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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_308#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 548 fasta sequence
[TCAGTTACTGATAATTTAGTTCAAGATTGGGTTTCTTCTGAACAAAGTACAGGAACATCAATTATGGCTTGTGAATTTGATGGAGGAGTAGTAATTGGAGCAGATTCTAGAGCTACCACTGGGGCTTATATCTCAAATCGTTTTGCTGATAAATTAACTAAAATCACAGATTATATTTATTGTTGCCGTTCTGGCTCTGCAGCAGACACTCAAGCTATTTCTGATATTGTTGCTTATCATTTAAGCCTTCACAAAATGGAATTAGGCATAGAACCTTTGGTAGAAACAGCAGCAAATGTATTCCGTGAATTATGTTACAATTATAGAGATTCCTTAATGGCAGGAATTTTAGTGGCAGGATGGGATAGTCGTAAAGGAGGTCAAGTTTATAGTGTACCTATAGGTGGCATGTGTGTAAGGCAACCAATTTCCATTGGAGGATCTGGTTCAACCTATGTATATGNNNATATGGATTCGCAGTATAAACCTAATATGTCAAAAAATGAATGTGTTAAACTTGTTGAAAATACATTGGCATTGGCAATGTC]
[+] EMBL BI512225 [TCAGTTACTGATAATTTAGTTCAAGATTGGGTTTCTTCTGAACAAAGTACAGGAACATCAATTATGGCTTGTGAATTTGATGGAGGAGTAGTAATTGGAGCAGATTCTAGAGCTACCACTGGGGCTTATATCTCAAATCGTTTTGCTGATAAATTAACTAAAATCACAGATTATATTTATTGTTGCCGTTCTGGCTCTGCAGCAGACACTCAAGCTATTTCTGATATTGTTGCTTATCATTTAAGCCTTCACAAAATGGAATTAGGCATAGAACCTTTGGTAGAAACAGCAGCAAATGTATTCCGTGAATTATGTTACAATTATAGAGATTCCTTAATGGCAGGAATTTTAGTGGCAGGATGGGATAGTCGTAAAGGAGGTCAAGTTTATAGTGTACCTATAGGTGGCATGTGTG ]
[+] EMBL BI512345 [TCAGTTACTGATAATTTAGTTCAAGATTGGGTTTCTTCTGAACAAAGTACAGGAACATCAATTATGGCTTGTGAATTTGATGGAGGAGTAGTAATTGGAGCAGATTCTAGAGCTACCACTGGGGCTTATATCTCAAATCGTTTTGCTGATAAATTAACTAAAATCACAGATTATATTTATTGTTGCCGTTCTGGCTCTGCAGCAGACACTCAAGCTATTTCTGATATTGTTGCTTATCATTTAAGCCTTCACAAAATGGAATTAGGCATAGAACCTTTGGTAGAAACAGCAGCAAATGTATTCCGTGAATTATGTTACAATTATAGAGATTCCTTAATGGCAGGAATTTTNGTGGCAGGATGGG ]
[+] EMBL BI509716 [ GGGTTTCTTCTGAACAAAGTACAGGAACATCAATTATGGCTTGTGAATTTGATGGAGGAGTAGTAATTGGAGCAGATTCTAGAGCTACCACTGGGGCTTATATCTCAAATCGTTTTGCTGATAAATTAACTAAAATCACAGATTATATTTATTGTTGCCGTTCTGGCTCTGCAGCAGACACTCAAGCTATTTCTGATATTGTTGCTTATCATTTAAGCCTTCACAAAATGGAATTAGGCATAGAACCTTTGGTAGAAACAGCAGCAAATGTATTCCGTGAATTATGTTACAATTATAGAGATTCCTTAATGGCAGGAATTTTAGTGGCAGGATGGGATAGTCGTAAAGGAGGTCAAGTTTATAGTGTACCTATAGGTGGCATGTGTGTAAGGCAACCAATTTCCATTGGAGGATCTGGTTCAACCTATGTATATGGTTATATGGATTCACAGTATAAACCTAATATGTCAAAAAATGAATGTGTTAAACTTGTTGAAAATACATTGGCATTGGCAATGTC]
[+] EMBL BI515338 [ ATTGTTGCCGTTCTGGCTCTGCAGCAGACACTCAAGCTATTTCTGATATTGTTGCTTATCATTTAAGCCTTCACAAAATGGAATTAGGCATAGAACCTTTGGTAGAAACAGCAGCAAATGTATTCCGTGAATTATGTTACAATTATAGAGATTCCTTAATGGCAGGAATTTTAGTGGCAGGATGGGATAGTCGTAAAGGAGGTCAAGTTTATAGTGTACCTATAGGTGGCATGTGTGTAAGGCAACCAATTTCCATTGGAGGATCTGGTTCAACCTATGTATATGNNNATATGGATTCGCAGTATAAACCTAATATGTCAAAAAATGAATGTGTTAAACTTGTTGAAAATACATTGGCATTGGCAATGTC]
consensusID : consensus_308#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 472 fasta sequence
[TGAGTTTAATACATTTACACATTAATATGTTTTAAGACATCAATTATGGCTTGTGAATTTGATGGAGGAGTAGTAATTGGAGCAGATTCTAGAGCTACCACTGGGGCTTATATCTCAAATCGTTTTGCTGATAAATTAACTAAAATCACAGATTATATTTATTGTTGCCGTTCTGGCTCTGCAGCAGACACTCAAGCTATTTCTGATATTGTTGCTTATCATTTAAGCCTTCACAAAATGGAATTAGGCATAGAACCTTTGGTAGAAACAGCAGCAAATGTATTCCGTGAATTATGTTACAATTATAGAGATTCCTTAATGGCAGGAATTTTAGTGGCAGGATGGGATAGTCGTAAAGGAGGTCAAGTTTATAGTGTACCTATAGGTGGCATGTGTGTAAGGCAACCAATTTCCATTGGAGGATCTGGTTCAACCTATGTATATGGTTATATGGATTCACAGTATAAACCTA]
[+] EMBL BI511472 [TGAGTTTAATACATTTACACATTAATATGTTTTAAGACATCAATTATGGCTTGTGAATTTGATGGAGGAGTAGTAATTGGAGCAGATTCTAGAGCTACCACTGGGGCTTATATCTCAAATCGTTTTGCTGATAAATTAACTAAAATCACAGATTATATTTATTGTTGCCGTTCTGGCTCTGCAGCAGACACTCAAGCTATTTCTGATATTGTTGCTTATCATTTAAGCCTTCACAAAATGGAATTAGGCATAGAACCTTTGGTAGAAACAGCAGCAAATGTATTCCGTGAATTATGTTACAATTATAGAGATTCCTTAATGGCAGGAATTTTAGTGGCAGGATGGGATAGTCGTAAAGGAGGTCAAGTTTATAGTGTACCTATAGGTGGCATGTGTGTAAGGCAACCAATTTCCATTGGAGGATCTGGTTCAACCTATGTATATGGTTATATGGATTCACAGTATAAACCTA]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_308#0 TCAGTTACTGATAATTTAGTTCAAGATTGGGTTTCTTCTGAACAAAGTACAGGAACATCA 60
consensus_308#1 ---------------TGAGTTTAATAC--ATTTACACATTAATATGTTTTAAGA-CATCA 42
* **** ** * ** * * ** * * * ** *****
consensus_308#0 ATTATGGCTTGTGAATTTGATGGAGGAGTAGTAATTGGAGCAGATTCTAGAGCTACCACT 120
consensus_308#1 ATTATGGCTTGTGAATTTGATGGAGGAGTAGTAATTGGAGCAGATTCTAGAGCTACCACT 102
************************************************************
consensus_308#0 GGGGCTTATATCTCAAATCGTTTTGCTGATAAATTAACTAAAATCACAGATTATATTTAT 180
consensus_308#1 GGGGCTTATATCTCAAATCGTTTTGCTGATAAATTAACTAAAATCACAGATTATATTTAT 162
************************************************************
consensus_308#0 TGTTGCCGTTCTGGCTCTGCAGCAGACACTCAAGCTATTTCTGATATTGTTGCTTATCAT 240
consensus_308#1 TGTTGCCGTTCTGGCTCTGCAGCAGACACTCAAGCTATTTCTGATATTGTTGCTTATCAT 222
************************************************************
consensus_308#0 TTAAGCCTTCACAAAATGGAATTAGGCATAGAACCTTTGGTAGAAACAGCAGCAAATGTA 300
consensus_308#1 TTAAGCCTTCACAAAATGGAATTAGGCATAGAACCTTTGGTAGAAACAGCAGCAAATGTA 282
************************************************************
consensus_308#0 TTCCGTGAATTATGTTACAATTATAGAGATTCCTTAATGGCAGGAATTTTAGTGGCAGGA 360
consensus_308#1 TTCCGTGAATTATGTTACAATTATAGAGATTCCTTAATGGCAGGAATTTTAGTGGCAGGA 342
************************************************************
consensus_308#0 TGGGATAGTCGTAAAGGAGGTCAAGTTTATAGTGTACCTATAGGTGGCATGTGTGTAAGG 420
consensus_308#1 TGGGATAGTCGTAAAGGAGGTCAAGTTTATAGTGTACCTATAGGTGGCATGTGTGTAAGG 402
************************************************************
consensus_308#0 CAACCAATTTCCATTGGAGGATCTGGTTCAACCTATGTATATGNNNATATGGATTCGCAG 480
consensus_308#1 CAACCAATTTCCATTGGAGGATCTGGTTCAACCTATGTATATGGTTATATGGATTCACAG 462
******************************************* ********** ***
consensus_308#0 TATAAACCTAATATGTCAAAAAATGAATGTGTTAAACTTGTTGAAAATACATTGGCATTG 540
consensus_308#1 TATAAACCTA-------------------------------------------------- 472
**********
consensus_308#0 GCAATGTC 548
consensus_308#1 --------
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| Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |