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Apis mellifera
cluster # 2840 cluster # 2840       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2840#0 length = 679 sequences # 2  

consensusID : consensus_2840#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 679
fasta sequence
                              [TTTGTAACTATAACTATATTATTTGTTGTTATTTGTAAATGATGAACTTTTATATCGTTTATTAACAAAGTAGTAAATAATTTGAAGATTTAGCAATATATGAAATAATGTAATATGACGTATTACTTCATATTTATATTCTATTCATCAATATTCGCCGATAATCGTGGTGAATTAAACACGGATTCGTATAATGTATTAAAAAACGTATAATTTTTATTAATTCGAATCTTTATTGTTTCTCTCAACAATAAGGAAATTGAATTAAAATTTACTTTACAATAGTAGTGATATTTATATTAAAAATATTCAGTTCTCACGCAATATGATTAAAATATTATTTTTTATCTTTGTCATATTTATAAAATTCATATTTTGTCAAAATGATTTTTTTGATGAAGAATTAATGTTGAAACCATTATCAAATAATTATGTCTATGCATATTTTCAATTTACTACGGTATGGGAAACTACAAAAGACATAAAAACGTTTCAACATTCTCATTTATTTCCAAGAGGCCTTGGTGAAATTATAAGTCGTCATAATGTAGATGAATTACATCTTACATTAACCAAAGGTTTATGGAATTATCAAAAATGGGGATATCCTTATCATGATGCTGGTCCTGGTGCTGAAATATTTACATGGTTTCATAAAGATGTCACCAATGTTGATATG]

[+] EMBL BE844585             [TTTGTAACTATAACTATATTATTTGTTGTTATTTGTAAATGATGAACTTTTATATCGTTTATTAACAAAGTAGTAAATAATTTGAAGATTTAGCAATATATGAAATAATGTAATATGACGTATTACTTCATATTTATATTCTATTCATCAATATTCGCCGATAATCGTGGTGAATTAAACACGGATTCGTATAATGTATTAAAAAATGTATAATTTTTATTAATTCGAATCTTTATTGTTTCTCTCAACAATAAGGAAATTGAATTAAAATTTACTTTACAATAGTAGTGATATTTATATTAAAAATATTCAGTTCTCACGCAATATGATTAAAATATTATTTTTTATCTTTGTCATATTTATAAAATTCATATTTTGTCAAAATGATTTTTTTGATGAAGAATTAATGTTGAAACCATTATCAAATAATTATGTCTATGCATATTTTCAATTTACTACGGTATGGGAAACTACAAAAGACATAAAAACGTTTCAACATTCTCATTTATTTCCAAGAGG                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BI508298             [                                                                                            GCAATATATGAAATAATGTAATATGACGTATTACTTCATATTTATATTCTATTCATCAATATTCGCCGATAATCGTGGTGAATTAAACACGGATTTGTATAATGTATTAAAAAACGTATAATTTTTATTAATTTGAATCTTTATTGTTTCTCTC ACAATAAGGAAATTGAATTAAAATTTACTTTACAATAGTAGTGATATTTATATTAAAAATATTCAGTTCTCATGCAATATGATTAAAATATTATTTTTTATCTTTGTCATATTTATAAAATTCATATTTTGTCAAAATGATTTTTTTGATGAAGAATTAATGTTGAAACCATTATCAAATAATTATGTCTATGCATATTTTCAATTTACTACGGTATGGGAAACTACAAAAGACATAAAAACGTTTCAACATTCTCATTTATTTCCAAGAGGCCTTGGTGAAATTATAAGTCGTCATAATGTAGATGAATTACATCTTACATTAACCAAAGGTTTATGGAATTATCAAAAATGGGGATATCCTTATCATGATGCTGGTCCTGGTGCTGAAATATTTACATGGTTTCATAAAGATGTCACCAATGTTGATATG]


>consensus_2840#0 TTTGTAACTATAACTATATTATTTGTTGTTATTTGTAAATGATGAACTTTTATATCGTTT ATTAACAAAGTAGTAAATAATTTGAAGATTTAGCAATATATGAAATAATGTAATATGACG TATTACTTCATATTTATATTCTATTCATCAATATTCGCCGATAATCGTGGTGAATTAAAC ACGGATTCGTATAATGTATTAAAAAACGTATAATTTTTATTAATTCGAATCTTTATTGTT TCTCTCAACAATAAGGAAATTGAATTAAAATTTACTTTACAATAGTAGTGATATTTATAT TAAAAATATTCAGTTCTCACGCAATATGATTAAAATATTATTTTTTATCTTTGTCATATT TATAAAATTCATATTTTGTCAAAATGATTTTTTTGATGAAGAATTAATGTTGAAACCATT ATCAAATAATTATGTCTATGCATATTTTCAATTTACTACGGTATGGGAAACTACAAAAGA CATAAAAACGTTTCAACATTCTCATTTATTTCCAAGAGGCCTTGGTGAAATTATAAGTCG TCATAATGTAGATGAATTACATCTTACATTAACCAAAGGTTTATGGAATTATCAAAAATG GGGATATCCTTATCATGATGCTGGTCCTGGTGCTGAAATATTTACATGGTTTCATAAAGA TGTCACCAATGTTGATATG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)