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Apis mellifera
cluster # 2294 cluster # 2294       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2294#0 length = 1022 sequences # 2  

consensusID : consensus_2294#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1022
fasta sequence
                              [AGTTCCATTAAGGCTCGAGCATTCAATAAATTCGGATCTTCGATAGCTTTTAGAAGTGTATCCTGAATCACTGTTGGGAATTTCCCGAGTTCAGATGCGTCTGAAATGTTTACCGCCTTTGCAGCCAACACATCAGCTGCATTCAAACTTTTCGATCGTTTCAATCCATAAGTAGAGACAAAGGATAATGATTTTATAAGTCTGCCAGGTTTAGCTGTGTTCACTTTGACATCATTTTGATCTACATTGAAGTGGACTCTACCTGAACCATGTAATATATTTCCACTTGATGCCGAGGTATCGAGTGGATGTGACTGTCGTAAAGCAGAGCCCGTTGAATGATGACTACTCTGAGAATGACGTGATGTCTGATGATGTTGCTGAAGGGTGTGTTGTATTTGTTGTTGCTGTTGAGCATAAAGATATCGATGTACGTTTCCACTTGATTTACTGTGTTGCAAATAATATGGAGATCGCTCTGAAGCATTTGTCCTAGACTTAGAAGGATGCGAATCGTTCTGCTTCATAGTGAACTCCTTAGCGTGTACGTTTAGCCGTGGATTAGTGATACTCGCTGTAGTTCCTTCCGTTCTTCCTCCTAAAAAATAATATATTACAGCTCTTAAATGTTCATTAAATTTATTTGAAAATTATTTAAAAAAGGATATAAAATTTAAAAATCTTATAATAAAAAATTAATATAAAATATAAACCTGGAGGTCGATAAATTTCCAAAGAAGGCTTGCTTTTTAACGTGGTTACGTTATTATTGTTGTTATTATTGTTATTACTGCTACTATTGTTATTATTGTTATTTCCTTTGTGTGGAACCGCATCCCTCATCTGCAAAATTAAACAACAAATTAATTTCAAGCAATCACTGTTCAAAAATGCATCAATGATTGTTTACACACATCTATATATACTGTTCTAAATTAATTTCACTAATAATAGAAGGACAACCGTACTTTACATTAAAATTTTCCTAACTTGTTGACCATATGTTCAGATATATATTACTG]

[-] EMBL BI506077             [AGTTCCATTAAGGCTCGAGCATTCAATAAATTCGGATCTTCGATAGCTTTTAGAAGTGTATCCTGAATCACTGTTGGGAATTTCCCGAGTTCAGATGCGTCTGAAATGTTTACCGCCTTTGCAGCCAACACATCAGCTGCATTCAAACTTTTCGATCGTTTCAATCCATAAGTAGAGACAAAGGATAATGATTTTATAAGTCTGCCAGGTTTAGCTGTGTTCACTTTGACATCATTTTGATCTACATTGAAGTGGACTCTACCTGAACCATGTAATATATTTCCACTTGATGCCGAGGTATCGAGTGGATGTGACTGTCGTAAAGCAGAGCCCGTTGAATGATGACTACTCTGAGAATGACGTGATGTCTGATGATGTTGCTGAAGGGTGTGTTGTATTTGTTGTTGCTGTTGAGCATAAAGATATCGATGTACGTTTCCACTTGATTTACTGTGTTGCAAATAATATGGAGATCGCTCTGAAGCATTTGTCCTAGACTTAGAAGGATGCGAATCGTTCTGCTTCATAGTGAACTCCTTAGCGTGTACGTTTAGCCGTGGATTAGTGATACTCGCTGTAGTTCCTTCCGTTCTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BI503633             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCTGAGAATGACGTGATGTCTGATGATGTTGCTGAAGGGTGTGTTGTATTTGTTGTTGCTGTTGAGCATAAAGATATCGATGTACGTTTCCACTTGATTTACTGTGTTGCAAATAATATGGAGATCGCTCTGAAGCATTTGTCCTAGACTTAGAAGGATGCGAATCGTTCTGCTTCATAGTGAACTCCTTAGCGTGTACGTTTAGCCGTGGATTAGTGATACTCGCTGTAGTTCCTTCCGTTCTTCCTCCTAAAAAATAATATATTACAGCTCTTAAATGTTCATTAAATTTATTTGAAAATTATTTAAAAAAGGATATAAAATTTAAAAATCTTATAATAAAAAATTAATATAAAATATAAACCTGGAGGTCGATAAATTTCCAAAGAAGGCTTGCTTTTTAACGTGGTTACGTTATTATTGTTGTTATTATTGTTATTACTGCTACTATTGTTATTATTGTTATTTCCTTTGTGTGGAACCGCATCCCTCATCTGCAAAATTAAACAACAAATTAATTTCAAGCAATCACTGTTCAAAAATGCATCAATGATTGTTTACACACATCTATATATACTGTTCTAAATTAATTTCACTAATAATAGAAGGACAACCGTACTTTACATTAAAATTTTCCTAACTTGTTGACCATATGTTCAGATATATATTACTG]


>consensus_2294#0 AGTTCCATTAAGGCTCGAGCATTCAATAAATTCGGATCTTCGATAGCTTTTAGAAGTGTA TCCTGAATCACTGTTGGGAATTTCCCGAGTTCAGATGCGTCTGAAATGTTTACCGCCTTT GCAGCCAACACATCAGCTGCATTCAAACTTTTCGATCGTTTCAATCCATAAGTAGAGACA AAGGATAATGATTTTATAAGTCTGCCAGGTTTAGCTGTGTTCACTTTGACATCATTTTGA TCTACATTGAAGTGGACTCTACCTGAACCATGTAATATATTTCCACTTGATGCCGAGGTA TCGAGTGGATGTGACTGTCGTAAAGCAGAGCCCGTTGAATGATGACTACTCTGAGAATGA CGTGATGTCTGATGATGTTGCTGAAGGGTGTGTTGTATTTGTTGTTGCTGTTGAGCATAA AGATATCGATGTACGTTTCCACTTGATTTACTGTGTTGCAAATAATATGGAGATCGCTCT GAAGCATTTGTCCTAGACTTAGAAGGATGCGAATCGTTCTGCTTCATAGTGAACTCCTTA GCGTGTACGTTTAGCCGTGGATTAGTGATACTCGCTGTAGTTCCTTCCGTTCTTCCTCCT AAAAAATAATATATTACAGCTCTTAAATGTTCATTAAATTTATTTGAAAATTATTTAAAA AAGGATATAAAATTTAAAAATCTTATAATAAAAAATTAATATAAAATATAAACCTGGAGG TCGATAAATTTCCAAAGAAGGCTTGCTTTTTAACGTGGTTACGTTATTATTGTTGTTATT ATTGTTATTACTGCTACTATTGTTATTATTGTTATTTCCTTTGTGTGGAACCGCATCCCT CATCTGCAAAATTAAACAACAAATTAATTTCAAGCAATCACTGTTCAAAAATGCATCAAT GATTGTTTACACACATCTATATATACTGTTCTAAATTAATTTCACTAATAATAGAAGGAC AACCGTACTTTACATTAAAATTTTCCTAACTTGTTGACCATATGTTCAGATATATATTAC TG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)