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Anopheles gambiae
cluster # 8610 cluster # 8610       Sequences # 11       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8610#0 length = 1192 sequences # 10  
consensus_8610#1 length = 634 sequences # 1  

consensusID : consensus_8610#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 1192
fasta sequence
                              [TATTCATATCGATTATTGTTGTTTGTTTTTTTTGAACGGTCCTACTACTTCAAATGGAGTGTCAATTGATACTACTTCAAATGGAGTGTAGGGTGTGTCTGTTTTAACAAAAGGCTCTACTGTTTTTGTATGATGTTTGTTAAGCTTGCATGTTGAACATTTGTCCAAAAAGTCTTTGATTGTCTTTTTCAATTATTAGTTCTTCCTCCGTGAGGATTTTTGGTTTCTTTTTGGGTGCCT-CCGGCAAGCACATCTCTTAGTTTTTTAGTTTTAGTTTTTTTAATAGTGCTTCTAGTGTGTCAAACACAGAGGCAACTAGGTTGAGGTCGTAATCGATATTCGAGATCAGCTCGAAACCCAACCGAGGGCCGATTACTCCCTCAAGGTGCCGCTGTGTATTCCTTCAGCAGTTCGTAGAGGATCACCACCCCGACGTTCACCAGGTTTCTCAGGGTTTCGTTGGTTCCTCGGATATTCTCACATACGTCCTCGTGAGTGGAAAGGTAAAGCAGCTTTGCTACGAACTCCTTCTCTGGTGTTTGGC-TTGTCGATTGCTCGACGGTGTCTCTCCCCTCCCAGGTTGTCCGTCTAGCTTCGATAGCTGCCAGGTCTTCAGCCTCCGCTGGTCCGTCAAAGTCTGTGTTATCCTCGTCGTTGATCCAACCGTCGCTCGGGTACACTTGGATTGTCACAACGTTCGTGCCTTTCTTTAGGTACATCAGACTGGTGGCTTCTGATGGCCTAATGATCGTTAATCTTTATATACACTTGCATTCCCACTGATCTTTTAGTTTGTGTTATCTTGTTGCACACTTGTTTACACTCACTTTTTCGGTAAGATTCAGCGTTCTGATGACCTG-TTTTTTTGTATATTATTTTCGAAACCTCGGCTTAGTTGCAAAAAGCACTGTCAAAATAATGAATTGTTTCCGTTTATCGACGTTCTGCGA-TTGCTCAAGCTTGTTG-AATTTTTCTGTTTAATTTCCAACAGTTGGCATATATTTTCCAACACCTAAACTATCAGGAGGTTAGACAGATTAGGAAAACAACATAAAAAAGAACATCAACTAGGGGAAGTACAAACAGAGGTCATGTAGTGTATGTGGAAACGCGTTAGATAAGGATATGTATTTGTAAGAGTATTGGCGTCA-CTATTTGTTGTTC-AATAAAATCAGACTACAATTACAAAAAA]

[+] EMBL CNS08T96             [TATTCATATCGATTATTGTTGTTTGTTTTTTTTGAACGGTCCTACTACTTCAAATGGAGTGTCAATTGATACTACTTCAAATGGAGTGTAGGGTGTGTCTGTTTTAACAAAAGGCTCTACTGTTTTTGTATGATGTTTGTTAAGCTTGCATGTTGAACATTTGTCCAAAAAGTCTTTGATTGTCTTTTTCAATTATTAGTTCTTCCTCCGTGA GATTTTTGGTTTCTTTTTGGGTG CT CCGGCAAGCACATCTCTTAGTTTTTTAGTTTTAGTTTTTTTAATAGTGCTTCTAGTGTGTCAAACACAGAGGCAACTAGGTTGAGGTCGTAATCGATATTCGAGATCAGCTCGAAACCCAACCGAGGGCCGATTACTCCCTCAAGGTGCCGCTGTGTATTCCTTCAGCAGTTCGTAGAGGATCACCACCCCGACGTTCACCAGGTTTCTCAGGGTTTCGTTGGTTCCTCGGATATTCTCACATACGTCCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CNS08D50             [         CGATTATTGTTGTTTGTTTTTTTTGAACGGTCCTACTACTTCAAATGGAGTGTCAATTGATACTACTTCAAATGGAGTGTAGGGTGTGTCTGTTTTAACAAAAGGCTCTACTGTTTTTGTATGATGTTTGTTAAGCTTGCATGTTGAACATTTGTCCAAAAAGTCTTTGATTGTCTTTTTCAATTATTAGTTCTTCCTCCGTGAGGATTTTTGGTTTCTTTTTGGGTGCCT CCGGCAAGCACATCTCTTAGTTTTTTAGTTTTAGTTTTTTTAATAGTGCTTCTAGTGTGTCAAACACAGAGGCAACTAGGTTGAGGTCGTAATCGATATTCGAGATCAGCTCGAAACCCAACCGAGGGCCGATTACTCCCTCAAGGTGCCGCTGTGTATTCCTTCAGCAGTTCGTAGAGGATCACCACCCCGACGTTCACCAGGTTTCTCAGGGTTTCGTTGGTTCCTCGGATATTCTCACATACGTCCTCGTGAGTGGAAAGGTAAAGCAGCTTTGCTACGAACTCCTTCTCTGGTGTTTGGC TTGTCGATTGCTTTTCGGTGTCTCTCCCCTCCCAGGTTGTCCGTCTAGCTTCGATAGCTGCCAGGTCTTCAGCCTCCGCTGGTCCGTCAAAGTCTGTGTTATCCTCGTCGTTGATCCAACCGTCGCTCGGGTACACTTGGATTGTCACAACGTTCGTGCCTTTCTTTAGGTACATCAGACTGGTGGCTTCTGATGGCCTAATGATCGTTAATCTTTATATACACTTGCATTCCCACTGATCTTTTAGTTTGTGTTATCTTGTTGCACACTTGTTTACACTCACTTTTTCGGTAAGATTCAGCGTTCTGATGACCTG TTTTTTTGTATATTATTTTCGAAACCTCGGCTTAGTTGCAAAAAGCACTGTCAAAATAATGAATTGTTTCCGTTTATCGACGTTCTGCGA TTGCTCAAGCTTGTTG AATTTT                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CNS08QXU             [                                                                                                                                                                                                             CTCCGTGAGGATTTTAGGTTTCTTTTTGGGTGCCT CCGGCAAGCACATCTCTTAGTTTTTTAGTTTTAGTTTTTTTAATAGTGCTTCTAGTGTGTCAAACACAGAGGCAACTAGGTTGAGGTCGTAATCGATATTCGAGATCAGCTCGAAACCCAACCGAGGGCCGATTACTCCCTCAAGGTGCCGCTGTGTATTCCTTCAGCAGTTCGTAGAGGATCACCACCCCGACGTTCACCAGGTTTCTCAGGGTTTCGTTGGTTCCTCGGATATTCTCACATACGTCCTCGTGAGTGGAAAGGTAAAGCAGCTTTGCTACGAACTCCTTCTCTGGTGTTTGGCTTTGTCGATTGCTCGACGGTGTCTCTCCCCTCCCAGGTTGTCCGTCTAGCTTCGATAGCTGCCAGGTCTTCAGCCTCCGCTGGTCCGTCAAAGTCTGTGTTATCCTCGTCGTTGATCCAACCGTCGCTCGGGTACACTTGGATTGTCACAACGTTCGTGCCTTTCTTTAGGTACATCAGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CNS08D51             [                                                                                                                                                                                                                                            GCCTCCCGGCAAGCACATCTCTTAGTTTTTTAGTTTTAGTTTTTTTAATAGTGCTTCTAGTGTGTCAAACACAGAGGCAACTAGGTTGAGGTCGTAATCGATATTCGAGATCAGCTCGAAACCCAACCGAGGGCCGATTACTCCCTCAAGGTGCCGCTGTGTATTCCTTCAGCAGTTCGTAGAGGATCACCACCCCGACGTTCACCAGGTTTCTCAGGGTTTCGTTGGTTCCTCGGATATTCTCACATACGTCCTCGTGAGTGGAAAGGTAAAGCAGCTTTGCTACGAACTCCTTCTCTGGTGTTTGGC TTGTCGATTGCTCGACGGTGTCTCTCCCCTCCCAGGTTGTCCGTCTGGCTTCGATGGCTGCCAGGTCTAAAAACTCCGCTGGTCCGTCAAAGTCTGTGTTATCCTCGTCGTTGATCCAACCGTCGCTCGGGTACACTTGGATTGTCACAACGTTCGTGCCTTTCTTTAGGTACATCAGACTGGTGGCTTCTGATGGCCTAATGATCGTTAATCTTTATATACACTTGCATTCCCACTGATCTTTTAGTTTGTGTTATCTTGTTGCACACTTGTTTACACTCACTTTTTCGGTAAGATTCAGCGTTCTGATGACCTG TTTTTTTGTATATTATTTTCGAAACCTCGGCTTAGTTGCAAAAAGCACTGTCAAAATAATGAATTGTTTCCGTTTATCGACGTTCTGCGA TTGCTCAAGCTTGTTG AATTTTTCTGTTTAATTTCCAACAGTTGGCATATATTTTCCAACACCTAAACTATCAGGAGGTTAGACAGATTAGGAAAACAACATAAAAAAGAACATCAACTAGGGGAAGTACAAACAGAGGTCATGTAGTGTATGTGGAAACGCGTTAGATAAGGATATGTATTTGTAAGAGTATTGGCGTCA CTATTTGTTGTTC AATAAA                      ]
[-] EMBL CNS08QXV             [                                                                                                                                                                                                                                                                                 AGTTTTTTTAATAGTGCTTCTAGTGTGTCAAACACAGAGGCAACTAGGTTGAGGTCGTAATCGATATTCGAGATCAGCTCGAAACCCAACCGAGGGCCGATTACTCCCTCAAGGTGCCGCTGTGTATTCCTTCAGCAGTTCGTAGAGGATCACCACCCCGACGTTCACCAGGTTTCTCAGGGTTTCGTTGGTTCCTCGGATATTCTTACATACGTCCTCGTGAGTGGAAAGGTAAAGCAGCTTTGCTACGAACTCCTTCTCTGGTGTTTGGC TTGTCGATTGCTCGACGGTGTCTCTCCCCTCCCAGGTTGTCCGTCTAGCTTCGATAGCTGCCAGGTCTTCAGCCTCCGCTGGTCCGTCAAAGTCTGTGTTATCCTCGTCGTTGATCCAACCGTCGCTCGGGTACACTTGGATTGTCACAACGTTCGTGCCTTTCTTTAGGTACATCAGACTGGTGGCTTCTGATGGCCTAATGATCGTTAATCTTTATATACACTTGCATTCCCACTGATCTTTTAGTTTGTGTTATCTTGTTGCACACTTGTTTACACTCACTTTTTCGGTAAGATTCAGCGTTCTGATGACCTG TTTTTTTGTATATTATTTTCGAAACCTCGGCTTAGTTGCAAAAAGCACTGTCAAAATAATGAATTGTTTCCGTTTATCGACGTTCTGCGA TTGCTCAAGCTTGTTG AATTTTTCTGTTTAATTTCCAACAGTTGGCATATATTTTCCAACACCTAAACTATCAGGAGGTTAGACAGATTAGGAAAACAACATAAAAAAGAACATCAACTAGGGGAAGTACAAACAGAGGTCATGTAGTGTATGTGGAAACGCGTTAGATAAGGATATGTATTTGTAAGAGTATTGGCGTCA CTATTTGTTG TC AATAAAtc                    ]
[+] EMBL CNS0998U             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAGGATCACCACCCCGACGTTCACCAGGTTTCTCAGGGTTTCGTTGGTTCCTCGGATATTCTCACATACGTCCTCGTGAGTGGAAAGGTAAAGCAGCTTTGCTACGAACTCCTTCTCTGGTGTTTGGC TTGTCGATTGCTCGACGGTGTCTCTCCCCTCCCAGGTTGTCCGTCTAGCTTCGATAGCTGCCAGGTCTTCAGCCTCCGCTGGTCCGTCAAAGTCTGTGTTATCCTCGTCGTTGATCCAACCGTCGCTCGGGTACACTTGGATTGTCACAACGTTCGTGCCTTTCTTTAGGTACATCAGACTGGTGGCTTCTGATGGCCTAATGATCGTTAATCTTTATATACACTTGCATTCCCACTGATCTTTTAGTTTGTGTTATCTTGTTGCACACTTGTTTACACTCACTTTTTCGGTAAGATTCAGCGTTCTGATGACCTG TTTTTTTGTATATTATTTTCGAAACCTCGGCTTAGTTGCAAAAAGCACTGTCAAAATAATGAATTGTTTCCGTTTATCGACGTTCTGCGA TTGCTCAAGCTTGTTG AATTTTTCTGTTTAATTTCCAACAGTTGGCATATATTTTCCAACACCTAAACTATCAGGAGGTTAGACAGATTAGGAAAACAACATA                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CNS0998V             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTGAGTGGAAAGGTAAAGCAGCTTTGCTACGAACTCCTTCTCTGGTGTTTGGC TTGTCGATTGCTCGACGGTGTCTCTCCCCTCCCAGGTTGTCCGTCTAGCTTCGATAGCTGCCAGGTCTTCAGCCTCCGCTGGTCCGTCAAAGTCTGTGTTATCCTCGTCGTTGATCCAACCGTCGCTCGGGTACACTTGGATTGTCACAACGTTCGTGCCTTTCTTTAGGTACATCAGACTGGTGGCTTCTGATGGCCTAATGATCGTTAATCTTTATATAAACTTGCATTCCCACTGATCTTTTAGTTTGTGTTATCTTGTTGCACACTTGTTTAAACTAACTTTTTCGGTAAGATTCAGCGTTCTGATGACCTG TTTTTTTGTATATTATTTTCGAAACCTCGGCTTAGTTGCAAAAAGGACTGTCAAAATAATGAATTGTTTCCGTTTATCGACGTTCTGCGATTTGCTCAAGCTTGTTG AATTTTTCTGTTTAATTTCCAACAGTTGGCATATATTTTCCAACACCTAAACTATCAGGAGGTTAGACAGATTAGGAAAACAACATAAAAAAGAACATCAACTAGGGGAAGTACAAACAGAGGTCATGTAGTGTATGTGGAAACGCGTTAGATAAGGATATGTATTTGTAAGAGTATTGGCGTCA CTATTTGTTGTTC AATAAAATCAGACTACAATTACAAAAAA]
[-] EMBL BX626835             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTAAAGCAGCTTTGCTACGAACTCCTTCTCTGGTGTTTGGC TTGTCGATTGCTCGACGGTGTCTCTCGCNTCCCAGGTTGTCCGTCTAGCTTCGATAGCTGCCAGGTCTTCAGCCTCCGCTGGTCCGTCAAAGTATGTGTTATCCTCGTCGTTGATCCAACCGTCGCTCGGGTACACTTGGATTGTCACAACGTTCGTGCCTTTCTTTAGGTACATCAGACTGGTGGCTTCTGATGGCCTAATGATCGTTAATCTTTATATACACTTGCATTCCCACTGCTCTTTTAGTTTGTGTTATCTTATTGCACACTTGTTTACACTCACTTTTTTGGTAAGATTCAGCGTTCTGATGACCTGCTTTTGTTGTATATTATTTTCGAAACCTCGGCTTAGTTGCAAAAAGCACTGTCAAAATAATGAATTGCTTCCGTTTATCGACGTTCTGCGA TTGCTCAAGCTTGTTG AATTTTTCTGTTTAATTTCCAACAGTTGGCATATATTTTCCAACACCTAAAATATCAGGAGGTTAGACAGATTAGGAAAACAACAT AAAAAGAACATCAACTAGGGGAAGTACAAACAGAGGTCATGTAGTGTATGTGGAAACGCGTTAGATAAGGATATGTATTT                                                             ]
[+] EMBL BM579859             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ccgAAGCAGCTTTGCTACGAACTCCTTCTCTGGTGTTTGGC TTGTCGATTGCTCGACGGTGTCTCTCGCCTCCCAGGTTGTCCGTCTAGCTTCGATAGCTGCCAGGTCTTCAGCCTCCGCTGGTCCGTCAAAGTATGTGTTATCCTCGTCGTTGATCCAACCGTCGCTCGGGTACACTTGGATTGTCACAACGTTCGTGCCTTTCTTTAGGTACATCAGACTGGTGGCTTCTGATGGCCTAATGATCGTTAATCTTTATATACACTTGCATTCCCACTGCTCTTTTAGTTTGTGTTATCTTATTGCACACTTGTTTACACTCACTTTTTTGGTAAGATTCAGCGTTCTGATGACCTGCTTTTGTTGTATATTATTTTCGAAACCTCGGCTTAGTTGCAAAAAGCACTGTCAAAATAATGAATTGCTTCCGTTTATCGACGTTCTGCGA TTGCTCAAGCTTGTTG AATTTTTCTGTTTAATTTCCAACAGTTGGCATATATTTTCCAACACCTAAAATATCAGGAGGTTAGACAGATTAGGAAAACAACAT AAAAAGAACATCAACTAGGGGAAGTACAAACAGAGGTCATGTAGTGTATGTGGAAACGCGTTAGATAAGGATATGTATTTGTAAGAGTATTGGCGTCA CTATTTGTTGTTC AATAAAATCAGACTACca          ]
[-] EMBL CNS08T97             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGATCGTTAATCTTTATATACACTTGCATTCCCACTGATCTTTTAGTTTGTGTTATCTTGTTGCACACTTG TTAAACTCACTTTTTCGGTAAGATTCAGCGTTCTGATGACCTG TTTTTTTGTATATTATTTTCGAAACCTCGGCTTAGTTGCAAAAAGCACTGTCAAAATAATGAATTGTTTCCGTTTATCGACGTTCTGCGA TTGCTCAAGCTTGTTGAAATTTTTCTGTTTAATTTCCAACAGTTGGCATATATTTTCCAACACCTAAACTATCAGGAGGTTAGACAGATTAGGAAAACAACATAAAAAAGAACATCAACTAGGGGAAGTACAAACAGAGGTCATGTAGTGTATGTGGAAACGCGTTAGATAAGGATATGTATTTGTAAGAGTATTGGCGTCATCTATTTGTTGTTCAAATAAAATaca                 ]


>consensus_8610#0 TATTCATATCGATTATTGTTGTTTGTTTTTTTTGAACGGTCCTACTACTTCAAATGGAGT GTCAATTGATACTACTTCAAATGGAGTGTAGGGTGTGTCTGTTTTAACAAAAGGCTCTAC TGTTTTTGTATGATGTTTGTTAAGCTTGCATGTTGAACATTTGTCCAAAAAGTCTTTGAT TGTCTTTTTCAATTATTAGTTCTTCCTCCGTGAGGATTTTTGGTTTCTTTTTGGGTGCCT CCGGCAAGCACATCTCTTAGTTTTTTAGTTTTAGTTTTTTTAATAGTGCTTCTAGTGTGT CAAACACAGAGGCAACTAGGTTGAGGTCGTAATCGATATTCGAGATCAGCTCGAAACCCA ACCGAGGGCCGATTACTCCCTCAAGGTGCCGCTGTGTATTCCTTCAGCAGTTCGTAGAGG ATCACCACCCCGACGTTCACCAGGTTTCTCAGGGTTTCGTTGGTTCCTCGGATATTCTCA CATACGTCCTCGTGAGTGGAAAGGTAAAGCAGCTTTGCTACGAACTCCTTCTCTGGTGTT TGGCTTGTCGATTGCTCGACGGTGTCTCTCCCCTCCCAGGTTGTCCGTCTAGCTTCGATA GCTGCCAGGTCTTCAGCCTCCGCTGGTCCGTCAAAGTCTGTGTTATCCTCGTCGTTGATC CAACCGTCGCTCGGGTACACTTGGATTGTCACAACGTTCGTGCCTTTCTTTAGGTACATC AGACTGGTGGCTTCTGATGGCCTAATGATCGTTAATCTTTATATACACTTGCATTCCCAC TGATCTTTTAGTTTGTGTTATCTTGTTGCACACTTGTTTACACTCACTTTTTCGGTAAGA TTCAGCGTTCTGATGACCTGTTTTTTTGTATATTATTTTCGAAACCTCGGCTTAGTTGCA AAAAGCACTGTCAAAATAATGAATTGTTTCCGTTTATCGACGTTCTGCGATTGCTCAAGC TTGTTGAATTTTTCTGTTTAATTTCCAACAGTTGGCATATATTTTCCAACACCTAAACTA TCAGGAGGTTAGACAGATTAGGAAAACAACATAAAAAAGAACATCAACTAGGGGAAGTAC AAACAGAGGTCATGTAGTGTATGTGGAAACGCGTTAGATAAGGATATGTATTTGTAAGAG TATTGGCGTCACTATTTGTTGTTCAATAAAATCAGACTACAATTACAAAAAA



consensusID : consensus_8610#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 634
fasta sequence
                              [CCGCTCCGTGAGGATTTTTGGTTTCTTTTTGGGTGCTTTCGGCAAGCACATCTCTTAGTTTTTTAGTTTTAGTTTTTTTAATAGTGCTTCTAGTGTGTCAAACACAGAGGCAACTAGGTTGAGGTCGTAATCGATATTCGAGATCAGCTCGAAACCCAACCGAGGGCCGATTGCTCCCTCAAGGTAGGTGCAGACTGCCGCTGTGTATTCCTTCAGCCGTTCGTAGAGGATCACCACCCCGACGTTCACCAGGTTTCTCAGGGTTTCGTTGGTTCCTCGGATACTCTCACATACGTCCTCGTGAGTGGACAGGTAAAGCAGCTTTGCTACGAACTCCTTCTCTGGTGTTTGGCTTGTCGATTGCTCGACGGTGTCTCTCGCCTCCCAGGTTGTCCGTCTAGCTTCGATAGCTGCCAGGTCTTCAGCCTCCGCTGGTCCGTCAAAGTATGTGTTATCCTCGTCGTTGATCCAACCGTCGCTCGGGTACACTTGGATTGTCACAACGTTCGTGCCTTTCTTTAGGTACATCAGACTGGTGGCTTCTGATGGCCTAATGATCGTTAATCTTTATATACACTTGCATTCCCACTGCTCTTTTAGTTTGTGTTATCTTATTGCACACTTGGTTACACTC]

[+] EMBL BM596438             [CCGCTCCGTGAGGATTTTTGGTTTCTTTTTGGGTGCTTTCGGCAAGCACATCTCTTAGTTTTTTAGTTTTAGTTTTTTTAATAGTGCTTCTAGTGTGTCAAACACAGAGGCAACTAGGTTGAGGTCGTAATCGATATTCGAGATCAGCTCGAAACCCAACCGAGGGCCGATTGCTCCCTCAAGGTAGGTGCAGACTGCCGCTGTGTATTCCTTCAGCCGTTCGTAGAGGATCACCACCCCGACGTTCACCAGGTTTCTCAGGGTTTCGTTGGTTCCTCGGATACTCTCACATACGTCCTCGTGAGTGGACAGGTAAAGCAGCTTTGCTACGAACTCCTTCTCTGGTGTTTGGCTTGTCGATTGCTCGACGGTGTCTCTCGCCTCCCAGGTTGTCCGTCTAGCTTCGATAGCTGCCAGGTCTTCAGCCTCCGCTGGTCCGTCAAAGTATGTGTTATCCTCGTCGTTGATCCAACCGTCGCTCGGGTACACTTGGATTGTCACAACGTTCGTGCCTTTCTTTAGGTACATCAGACTGGTGGCTTCTGATGGCCTAATGATCGTTAATCTTTATATACACTTGCATTCCCACTGCTCTTTTAGTTTGTGTTATCTTATTGCACACTTGGTTACACTC]


>consensus_8610#1 CCGCTCCGTGAGGATTTTTGGTTTCTTTTTGGGTGCTTTCGGCAAGCACATCTCTTAGTT TTTTAGTTTTAGTTTTTTTAATAGTGCTTCTAGTGTGTCAAACACAGAGGCAACTAGGTT GAGGTCGTAATCGATATTCGAGATCAGCTCGAAACCCAACCGAGGGCCGATTGCTCCCTC AAGGTAGGTGCAGACTGCCGCTGTGTATTCCTTCAGCCGTTCGTAGAGGATCACCACCCC GACGTTCACCAGGTTTCTCAGGGTTTCGTTGGTTCCTCGGATACTCTCACATACGTCCTC GTGAGTGGACAGGTAAAGCAGCTTTGCTACGAACTCCTTCTCTGGTGTTTGGCTTGTCGA TTGCTCGACGGTGTCTCTCGCCTCCCAGGTTGTCCGTCTAGCTTCGATAGCTGCCAGGTC TTCAGCCTCCGCTGGTCCGTCAAAGTATGTGTTATCCTCGTCGTTGATCCAACCGTCGCT CGGGTACACTTGGATTGTCACAACGTTCGTGCCTTTCTTTAGGTACATCAGACTGGTGGC TTCTGATGGCCTAATGATCGTTAATCTTTATATACACTTGCATTCCCACTGCTCTTTTAG TTTGTGTTATCTTATTGCACACTTGGTTACACTC



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_8610#0      TATTCATATCGATTATTGTTGTTTGTTTTTTTTGAACGGTCCTACTACTTCAAATGGAGT 60
consensus_8610#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8610#0      GTCAATTGATACTACTTCAAATGGAGTGTAGGGTGTGTCTGTTTTAACAAAAGGCTCTAC 120
consensus_8610#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8610#0      TGTTTTTGTATGATGTTTGTTAAGCTTGCATGTTGAACATTTGTCCAAAAAGTCTTTGAT 180
consensus_8610#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8610#0      TGTCTTTTTCAATTATTAGTTCTTCCTCCGTGAGGATTTTTGGTTTCTTTTTGGGTGCCT 240
consensus_8610#1      ----------------------CCGCTCCGTGAGGATTTTTGGTTTCTTTTTGGGTGCTT 38
                                               ********************************* *

consensus_8610#0      CCGGCAAGCACATCTCTTAGTTTTTTAGTTTTAGTTTTTTTAATAGTGCTTCTAGTGTGT 300
consensus_8610#1      TCGGCAAGCACATCTCTTAGTTTTTTAGTTTTAGTTTTTTTAATAGTGCTTCTAGTGTGT 98
                       ***********************************************************

consensus_8610#0      CAAACACAGAGGCAACTAGGTTGAGGTCGTAATCGATATTCGAGATCAGCTCGAAACCCA 360
consensus_8610#1      CAAACACAGAGGCAACTAGGTTGAGGTCGTAATCGATATTCGAGATCAGCTCGAAACCCA 158
                      ************************************************************

consensus_8610#0      ACCGAGGGCCGATTACTCCCTCAAGGT-----------GCCGCTGTGTATTCCTTCAGCA 409
consensus_8610#1      ACCGAGGGCCGATTGCTCCCTCAAGGTAGGTGCAGACTGCCGCTGTGTATTCCTTCAGCC 218
                      ************** ************           ********************* 

consensus_8610#0      GTTCGTAGAGGATCACCACCCCGACGTTCACCAGGTTTCTCAGGGTTTCGTTGGTTCCTC 469
consensus_8610#1      GTTCGTAGAGGATCACCACCCCGACGTTCACCAGGTTTCTCAGGGTTTCGTTGGTTCCTC 278
                      ************************************************************

consensus_8610#0      GGATATTCTCACATACGTCCTCGTGAGTGGAAAGGTAAAGCAGCTTTGCTACGAACTCCT 529
consensus_8610#1      GGATACTCTCACATACGTCCTCGTGAGTGGACAGGTAAAGCAGCTTTGCTACGAACTCCT 338
                      ***** ************************* ****************************

consensus_8610#0      TCTCTGGTGTTTGGCTTGTCGATTGCTCGACGGTGTCTCTCCCCTCCCAGGTTGTCCGTC 589
consensus_8610#1      TCTCTGGTGTTTGGCTTGTCGATTGCTCGACGGTGTCTCTCGCCTCCCAGGTTGTCCGTC 398
                      ***************************************** ******************

consensus_8610#0      TAGCTTCGATAGCTGCCAGGTCTTCAGCCTCCGCTGGTCCGTCAAAGTCTGTGTTATCCT 649
consensus_8610#1      TAGCTTCGATAGCTGCCAGGTCTTCAGCCTCCGCTGGTCCGTCAAAGTATGTGTTATCCT 458
                      ************************************************ ***********

consensus_8610#0      CGTCGTTGATCCAACCGTCGCTCGGGTACACTTGGATTGTCACAACGTTCGTGCCTTTCT 709
consensus_8610#1      CGTCGTTGATCCAACCGTCGCTCGGGTACACTTGGATTGTCACAACGTTCGTGCCTTTCT 518
                      ************************************************************

consensus_8610#0      TTAGGTACATCAGACTGGTGGCTTCTGATGGCCTAATGATCGTTAATCTTTATATACACT 769
consensus_8610#1      TTAGGTACATCAGACTGGTGGCTTCTGATGGCCTAATGATCGTTAATCTTTATATACACT 578
                      ************************************************************

consensus_8610#0      TGCATTCCCACTGATCTTTTAGTTTGTGTTATCTTGTTGCACACTTGTTTACACTCACTT 829
consensus_8610#1      TGCATTCCCACTGCTCTTTTAGTTTGTGTTATCTTATTGCACACTTGGTTACACTC---- 634
                      ************* ********************* *********** ********    

consensus_8610#0      TTTCGGTAAGATTCAGCGTTCTGATGACCTGTTTTTTTGTATATTATTTTCGAAACCTCG 889
consensus_8610#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8610#0      GCTTAGTTGCAAAAAGCACTGTCAAAATAATGAATTGTTTCCGTTTATCGACGTTCTGCG 949
consensus_8610#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8610#0      ATTGCTCAAGCTTGTTGAATTTTTCTGTTTAATTTCCAACAGTTGGCATATATTTTCCAA 1009
consensus_8610#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8610#0      CACCTAAACTATCAGGAGGTTAGACAGATTAGGAAAACAACATAAAAAAGAACATCAACT 1069
consensus_8610#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8610#0      AGGGGAAGTACAAACAGAGGTCATGTAGTGTATGTGGAAACGCGTTAGATAAGGATATGT 1129
consensus_8610#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8610#0      ATTTGTAAGAGTATTGGCGTCACTATTTGTTGTTCAATAAAATCAGACTACAATTACAAA 1189
consensus_8610#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8610#0      AAA 1192
consensus_8610#1      ---
                         




Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)