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Anopheles gambiae
cluster # 8707 cluster # 8707       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8707#0 length = 1397 sequences # 11  

consensusID : consensus_8707#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 1397
fasta sequence
                              [GTTTTTAAGCCAACATAAACATCTTGTACAGGTCGNCCGTCTGTCTGTTTTGTATGTTAAATCTTTAACTCTTTAATTTTGAAATGTTTTTTCTTCTCTTTTTTACCTCATTTTCTTCTTTGCCAAAGGAGTACTTGTGTTATCGTTTTTCCCTTTTCGGTTCACTTACAATAACTAAACTCACTATCAATTAAGTACTTGTTCTTAATATCTTAGATTATAATTATTAAAAAAAAAGAAAACAGAAATCACATACGACCACAAAGACCACACACAGGTGTTGTGTTGTCCCGCCTTTCTAGCGCGTGTATGAGGAGCAAATTGAGAGAGGGGACAGGGAC-AAAACTAGGCCC-TACG-AATGGTCGTATATGGGGATGGGCGGCATATTTCTTAAATGGCAAATTCTCATCAAAATAGAGGAGGAATGGAATGGCAAATATGAAGGACGGTTTGTTTTCGTTTTTTTGTGTGAATTGGTTACTCTTATCACTAAATTGAGGCGCACATGTGGGTGCCATCAATTGGGAATGAAATGTGTATGCGTTTGCTGCTTAAACTGAGACGTGTCTAACGTGTTCACAAAAGTAAAACGGTTAAAACAGGTAATACTAAGTAAAGAGTGTGTGGTTTGTGATGCGTGCAGAGGTAATACTAGCTTGCCACTACTAACACGAAGCAATTGAAATGTGTTTTTGCTGCTGATAACTGCTAATTATTTGCAAACTTGAAATCTTTCTTACGGTTCTACTATTATGCCTGTTTCTGCTT-TTG-TTTGTGCTTTGTGAAAAATGAATCCAGTAGAAAGCTTAGTAAATTGTTCAAGCTAGAGGCTTATCGTATAAGCAGTTTATCTAGTGTAAAGCAATTATACTAGCGTACTTCTTCTAAATTAAGTTT-GTAAACACGGACATTGGAGTAACGAAAAGAGAATAAAAATCCCTAAATCCTACCACTTTCTATCAATGATACTTTCTCCGCTTCTCTACCTACTCTATCGTCTTAGCAAAAACATAATG----AAAAAAAAAACTAATGTCATTGTAAAATTAATATTGCATTTTTACGGAAGCCTACACGTGTGTTGCATGCACCTTCCTGTTTATGAAATTACCTAAAAGTACAACGGTGAATACCCTAGACTCTTCCTAATTTCTTAACTTCCTCATAAGCTACTGTTACTGTTCCTTAATGCAGTGCTTGTTCACTTTTCTGATAGATGGCGCTTGAATATGCACCGCTACCGTTTCACTGCCTTCCTGTTCTTCTAAAGTATCAGTATCCTCTCACGATCGATCATTCGATCCTCTGCCTGCTCCGTCCTCTCCATCGCACAACGCGTTTGGCCACTCTGGGAGAATACCACAGCGTGTTTTGATATAGTAAGCAAGGTTAAAGAAATA]

[-] EMBL BX622306             [GTTTTTAAGCCAACATAAACATCTTGTACAGGTCGNCCGTCTGTCTGTTTTGTATGTTAAATCTTTAACTCTTTAATTTTGAAATGTTTTTTCTTCTCTTTTTTACCTCATTTTCTTCTTTGCCAAAGGAGTACTTGTGTTATCGTTTTTCCCTTTTCGGTTCACTTACAATAACTAAACTCACTATCAATTAAGTACTTGTTCTTAATATCTTAGATTATAATTATTAAAAAAAAAGAAAACAGAAATCACATACGACCACAAAGACCACACACAGGTGTTGTGTTGTCCCGCCTTTCTAGCGCGTGTATGAGGAGCAAATTGAGAGAGGGGACAGGGAC AAAACTAGGCCC TACG AATGGTCGTATATGGGGATGGGCGGCATATTTCTTAAATGGCAAATTCTCATCAAAATAGAGGAGGAATGGAATGGCAAATATGAAGGACGGTTTGTTTTCGTTTTTTTGTGTGAATTGGTTACTCTTATCACTAAATTGAGGCGCACATGTGGGTGCCATCAATTGGGAATGAAATGTGTATGCGTTTGCTGCTTAAACTGAGACGTGTCTAACGTGTTCACAAAAGTAAAACGGTTAAAACAGGTAATACTAAGTAAAGAGTGTGTGGTTTGTGATGCGTGCAGAGGTAATACTAGCTTGCCACTACTAACACGAAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BX625654             [                                                                                                                 TCTTCTTTGCCAAAGGAGTACTTGTGTTATCGTTTTTCCCTTTTCGGTTCACTTACAATAACTAAACTCACTATCAATTAAGTACTTGTTCTTAATATCTTAGATTATAATTATTAAAAAAAAAGAAAACAGAAATCACATACGACCACAAAGACCACACACAGGTGTTGTGTTGTCCCGCCTTTCTAGCGCGTGTATGAGGAGCAAATTGAGAGAGGGGACAGGGAC AAAACTAGGCCC TACG AATGGTCGTATATGGGGATGGGCGGCATATTTCTTAAATGGCAAATTCTCATCAAAATAGAGGAGGAATGGAATGGCAAATATGAAGGACGGTTTGTTTTCGTTTTTTTGTGTGAATTGGTTACTCTTATCACTAAATTGAGGCGCACATGTGGGTGCCATCAATTGGGAATGAAATGTGTATGCGTTTGCTGCTTAAACTGAGACGTGTCTAACGTGTTCACAAAAGTAAAACGGTTAAAACAGGTAATACTAAGTAAAGAGTGTGTGGTTTGTGATGCGTGCAGAGGTAATACTAGCTTGCCACTACTAACACGAAGCAATTGAAATGTGTTTTTGCTGCTGATAACTGCTAATTATTTGCAAACTTGAAATCTTTCTTACGGTTCTACTATCATGCCTGTTTCTGCTTCTGG TTTGTGCTTTGTGAAAAATGGATCCAGTANAAAGCTTAGTAAATTGTTCAAGCTAGANGCTTATCGTATNAGCAGTTTATCTAGTGTAAAGCAATTATACTAGCGTACTTCNTCTAAATTAAGTTTGGTAAACACGGACATTGGAGTAACGAAAAGANAATAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL BX610318             [                                                                                                                                                                                  ACTCACTATCAATTAAGTACTTGTTCTTAATATCTTAGATTATAATTATTAAAAAAAAAGAAAACAGAAATCACATACGACCACAAAGACCACACACAGGTGTTGTGTTGTCCCGCCTTTCTAGCGCGTGTATGAGGAGCAAATTGAGAGAGGGGACAGGGAC AAAACTAGGCCC TACG AATGGTCGTATATGGGGATGGGCGGCATATTTCTTAAATGGCAAATTCTCATCAAAATAGAGGAGGAATGGAATGGCAAATATGAAGGACGGTTTGTTTTCGTTTTTTTGTGTGAATTGGTTACTCTTATCACTAAATTGAGGCGCACATGTGGGTGCCATCAATTGGGAATGAAATGTGTATGCGTTTGCTGCTTAAACTGAGACGTGTCTAACGTGTTCACAAAAGTAAAACGGTTAAAACAGGTAATACTAAGTAAAGAGTGTGTGGTTTGTGATGCGTGCAGAGGTAATACTAGCTTGCCACTACTAACACGAAGCAATTGAAATGTGTTTTTGCTGCTGATAACTGCTAATTATTTGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL BX619897             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GAGAG GGGGACAGGGACAAAAACTAGGCCCTTACGNAATGGTCGTATATGGGGATGGGCGGCATATTTCTTAAATGGCAAANTCTCATCAAAATAGAGGAGGAATGGAATGGCAAATATGAAGGACGGTTTGTTTTCGTTTTTTTGTGTGAATTGGTTACTCTTATCACTAAATTGAGGCGCACATGTGGGTGCCATCAATTGGGAATGAAATGTGTATGCGTTTGCTGCTTAAACTGAGACGTGTCTAACGTGTTCACAAAAGTAAAACGGTTAAAACAGGTAATACTAAGTAAAGAGTGTGTGGTTTGTGATGCGTGCAGAGGTAATACTAGCTTGCCACTACTAACACGAAGCAATTGAAATGTGTTTTTGCTGCaatacccct                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL BX616613             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CAAATTCTCATCAAAATAGAGGAGGAATGGAATGGCAAATATGAAGGACGGTTTGTTTTCGTTTTTTTGTGTGAATTGGTTACTCTTATCACTAAATTGAGGCGCACATGTGGGTGCCATCAATTGGGAATGAAATGTGTATGCGTTTGCTGCTTAAACTGAGACGTGTCTAACGTGTTCACAAAAGTAAAACGGTTAAAACAGGTAATACTAAGTAAAGAGTGTGTGGTTTGTGATGCGTGCAGAGGTAATACTAGCTTGCCACTACTAACACGAAGCAATTGAAATGTGTTTTTGCTGCTGATAACTGCTAATTATTTGCAAACTTGAAATCTTTCTTACGGTTCTACTATCATGCCTGTTTCTGCTT CTGTTTTGTGCTTTGTGAAAAATGGATCCAGTAGAAAGCTTAGTAAATTGTTCAAGCTAGAGGCTTATCGTATAAGCAGTTTATCTAGTGTAAAGCAATTATACTAGCGTACTTCTTCTAAATTAAGTTT GTAAACACGGACATTGGAGTAACGAAAAGAGAATAAAAATCCCTAAATCCTACCACTTTCTATCAATGATACTTTCTCCGCTTCTCTACCTACTCTATCGTCTTAGCAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CNS08W8V             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tcTATCACTAAATTGAGGCGCACATGTGGGTGCCATCAATTGGGAATGAAATGTGTATGCGTTTGCTGCTTATACTGAGACGTGTCTAACGTGTTCACAAAAGTAAAACGGTTAAAAAAGGTAATACTAAGTAAAGAGTGTGTGGTTTGTGATGCGTGCAGAGGTAATACTAGCTTGCCACTACTAACACGAAGCAATTGAAATGTGTTTTTGCTGCTGATAACTGCTAATTATTTGCAAACTTGAAATCTTTCTTACGGTTCTACTATTATGCCTGTTTCTGCTT TTG TTTGTGCTTTGTGAAAAATGAATCCAGTAGAAAGCTTAGTAAATTGTTCAAGCTAGAGGCTTATCGTATAAGCAGTTTATCTAGTGTAAAGCAATTATACTAGCGTACTTCTTCTACATTAAGATT GTAAACACGGACATTGGAGTAACGAAAAGAGAATAAAAATCCCTAAATCCTACCACTTTCTATCAATGATACTTTCTCCGCTTCTCTACCTACTCTATCGTCTTAGCAAAAACATAATG    AAAAAAAAAACTAATGTCATTGTAAAATTAATATTGCATTTTTACGGAAGCCTACACGTGTGTCGCATGCACCCTCCTGTTTATGAAATTACCTAAAAGTACAACGGTGAATACCCTAGACTCTTCCTAATTTCTTAACTTCCTCATAAGCTACTGTTACTGTTCCTTAATGCAGTGCTTGTTCACTTTTCTGATAGATGGCGCTTGAATATGCACCGCTACCGTTTCACTGCCTTCC                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CNS08XOC             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCACTAAATTGAGGCGCACATGTGGGTGCCATCAATTGGGAATGAAATGTGTATGCGTTTGCTGCTTATACTGAGACGTGTCTAACGTGTTCACAAAAGTAAAACGGTTAAAAAAGGTAATACTAAGTAAAGAGTGTGTGGTTTGTGATGCGTGCAGAGGTAATACTAGCTTGCCACTACTAACACGAAGCAATTGAAATGTGTTTTTGCTGCTGATAACTGCTAATTATTTGCAAACTTGAAATCTTTCTTACGGTTCTACTATTATGCCTGTTTCTGCTT TTG TTTGTGCTTTGTGAAAAATGAATCCAGTAGAAAGCTTAGTAAATTGTTCAAGCTAGAGGCTTATCGTATAAGCAGTTTATCTAGTGTAAAGCTATTATACTAGCGTACTTCTTCTACATTAAGATT GTAAACACGGACATTGGAGTAACGAAAAGAGAATAAAAATCCCTAAATCCTACCACTTTCTATCAATGATACTTTCTCCGCTTCTCTACCTACTCTATCGTCTTAGCAAAAACATAATG    AAAAAAAAAACTAATGTCATTGTAAAATTAATATTGCATTTTTACGGAAGCCTACACGTGTTTTGCATGCACCTTCCTGTTTATGAAATTACCTAAAAGTACAACGGTGAATACCCTAGACTCTTCCTAATTTCTTAACTTCCTCATAAGCTACTGTTACTGTTCCTTAATGCAGTTCTTGTTCACTTTAAAAATAAATGGCGCTTGAAT TTTTTTTTTACCGTTTCACTGCCTTCC                                                                                                                                               ]
[-] EMBL BX628675             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTAACGTGTTCACAAAAGTAAAACGGTTAAAAAAGGTAATACTAAGTAAAGAGTGAGTGGTTTGTGATGCGTGCAGAGGTAATACTAGCTTGCCACTACTAACACGAAGCAATTGAAATGTGTTTTTGCTGCTGATAACTGCTAATTATTTGCAAACTTGAAATCTTTCTTACGGTTCTACTATTATGCCTGTTTCTGCTT CTGTTTTGTGCTTTGTGAAAAATGAATCCAGTAGAAAGCTTAGTAAATTGTTCAAGCTAGAGGCTTATCGTATAAGCAGTTGATCTAGTGTAAAGCAATTATACTAGCGTACTTCTTCTAAATTAAGTTT GTAAACACGGACATTGGAGTAACGAAAAGAGAATAAAAATCCCTAAATCCTACAACTTTCTATCAATGATACTTTCTCCGCTTCTCTACCTACTCTATCGTCTTAGCAAAAACAAAATG     AAAAAAAAACTAATGTCATTGTAAAATTAATATTGCATTTTTACGGAAGCCTACACGTGTGTTGCATGCACCTTCCTGTTTATGAAATTACCTAAAAGTACAACGGTGAATACCCTAGACTCTTCCTAATTTCTTAACTTCCTCATAAGCTACTGTTACTGTTCCTTAATGCAGTGCTTGTTCACTTTTCTGATAGATGGCGCTTGTATATGCACCGC                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CNS08W8U             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTGCTAATTATTTGCAAACTTGAAATCTTTCTTACGGTTCTACTATTATGCCTGTTTCTGCTT TTG TTTGTGCTTTGTGAAAAATGAATCCAGTAGAAAGCTTAGTAAATTGTTCAAGCTAGAGGCTTATCGTATAAGCAGTTTATCTAGTGTAAAGCAATTATACTAGCGTACTTCTTCTACATTAAGATT GTAAACACGGACATTGGAGTAACGAAAAGAGAATAAAAATCCCTAAATCCTACCACTTTCTATCAATGATACTTTCTCCGCTTCTCTACCTACTCTATCGTCTTAGCAAAAACATAATG    AAAAAAAAAACTAATGTCATTGTAAAATTAATATTGCATTTTTACGGAAGCCTACACGTGTGTTGCATGCACCCTCCTGTTTATGAAATTACCTAAAAGTACAACGGTGAATACCCTAGACTCTTCCTAATTTCTTAACTTCCTCATAAGCTACTGTTACTGTTCCTTAATGCAGTGCTTGTTCACTTTTCTGATAGATGGCGCTTGAATATGCACCGCTAGCGTTTCACTGCCTTCCTGTTCTTCTAAAGTATCAGTATCCTCTCACGATCGGTCATTCGATCCTCTGCCTGCTCCGTCCTCTCCATCGCACAACGCGT                                                             ]
[-] EMBL CNS08XOB             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaACTATTATGCCTGTTTTTTCTT TTG TTTGTGCTTTGTGAAAAATGAATCCAGTAGAAAGCTTAGTAAATTGTTCAAGCTAGAGGCTTATCGTATAAGCAGTTTATCTAGTGTAAAGCAATTATACTAGCGTACTTCTTCTACATTAAGATT GTAAACACGGACATTGGAGTAACGAAAAGAGAATAAAAATCCCTAAATCCTACCACTTTCTATCAATGATACTTTCTCCGCTTCTCTACCTACTCTATCGTCTTAGCAAAAACATAATG    AAAAAAAAAACTAATGTCATTGTAAAATTAATATTGCATTTTTACGGAAGCCTACACGTGTGTTGCATGCACCTTCCTGTTTATGAAATTACCTAAAAGTACAACGGTGAATACCCTAGACTCTTCCTAATTTCTTAACTTCCTCATAAGCTACTGTTACTGTTCCTTAATGCAGTGCTTGTTCACTTTTCTGATAGATGGCGCTTGAATATGCACCGCTACCGTTTCACTGCCTTCCTGTTCTTCTAAAGTATCAGTATCCTCTCACGATCGATCATTCGATCCTCTGCCTGCTCCGTCCTCTCCATCGCACAACGCGT                                                             ]
[-] EMBL BX628673             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CCAGTAGAAAGCTTAGTAAATTGTTCAAGCTAGAGGCTTATCGTATAAGCAGTTTATCTAGTGTAAAGCAATTATACTAGCGTACTTCTTCTAAATTAAGTTT GTAAACACGGACATTGGAGTAACGAAAAGAGAATAAAAATCCCTAAATCCTACCACTTTCTATCAATGATACTTTCTCCGCTTCTCTACCTACTCTATCGTCTTAGCAAAAACATAATGAAAAAAAAAAAAAACTAATGTCATTGTAAAATTAATATTGCATTTTTACGGAAGCCTACACGTGTGTTGCATGCACCTTCCTGTTTATGAAATTACCTAAAAGTACAACGGTGAATACCCTAGACTCTTCCTAATTTCTTAACTTCCTCATAAGCTACTGTTACTGTTTCTTAATGCAGTGCTTGTTCACTTTTCTGATAGATGGCGCTTGAATATGCACCGCTACCGTTTCACTGCCTTCCTGTTCTTCTAAAGTATCAGTATCCTATCACGATCGATCATTCGATCCTCTGCCTGCTCCGTCCTCTCCATCGCACAACGCGTTTGGCCACTCTGGGAGAATACCACAGCGTGTTTTGATATAGTAAGCAAGGTTAAAGAAATA]


>consensus_8707#0 GTTTTTAAGCCAACATAAACATCTTGTACAGGTCGNCCGTCTGTCTGTTTTGTATGTTAA ATCTTTAACTCTTTAATTTTGAAATGTTTTTTCTTCTCTTTTTTACCTCATTTTCTTCTT TGCCAAAGGAGTACTTGTGTTATCGTTTTTCCCTTTTCGGTTCACTTACAATAACTAAAC TCACTATCAATTAAGTACTTGTTCTTAATATCTTAGATTATAATTATTAAAAAAAAAGAA AACAGAAATCACATACGACCACAAAGACCACACACAGGTGTTGTGTTGTCCCGCCTTTCT AGCGCGTGTATGAGGAGCAAATTGAGAGAGGGGACAGGGACAAAACTAGGCCCTACGAAT GGTCGTATATGGGGATGGGCGGCATATTTCTTAAATGGCAAATTCTCATCAAAATAGAGG AGGAATGGAATGGCAAATATGAAGGACGGTTTGTTTTCGTTTTTTTGTGTGAATTGGTTA CTCTTATCACTAAATTGAGGCGCACATGTGGGTGCCATCAATTGGGAATGAAATGTGTAT GCGTTTGCTGCTTAAACTGAGACGTGTCTAACGTGTTCACAAAAGTAAAACGGTTAAAAC AGGTAATACTAAGTAAAGAGTGTGTGGTTTGTGATGCGTGCAGAGGTAATACTAGCTTGC CACTACTAACACGAAGCAATTGAAATGTGTTTTTGCTGCTGATAACTGCTAATTATTTGC AAACTTGAAATCTTTCTTACGGTTCTACTATTATGCCTGTTTCTGCTTTTGTTTGTGCTT TGTGAAAAATGAATCCAGTAGAAAGCTTAGTAAATTGTTCAAGCTAGAGGCTTATCGTAT AAGCAGTTTATCTAGTGTAAAGCAATTATACTAGCGTACTTCTTCTAAATTAAGTTTGTA AACACGGACATTGGAGTAACGAAAAGAGAATAAAAATCCCTAAATCCTACCACTTTCTAT CAATGATACTTTCTCCGCTTCTCTACCTACTCTATCGTCTTAGCAAAAACATAATGAAAA AAAAAACTAATGTCATTGTAAAATTAATATTGCATTTTTACGGAAGCCTACACGTGTGTT GCATGCACCTTCCTGTTTATGAAATTACCTAAAAGTACAACGGTGAATACCCTAGACTCT TCCTAATTTCTTAACTTCCTCATAAGCTACTGTTACTGTTCCTTAATGCAGTGCTTGTTC ACTTTTCTGATAGATGGCGCTTGAATATGCACCGCTACCGTTTCACTGCCTTCCTGTTCT TCTAAAGTATCAGTATCCTCTCACGATCGATCATTCGATCCTCTGCCTGCTCCGTCCTCT CCATCGCACAACGCGTTTGGCCACTCTGGGAGAATACCACAGCGTGTTTTGATATAGTAA GCAAGGTTAAAGAAATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)