Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 1376 cluster # 1376       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1376#0 length = 707 sequences # 2  

consensusID : consensus_1376#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 707
fasta sequence
                              [AGGCGGACGTTGCGAGGCATCGAAGTAAAAAAAAACGAACACGACAGGAAATAATTTTTGTTCGTATAAATGAAAACGATTAATATGTAGAGATAATGTGAATTTTTACACATGCAGAATCATGTTCGACAGAACGAAACAAAAAGTTTCCGTCGAGCCTATTTCCTAATCGTAAAACAGAGCCCCATCGAGAGGACTATTTCTGGTTTCACCAGCAACGAACGAAGTTATTCGTGTTTTTTCGATCAAGTAAATGGCAATCGTGAATTTCATCCATTTGTGGAGAGAAATTCGAGTTTGATAAAAAAAAATGTATTGAACCGAAAGTTTCCGTTGAACCCCTTTTTTTATGCTTTCGGTTGTACGCCATTTTCAGTAACACGTGCACGAGCATGACCATTAATCGATAAGCAAGAAATCTGCTTAACCTGTTAACGGTGTTAAAAGTAAGAAGTTATCTATTTATCATTAATGAAATTGCAAGTTGTTATCACCGTACAAGGTGTTAAACTTTTGAAACAAACCAAAGAATCATACGTTTCGAGTAATTTAATCTCGAAAATTTTACGACCTAACTTTTAAACGAGAAGTTTGCCTTGTTTAAACGACCTGTTCGCGTACGAGAAACGTAATTTTAACGTAATTTCGTGAAAATTGTTCCGAATATCGTGAGATTTTTCAGTAAAAAAAGTCGATAATTCGAGGCG]

[+] EMBL BI506764             [AGGCGGACGTTGCGAGGCATCGAAGTAAAAAAAAACGAACACGACAGGAAATAATTTTTGTTCGTATAAATGAAAACGATTAATATGTAGAGATAATGTGAATTTTTACACATGCAGAATCATGTTCGACAGAACGAAACAAAAAGTTTCCGTCGAGCCTATTTCCTAATCGTAAAACAGAGCCCCATCGAGAGGACTATTTCTGGTTTCACCAGCAACGAACGAAGTTATTCGTGTTTTTTCGATCAAGTAAATGGCAATCGTGAATTTCATCCATTTGTGGAGAGAAATTCGAGTTTGATAAAAAAAAATGTATTGAACCGAAAGTTTCCGTTGAACCCC TTTTTTATGCTTTCGGTTGTACGCCATTTTCAGTAACACGTGCACGAGCATGACCATTAATCGATAAGCAAGAAATCTGCTTAACCTGTTAACGGTGTTAAAAGTAAGAAGTTATCTATTTATCATTAATGAAATTGCAAGTTGTTATCACCGTACAAGGTGTTAAACTTTTGAAACAAACCAAAGAATCATACGTTTCGAGTAATTTAATCTCGAAAATTT                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BI509887             [                                                    AATTTTTGTTCGTATAAATGAAAACGATTAATATGTAGAGATAATGTGAATTTTTACACATGCAGAATCATGTTCGACAGAACGAAACAAAAAGTTTCCGTCGAGCCTATTTCCTAATCGTAAAACAGAGCCCCATCGAGAGGACTATTTCTGGTTTCACCAGCAACGAACGAAGTTATTCGTGTTTTTTCGATCAAGTAAATGGCAATCGTGAATTTCATCCATTTGTGGAGAGAAATTCGAGTTTGATAAAAAAAAATGTATTGAACCGAAAGTTTCCGTTGAACCCCTTTTTTTATGCTTTCGGTTGTACGCCATTTTCAGTAACACGTGCACGAGCATGACCATTAATCGATAAGCAAGAAATCTGCTTAACCTGTTAACGGTGTTAAAAGTAAGAAGTTATCTATTTATCATTAATGAAATTGCAAGTTGTTATCACCGTACAAGGTGTTAAACTTTTGAAACAAACCAAAGAATCATACGTTTCGAGTAATTTAATCTCGAAAATTTTACGACCTAACTTTTAAACGAGAAGTTTGCCTTGTTTAAACGACCTGTTCGCGTACGAGAAACGTAATTTTAACGTAATTTCGTGAAAATTGTTCCGAATATCGTGAGATTTTTCAGTAAAAAAAGTCGATAATTCGAGGCG]


>consensus_1376#0 AGGCGGACGTTGCGAGGCATCGAAGTAAAAAAAAACGAACACGACAGGAAATAATTTTTG TTCGTATAAATGAAAACGATTAATATGTAGAGATAATGTGAATTTTTACACATGCAGAAT CATGTTCGACAGAACGAAACAAAAAGTTTCCGTCGAGCCTATTTCCTAATCGTAAAACAG AGCCCCATCGAGAGGACTATTTCTGGTTTCACCAGCAACGAACGAAGTTATTCGTGTTTT TTCGATCAAGTAAATGGCAATCGTGAATTTCATCCATTTGTGGAGAGAAATTCGAGTTTG ATAAAAAAAAATGTATTGAACCGAAAGTTTCCGTTGAACCCCTTTTTTTATGCTTTCGGT TGTACGCCATTTTCAGTAACACGTGCACGAGCATGACCATTAATCGATAAGCAAGAAATC TGCTTAACCTGTTAACGGTGTTAAAAGTAAGAAGTTATCTATTTATCATTAATGAAATTG CAAGTTGTTATCACCGTACAAGGTGTTAAACTTTTGAAACAAACCAAAGAATCATACGTT TCGAGTAATTTAATCTCGAAAATTTTACGACCTAACTTTTAAACGAGAAGTTTGCCTTGT TTAAACGACCTGTTCGCGTACGAGAAACGTAATTTTAACGTAATTTCGTGAAAATTGTTC CGAATATCGTGAGATTTTTCAGTAAAAAAAGTCGATAATTCGAGGCG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)