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Apis mellifera
cluster # 234 cluster # 234       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_234#0 length = 682 sequences # 5  

consensusID : consensus_234#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 682
fasta sequence
                              [TATTACGGTATTTTCACCAGATGGACATTTGCTACAAGTAGAATATGCACAAGAAGCTGTCAGAAAAGGTTCTTCTGCGGTCGGCGTTCGTGGGAATGACGTAGTCGTTTTAGGTGTTGAAAAAAAATCTATAGCAAAACTTCAAGAGGAACGAACAGTTCGTAAGATATGTCTTTTAGATGAACATGTTGTAATGGCATTTGCAGGTTTAACAGCAGATGCAAGAGTATTAATTAATCGTGCACAAGTGGAATGTCAGAGTCATAGATTAACTGTGGAAGATCCAGTTACATTGGAATATATAACTAGATACATTGCAGGTTTAAAACAAAAATATACACAAAGTAATGGTAGAAGACCTTTTGGAATATCGTGTCTTTTAGCTGGATTCGATTATGATGGTGTTCCACATTTATACCAAACAGAACCTTCAGGCATTTATTATGAGTGGAAGGCAAATGCAACAGGTCGAAATGCCAAAACGGTTCATGAATTTTTACAAAAATATTATACACCAGAAGAAGTAGCAACTGAAAAGGGAACAATAAAATTAGCTATTAGAGCCTTATTAGAAGTAGTACAATCGGGAAGAAAAAATTTAGAAATCGCAGTAATGAGACGTGGTCAACCTTTACAGATGTTAGACTTGGATACTATTGGAGAATATGTCACTGAAATTGAA]

[+] EMBL BI509607             [TATTACGGTATTTTCACCAGATGGACATTTGCTACAAGTAGAATATGCACAAGAAGCTGTCAGAAAAGGTTCTTCTGCGGTCGGCGTTCGTGGGAATGACGTAGTCGTTTTAGGTGTTGAAAAAAAATCTATAGCAAAACTTCAAGAGGAACGAACAGTTCGTAAGATATGTCTTTTAGATGAACATGTTGTAATGGCATTTGCAGGTTTAACAGCAGATGCAAGAGTATTAATTAATCGTGCACAAGTGGAATGTCAGAGTCATAGATTAACTGTGGAAGATCCAGTTACATTGGAATATATAACTAGATACATTGCAGGTTTAAAACAAAAATATACACAAAGTAATGGTAGAAGACCTTTTGGAATATCGTGTCTTTTAGCTGGATTCGATTATGATGGTGTTCCACATTTATACCAAACAGAACCTTCAGGCATTTATTATGAGTGGAAGGCAAATGCAACAGGTCGAAATGCCAAAACGGTTCATGAATTTTTACAAAAATATTATACACCAGAAGAAGTAGCAACTGAAAAGGGAA                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI505299             [              CACCAGATGGACATTTGCTACAAGTAGAATATGCACAAGAAGCTGTCAGAAAAGGTTCTTCTGCGGTCGGCGTTCGTGGGAATGACGTAGTCGTTTTAGGTGTTGAAAAAAAATCTATAGCAAAACTTCAAGAGGAACGAACAGTTCGTAAGATATGTCTTTTAGATGAACATGTTGTAATGGCATTTGCAGGTTTAACAGCAGATGCAAGAGTATTAATTAATCGTGCACAAGTGGAATGTCAGAGTCATAGATTAACTGTGGAAGATCCAGTTACATTGGAATATATAACTAGATACATTGCAGGTTTAAAACAAAAATATACACAAAGTAATGGTAGAAGACCTTTTGGAATATCGTGTCTTTTAGCTGGATTCGATTATGATGGTGTTCCACATTTATACCAAACAGAACCTTCAGGCATTTATTATGAGTGGAAGGCAAATGCAACAGGTCGAAATGCCAAAACGGTTCATGAATTTTTACAAAAATATTATACACCAGAAGAAGTAGCAACTGAAAAGG                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BI502902             [                    ATGGACATTTGCTACAAGTAGAATATGCACAAGAAGCTGTCAGAAAAGGTTCTTCTGCGGTCGGCGTTCGTGGGAATGACGTAGTCGTTTTAGGTGTTGAAAAAAAATCTATAGCAAAACTTCAAGAGGAACGAACAGTTCGTAAGATATGTCTTTTAGATGAACATGTTGTAATGGCATTTGCAGGTTTAACAGCAGATGCAAGAGTATTAATTAATCGTGCACAAGTGGAATGTCAGAGTCATAGATTAACTGTGGAAGATCCAGTTACATTGGAATATATAACTAGATACATTGCAGGTTTAAAACAAAAATATACACAAAGTAATGGTAGAAGACCTTTTGGAATATCGTGTCTTTTAGNTGGATTCGATTATGATGGTGTTCCACATTTATACCAAACAGAACCTTCAGGCATTTATTATGAGTGGAAGGCAAATGCAACAGGTCGAAATGCCAAAACGGTTCATGAATTTTTA                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BI509663             [                                            ATGCACAAGAAGCTGTCAGAAAAGGTTCTTCTGCGGTCGGCGTTCGTGGGAATGACGTAGTCGTTTTAGGTGTTGAAAAAAAATCTATAGCAAAACTTCAAGAGGAACGAACAGTTCGTAAGATATGTCTTTTAGATGAACATGTTGTAATGGCATTTGCAGGTTTAACAGCAGATGCAAGAGTATTAATTAATCGTGCACAAGTGGAATGTCAGAGTCATAGATTAACTGTGGAAGATCCAGTTACATTGGAATATATAACTAGATACATTGCAGGTTTAAAACAAAAATATACACAAAGTAATGGTAGAAGACCTTTTGGAATATCGTGTCTTTTAGCTGGATTCGATTATGATGGTGTTCCACATTTATATCAAACAGAACCTTCAGGCATTTATTATGAGTGGAAGGCAAATGCAACAGGTCGAAATGCCAAAACGGTTCATGAATTTTTACAAAAATATTATACACCAGAAGAAGTAGCAACTGAAAAGGGAACAATAAAATTAGCTATTAGAGCTTTATTAGAAGTAGTACAATCGGGAAGAAAAAATTTAGAAATCGCAGTAATGAGACGTGGTCAACCTTTACAGATGTTAGACTTGGATACTATTGGAGAATATGTCACTGAAATTGAA]
[+] EMBL BI503489             [                                                                                          TGGGAATGACGTAGTCGTTTTAGGTGTTG AAAAAAATCTATAGCAAAACTTCAAGAGGAACGAACAGTTCGTAAGATATGTCTTTTAGATGAACATGTTGTAATGGCATTTGCAGGTTTAACAGCAGATGCAAGAGTATTAATTAATCGTGCACAAGTAGAATGTCAGAGTCATAGATTAACTGTGGAAGATCCAGTTACATTGGAATATATAACTAGATACATTGCAGGTTTAAAACAAAAATATACACAAAGTAATGGTAGAAGACCTTTTGGAATATCGTGTCTTTTAGCTGGATTCGATTATGATGGTGTTCCACATTTATACCAAACAGAACCTTCAGGCATTTATTATGAGTGGAAGGCAAATGCAACAGGTCGAAATGCCAAAACGGTTCATGAATTTTTACAAAAATATTATACACCAGAAGAAGTAGCAACTGAAAAGGGAACAATAAAATTAGCTATTAGAGCCTTATTAGAA                                                                                                            ]


>consensus_234#0 TATTACGGTATTTTCACCAGATGGACATTTGCTACAAGTAGAATATGCACAAGAAGCTGT CAGAAAAGGTTCTTCTGCGGTCGGCGTTCGTGGGAATGACGTAGTCGTTTTAGGTGTTGA AAAAAAATCTATAGCAAAACTTCAAGAGGAACGAACAGTTCGTAAGATATGTCTTTTAGA TGAACATGTTGTAATGGCATTTGCAGGTTTAACAGCAGATGCAAGAGTATTAATTAATCG TGCACAAGTGGAATGTCAGAGTCATAGATTAACTGTGGAAGATCCAGTTACATTGGAATA TATAACTAGATACATTGCAGGTTTAAAACAAAAATATACACAAAGTAATGGTAGAAGACC TTTTGGAATATCGTGTCTTTTAGCTGGATTCGATTATGATGGTGTTCCACATTTATACCA AACAGAACCTTCAGGCATTTATTATGAGTGGAAGGCAAATGCAACAGGTCGAAATGCCAA AACGGTTCATGAATTTTTACAAAAATATTATACACCAGAAGAAGTAGCAACTGAAAAGGG AACAATAAAATTAGCTATTAGAGCCTTATTAGAAGTAGTACAATCGGGAAGAAAAAATTT AGAAATCGCAGTAATGAGACGTGGTCAACCTTTACAGATGTTAGACTTGGATACTATTGG AGAATATGTCACTGAAATTGAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)