Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 310 cluster # 310       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_310#0 length = 812 sequences # 5  

consensusID : consensus_310#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 812
fasta sequence
                              [TCGCTTAAAAAGATAGTCTTTTGAATAAACATATAAATATATTGAAATTCAAAAAAATAAAATAAATATAAATTTAAATTTTTTGAAATTGTTTAAACGTAATTTTATGCAAGAAAAACAATGAAGCATTTTTTAATCATTTTCACACTGATGTTGTACTTCACCATCATATATGGTCAATCCAGATATGAATATAGATATGAACCATTTGTTGAGAAACCAGGTTCCTGCCCACCACCATTACCAGTGGATATTTGTAGTCAATCTTGTTTCTCTGATTCACATTGCTTAGGAATTGGTAAATGTTGTCCTACTAATTGTGGAGGCTTTGTTTGCACAAAACCTGTGACTATGAGGAAAACTTCTAAGGAAAAACCAGGTTCCTGTCCAGCAATACCTAAAGGAAGATGGATATGTTCATCAACTTGCAGTGTTGACAGTGATTGCAGAAGTACAATGAAATGTTGTAAGAATCGTTGTGGAGCTATGGCCTGTCAAAAACCAGATATCCAAGAATCTATGGACATCCCAGTTATTCCACTGCCAGAAGATTCTTATGATATTTCCAGAAATGTCAATCCCAGAGTCAATCCAAATAATTATCCTTATTATTTTTATAATAATTAGTAAAAATAATTGCAAATCATGCTAAAGCATTAATATGAAAATATAATTTTTGTTTATCATTATATTAATAAAATATTCTGTGCCATATCTATTATACCAAAAATAAATAATTGTATATTTATACTATTTAATAAAAAATTTGTATTTTCATGTTAATTAATAAAATTTTAAATTTAAAAAAAAAA]

[+] EMBL BI506196             [TCGCTTAAAAAGATAGTCTTTTGAATAAACATATAAATATATTGAAATTCAAAAAAATAAAATAAATATAAATTTAAATTTTTTGAAATTGTTTAAACGTAATTTTATGCAAGAAAAACAATGAAGCATTTTTTAATCATTTTCACACTGATGTTGTACTTCACCATTATATATGGTCAATCCAGATATGAATATAGATATGAACCATTTGTTGAGAAACCAGGTTCCTGCCCACCACCATTGCCAGTGGATATTTGTAGTCAATCTTGTTTCTCTGATTCACATTGCTTNNNAATTGGCAAATGTTGTCCTACTAATTGTGGAGGCTTTGTTTGCACAAAACCTGTGACTATGAGGAAAATTTCTAAAGAAAAACCAGGTTCCTGTCCAGCAATACCTAAAGGAAGATGGATATGTTCATCAACTTGCAGTGTTGACAGTGATTGCAGAAGTACAATGAAATGTTGTAAGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI511087             [                                                                                                                                                           GTACTTCACCATCATATATGGTCAATCCAGATATGAATATAGATATGAACCATTTGTTGAGAAACCAGGTTCCTGCCCACCACCATTACCAGTGGATATTTGTAGTCAATCTTGTTTCTCTGATTCACATTGCTTAGGAATTGGTAAATGTTGTCCTACTAATTGTGGAGGCTTTGTTTGCACAAAACCTGTGACTATGAGGAAAACTTCTAAGGAAAAACCAGGTTCCTGTCCAGCAATACCTAAAGGAAGATGGATATGTTCATCAACTTGCAGTGTTGACAGTGATTGCAGAAGTACAATGAAATGTTGTAAGAATCGTTGTGGAGCTATGGCCTGTCAAAAACCAGATATCCAAGAATCTATGGACATCCCAGTTATTCCACTGCCAGAAGATTCTTATGATATTTCCAGAAATGTCAATCCCAGAGTCAATCCAAATAATTATCCTTATTATTTTTATAATA                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BI514213             [                                                                                                                                                                             TGGTCAATCCAGATATGAATATAGATATGAACCATTTGTTGAGAAACCAGGTTCCTGCCCACCACCATTACCAGTGGATATTTGTAGTCAATCTTGTTTCTCTGATTCACATTGCTTAGGAATTGGTAAATGTTGTCCTACTAATTGTGGAGGCTTTGTTTGCACAAAACCTGTGACTATGAGGAAAACTTCTAAGGAAAAACCAGGTTCCTGTCCAGCAATACCTAAAGGAAGATGGATATGTTCATCAACTTGCAGTGTTGACAGTGATTGCAGAAGTACAATGAAATGTTGTAAGAATCGTTGTGGAGCTATGGCCTGTCAAAAACCAGATATCCAAGAATCTATGGACATCCCAGTTATTCCACTGCCAGAAGATTCTTATGATATTTCCAGAAATGTCAATCCCAGAGTCAATCCAAATAATTATCCTTATTATTTTTATAATAATTAGTAAAAATAATTGCAAATCATGCTAAAGCATTAATAT                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BI507906             [                                                                                                                                                                                                     ATATGAACCATTTGTTGAGAAACCAGGTTCCTGCCCACCACCATTGCCAGTGGATATTTGTAGTCAATCTTGTTTCTCTGATTCACATTGCTTAGGAATTGGCAAATGTTGTCCTACTAATTGTGGAGGCTTTGTTTGCACAAAACCTGTGACTATGAGGAAAATTTCTAAAGAAAAACCAGGTTCCNNNNNNNCAATACCTAAAGGAAGATGGATATGTTCATCAACTTGCAGTGTTGACAGTGATTGCAGAAGTACAATGAAATGTTGTAAGAATCGTTGTGGAGCTATGGCCTGTCAAAAACCAGATATCCAAGAATCTATGGACATCCCAGTTATTCCACTGCCAGAAGATTCTTATGATATTTCCAGAAATGTCAATCCCAGAGTCAATCCAAATAATTACCCTTATTATTTTTATAATAATTAGTAAAAATAATTGCAAATCATGCTAAAGCATTAATATGAAAATATAATTTTTGTTTATCATTATATTAATAAAATATTCTGTGCCATATCTATTATACCAAAAATAAATAATTGTATATTTATACTATTTAATAATAAAT                                              ]
[+] EMBL BI510230             [                                                                                                                                                                                                                                            ACCATTACCAGTGGATATTTGTAGTCAATCTTGTTTCTCTGATTCACATTGCTTANNAATTGGTAAATGTTGTCCTACTAATTGTGGAGGCTTTGTTTGCACAAAACCTGTGACTATGAGGAAAACTTCTAAGGAAAAACCAGGTTCCTGTCCAGCAATACCTAAAGGAAGATGGATATGTTCATCAACTTGCAGTGTTGACAGTGATTGCAGAAGTACAATGAAATGTTGTAAGAATCGTTGTGGAGCTATGGCCTGTCAAAAACCAGATATCCAAGAATCTATGGACATCCCAGTTATTCCACTGCCAGAAGATTCTTATGATATTTCCAGAAATGTCAATCCCAGAGTCAATCCAAATAATTATCCTTATTATTTTTATAATAATTAGTAAAAATAATTGCAAATCATGCTAAAGCATTAATATGAAAATATAATTTTTGTTTATCATTATATTAATAAAATATTCTGTGCCATATCTATTATACCAAAAATAAATAATTGTATATTTATACTATTTAATAAAAAATTTGTATTTTCATGTTAATTAATAAAATTTTAAATTTAAAAAAAAAA]


>consensus_310#0 TCGCTTAAAAAGATAGTCTTTTGAATAAACATATAAATATATTGAAATTCAAAAAAATAA AATAAATATAAATTTAAATTTTTTGAAATTGTTTAAACGTAATTTTATGCAAGAAAAACA ATGAAGCATTTTTTAATCATTTTCACACTGATGTTGTACTTCACCATCATATATGGTCAA TCCAGATATGAATATAGATATGAACCATTTGTTGAGAAACCAGGTTCCTGCCCACCACCA TTACCAGTGGATATTTGTAGTCAATCTTGTTTCTCTGATTCACATTGCTTAGGAATTGGT AAATGTTGTCCTACTAATTGTGGAGGCTTTGTTTGCACAAAACCTGTGACTATGAGGAAA ACTTCTAAGGAAAAACCAGGTTCCTGTCCAGCAATACCTAAAGGAAGATGGATATGTTCA TCAACTTGCAGTGTTGACAGTGATTGCAGAAGTACAATGAAATGTTGTAAGAATCGTTGT GGAGCTATGGCCTGTCAAAAACCAGATATCCAAGAATCTATGGACATCCCAGTTATTCCA CTGCCAGAAGATTCTTATGATATTTCCAGAAATGTCAATCCCAGAGTCAATCCAAATAAT TATCCTTATTATTTTTATAATAATTAGTAAAAATAATTGCAAATCATGCTAAAGCATTAA TATGAAAATATAATTTTTGTTTATCATTATATTAATAAAATATTCTGTGCCATATCTATT ATACCAAAAATAAATAATTGTATATTTATACTATTTAATAAAAAATTTGTATTTTCATGT TAATTAATAAAATTTTAAATTTAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)