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Apis mellifera
cluster # 1015 cluster # 1015       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1015#0 length = 922 sequences # 3  

consensusID : consensus_1015#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 922
fasta sequence
                              [AAATTATATTTAAATTTATTATTATTTTTATAATTTCTAATATAAAAAAATTATTTCCAAATATTATTTTTTGTAAAACATTAATTTTTTTATTTGATAATATTTAAATTAATTTAAATAATATAANNNTTTTAATAATATAATATTTTTATTTTCTTTTTTATCATTTAACAAGAAATGATAATTTATGTTTTTTAATATTTTTTCCGATAAATAAATTATCATTTAATATTGTGGGAAAAAACTGCTCTAAAGTATGATAACTAATAGTTATTGAATTATTTAAAAGTGTGTTCAAGATTGTCAATATGCAACGAGTTCTTAGNTTTCAAATGGCTCGTGGACTTAGCGAGTCTAGCGAATTTGTGACAAAACGTATATGTTTTTCGTTAATATTTTCTGTCGGTTTTCTTTCTTTATTATGTGGATTTTTACTTGGCCGCTTTGCCACACAAAGGGCTATAGAATTTCGTGCAGAAAAAAAACGTCTTGAATTAGCGGGAAATGGTTTAGAGAATACTGAATATCTTCAACGTTTAGTACTCGAACAATTAGAAAGAGCGCCTCTTGATGCTGATTTCGAAAGGAAATGGGAATCTTTCAATTTAAAAGAAGATGATATAAATCAAGTGAATGATATTTTATCGAATTTATCACTTATTGAAAAAGTTNNNAAACATCAATCGCATATTATGGCTACTATTAGAGGATCTAGAGAATCAGATAGGTATATAATTTTATCAGTCAGTTGCGAAGGCGTCGGTGTTGCTTTGGAATTGGCAAAAATTTTTAATCAAATTCAAAAAGAATATAAATGGAAACCTCGTAGATCTCTTATTTTTTGTTTATTTTCGGGATCTTCCAACTCTTGTACAGAAGTATTATCTAATTTTATGCCCCATAAAATTATGGCTTATATTGT]

[+] EMBL BI507343             [AAATTATATTTAAATTTATTATTATTTTTATAATTTCTAATATAAAAAAATTATTTCCAAATATTATTTTTTGTAAAACATTAATTTTTT  TTTGATAATATTTAAATTAATTTAAATAATATAANNNTTTTAATAATATAATATTTTTATTTTCTTTTTTATCATTTAACAAGAAATGATAATTTATGTTTTTTAATATTTTTTCCGATAAATAAATTATCATTTAATATTGTGGGAAAAAACTGCTCTAAAGTATGATAACTAATAGTTATTGAATTATTTAAAAGTGTGTTCAAGATTGTCAATATGCAACGAGTTCTTAGNTTTCAAATGGCTCGTGGACTTAGCGAGTCTAGCGAATTTGTGACAAAACGTATATGTTTTTCGTTAATATTTTCTGTCGGTTTTCTTTCTTTATTATGTGGATTTTTACTTGGCCGCTTTGCTACACAAAGGGCTATAGAATTTCGTGCAGAAAAAAAACGTCTTGAATTAGCGGGAAATGGTTTAGAGNATACTGAATATCTTCAACGTTTAGTACTCGAACAATTAGAAAGAGCGCCTCTTGATGCTGATTTCGAAAGGAAATGGGAATCTTTCAATTTAAAAGAAGATGATATAAATCAAGTGAATGATATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BI510567             [                                  TTCTAATATAAAAAAATTATTTCCAAATATTATTTTTTGTAAAACATTAATTTTTTTATTTGATAATATTTAAATTAATTTAAATAATATAA ATTTTTAATAATATAATATTTTTATTTTCTTTTTTATCATTTAACAAGAAATGATAATTTATGTTTTTTAATATTTTTTCCGATAAATAAATTATCATTTAATATTGTGGGAAAAAACTGCTCTAAAGTATGATAACTAATAGTTATTGAATTATTTAAAAGTGTGTTCAAGATTGTCAATATGCAACGAGTTCTTAGCTTTCAAATGGCTCGTGGACTTAGCGAGTCTAGCGAATTTGTGACAAAACGTATATGTTTTTCGTTAATATTTTCTGTCGGTTTTCTTTCTTTATTATGTGGATTTTTACTTGGCCGCTTTGCCACACAAAGGGCTATAGAATTTCGTGCAGAAAAAAAACGTCTTGAATTAGCGGGAAATGGTTTAGAGAATACTGAATATCTTCAACGTTTAGTACTCGAACAATTAGAAAGAGCGCCTCTTGATGCTGATTTCGAAAGGAAATGGGAATCTTTCAATTTAAAAGAAGATGATATAAATCAAGTGAATGATATTTTATCGAATTTATCACTTATTGAAAAAGTTGTTAAACAT                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BI507984             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TATAGAATTTCGTGCAGAAAAAAAACGTCTTGAATTAGCGGGAAATGGTTTAGAGAATACTGAATATCTTCAACGTTTAGTACTCGAACAATTAGAAAGAGCGCCTCTTGATGCTGATTTCGAAAGGAAATGGGAATCTTTCAATTTAAAAGAAGATGATATAAATCAAGTGAATGATATTTTATCGAATTTATCACTTATTGAAAAAGTTNNNAAACATCAATCGCATATTATGGCTACTATTAGAGGATCTAGAGAATCAGATAGGTATATAATTTTATCAGTCAGTTGCGAAGGCGTCGGTGTTGCTTTGGAATTGGCAAAAATTTTTAATCAAATTCAAAAAGAATATAAATGGAAACCTCGTAGATCTCTTATTTTTTGTTTATTTTCGGGATCTTCCAACTCTTGTACAGAAGTATTATCTAATTTTATGCCCCATAAAATTATGGCTTATATTGT]


>consensus_1015#0 AAATTATATTTAAATTTATTATTATTTTTATAATTTCTAATATAAAAAAATTATTTCCAA ATATTATTTTTTGTAAAACATTAATTTTTTTATTTGATAATATTTAAATTAATTTAAATA ATATAANNNTTTTAATAATATAATATTTTTATTTTCTTTTTTATCATTTAACAAGAAATG ATAATTTATGTTTTTTAATATTTTTTCCGATAAATAAATTATCATTTAATATTGTGGGAA AAAACTGCTCTAAAGTATGATAACTAATAGTTATTGAATTATTTAAAAGTGTGTTCAAGA TTGTCAATATGCAACGAGTTCTTAGNTTTCAAATGGCTCGTGGACTTAGCGAGTCTAGCG AATTTGTGACAAAACGTATATGTTTTTCGTTAATATTTTCTGTCGGTTTTCTTTCTTTAT TATGTGGATTTTTACTTGGCCGCTTTGCCACACAAAGGGCTATAGAATTTCGTGCAGAAA AAAAACGTCTTGAATTAGCGGGAAATGGTTTAGAGAATACTGAATATCTTCAACGTTTAG TACTCGAACAATTAGAAAGAGCGCCTCTTGATGCTGATTTCGAAAGGAAATGGGAATCTT TCAATTTAAAAGAAGATGATATAAATCAAGTGAATGATATTTTATCGAATTTATCACTTA TTGAAAAAGTTNNNAAACATCAATCGCATATTATGGCTACTATTAGAGGATCTAGAGAAT CAGATAGGTATATAATTTTATCAGTCAGTTGCGAAGGCGTCGGTGTTGCTTTGGAATTGG CAAAAATTTTTAATCAAATTCAAAAAGAATATAAATGGAAACCTCGTAGATCTCTTATTT TTTGTTTATTTTCGGGATCTTCCAACTCTTGTACAGAAGTATTATCTAATTTTATGCCCC ATAAAATTATGGCTTATATTGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)