAATTTTCCGCCTAATGATATCGCGTTAATACGTTTAACAACGCCGTTGAAATTCAACGAGC GGGTAAAAAAGATTGAGTTCACGGCAGAAACTGTGCCGGAAAATGCTACACTTACACTGACAGGATGGGGAGAGATGAGAAATGGGGACGATACCTACTAAGCTGCAAACCATCAATGCGCCCTCCATAGGGATTGATCGTTGTCGGGCTATTTATAATGAAATCTTGGTGAATAACGGCACAATTTGTAGTCTATCAAAACGGGGCG AAGGAGCATGCATGGGCGATTCT GGTGGCCCTGTGACATGG AAAGGAAAACTGGTCGGTATATTCAAAGCAGTACACAAAAAAGGGTGCGGTGAGGGATTTCCAGATGTCCACACAAATGTTGCCTACTACTACGAATGGGTAAAGGATACTATTGCCAACAATAGCGTTTAAAAATAGGAATTGAACCGATCAGAAGCAAGGTTTTAAATAT  ]
[+] EMBL BM629307             [      ccgGTCAAGGAAG G  TCACTTGTGGTTGTGAGAAGGATAAGCATTACTTAAACGAGGAAAAATGGTAGTTCATATCATTTTCGCTATTCTACTTGCATGCGTTAGCAGAGGTAGTGCAAGTCCAATAGATCATCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGTCGATGGATCGGATGCAGAGGAGAATGCGGCACCGTATCAGGTTTCACTGCAGATTGATGGTAACAGCACATGCAGTGGATCGATAGTCGGTGATCGATGGATATTGACAGCAGAGCACTGTGTGCCATTGTTACAATTTTTCTCCGAACGATCTAACAACACTCGTGTTGTAGCAGGCACAAATGATTTGAAAAAGGGCGGCACACCGTATTTTATAGATCGCTTTTTTAACTACGACAATTGCTCAACAATGCTAGTGCAT AAAATTATGTTTAATTTTCCGCCTAATGATATCGCGTTAATACGTTTAACAACGCCGTTGAAATTCAACGAGC GGGTAAAAAAGATTGAGTTCACGGCAGAAACTGTGCCGGAAAATGCTACACTTACACTGACAGGATGGGGAGAGATGAAAAAT GGGACGATACCTACTAAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BM641843             [        ccgctAGGAAG C  TCACTTGTGGTTGTGAGAAGGATAAGCATTACTTAAACGAGGAAAAATGGTAGTTCATATCATTTTCGCAATTCTACTTGCATGCGTTAGCAGAGGTAGTGCAAGTCCAATAGATCATCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BM651529             [                ccg c  TCACTTGTGGTTGTGAGAAGGATAAGCATTACTTAAGCGAGGAAAAATGGTAGTGCATATAATTTTCGCGATTCTACTAGCATGCGTTAGCAGAGGTAGTACAAGTCCAATAGATCACCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGTCGATGAATCGGATGCAGAGGAGAATGCGGCACCGTATCAGGTTTCACTGCAGATTGATGGTAACAGCACATGCAGTGGATCGATAGTCGGTGATCGATGGATATTGACAGCAGAGCACTGTGTGCCATTGTTACAATTTTTCTCCGAACGATCTAACAACACTCGTGTTGTAGCAGGCACAAATGATTTGAAAAAGGGCGGCACACCATATTTTATAGATCGCTTTTTTAACTACGACAATTGCTCAACGATGCTAGTGCAT ACATTTATGTTTAATTCAACGCCTAATGATATCGCGTTAATACGTTTAACAACGCCGTTGAAATTCAACGAGC GGGTAAAAAAGATTGAATTCACGACAGAAACTGTGCCGGAAAATGCTACACTTACACTGACAGGATGGGGACAAATGAGAAAT GGGACGAGTCCTGCTAAGCTGCAAACCATCAATGCGCCCTCCATTGGGATTGATCATTGTCGGGCTATTTATAATGAAACGTATCTTAATGACGGCACAATTTGTAGTCTATCAAAACGGGGCG AAGGAG                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BM642524             [                        ccgTTGTGGTTGTGAGAAGGATAAGCATTACTTAAACGAGGAAAAATGGTAGTTCATATCATTTTCGCTATTCTACTTGCATGCGTTAGCAGAGGTAGTGCAAGTCCAATAGATCATCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGTCGATGGATCGGATGCAGAGGAGAATGCGGCACCGTATCAGGTTTCACTGCAGATTGATGGTAACAGCACATGCAGTGGATCGATAGTCGGTGATCGATGGATATTGACAGCAGAGCACTGTGTGCCATTGTTACAATTTTTCTCCGAACGATCTAACAACACTCGTGTTGTAGCAGGCACAAATGATTTGAAAAAGGGCGGCACACCGTATTTTATAGATCGCTTTTTTAACTACGACAATTGCTCAACAATGCTAGTGCAT AAAATTATGTTTAATTTTCCGCCTAATGATATCGCGTTAATACGTTTAACAACGCCGTTGAAATTCAACGAGC GGGTAAAAAAGATTGAGTTCACGGCAGAAACTGTGCCGGAAAATGCTACACTTACACTGACAGGATGGGGAGAGATGAGAAAT GGGACGATACCTACTAAGCTGCAAACCATCAATGCGCCCTCCATAGGGATTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AF203336             [                                                         AAACGAGGAAAAATGGTAGTTCATATCATTTTCGCTATTCTACTTGCATGCGTTAGCAGAGGTAGTGCAAGTCCAATAGATCATCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGTCGATGGATCGGATGCAGAGGAGAATGCGGCACCGTATCAGGTTTCACTGCAGATTGATGGTAACAGCACATGCAGTGGATCGATAGTCGGTGATCGATGGATATTGACAGCAGAGCACTGTGTGCCATTGTTACAATTTTTCTCCGAACGATCTAACAACACTCGTGTTGTAGCAGGCACAAATGATTTGAAAAAGGGCGGCACACCATATTTTATAGATCGCTTTTCTAACTACGACAATTGCTCAACGATGCTAGTGCAT ACATTTATGTTTAATTCAACGCCTAATGATATCGCGTTAATACGTTTAACAACGCCGTTGAAATTCAACGAGC GGGTAAAAAAGATTGAATTCACGACAGAAACTGTGCCGGAAAATGCTACACTTACACTGACAGGATGGGGACAAATGAGAAAT GGGACGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BX625498             [                                                                                      TTTCGCTATTCTACTTGCATGCGTTAGCAGAGGTAGTGCAAGTCCAATAGATCATCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGTCGATGGATCGGATGCAGAGGAGAATGCGGCACCGTATCAGGTTTCACTGCAGATTGATGGTAACAGCACATGCAGTGGATCGATAGTCGGTGATCGATGGATATTGACAGCAGAGCACTGTGTGCCATTGTTACAATTTTTCTCCGAACGATCTAACAACACTCGTGTTGTAGCAGGCACAAATGATTTGAAAAAGGGCGGCACACCATATTTTATAGATCGCTTTTTTAACTACGACAATTGCTCAACGATGCTAGTGCAT ACATTTATGTTTAATTCAACGCCTAATGATATCGCGTTAATACGTTTAACAACGCCGTTGAAATTCAACCAGC GGGTAAAAAAGATTGAATTCACGACAGAAACTGTGCCGGAAAATGCTACACTTACACTGACAGGATGGGGACAAATGAGAAAT GGGACGAGTCCTGCTAAGCTGCAAACCATCAATGCGCCCTCCATTAGGATTGATCATTGTCGGGCTATTTATAATGAAACGTATCTTAATGACGGCACAATTTGTAGTCTATCAAAACGGGGCG AAGGAGCATGTATGGGAGATTCTGGGTGGNCCTGTGACATGG AAAGGAAAACTGGTCGGTATATTCNAAGCAGT                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BX622466             [                                                                                                       CATGCGTTAGCAGAGGTAGTGCAAGTCCAATAGATCATCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGTCGATGGATCGGATGCAGAGGAGAATGCGGCACCGTATCAGGTTTCACTGCAGATTGATGGTAACAGCACATGCAGTGGATCGATAGTCGGTGATCGATGGATATTGACAGCAGAGCACTGTGTGCCATTGTTACAATTTTTCTCCGAACGATCTAACAACACTCGTGTTGTAGCAGGCACAAATGATTTGAAAAAGGGCGGCACACCATATTTTATAGATCGCTTTTTTAACTACGACAATTGCTCAACGATGCTAGTGCAT ACATTTATGTTTAATTCAACGCCTAATGATATCGCGTTAATACGTTTAACAACGCCGTTGAAATTCAACCAGC GGGTAAAAAAGATTGAATTCACGACAGAAACTGTGCCGGAAAATGCTACACTTACACTGACAGGATGGGGACAAATGAGAAAT GGGACGAGTCCTGCTAAGCTGCAAACCATCAATGCGCCCTCCATTAGGATTGATCATTGTCGGGCTATTTATAATGAAACGTATCTTAATGACGGCACAATTTGTAGTCTATCAAAACGGGGCGAAAGGAGCATGTATGGGAGATTCT GGTGGGCCTGTGACATGGAAAAGGAAAACTGGTCGGTATA                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CNS09Q22             [                                                                                                             TTAGCAGAGGTAGTGCAAGTCCAATAGATCATCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGTCGATGGATCGGATGCAGAGGAGAATGCGGCACCGTATCAGGTTTCACTGCAGATTGATGGTAACAGCACATGCAGTGGATCGATAGTCGGTGATCGATGGATATTGACAGCAGAGCACTGTGTGCCATTGTTACAATTTTTCTCCGAACGATCTAACAAAACTCGTGTTGTAGCAGGCACAAATGATTTGAAAAAGGGCGGCACACCGTATTTTATAGATCGCTTTTTTAACTACGACAATTGCTCAACAATGCTAGTGCATAAAAATTATGTTTAATTTTCCGCCTAATGATATCGCGTTAATACGTTTAACAACGCCGTTGAAATTCAACGAGC GGGTAAAAAAGATTGAGTTCACGGCAGAAACTGTGCCGGAAAATGCTACACTTACACTGACAGGATGGGGAGAGATGAGAAAT GGGACGATACCTACTAAGCTGCAAACCATCAATGCGCCCTCCATAGGGATTGATCGTTGTCGGGCTATTTATAATGAAATCTTGGTGAATAACGGCACAATTTGTAGTCTATCAAAACGGGGCG AAGGAGCATGCATGGGCGATTCT GGTGGCCCTGTGACATGG AAAGGAAAACTGGTCGGTATATTCAAAGCAGTACACAAAAAAGGGTGCGGTGAGGGATTTCCAGATGTCCACACAAATGTTGCCTACTACTACGAATGGGTAAAGGATACTATTGCCAACAATAGCGTTTAAAAATAGGAATTGAACCGATCAGAAGCAAGGTTTTAAATATAT]


>consensus_8608#0 CCGCCGACAGTCAAGGAAGGTCACTTGTGGTTGTGAGAAGGATAAGCATTACTTAAACGA GGAAAAATGGTAGTTCATATCATTTTCGCTATTCTACTTGCATGCGTTAGCAGAGGTAGT GCAAGTCCAATAGATCATCCGATATCTCCCTTCGCTGCTAACTACATTGTCGATGGATCG GATGCAGAGGAGAATGCGGCACCGTATCAGGTTTCACTGCAGATTGATGGTAACAGCACA TGCAGTGGATCGATAGTCGGTGATCGATGGATATTGACAGCAGAGCACTGTGTGCCATTG TTACAATTTTTCTCCGAACGATCTAACAACACTCGTGTTGTAGCAGGCACAAATGATTTG AAAAAGGGCGGCACACCATATTTTATAGATCGCTTTTTTAACTACGACAATTGCTCAACG ATGCTAGTGCATACATTTATGTTTAATTCAACGCCTAATGATATCGCGTTAATACGTTTA ACAACGCCGTTGAAATTCAACGAGCGGGTAAAAAAGATTGAATTCACGACAGAAACTGTG CCGGAAAATGCTACACTTACACTGACAGGATGGGGACAAATGAGAAATGGGACGAGTCCT GCTAAGCTGCAAACCATCAATGCGCCCTCCATAGGGATTGATCATTGTCGGGCTATTTAT AATGAAACGTATCTTAATGACGGCACAATTTGTAGTCTATCAAAACGGGGCGAAGGAGCA TGCATGGGCGATTCTGGTGGCCCTGTGACATGGAAAGGAAAACTGGTCGGTATATTCAAA GCAGTACACAAAAAAGGGTGCGGTGAGGGATTTCCAGATGTCCACACAAATGTTGCCTAC TACTACGAATGGGTAAAGGATACTATTGCCAACAATAGCGTTTAAAAATAGGAATTGAAC CGATCAGAAGCAAGGTTTTAAATATAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)