Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 1199 cluster # 1199       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1199#0 length = 577 sequences # 3  

consensusID : consensus_1199#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 577
fasta sequence
                              [TTTTTTTTTTGTTAAATTTTGTATAAATTCAATGCGAGCCTGTTCATTAGACTTTTCTATTCGCTTGTAGTTTAATTGTAACTTAAATATTTGGTACCTATATAACTTATGTACACAAGAATCATGCGTTTAGGGTAAATACGTATGTATCGTTAGATTTGTTCGTATTAAGGACTTTGTAAGCTCATGATAATGACAAGATAATTATTCAAAAATGAAGCGAAACGATGAGCAAAAACTATTTATTGGATAAATTAATTGCAGACTGCTCGAGTGCACTGGAAAGAGAGACCACGTAGTCCCAGTTTGATGAGATAAAAATGAATTTGTTTCCCAGCCGTGGCGACATTAAAAAAAGACAATTCAAACAATTGTAAATCATGAAATCACAATGTCCAAGCGGCAGCAATGCTTTGATTGGCCGAAATATTGGCACAGATTCGTATATATATATATGTAGGCATTTTGATACTCGAGATCTCTTCGCTAAGAATCATTGTTGGACAATTGAATGTAATGATAAAAGGAAAAAGAAAAAGGAAAAAAAAAAAAAGAGAAATGAAAAAAGGAAAAAAAA]

[+] EMBL BI508536             [TTTTTTTTTTGTTAAATTTTGTATAAATTCAATGCGAGCCTGTTCATTAGNCTTTTCTATTCGCTTGTAGTTTAATTGTAACTTAAATATTTGGTACCTATATAACTTATGTACACAAGAATCATGCGTTTAGGGTAAATACGTATGTATCGTTAGATTTGTTCGTATTAAGGACTTTGTAAGCTCATGATAATGACAAGATAATTATTCAAAAATGAAGCGAAACGATGAGCAAAAACTATTTATTGGATAAATTAATTGCAGACTGCTCGAGTGCACTGGAAAGAGAGACCACGTAGTCCCAGTTTGATGAGATAAAAATGAATTTGTTTCCCAGCCGTGGCGACATTAAAAAAAGACAATTCAAACAATTGTAAATCATGAAATCACAATGTCCAAGCGGCAGCAATGCTTTGATTGGCCGAAATATTGGCACAGATTCG                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BI506892             [                  TTGTATAAATTCAATGCGAGCCTGTTCATTAGACTTTTCTATTCGCTTGTAGTTTAATTGTAACTTAAATATTTGGTACCTATATAACTTATGTACACAAGAATCATGCGTTTAGGGTAAATACGTATGTATCGTTAGATTTGTTCGTATTAAGGACTTTGTAAGCTCATGAAAATGACAAGATAATTATTCAAAAATGAAGCGAAACGATGAGCAAAAACTATTTATTGGATAAATTAATTGCAGACTGCTCGAGTGCACTGGAAAGAGAGACCACGTAGTCCCAGTTTGATGAGATAAAAATGAATTTGTTTCCCAGCCGTGGCGACATTAAAAAAAGACATTTCAAACAATTGTAAATCATGAAATCACAATGTCCAAGCGGCAGCAATGCTTTGATTGGCCGAAATATTGGCACAGATTCGTATATATATATATGTAGGCATTTTGATACTCGAGATCTCTTCGCTAAGAATCATTGTTGGACAATTGAATGTAATGATAAAAGGAAAAAGAAAAAGGAAAAAAAAAAAAAGAGAAATGAAAAAAGGAAAAAAAA]
[+] EMBL BI506194             [                  TTGTATAAATTCAATGCGAGCCTGTTCATTAGACTTTTCTATTCGCTTGTAGTTTAATTGTAACTTAAATATTTGGTACCTATATAACTTATGTACACAAGAATCATGCGTTTAGGGTAAATACGTATGTATCGTTAGATTTGTTCGTATTAAGGACTTTGTAAGCTCATGATAATGACAAGATAATTATTCAAAAATGAAGCGAAACGATGAGCAAAAACTATTTATTGGATAAATTAATTGCAGACTGCTCGAGTGCACTGGAAAGAGAGACCACGTAGTCCCAGTTTGATGAGATAAAAATGAATTTGTTTCCCAGCCGTGGCGACATTAAAAAAAGACAATTCAAACAATTGTAAATCATGAAATCACAATGTCCAAGCGGCAGCAATGCTTTGATTGGCCGAAATATTGGCACAGATTCGTATATATATATATGTAGGCATTTTGATACTCGAGATCTCTTCGCTAAGAATCATTGTTGGACAATTGAATGTAATGATAAAAGGAAAAAGAAAAAGGAAAAAAAAAAAA                         ]


>consensus_1199#0 TTTTTTTTTTGTTAAATTTTGTATAAATTCAATGCGAGCCTGTTCATTAGACTTTTCTAT TCGCTTGTAGTTTAATTGTAACTTAAATATTTGGTACCTATATAACTTATGTACACAAGA ATCATGCGTTTAGGGTAAATACGTATGTATCGTTAGATTTGTTCGTATTAAGGACTTTGT AAGCTCATGATAATGACAAGATAATTATTCAAAAATGAAGCGAAACGATGAGCAAAAACT ATTTATTGGATAAATTAATTGCAGACTGCTCGAGTGCACTGGAAAGAGAGACCACGTAGT CCCAGTTTGATGAGATAAAAATGAATTTGTTTCCCAGCCGTGGCGACATTAAAAAAAGAC AATTCAAACAATTGTAAATCATGAAATCACAATGTCCAAGCGGCAGCAATGCTTTGATTG GCCGAAATATTGGCACAGATTCGTATATATATATATGTAGGCATTTTGATACTCGAGATC TCTTCGCTAAGAATCATTGTTGGACAATTGAATGTAATGATAAAAGGAAAAAGAAAAAGG AAAAAAAAAAAAAGAGAAATGAAAAAAGGAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)