Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 1843 cluster # 1843       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1843#0 length = 705 sequences # 2  

consensusID : consensus_1843#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 705
fasta sequence
                              [TCTTATTTATTAGCATTAAAAGAATTTTTTTACATAATTAGATATGATATAATATATATACACATTATGTTAAAAAACTTCGAGTTTACAAAGAAACTGAAATTAATGAACATGATATATGTGGCCTTAAGATTCATTTTTATAACTAATAAAGTAAAAGAATCAAAATGCCAAGTTTCTATAGTAGTAAGTATTTATGAATTAACAATTGGGTGATTCAAAAATACTATTCTTCGCAATTATTCATATTATTTTCGTATAAATTTAATTACAAAGATTTTCTTAATATATAATCAGTAGATCTATTATGTATC-ATATATATATATATATATATATAATTAGTAGATCTATTCCTGTAACTTAAACATATTATTGTTAATTTAAACTATCAAATGCAAAGATAATTGTATAAAAGAGTATAAGTTAGTGTTAATAGTATTATTAGTTATCATTAATAACTAAAATTTTTTGAAACATTTTACATTTGATGTTTAATACACTCTCTAACATTTATCTTTAACTTTTGATTTCTAGCTATTTATTGCACATTTATATAAAATCAATGAATATTTATATTTCACAGCAATATTTCCAAAAAAAAAGATGGAATATTTTAATGATGAAACATATTTTTAGTATATNNTTTCTATACTATATTTTTATATACTATATTTTTTAATTTCAAAAAATTCATTCTTTTTTTTA]

[+] EMBL BI510536             [TCTTATTTATTAGCATTAAAAGAATTTTTTTACATAATTAGATATGATATAATATATATACACATTATGTTAAAAAACTTCGAGTTTACAAAGAAACTGAAATTAATGAACATGATATATGTGGCCTTAAGATTCATTTTTATAACTAATAAAGTAAAAGAATCAAAATGCCAAGTTTCTATAGTAGTAAGTATTTATGAATTAACAATTGGGTGATTCAAAAATACTATTCTTCGCAATTATTCATATTATTTTCGTATAAATTTAATTACAAAGATTTTCTTAATATATAATCAGTAGATCTATTATGTATCTATATATATATATATATATATATAATTAGTAGATCTATTCCTGTAACTTAAACATATTATTGTTAATTTAAACTATCAAATGCAAAGATAATTGTATAAAAGAGTATAAGTTAGTGTTAATAGTATTATTAGTTATCATTAATAACTAAAATTTTTTGAAACATTTTACATTTGATGTTTAATACACTCTCTAACATTTATCTTTAACTTTTGATTTCTAGCTATTTATTGCACATTTATATAAAATCAATGAATATTTATATTTCACAGCAATATTTCCAAAAAAAAAGATGGAATATTTTAATGATGAAACATATTTTTAGTATATGTTTTCTATACTATATTTT                                             ]
[+] EMBL BI517106             [                                                                                                                                                     TAAAGTAAAAGAATCAAAATGCCAAGTTTCTATAGTAGTAAGTATTTATGAATTAACAATTGGGTGATTCAAAAATACTATTCTTCGCAATTATTCATATTATTTTCGTATAAATTTAATTACAAAGATTTTCTTAATATATAATCAGTAGATCTATTATGTATC  TATATATATATATATATATATAATTAGTAGATCTATTCCTGTAACTTAAACATATTATTGTTAATTTAAACTATCAAATGCAAAGATAATTGTATAAAAGAGTATAAGTTAGTGTTAATAGTATTATTAGTTATCATTAATAACTAAAATTTTTTGAAACATTTTACATTTGATGTTTAATACACTCTCTAACATTTATCTTTAACTTTTGATTTCTAGCTATTTATTGCACATTTATATAAAATCAATGAATATTTATATTTCACAGCAATATTTCC AAAAAAAAGATGGAATATTTTAATGATGAAACATATTTTTAGTATATNNTTTCTATACTATATTTTTATATACTATATTTTTTAATTTCAAAAAATTCATTCTTTTTTTTA]


>consensus_1843#0 TCTTATTTATTAGCATTAAAAGAATTTTTTTACATAATTAGATATGATATAATATATATA CACATTATGTTAAAAAACTTCGAGTTTACAAAGAAACTGAAATTAATGAACATGATATAT GTGGCCTTAAGATTCATTTTTATAACTAATAAAGTAAAAGAATCAAAATGCCAAGTTTCT ATAGTAGTAAGTATTTATGAATTAACAATTGGGTGATTCAAAAATACTATTCTTCGCAAT TATTCATATTATTTTCGTATAAATTTAATTACAAAGATTTTCTTAATATATAATCAGTAG ATCTATTATGTATCATATATATATATATATATATATAATTAGTAGATCTATTCCTGTAAC TTAAACATATTATTGTTAATTTAAACTATCAAATGCAAAGATAATTGTATAAAAGAGTAT AAGTTAGTGTTAATAGTATTATTAGTTATCATTAATAACTAAAATTTTTTGAAACATTTT ACATTTGATGTTTAATACACTCTCTAACATTTATCTTTAACTTTTGATTTCTAGCTATTT ATTGCACATTTATATAAAATCAATGAATATTTATATTTCACAGCAATATTTCCAAAAAAA AAGATGGAATATTTTAATGATGAAACATATTTTTAGTATATNNTTTCTATACTATATTTT TATATACTATATTTTTTAATTTCAAAAAATTCATTCTTTTTTTTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)