These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_30#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 12 consensus length = 811 fasta sequence [GTTATTTCATTTTACGAATCTCATTAGAAATTCAAAATGTCTACCTACAAATTGACTTACTTCCCAGTTAAAGGATTGGGTGAACCAATTCGTTTTCTCTTAAGCTATGCTGGAATTTCATTTGAAGATGAGCGTTTTGATAGAGATGACTGGCCAAAGATAAAGCCTACTACTCCTTTTGGTCAAGTTCCTGTACTTGATGTTGATGGGAAAAAAATAGCTCAGTCAGTAGCTATTTCTCGTTATTTGGCAAAAAAATCTGGTTTAGCTGGAAAAGATGATTGGGAAGCTCTAGAAATTGATAGTATTGTTGATACTATTCATGATGTTCGTGCAAGACTTGCTGCTTTCCACTATGAAGAAAATGAAGAAATCAAAGCTGCGAAACGTAAAATTGCTGATGAAGTAGTACCATATTATTTGGAACGTTTAGATGCTCAAGTGAAGAATAATGGTGGCTACTTTGTTGGTGGTGCTCTTTCTTGGGCTGATTTATCATTTGTTGCTTTGCTCGACTATTTAAATTTTATGAATGGATCCGATCTCATCGAGAAATATGATAATCTGAAGCAGTTGAAAGAAAAAGTTCTCAATCTACCTGCTATTAAGNGCTGGCTTGATAAGCGTCCACATTCTGATTTCTAAATTTTTCATTTCTTGATTACTTTCTGTTCTATAAACATTTTAAGTTTGCGATCTAAATTTCTTAAAAAAAATGGATCGCTTCAATTGCTTTCATAAAAATGTTAATTCTTGTACGGAATATATGAAGATGCTTTTTTAACAGCTTAGTTTCAGTTATGAGCAACGT] [+] EMBL BI510846 [GTTATTTCATTTTACGAATCTCATTAGAAATTCAAAATGTCTACCTACAAATTGACTTACTTCCCAGTTAAAGGATTGGGTGAACCAATTCGTTTTCTCTTAAGCTATGCTGGAATTTCATTTGAAGATGAGCGTTTTGATAGAGATGACTGGCCAAAGATAAAGCCTACTACTCCTTTTGGTCAAGTTCCTGTACTTGATGTTGATGGGAAAAAAATAGCTCAGTCAGTAGCTATTTCTCGTTATTTGGCAAAAAAATCTGGTTTAGCTGGAAAAGATGATTGGGAAGCTCTAGAAATTGATAGTATTGTTGATACTATTCATGATGTTCGTGCAAGACTTGCTGCTTTCCACTATGAAGAAAATGAAGAAATCAAAGCTGCGAAACGTAAAATTGCTGATGAAGTAGTACCATATTATTTGGAACGTTTAGATGCTCAAGTGAAGAATAATGGTGGCTACTTTGTTGGTGGTGCTCTTTCTTGGGCTGATTTATCATTTGTTGCTTTGCTCGACTATTTAAATTTTATGAATGGATCCGATCTCATCGAG ] [+] EMBL BI512233 [ TTTTTTTTTTTACGAATCTCATTAGAAATTCAAAATGTCTACCTACAAATTGACTTACTTCCCAGTTAAAGGATTGGGTGAACCAATTCGTTTTCTCTTAAGCTATGCTGGAATTTCATTTGAAGATGAGCGTTTTGATAGAGATGACTGGCCAAAGATAAAGCCTACTACTCCTTTTGGTCAAGTTCCTGTACTTGATGTTGATGGGAAAAAAATAGCTCAGTCAGTAGCTATTTCTCGTTATTTGGCAAAAAAATCTGGTTTAGCTGGAAAAGATGATTGGGAAGCTCTAGAAATTGATAGTATTGTTGATACTATTCATGATGTTCGTGCAAGACTTGCTGCTTTCCACTATGAAGAAAATGAAGAAATCAAAGCTGCGAAACGTA ] [+] EMBL BI514403 [ CGTTTTCTCTTAAGCTATGCTGGAATTTCATTTGAAGATGAGCGTTTTGATAGAGATGACTGGCCAAAGATAAAGCCTACTACTCCTTTTGGTCAAGTTCCTGTACTTGATGTTGATGGGAAAAAAATAGCTCAGTCAGTAGCTATTTCTCGTTATTTGGCAAAAAAATCTGGTTTAGCTGGAAAAGATGATTGGGAAGCTCTAGAAATTGATAGTATTGTTGATACTATTCATGATGTTCGTGCAAGACTTGCTGCTTTCCACTATGAAGAAAATGAAGAAATCAAAGCTGCGAAACGTAAAATTGCTGATGAAGTAGTACCATATTATTTGGAACGTTTAGATGCTCAAGTGAAGAATAATGGTGGCTACTTTGTTGGTGGTGCTCTTTCTTGGGCTGATTTATCATTTGTTGCTTTGCTCGACTATTTAAATTTTATGAATGGATCCGATCTCATCGAGAAATATGATAATCTGAAGCAGTTGAAAGAAAAAGTTCTCAAT ] [+] EMBL BI512252 [ TTTTCTCTTAAGCTATGCTGGAATTTCATTTGAAGATGAGCGTTTTGATAGAGATGACTGGCCAAAGATAAAGCCTACTACTCCTTTTGGTCAAGTTCCTGTACTTGATGTTGATGGGAAAAAAATAGCTCAGTCAGTAGCTATTTCTCGTTATTTGGCAAAAAAATCTGGTTTAGCTGGAAAAGATGATTGGGAAGCTCTAGAAATTGATAGTATTGTTGATACTATTCATGATGTTCGTGCAAGACTTGCTGCTTTCCACTATGAAGAAAATGAAGAAATCAAAGCTGCGAAACGTAAAATTGCTGATGAAGTAGTACCATATTATTTGGAACGTTTAGATGCTCAAGTGAAGAATAATGGTGGCTACTTTGTTGGTGGTGCTCTTTCTTGGGCTGATTTATCATTTGTTGCTTTGCTCGACTATTTAAATTTTATGAATGGATCCGATCTCATCGA ] [+] EMBL BI513972 [ TCATTTGAAGATGAGCGTTTTGATAGAGATGACTGGCCAAAGATAAAGCCTACTACTCCTTTTGGTCAAGTTCCTGTACTTGATGTTGATGGGAAAAAAATAGCTCAGTCAGTAGCTATTTCTCGTTATTTGGCAAAAAAATCTGGTTTAGCTGGAAAAGATGATTGGGAAGCTCTAGAAATTGATAGTATTGTTGATACTATTCATGATGTTCGTGCAAGACTTGCTGCTTTCCACTATGAAGAAAATGAAGAAATCAAAGCTGCGAAACGTAAAATTGCTGATGAAGTAGTACCATATTATTTGGAACGTTTAGATGCTCAAGTGAAGAATAATGGTGGCTACTTTGTTGGTGGTGCTCTTTCTTGGGCTGATTTATCATTTGTTGCTTTGCTCGACTATTTAAATTTTATGAATGGATCCGATCTCATCGAGAAATATGATAATCTGAAGCAGTTGAAAGAAAAAGTTCTCAATCTACCTGCTATTAAGNGCTGGCTTGATAAGCGTCNACATTCTGATTTCTAAATTTTTCAT ] [+] EMBL BI514062 [ TCATTTGAAGATGAGCGTTTTGATAGAGATGACTGGCCAAAGATAAAGCCTACTACTCCTTTTGGTCAAGTTCCTGTACTTGATGTTGATGGGAAAAAAATAGCTCAGTCAGTAGCTATTTCTCGTTATTTGGCAAAAAAATCTGGTTTAGCTGGAAAAGATGATTGGGAAGCTCTAGAAATTGATAGTATTGTTGATACTATTCATGATGTTCGTGCAAGACTTGCTGCTTTCCACTATGAAGAAAATGAAGAAATCAAAGCTGCGAAACGTAAAATTGCTGATGAAGTAGTACCATATTATTTGGAACGTTTAGATGCTCAAGTGAAGAATAATGGTGGCTACTTTGTTGGTGGTGCTCTTTCTTGGGCTGATTTATCATTTGTTGCTTTGCTCGACTATTTAAATTTTATGAATGGATCCGATCTCATCGAGAAATATGATAATCTGAAGCAGTTGAA ] [+] EMBL BI514114 [ TCATTTGAAGATGAGCGTTTTGATAGAGATGACTGGCCAAAGATAAAGCCTACTACTCCTTTTGGTCAAGTTCCTGTACTTGATGTTGATGGGAAAAAAATAGCTCAGTCAGTAGCTATTTCTCGTTATTTGGCAAAAAAATCTGGTTTAGCTGGAAAAGATGATTGGGAAGCTCTAGAAATTGATAGTATTGTTGATACTATTCATGATGTTCGTGCAAGACTTGCTGCTTTCCACTATGAAGAAAATGAAGAAATCAAAGCTGCGAAACGTAAAATTGCTGATGAAGTAGTACCATATTATTTGGAACGTTTAGATGCTCAAGTGAAGAATAATGGTGGCTACTTTGTTGGTGGTGCTCTTTCTTGGGCTGATTTATCATTTGTTGCTTTGCTCGACTATTTAAATTTTATGAATGGATCCGATCTCATCGAGAAATATGATAATCTGAAGCAGTTGAA ] [+] EMBL BI513885 [ TCATTTGAAGATGAGCGTTTTGATAGAGATGACTGGCCAAAGATAAAGCCTACTACTCCTTTTGGTCAAGTTCCTGTACTTGATGTTGATGGGAAAAAAATAGCTCAGTCAGTAGCTATTTCTCGTTATTTGGCAAAAAAATCTGGTTTAGCTGGAAAAGATGATTGGGAAGCTCTAGAAATTGATAGTATTGTTGATACTATTCATGATGTTCGTGCAAGACTTGCTGCTTTCCACTATGAAGAAAATGAAGAAATCAAAGCTGCGAAACGTAAAATTGCTGATGAAGTAGTACCATATTATTTGGAACGTTTAGATGCTCAAGTGAAGAATAATGGTGGCTACTTTGTTGGTGGTGCTCTTTCTTGGGCTGATTTATCATTTGTTGCTTTGCTCGACTATTTAAATTTTATGAATGGATCCGATCTCATCGAGAAATATGATAATCTGAAGCAGTTGAAAGAAAAAGTTCTCAATCTACCTGCTATTAAGAGCTGGCTTGATAAGCGTCCACATTCTGATTTCTAAATTTTTCATT ] [+] EMBL BI514972 [ 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] [+] EMBL BI515635 [ CTGCTTTCCACTATGAAGAAAATGAAGAAATCAAAGCTGCGAAACGTAAAATTGCTGATGAAGTAGTACCATATTATTTGGAACGTTTAGATGCTCAAGTGAAGAATAATGGTGGCTACTTTGTTGGTGGTGCTCTTTCTTGGGCTGATTTATCATTTGTTGCTTTGCTCGACTATTTAAATTTTATGAATGGATCCGATCTCATCGAGAAATATGATAATCTGAAGCAGTTGAAAGAAAAAGTTCTCAATCTACCTGCTATTAAGAGCTGGCTTGATAAGCGTCCACATTCTGATTTCTAAATTTTTCATTTCTTGATTACTTTCTGTTCTATAAACATTTTAAGTTTGCGATCTAAATTTCTTAAAAAAAATGGATCGCTTCAATTGCTTTCATAAAAATGTTAATTCTTGTACGGAATATATGAAGATGCTTTTTTAACAGCTTAGTTTCAGTTATGAGCAACGT] [+] EMBL BG101627 [ ACNTTTAGANGCTCAAGTGAAGAATAATGGTGGCTACTTTGTTGGTGGTGCTCTTTCTTGGGCTGATNTATCATTTNATGCTTTGCTCAACTNTNTAAATTATATGANTGG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |