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Apis mellifera
cluster # 1680 cluster # 1680       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1680#0 length = 1005 sequences # 2  

consensusID : consensus_1680#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1005
fasta sequence
                              [AGTAAATGATTTAAAGAGTGCAATTGCTGCAATGATATTTAAATTAGAACATGAATATGAAACATTGAATTGGCCTAATTTTCTTGATAATTTTGCTCTTATTTCGGGACATTTGACTAGTCTTTCAAAAATTCTTGGACATGATAAGGCACCAAATTTAAGAAACTTAACAGTTTTACCATTAAGATTAAGTCCAGAGAAAGATGAAGAATTGCTTCGTTTAACTGAAGGTAGAATTCCCACATTTGCTCATGATTTAGTACCAGATTATCTACGAACTAAAGTAGAACCTCAAGCTGAACAAAAAATGATGCAGCTTGAAGCAAAAGCTGCAAATTTAAATTATGAAACATCACATAAACAAGTGGCTCAATACACAAAAGTTATTAATCATGTATGGGATATAGCAAATAAGGCACGTGAAGAATGGGAAAGTGAAGCTGGTTCTAGAGCAACTCAAGCTCAAACCAGCAGTACAGCAGATACTCATGCTCTTGTAGCCGCTGTGGGTATGGGTAAAGNNNTAAAGTCCGATTCTGTTCAAATGGTACAATCAGGTGTAAATTCAGTACCTAGTGGAATGATAGTAGGANGNCCTGGAAATCAGCAACAAACTCCAGGACAATCATTAGGAAATCCACCTATGGGACAAATGACTAAAGCTCCAAGTACAATCAAAACCAATATCAAGGCAGCACCACAAATTCATCCATATAGATAAAAATATTAACTTTAATATAATATTTTTCAAATTGAAAATTATTTTCATTTTAATTTATTATTTTTTAATATATAGCAAGTAACATTAAAATAATTTGTTCTTTTTATTTTTAAATAAAATATTTACATATATATAATTATATATATTGTAATTAAAATCATATTTTTAATATCAGTATTACATTGTAAAATATAAAATATAAAATCATACAAATTACGGCTATACTTTATAATAATGTACATTAAAAATATAAATATAATATTGATTATATTTTAAATAAATTC]

[+] EMBL BI505414             [AGTAAATGATTTAAAGAGTGCAATTGCTGCAATGATATTTAAATTAGAACATGAATATGAAACATTGAATTGGCCTAATTTTCTTGATAATTTTGCTCTTATTTCGGGACATTTGACTAGTCTTTCAAAAATTCTTGGACATGATAAGGCACCAAATTTAAGAAACTTAACAGTTTTACCATTAAGATTAAGTCCAGAGAAAGATGAAGAATTGCTTCGTTTAACTGAAGGTAGAATTCCCACATTTGCTCATGATTTAGTACCAGATTATCTACGAACTAAAGTAGAACCTCAAGCTGAACAAAAAATGATGCAGCTTGAAGCAAAAGCTGCAAATTTAAATTATGAAACATCACATAAACAAGTGGCTCAATACACAAAAGTTATTAATCATGTATGGGATATAGCAAATAAGGCACGTGAAGAATGGGAAAGTGAAGCTGGTTCTAGAGCAACTCAAGCTCAAACCAGCAGTACAGCAGATACTCATGCTCTTGTAGCCGCTGTGGGTATGGGTAAAGNNNTAAAGTCCGATTCTGTTCAAATGGTACAATCAGGTGTAAATTCAGTACCTAGTGGAATGATAGTAGGANGNCCTGGAAATCAGCAACAAACTCCAGGACAATCATTAGGAAATCCACCTATGGGACAAATGACTAAAGCTCCAAGTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BI508357             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTGTAGCCGCTGTGGGTATGGGTAAAGGTTTAAAGTCCGATTCTGTTCAAATGGTACAATCAGGTGTAAATTCAGTACCTAGTGGAATGATAGTAGGAAGACCTGGAAATCAGCAACAAACTCCAGGACAATCATTAGGAAATCCACCTATGGGACAAATGACTAAAGCTCCAAGTACAATCAAAACCAATATCAAGGCAGCACCACAAATTCATCCATATAGATAAAAATATTAACTTTAATATAATATTTTTCAAATTGAAAATTATTTTCATTTTAATTTATTATTTTTTAATATATAGCAAGTAACATTAAAATAATTTGTTCTTTTTATTTTTAAATAAAATATTTACATATATATAATTATATATATTGTAATTAAAATCATATTTTTAATATCAGTATTACATTGTAAAATATAAAATATAAAATCATACAAATTACGGCTATACTTTATAATAATGTACATTAAAAATATAAATATAATATTGATTATATTTTAAATAAATTC]


>consensus_1680#0 AGTAAATGATTTAAAGAGTGCAATTGCTGCAATGATATTTAAATTAGAACATGAATATGA AACATTGAATTGGCCTAATTTTCTTGATAATTTTGCTCTTATTTCGGGACATTTGACTAG TCTTTCAAAAATTCTTGGACATGATAAGGCACCAAATTTAAGAAACTTAACAGTTTTACC ATTAAGATTAAGTCCAGAGAAAGATGAAGAATTGCTTCGTTTAACTGAAGGTAGAATTCC CACATTTGCTCATGATTTAGTACCAGATTATCTACGAACTAAAGTAGAACCTCAAGCTGA ACAAAAAATGATGCAGCTTGAAGCAAAAGCTGCAAATTTAAATTATGAAACATCACATAA ACAAGTGGCTCAATACACAAAAGTTATTAATCATGTATGGGATATAGCAAATAAGGCACG TGAAGAATGGGAAAGTGAAGCTGGTTCTAGAGCAACTCAAGCTCAAACCAGCAGTACAGC AGATACTCATGCTCTTGTAGCCGCTGTGGGTATGGGTAAAGNNNTAAAGTCCGATTCTGT TCAAATGGTACAATCAGGTGTAAATTCAGTACCTAGTGGAATGATAGTAGGANGNCCTGG AAATCAGCAACAAACTCCAGGACAATCATTAGGAAATCCACCTATGGGACAAATGACTAA AGCTCCAAGTACAATCAAAACCAATATCAAGGCAGCACCACAAATTCATCCATATAGATA AAAATATTAACTTTAATATAATATTTTTCAAATTGAAAATTATTTTCATTTTAATTTATT ATTTTTTAATATATAGCAAGTAACATTAAAATAATTTGTTCTTTTTATTTTTAAATAAAA TATTTACATATATATAATTATATATATTGTAATTAAAATCATATTTTTAATATCAGTATT ACATTGTAAAATATAAAATATAAAATCATACAAATTACGGCTATACTTTATAATAATGTA CATTAAAAATATAAATATAATATTGATTATATTTTAAATAAATTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)