These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_139#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 925 fasta sequence [ATTGTTGAAGGTCGAAAGAATATTTTCAAAATTTGTTTCAGATTTGCAAGTAACTTGCAAATTTATTACTATTAATAGTTTACTTGTATCAATATACTCTAAGGCCATGGGTCGTAAATTTTTTGTTGGTGGTAATTGGAAAATGAATGGTACCAAAAGTGAAATAAATGATA-TTGTTGGC-TTTTTAAAAAAAGGTCCACTTGATTCAAATGTTGAGGTTGTTGTTGGTGTACCATCTATATATTTAACATATGCCAAGAATATATTACCCAATAATATTAGTATTGCTGGACAAAATACATATAAGGTTGCAAAAGGAGCATTTACTGGAGAAATAAGTCCTGCTATGCTTTTGGACAATGGAATCCCATGGGTAATTCTTGGTCATTCCGAACGTAGAAATATTTTTGGTGAAAATGATGAATTAATAGCAGAAAAAGTAGCCCATGCTTTAGAAAGTGGACTAAAGGTAATTGCATGTATTGGAGAAAAATTAGAAGAAAGAGAAGCTGGTAAAACAGATGAAGTAGTTTTTAGACAGACAAAAGCTATTGCAAATAAAATCAATTCATGGGATAATGTAGTTGTTGCTTATGAACCAGTTTGGGCAATTGGAACGGGTAAAACAGCCACACCACAACAAGCTCAAGANNTTCATGAAAAATTAAGAAATTGGTTTTCTAAAAATGTTAATCAAACTGTCGCAGAAACTGTTAGAATTATTTATGGAGGTTCAGTAACAGCAGGAAATGCAAAAGATTTAGCAAAAGAGAAAGATATTGATGGATTTTTAGTTGGTGGAGCATCTCTAAAACCTGATTTTGTACAGATCGTTAACGCTAAGCAGTGAGATGAAATATTCTTTATATAAGAATATTATTCCTTAAATTAATATACACTCTAGAATGTGTATATTATAATAAGT] [+] EMBL BI511970 [ATTGTTGAAGGTCGAAAGAATATTTTCAAAATTTGTTTCAGATTTGCAAGTAACTTGCAAATTTATTACTATTAATAGTTTACTTGTATCAATATACTCTAAGGCCATGGGTCGTAAATTTTTTGTTGGTGGTAATTGGAAAATGAATGGTACCAAAAGTGAAATAAATGATA TTGTTGGC TTTTTAAAAAAAGGTCCACTTGATTCAAATGTTGAGGTTGTTGTTGGTGTACCATCTATATATTTAACATATGCCAAGAATATATTACCCAATAATATTAGTATTGCTGGACAAAATACATATAAGGTTGCAAAAGGAGCATTTACTGGAGAAATAAGTCCTGCTATGCTTTTGGACAATGGAATCCCATGGGTAATTCTTGGTCATTCCGAACGTAGAAATATTTTTGGTGAAAATGATGAATTAATAGCAGAAAA ] [+] EMBL BI509972 [ AATATACTCTAAGGCCATGGGTCGTAAATTTTTTGTTGGTGGTAATTGGAAAATGAATGGTACCAAAAGTGAAATAAATGATANNNGTTGGCNTTTTTAAAAAAAGGTCCACTTGATTCAAATGTTGAGGTTGTTGTTGGTGTACCATCTATATATTTAACATATGCCAAGAATATATTACCCAATAATATTAGTATTGCTGGACAAAATACATATAAGGTTGCAAAAGGAGCATTTACTGGAGAAATAAGTCCTGCTATGCTTTTGGACAATGGAATCCCATGGGTAATTCTTGGTCATTCCGAACGTAGAAATATTTTTGGTGAAAATGATGAATTAATAGCAGAAAAAGTAGCCCATGCTTTAGAAAGTGGACTAAAGGTAATTGCATGTATTGGAGAAAAATTAGAAGAAAGAGAAGCTGGTAAAACAGATGAAGTAGTTTTTAGACAGACAAAAGCTATTGCAAATAAAATCAATTCATGGGATAATGTAGTTGTTGCTTATGAACCAGTTTGGGCAATTGGAACGGGTAAAACAGCCACAC ] [+] EMBL BI509036 [ TTTGTTGGTGGTAATTGGAAAATGAATGGTACCAAAAGTGAAATAAATGATA TTGTTGGC TTTTTAAAAAAAGGTCCACTTGATTCAAATGTTGAGGTTGTTGTTGGTGTACCATCTATATATTTAACATATGCCAAGAATATATTACCCAATAATATTAGTATTGCTGGACAAAATACATATAAGGTTGCAAAAGGAGCATTTACTGGAGAAATAAGTCCTGCTATGCTTTTGGACAATGGAATCCCATGGGTAATTCTTGGTCATTCCGAACGTAGAAATATTTTTGGTGAAAATGATGAATTAATAGCAGAAAAAGTAGCCCATGCTTTAGAAAGTGGACTAAAGGTAATTGCATGTATTGGAGAAAAATTAGAAGAAAGAGAAGCTGGTAAAACAGATGAAGTAGTTTTTAGACAGACAAAAGCTATTGCAAATAAAATCAATTCATGGGATAATGTAGTTGTTGCTTATGAACCAGTTTGGGCAATTGGAACGGGTAAAACAGCCACACCACAACAAGCTCAAGANNTTCATGAAAAATTAAGAAATTGGTTTTCTAAAAATGT ] [+] EMBL BI511723 [ TTGGAAAATGAATGGTACCAAAAGTGAAATAAATGATA TTGTTGGC TTTTTAAAAAAAGGTCCACTTGATTCAAATGTTGAGGTTGTTGTTGGTGTACCATCTATATATTTAACATATGCCAAGAATATATTACCCAATAATATTAGTATTGCTGGACAAAATACATATAAGGTTGCAAAAGGAGCATTTACTGGAGAAATAAGTCCTGCTATGCTTTTGGACAATGGAATCCCATGGGTAATTCTTGGTCATTCCGAACGTAGAAATATTTTTGGTGAAAATGATGAATTAATAGCAGAAAAAGTAGCCCATGCTTTNNNAAGTGGACTAAAGGTAATTGCATGTATTGGAGAAAAATTATAAGAAAGAGAAGCTGGTAAAACAGATGAAGTAGTTTTTNNNCAGACAAAAGCTATTGCAAATAAAATCAATTCATGGGATAATGTNGTTGTTGCTTATGAACCAGTTTGGGCAATTGGAACGGGTAAAACAGCC ] [+] EMBL BI517266 [ ACCAAAAGTGAAATAAATGATA TTGTTGGC TTTTTAAAAAAAGGTCCACTTGATTCAAATGTTGAGGTTGTTGTTGGTGTACCATCTATATATTTAACATATGCCAAGAATATATTACCCAATAATATTAGTATTGCTGGACAAAATACATATAAGGTTGCAAAAGGAGCATTTACTGGAGAAATAAGTCCTGCTATGCTTTTGGACAATGGAATCCCATGGGTAATTCTTGGTCATTCTGAACGTAGAAATATTTTTGGTGAAAATGATGAATTAATAGCAGAAAAAGTAGCCCATGCTTTAGAAAGTGGACTAAAGGTAATTGCATGTATTGGAGAAAAATTNNNAGAAAGAGAAGCTGGTAAAACAGATGAAGTAGTTTTTAGACAGACAAAAGCTATTGCAAATA ] [+] EMBL BI516689 [ CTTGATTCAAATGTTGAGGTTGTTGTTGGTGTACCATCTATATATTTAACATATGCCAAGAATATATTACCCAATAATATTAGTATTGCTGGACAAAATACATATAAGGTTGCAAAAGGAGCATTTACTGGAGAAATAAGTCCTGCTATGCTTTTGGACAATGGAATCCCATGGGTAATTCTTGGTCATTCCGAACGTAGAAATATTTTTGGTGAAAATGATGAATTAATAGCAGAAAAAGTAGCCCATGCTTTNGAAAGTGGACTAAAGGTAATTGCATGTATTGGAGAAAAATTAGAAGAAAGAGAAGCTGGTAAAACAGATGAAGTAGTTTTTAGACAGACAAAAGCTATTGCAAATAAAATCAATTCATGGGATAATGTAGT ] [+] EMBL BI511024 [ TTTTGGTGAAAATGATGAATTAATAGCAGAAAAAGTAGCCCATGCTTTAGAAAGTGGACTAAAGGTAATTGCATGTATTGGAGAAAAATTAGAAGAAAGAGAAGCTGGTAAAACAGATGAAGTAGTTTTTAGACAGACAAAAGCTATTGCAAATAAAATCAATTCATGGGATAATGTAGTTGTTGCTTATGAACCAGTTTGGGCAATTGGAACGGGTAAAACAGCCACACCACAACAAGCTCAAGAGGTTCATGAAAAATTAAGAAATTGGTTTTCTAAAAATGTTAATCAAACTGTCGCAGAAACTGTTAGAATTATTTATGGAGGTTCAGTAACAGCAGGAAATGCAAAAGATTTAGCAAAAGAGAAAGATATTGATGGATTTTTAGTTGGTGGAGCATCTCTAAAACCTGATTTTGTACAGATCGTTAACGCTAAGCAGTGAGATGAAATATTCTTTATATAAGAATATTATTCCTTAAATTAATATACACTCTAGAATGTGTATATTATAATAAGT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |