Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 1895 cluster # 1895       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1895#0 length = 667 sequences # 2  

consensusID : consensus_1895#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 667
fasta sequence
                              [AGATTTATTCAAAGTGTATAACAAGTGTATCTCCCTGTGTAAATTTGTATCGAAGATCGTATTGTTCTCGTTGTATCGCAGAAAAATTTGTGTGTAATTGAAGATGTCTATATGGATGTACGTATGTGTATGTGTGTATGTTTGTATGTATGTGTATAGAACAATTGTACGGATTAGAAAGTGATACAATTAAAAAGAACGTTCGTTAAAATCTAAAATTTGAATCGTTTTGGGCCACTCTATTCGTCCGCTTCCAAATACGGAACCAGTTAATATGTTTTATCACTAAATACAGACTGAACGAGAAACATTATCTCAAAATGATGAACGATCATTTATGCGCGAACAACTATTGCTGTTGGGTAAAGCGCAAACAGACTGAACTTTCTACGTGAACATTAGTGAACCATGTTGCGTTCAAGCCCGCGTACTATATTTCCTAATAGTTGTATAATCATTCTCGTACAACATGGTCCATTAATTGCAAAACGGCTTAAATACGCTTGATTATGTCGAATTTGCTCGCAGTGGCGTCTTTGTTAAATTATTACTCGATATTGCTGTTATTCTCTACGAAATATCGTATGATCTAATTCCGCGAATTACTTTAAACTTTTGTTTAACGCGAGGTGATCGAAGTTGATAAAACGATATTTAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL BI513449             [AGATTTATTCAAAGTGTATAACAAGTGTATCTCCCTGTGTAAATTTGTATCGAAGATCGTATTGTTCTCGTTGTATCGCAGAAAAATTTGTGTGTAATTGAAGATGTCTATATGGATGTACGTATGTGTATGTGTGTATGTTTGTATGTATGTGTATAGAACAATTGTACGGATTAGAAAGTGATACAATTAAAAAGAACGTTCGTTAAAATCTAAAATTTGAATCGTTTTGGGCCACTCTATTCGTCCGCTTCCAAATACGGAACCAGTTAATATGTTTTATCACTAAATACAGACTGAACGAGAAACATTATCTCAAAATGATGAACGATCATTTATGCGCGAACAACTATTGCTGTTGGGTAAAGCGCAAACAGACTGAACTTTCTACGTGAACATTAGTGAACCATGTTGCGTTCAAGCCCGCGTACTATATTTCCTAATAGTTGTATAATCATTCTCGTACAACATGGTCCATTAATTGCAAAACGGCTTAAATACGCTTGATTATGTCGAATTTGCTCGCAGTGGCGTCTTTGTTAAAT                                                                                                                          ]
[+] EMBL BI504714             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACTATTGCTGTTGGGTAAAGCGCAAACAGACTGAACTTTCTACGTGAACATTAGTGAACCATGTTGCGTTCAAGCCCGCGTACTATATTTCCTAATAGTTGTATAATCATTCTCGTACAACATGGTCCATTAATTGCAAAACGGCTTAAATACGCTTGATTATGTCGAATTTGCTCGCAGTGGCGTCTTTGTTAAATTATTACTCGATATTGCTGTTATTCTCTACGAAATATCGTATGATCTAATTCCGCGAATTACTTTAAACTTTTGTTTAACGCGAGGTGATCGAAGTTGATAAAACGATATTTAAAAAAAAAAA]


>consensus_1895#0 AGATTTATTCAAAGTGTATAACAAGTGTATCTCCCTGTGTAAATTTGTATCGAAGATCGT ATTGTTCTCGTTGTATCGCAGAAAAATTTGTGTGTAATTGAAGATGTCTATATGGATGTA CGTATGTGTATGTGTGTATGTTTGTATGTATGTGTATAGAACAATTGTACGGATTAGAAA GTGATACAATTAAAAAGAACGTTCGTTAAAATCTAAAATTTGAATCGTTTTGGGCCACTC TATTCGTCCGCTTCCAAATACGGAACCAGTTAATATGTTTTATCACTAAATACAGACTGA ACGAGAAACATTATCTCAAAATGATGAACGATCATTTATGCGCGAACAACTATTGCTGTT GGGTAAAGCGCAAACAGACTGAACTTTCTACGTGAACATTAGTGAACCATGTTGCGTTCA AGCCCGCGTACTATATTTCCTAATAGTTGTATAATCATTCTCGTACAACATGGTCCATTA ATTGCAAAACGGCTTAAATACGCTTGATTATGTCGAATTTGCTCGCAGTGGCGTCTTTGT TAAATTATTACTCGATATTGCTGTTATTCTCTACGAAATATCGTATGATCTAATTCCGCG AATTACTTTAAACTTTTGTTTAACGCGAGGTGATCGAAGTTGATAAAACGATATTTAAAA AAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)