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Apis mellifera
cluster # 2040 cluster # 2040       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2040#0 length = 580 sequences # 2  
consensusID : consensus_2040#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 580
fasta sequence 
                              [TGTCGTTCCTCGTTGTGCACAGATAACAGAATTGTGATGCGCCCACGTCTGGATTCGATCCTCGGGGTCGCGGAACCGATTCGGCGTTCTCGAAGCGACAGCTAAAAAAAAAAAAAGGCCAGATTTCATTGCACCACAAACTCTATGTAATTGTATAAAATATCAACGGTATCAAAAAGTGTCAATATCTCGTGTTTCTTCGATGGTACTTAAGGTAAAATATCCGCGGCCCGCTTGGGCGATCGGATCTGTTTGTTGATAAATACACTTCCTGTGAACATACAAGGGGTTGAAAGCTGTGGGAAAAAGAGTGCTCGGAAAAAAATAAAATAAATCTCGAAAGATAATATAATTCTTCGAAATCGNNGGAATTCGTCTTCTATCATTTCAAATGATCGTAATTGTTCAATTGATAATTGCTAATTTTCGAGGAGTCCTTTGAAGGAAGGGTTGTGGGGGTTGTTAAAGATTTCGTTTNNNCACGTTTTTTTTAACAATTCTTTCGACCTGTGGGACGATTCTTTGGGAAATTGAATTTGAAATTTTACGGGAGCAAAATTCTTAAAATTAAATCTTAGTC]

[+] EMBL BI511702             [TGTCGTTCCTCGTTGTGCACAGATAACAGAATTGTGATGCGCCCACGTCTGGATTCGATCCTCGGGGTCGCGGAACCGATTCGGCGTTCTCGAAGCGACAGCT AAAAAAAAAAAAGGCCAGATTTCATTGCACCACAAACTCTATGTAATTGTATAAAATATCAACGGTATCAAAAAGTGTCAATATCTCGTGTTTCTTCGATGGTACTTAAGGTAAAATATCCGCGGCCCGCTTGGGCGATCGGATCTGTTTGTTGATAAATACACTTCCTGTGAACATACAAGGGGTTGAAAGCTGTGGGAAAAAGAGTGCTCGGAAAAAAATAAAATAAATCTCGAAAGATAATATAATTCTTCGAAATCGGTGGAATTCGTCTTCTATCATTTCAAATGATCGTAATTGTTCAATTGATAATTGCTAATTTTCGAGGAGTCCTTTGAAGGAAGGGTTGTGGGGGTTG                                                                                                                      ]
[+] EMBL BI512059             [                                         CCCACGTCTGGATTCGATCCTCGGGGTCGCGGAACCGATTCGGCGTTCTCGAAGCGACAGCTAAAAAAAAAAAAAGGCCAGATTTCATTGCACCACAAACTCTATGTAATTGTATAAAATATCAACGGTATCAAAAAGTGTCAATATCTCGTGTTTCTTCGATGGTACTTAAGGTAAAATATCCGCGGCCCGCTTGGGCGATCGGATCTGTTTGTTGATAAATACACTTCCTGTGAACATACAAGGGGTTGAAAGCTGTGGGAAAAAGAGTGCTCGGAAAAAAATAAAATAAATCTCGAAAGATAATATAATTCTTCGAAATCGNNGGAATTCGTCTTCTATCATTTCAAATGATCGTAATTGTTCAATTGATAATTGCTAATTTTCGAGGAGTCCTTTGAAGGAAGGGTTGTGGGGGTTGTTAAAGATTTCGTTTNNNCACGTTTTTTTTAACAATTCTTTCGACCTGTGGGACGATTCTTTGGGAAATTGAATTTGAAATTTTACGGGAGCAAAATTCTTAAAATTAAATCTTAGTC]




>consensus_2040#0
TGTCGTTCCTCGTTGTGCACAGATAACAGAATTGTGATGCGCCCACGTCTGGATTCGATC
CTCGGGGTCGCGGAACCGATTCGGCGTTCTCGAAGCGACAGCTAAAAAAAAAAAAAGGCC
AGATTTCATTGCACCACAAACTCTATGTAATTGTATAAAATATCAACGGTATCAAAAAGT
GTCAATATCTCGTGTTTCTTCGATGGTACTTAAGGTAAAATATCCGCGGCCCGCTTGGGC
GATCGGATCTGTTTGTTGATAAATACACTTCCTGTGAACATACAAGGGGTTGAAAGCTGT
GGGAAAAAGAGTGCTCGGAAAAAAATAAAATAAATCTCGAAAGATAATATAATTCTTCGA
AATCGNNGGAATTCGTCTTCTATCATTTCAAATGATCGTAATTGTTCAATTGATAATTGC
TAATTTTCGAGGAGTCCTTTGAAGGAAGGGTTGTGGGGGTTGTTAAAGATTTCGTTTNNN
CACGTTTTTTTTAACAATTCTTTCGACCTGTGGGACGATTCTTTGGGAAATTGAATTTGA
AATTTTACGGGAGCAAAATTCTTAAAATTAAATCTTAGTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)