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Apis mellifera
cluster # 30 cluster # 30       Sequences # 12       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_30#0 length = 811 sequences # 12  

consensusID : consensus_30#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 811
fasta sequence
                              [GTTATTTCATTTTACGAATCTCATTAGAAATTCAAAATGTCTACCTACAAATTGACTTACTTCCCAGTTAAAGGATTGGGTGAACCAATTCGTTTTCTCTTAAGCTATGCTGGAATTTCATTTGAAGATGAGCGTTTTGATAGAGATGACTGGCCAAAGATAAAGCCTACTACTCCTTTTGGTCAAGTTCCTGTACTTGATGTTGATGGGAAAAAAATAGCTCAGTCAGTAGCTATTTCTCGTTATTTGGCAAAAAAATCTGGTTTAGCTGGAAAAGATGATTGGGAAGCTCTAGAAATTGATAGTATTGTTGATACTATTCATGATGTTCGTGCAAGACTTGCTGCTTTCCACTATGAAGAAAATGAAGAAATCAAAGCTGCGAAACGTAAAATTGCTGATGAAGTAGTACCATATTATTTGGAACGTTTAGATGCTCAAGTGAAGAATAATGGTGGCTACTTTGTTGGTGGTGCTCTTTCTTGGGCTGATTTATCATTTGTTGCTTTGCTCGACTATTTAAATTTTATGAATGGATCCGATCTCATCGAGAAATATGATAATCTGAAGCAGTTGAAAGAAAAAGTTCTCAATCTACCTGCTATTAAGNGCTGGCTTGATAAGCGTCCACATTCTGATTTCTAAATTTTTCATTTCTTGATTACTTTCTGTTCTATAAACATTTTAAGTTTGCGATCTAAATTTCTTAAAAAAAATGGATCGCTTCAATTGCTTTCATAAAAATGTTAATTCTTGTACGGAATATATGAAGATGCTTTTTTAACAGCTTAGTTTCAGTTATGAGCAACGT]

[+] EMBL BI510846             [GTTATTTCATTTTACGAATCTCATTAGAAATTCAAAATGTCTACCTACAAATTGACTTACTTCCCAGTTAAAGGATTGGGTGAACCAATTCGTTTTCTCTTAAGCTATGCTGGAATTTCATTTGAAGATGAGCGTTTTGATAGAGATGACTGGCCAAAGATAAAGCCTACTACTCCTTTTGGTCAAGTTCCTGTACTTGATGTTGATGGGAAAAAAATAGCTCAGTCAGTAGCTATTTCTCGTTATTTGGCAAAAAAATCTGGTTTAGCTGGAAAAGATGATTGGGAAGCTCTAGAAATTGATAGTATTGTTGATACTATTCATGATGTTCGTGCAAGACTTGCTGCTTTCCACTATGAAGAAAATGAAGAAATCAAAGCTGCGAAACGTAAAATTGCTGATGAAGTAGTACCATATTATTTGGAACGTTTAGATGCTCAAGTGAAGAATAATGGTGGCTACTTTGTTGGTGGTGCTCTTTCTTGGGCTGATTTATCATTTGTTGCTTTGCTCGACTATTTAAATTTTATGAATGGATCCGATCTCATCGAG                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI512233             [  TTTTTTTTTTTACGAATCTCATTAGAAATTCAAAATGTCTACCTACAAATTGACTTACTTCCCAGTTAAAGGATTGGGTGAACCAATTCGTTTTCTCTTAAGCTATGCTGGAATTTCATTTGAAGATGAGCGTTTTGATAGAGATGACTGGCCAAAGATAAAGCCTACTACTCCTTTTGGTCAAGTTCCTGTACTTGATGTTGATGGGAAAAAAATAGCTCAGTCAGTAGCTATTTCTCGTTATTTGGCAAAAAAATCTGGTTTAGCTGGAAAAGATGATTGGGAAGCTCTAGAAATTGATAGTATTGTTGATACTATTCATGATGTTCGTGCAAGACTTGCTGCTTTCCACTATGAAGAAAATGAAGAAATCAAAGCTGCGAAACGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BI514403             [                                                                                          CGTTTTCTCTTAAGCTATGCTGGAATTTCATTTGAAGATGAGCGTTTTGATAGAGATGACTGGCCAAAGATAAAGCCTACTACTCCTTTTGGTCAAGTTCCTGTACTTGATGTTGATGGGAAAAAAATAGCTCAGTCAGTAGCTATTTCTCGTTATTTGGCAAAAAAATCTGGTTTAGCTGGAAAAGATGATTGGGAAGCTCTAGAAATTGATAGTATTGTTGATACTATTCATGATGTTCGTGCAAGACTTGCTGCTTTCCACTATGAAGAAAATGAAGAAATCAAAGCTGCGAAACGTAAAATTGCTGATGAAGTAGTACCATATTATTTGGAACGTTTAGATGCTCAAGTGAAGAATAATGGTGGCTACTTTGTTGGTGGTGCTCTTTCTTGGGCTGATTTATCATTTGTTGCTTTGCTCGACTATTTAAATTTTATGAATGGATCCGATCTCATCGAGAAATATGATAATCTGAAGCAGTTGAAAGAAAAAGTTCTCAAT                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BI512252             [                                                                                            TTTTCTCTTAAGCTATGCTGGAATTTCATTTGAAGATGAGCGTTTTGATAGAGATGACTGGCCAAAGATAAAGCCTACTACTCCTTTTGGTCAAGTTCCTGTACTTGATGTTGATGGGAAAAAAATAGCTCAGTCAGTAGCTATTTCTCGTTATTTGGCAAAAAAATCTGGTTTAGCTGGAAAAGATGATTGGGAAGCTCTAGAAATTGATAGTATTGTTGATACTATTCATGATGTTCGTGCAAGACTTGCTGCTTTCCACTATGAAGAAAATGAAGAAATCAAAGCTGCGAAACGTAAAATTGCTGATGAAGTAGTACCATATTATTTGGAACGTTTAGATGCTCAAGTGAAGAATAATGGTGGCTACTTTGTTGGTGGTGCTCTTTCTTGGGCTGATTTATCATTTGTTGCTTTGCTCGACTATTTAAATTTTATGAATGGATCCGATCTCATCGA                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BI513972             [                                                                                                                     TCATTTGAAGATGAGCGTTTTGATAGAGATGACTGGCCAAAGATAAAGCCTACTACTCCTTTTGGTCAAGTTCCTGTACTTGATGTTGATGGGAAAAAAATAGCTCAGTCAGTAGCTATTTCTCGTTATTTGGCAAAAAAATCTGGTTTAGCTGGAAAAGATGATTGGGAAGCTCTAGAAATTGATAGTATTGTTGATACTATTCATGATGTTCGTGCAAGACTTGCTGCTTTCCACTATGAAGAAAATGAAGAAATCAAAGCTGCGAAACGTAAAATTGCTGATGAAGTAGTACCATATTATTTGGAACGTTTAGATGCTCAAGTGAAGAATAATGGTGGCTACTTTGTTGGTGGTGCTCTTTCTTGGGCTGATTTATCATTTGTTGCTTTGCTCGACTATTTAAATTTTATGAATGGATCCGATCTCATCGAGAAATATGATAATCTGAAGCAGTTGAAAGAAAAAGTTCTCAATCTACCTGCTATTAAGNGCTGGCTTGATAAGCGTCNACATTCTGATTTCTAAATTTTTCAT                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BI514062             [                                                                                                                     TCATTTGAAGATGAGCGTTTTGATAGAGATGACTGGCCAAAGATAAAGCCTACTACTCCTTTTGGTCAAGTTCCTGTACTTGATGTTGATGGGAAAAAAATAGCTCAGTCAGTAGCTATTTCTCGTTATTTGGCAAAAAAATCTGGTTTAGCTGGAAAAGATGATTGGGAAGCTCTAGAAATTGATAGTATTGTTGATACTATTCATGATGTTCGTGCAAGACTTGCTGCTTTCCACTATGAAGAAAATGAAGAAATCAAAGCTGCGAAACGTAAAATTGCTGATGAAGTAGTACCATATTATTTGGAACGTTTAGATGCTCAAGTGAAGAATAATGGTGGCTACTTTGTTGGTGGTGCTCTTTCTTGGGCTGATTTATCATTTGTTGCTTTGCTCGACTATTTAAATTTTATGAATGGATCCGATCTCATCGAGAAATATGATAATCTGAAGCAGTTGAA                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BI514114             [                                                                                                                     TCATTTGAAGATGAGCGTTTTGATAGAGATGACTGGCCAAAGATAAAGCCTACTACTCCTTTTGGTCAAGTTCCTGTACTTGATGTTGATGGGAAAAAAATAGCTCAGTCAGTAGCTATTTCTCGTTATTTGGCAAAAAAATCTGGTTTAGCTGGAAAAGATGATTGGGAAGCTCTAGAAATTGATAGTATTGTTGATACTATTCATGATGTTCGTGCAAGACTTGCTGCTTTCCACTATGAAGAAAATGAAGAAATCAAAGCTGCGAAACGTAAAATTGCTGATGAAGTAGTACCATATTATTTGGAACGTTTAGATGCTCAAGTGAAGAATAATGGTGGCTACTTTGTTGGTGGTGCTCTTTCTTGGGCTGATTTATCATTTGTTGCTTTGCTCGACTATTTAAATTTTATGAATGGATCCGATCTCATCGAGAAATATGATAATCTGAAGCAGTTGAA                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BI513885             [                                                                                                                     TCATTTGAAGATGAGCGTTTTGATAGAGATGACTGGCCAAAGATAAAGCCTACTACTCCTTTTGGTCAAGTTCCTGTACTTGATGTTGATGGGAAAAAAATAGCTCAGTCAGTAGCTATTTCTCGTTATTTGGCAAAAAAATCTGGTTTAGCTGGAAAAGATGATTGGGAAGCTCTAGAAATTGATAGTATTGTTGATACTATTCATGATGTTCGTGCAAGACTTGCTGCTTTCCACTATGAAGAAAATGAAGAAATCAAAGCTGCGAAACGTAAAATTGCTGATGAAGTAGTACCATATTATTTGGAACGTTTAGATGCTCAAGTGAAGAATAATGGTGGCTACTTTGTTGGTGGTGCTCTTTCTTGGGCTGATTTATCATTTGTTGCTTTGCTCGACTATTTAAATTTTATGAATGGATCCGATCTCATCGAGAAATATGATAATCTGAAGCAGTTGAAAGAAAAAGTTCTCAATCTACCTGCTATTAAGAGCTGGCTTGATAAGCGTCCACATTCTGATTTCTAAATTTTTCATT                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI514972             [                                                                                                                            AAGATGAGCGTTTTGATAGAGATGACTGGCCAAAGATAAAGCCTACTACTCCTTTTGGTCAAGTTCCTGTACTTGATGTTGATGGGAAAAAAATAGCTCAGTCAGTAGCTATTTCTCGTTATTTGGCAAAAAAATCTGGTTTAGCTGGAAAAGATGATTGGGAAGCTCTAGAAATTGATAGTATTGTTGATACTATTCATGATGTTCGTGCAAGACTTGCTGCTTTCCACTATGAAGAAAATGAAGAAATCAAAGCTGCGAAACGTAAAATTGCTGATGAAGTAGTACCATATTATTTGGAACGTTTAGATGCTCAAGTGAAGAATAATGGTGGCTACTTTGTTGGTGGTGCTCTTTCTTGGGCTGATTTATCATTTGTTGCTTTGCTCGACTATTTAAATTTTATGAATGGATCCGATCTCATCGAGAAATATGATAATCTGANNCAGTTGAAAGAAAAAGTTCTCAATCTACCTGCTATTAAGNGCTGGCTTGATAAGCGTCCACATTCTGATTTCTAAATTTTTCATT                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI515659             [                                                                                                                                                GATGACTGGCCAAAGATAAAGCCTACTACTCCTTTTGGTCAAGTTCCTGTACTTGATGTTGATGGGAAAAAAATAGCTCAGTCAGTAGCTATTTCTCGTTATTTGGCAAAAAAATCTGGTTTAGCTGGAAAAGATGATTGGGAAGCTCTAGAAATTGATAGTATTGTTGATACTATTCATGATGTTCGTGCAAGACTTGCTGCTTTCCACTATGAAGAAAATGAAGAAATCAAAGCTGCGAAACGTAAAATTGCTGATGAAGTAGTACCATATTATTTGGAACGTTTAGATGCTCAAGTGAAGAATAATGGTGGCTACTTTGTTGGTGNNGCTCTTTCTTGGGCTGATTTATCATTTGTTGCTTTGCTCGACTATTTAAATTTTATGAATGGATCCGATCTCATCGAGAAATATGATAATCTGAAGCAGTTGAAAGAAAAAGTTCT                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BI515635             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CTGCTTTCCACTATGAAGAAAATGAAGAAATCAAAGCTGCGAAACGTAAAATTGCTGATGAAGTAGTACCATATTATTTGGAACGTTTAGATGCTCAAGTGAAGAATAATGGTGGCTACTTTGTTGGTGGTGCTCTTTCTTGGGCTGATTTATCATTTGTTGCTTTGCTCGACTATTTAAATTTTATGAATGGATCCGATCTCATCGAGAAATATGATAATCTGAAGCAGTTGAAAGAAAAAGTTCTCAATCTACCTGCTATTAAGAGCTGGCTTGATAAGCGTCCACATTCTGATTTCTAAATTTTTCATTTCTTGATTACTTTCTGTTCTATAAACATTTTAAGTTTGCGATCTAAATTTCTTAAAAAAAATGGATCGCTTCAATTGCTTTCATAAAAATGTTAATTCTTGTACGGAATATATGAAGATGCTTTTTTAACAGCTTAGTTTCAGTTATGAGCAACGT]
[+] EMBL BG101627             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ACNTTTAGANGCTCAAGTGAAGAATAATGGTGGCTACTTTGTTGGTGGTGCTCTTTCTTGGGCTGATNTATCATTTNATGCTTTGCTCAACTNTNTAAATTATATGANTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]


>consensus_30#0 GTTATTTCATTTTACGAATCTCATTAGAAATTCAAAATGTCTACCTACAAATTGACTTAC TTCCCAGTTAAAGGATTGGGTGAACCAATTCGTTTTCTCTTAAGCTATGCTGGAATTTCA TTTGAAGATGAGCGTTTTGATAGAGATGACTGGCCAAAGATAAAGCCTACTACTCCTTTT GGTCAAGTTCCTGTACTTGATGTTGATGGGAAAAAAATAGCTCAGTCAGTAGCTATTTCT CGTTATTTGGCAAAAAAATCTGGTTTAGCTGGAAAAGATGATTGGGAAGCTCTAGAAATT GATAGTATTGTTGATACTATTCATGATGTTCGTGCAAGACTTGCTGCTTTCCACTATGAA GAAAATGAAGAAATCAAAGCTGCGAAACGTAAAATTGCTGATGAAGTAGTACCATATTAT TTGGAACGTTTAGATGCTCAAGTGAAGAATAATGGTGGCTACTTTGTTGGTGGTGCTCTT TCTTGGGCTGATTTATCATTTGTTGCTTTGCTCGACTATTTAAATTTTATGAATGGATCC GATCTCATCGAGAAATATGATAATCTGAAGCAGTTGAAAGAAAAAGTTCTCAATCTACCT GCTATTAAGNGCTGGCTTGATAAGCGTCCACATTCTGATTTCTAAATTTTTCATTTCTTG ATTACTTTCTGTTCTATAAACATTTTAAGTTTGCGATCTAAATTTCTTAAAAAAAATGGA TCGCTTCAATTGCTTTCATAAAAATGTTAATTCTTGTACGGAATATATGAAGATGCTTTT TTAACAGCTTAGTTTCAGTTATGAGCAACGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)