These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_178#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1054 fasta sequence [TTCCTTTAATACTAGGATCACCTGATATAGCATTCCCCCGAATAAATAATATTAGATTTTGATTACTTCCTCCCTCATTATTTATACTTTTATTAAGAAATTT--ATCTTATCCAAGACCAGGAACTGGATGAACAGTATATCCACCATTATCAGCATATT-TATATCA-TTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAATTTTTTCTCTTCATATATCAGGAATTTCCTCAATTATAGGATCATTAAACTT-AATAGTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCTATAAATTATGACC-AAATTTCATTATTTCCATGATCAGTTTTTATTACAGCAATTTTATTAATTATATCATTACCTGTATTAGCTGGAGCAATTACTATACTATTATTTGATCGAAATTTTAATACATCATTTTTCGATCCTATAGGAGGTGGAGATCCAATTCTTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGTCAT-CCAGAAGTTTATATTTTAATTTTACCT-GGATTTGGATTAATCTCTCATATTGTAATAAATGAAAGAGGAAAAAAAGAAATTTTTGGTAATTTAAGAATAATTTATGCAATATTAGGAATTGGATTTCTAGGTTTTATTGTTTGAGCACATCACATATTTACAGTCGGATTAGATGTTGATACTCGAGCATATTTTACTTCAGCAACAATAATCATTGCTGTACCAACAGGAATTAAAGTTTTTAGATGATTAGCAACTTATCATGGTTCAAAATTAAAATTAAATATTTCAATTTTATGATCACTAGGTTTTATTATACTATTTACTATTGGTGGATTAACAGGAATTATATTATCAAATTCTTCTATTGATATTATTCTTCATGATACATATTACGTTGTTGGACATTTTCATTATGTTCTTTCAATA-GGTGCAGTATTTGCAATTATTTCAAGATTTATTCATTGATATCCATTAATTACTGGATTATTATTAAATATTAAAT-GATTAAAAATTCAATTTATTATAAT-ATTTATTGGAGTAAATCTAACTTTCTTTCCTCAACATTTTTTAGGACTAAT] [+] EMBL BE844451 [TTCCTTTAATACTAGGATCACCTGATATAGCATTCCCCCGAATAAATAATATTAGATTTTGATTACTTCCTCCCTCATTATTTATACTTTTATTAAGAAATTT ATTTTATCCAAGACCAGGAACTGGATGAACAGTATATCCACCATTATCAGCATATT TATATCA TTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAATTTTTTCTCTTCATATATCAGGAATTTCCTCAATTATAGGATCATTAAACTT AATAGTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCTATAAATTATGACC AAATTTCATTATTTCCATGATCAGTTTTTATTACAGCAATTTTATTAATTATATCATTACCTGTATTAGCTGGAGCAATTACTATACTATTATTTGATCGAAATTTTAATACATCATTTTTCGATCCTATAGGAGGTGGAGATCCAATTCTTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGTCATCCCAGAAGTTTATATTTTAATTTTACCTGGGATTTGGATTAATCTCTCATATTGTAATAAATGAAAGAGGAAAAAAAGAAATTTTTGGTAATTTAAGAATAA ] [-] EMBL BE844453 [ ATTAAGAAATTTTATTCTTATCCAAGACCAGGAACTGGATGAACAGTATATCCACCATTATCAGCATATTCTATATCATTTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAATTTTTTCTCTTCATATATCAGGAATTTCCTCAATTATAGGATCATTAAACTTAAATAGTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCTATAAATTATGACCAAAATTTCATTATTTCCATGATCAGTTTTTATTACAGCAATTTTATTAATTATATCATTACCTGTATTAGCTGGAGCAATTACTATACTATTATTTGATCGAAATTTTAATACATCATTTTTCGATCCTATAGGAGGTGGAGATCCAATTCTTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGTCAT CCAGAAGTTTATATTTTAATTTTACCT GGATTTGGATTAATCTCTCATATTGTAATAAATGAAAGAGGAAAAAAAGAAATTTTTGGTAATTTAAGAATAATTTATGCAATATTAGGAATTGGATTTCTAGGTTTTATTGTTTGAGCACATCACATATTTACAGTCGGATTAGATGTTGATACT ] [-] EMBL BE844371 [ ATGATCAGTTTTTATTACAGCAATTTTATTAATTATATCATTACCTGTATTAGCTGGAGCAATTACTATACTATTATTTGATCGAAATTTTAATACATCATTTTTCGATCCTATAGGAGGTGGAGATCCAATTCTTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGTCAT CCAGAAGTTTATATTTTAATTTTACCT GGATTTGGATTAATCTCTCATATTGTAATAAATGAAAGAGGAAAAAAAGAAATTTTTGGTAATTTAAGAATAATTTATGCAATATTAGGAATTGGATTTCTAGGTTTTATTGTTTGAGCACATCACATATTTACAGTCGGATTAGATGTTGATACTCGAGCATATTTTACTTCAGCAACAATAATCATTGCTGTACCAACAGGAATTAAAGTTTTTAGATGATTAGCAACTTATCATGGTTCAAAATTAAAATTAAATATTTCAATTTTATGATCACTAGGTTTTATTATACTATTTACTATTGGTGGATTAACAGGAATTATATTATCAAATTCTTCTATTGATATTATTCTTCATGATACATATTACGTTGTTGGACATTTTCATTATGTTCTTTCAATA GGTGCAGTATTTGCAATTATTTCAAGATTTATTCATTGATATCCATTAATTACTGGATTATTATTAAATATTAAAT GATTAAAAATTCAATTTATTATAAT ATTTATTGGAGTAAATCTAACTTTCTTTCC ] [+] EMBL BI946525 [ AGGAGGTGGAGATCCAATTCTTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGTCAT CCAGAAGTTTATATTTTAATTTTACCT GGATTTGGATTAATCTCTCATATTGTAATAAATGAAAGAGGAAAAAAAGAAATTTTTGGTAATTTAAGAATAATTTATGCAATATTAGGAATTGGATTTCTAGGTTTTATTGTTTGAGCACATCACATATTTACAGTCGGATTAGATGTTGATACTCGAGCATATTTTACTTCAGCAACAATAATCATTGCTGTACCAACAGGAATTAAAGTTTTTAGATGATTAGCAACTTATCATGGTTCAAAATTAAAATTAAATATTTCAATTTTATGATCACTAGGTTTTATTATACTATTTACTATTGGTGGATTAACAGGAATTATATTATCAAATTCTTCTATTGATATTATTCTTCATGATACATATTACGTTGGTGGACATTTTCATTATGGTCTTTCAATAGGGTGCAGTATTTGCAATTATTTCAAGATTTATTCATTGATATCCATTAATTACTGGATTATTATTAAATATTAAATGGATTAAAAATTCAATTTATTATAATAATTTAATTGAGTAAATCTAAC TTCTTTCt ] [+] EMBL BE844357 [ AAATGAAAGAGGAAAAAAAGAAATTTTTGGTAATTTAAGAATAATTTATGCAATATTAGGAATTGGATTTCTAGGTTTTATTGTTTGAGCACATCACATATTTACAGTCGGATTAGATGTTGATACTCGAGCATATTTTACTTCAGCAACAATAATCATTGCTGTACCAACAGGAATTAAAGTTTTTAGATGATTAGCAACTTATCATGGTTCAAAATTAAAATTAAATATTTCAATTTTATGATCACTAGGTTTTATTATACTATTTACTATTGGTGGATTAACAGGAATTATATTATCAAATTCTTCTATTGATATTATTCTTCATGATACATATTACGTTGTTGGACATTTTCATTATGTTCTTTCAATA GGTGCAGTATTTGCAATTATTTCAAGATTTATTCATTGATATCCATTAATTACTGGATTATTATTAAATATTAAAT GATTAAAAATTCAATTTATTATAAT ATTTATTGGAGTAAATCTAACTTTCTT ] [-] EMBL BE844455 [ CACATCACATATTTACAGTCGGATTAGATGTTGATACTCGAGCATATTTTACTTCAGCAACAATAATCATTGCTGTACCAACAGGAATTAAAGTTTTTAGATGATTAGCAACTTATCATGGTTCAAAATTAAAATTAAATATTTCAATTTTATGATCACTAGGTTTTATTATACTATTTACTATTGGTGGATTAACAGGAATTATATTATCAAATTCTTCTATTGATATTATTCTTCATGATACATATTACGTTGTTGGACATTTTCATTATGTTCTTTCAATA GGTGCAGTATTTGCAATTATTTCAAGATTTATTCATTGATATCCATTAATTACTGGATTATTATTAAATATTAAAT GATTAAAAATTCAATTTATTATAAT ATTTATTGGAGTAAATCTAACTTTCTTTCCTCAACATTTTTTAGGACTAAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |