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Apis mellifera
cluster # 314 cluster # 314       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_314#0 length = 689 sequences # 5  

consensusID : consensus_314#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 689
fasta sequence
                              [CGTTATCACCGAGAATTGGAAGAACATTTTAAACGTCTTAGTACTAGAGATGATTTTTGGAAACCACCACCAATGCCATCCTTCAATGAATTTTTCCAACCATGGAGGAATATGATGGAACAATTGGAACATCAAGTTGGAGGTTCGACCACCATTGAACGAGATCAAAACAAATATCAAGTAATTGTTGATGTGCAACAATTTGCACCAGAAGAAATCACCGTCAGAACCGATGATAAATGTATTACCATTGAGGGGAAACACGAAGAGAAAAAAGATGAACATGGTTACGTATCGAGGCATTTTGTGCGTCGATATGTGCTTCCACAAGGATATGATATTGGCCACGTTAAACCAAGTTTGTCATCTGATGGTATTCTTACTATTACTGCTCCAAGATTAGCTCTGCCAGCACCTGGAGAAAGAATTATACCGATCGAACGAAGTAATGCACCAGCTATTAAGGCAGCATAATTTGTAAATAATATCGTCTAATAGATTCTTATATATTTAAGATTCGTTATATACAATTTATTTTTTTAACTTTTCTTTCTGCGTATACTTCGAAATTGTTCGTTTATTAATTTATTAATTATTAATTGTCAATAACAAATAGTC--ATATATATATGTGGAACTGATAATTTAATTACATTATATTTTTAACTCTTTAGATATATAAGATTATATTA]

[+] EMBL BI507793             [CGTTATCACCGAGAATTGGAAGAACATTTTAAACGTCTTAGTACTAGAGATGATTTTTGGAAACCACCACCAATGCCATCCTTCAATGAATTTTTCCAACCATGGAGGAATATGATGGAACAATTGGAACATCAAGTTGGAGGTTCGACCACCATTGAACGAGATCAAAACAAATATCAAGTAATTGTTGATGTGCAACAATTTGCACCAGAAGAAATCACCGTCAGAACCGATGATAAATGTATTACCATTGAGGGGAAACACGAAGAGAAAAAAGATGAACATGGTTACGTATCGAGGCATTTTGTGCGTCGATATGTGCTTCCACAAGGATATGATATTGGCCGCGTTAAACCAAGTTTGTCATCTGATGGTATTCTTACTATTACTGCTCCAAGATTAGCTCTGCCAGCACCTGGAGAAAGAATTATACCGATCGAACGAAGTAATGCACCAGCTATTAAGGCAGCATAATTTGTAAATAATATTGTCTAATAGATTCTTATATATTTAAGATTCGTTATATACAATTTATTTTTTTAACTTTTCTTTCTGCGTATACTTCGAAATTNNNCGTTTATTAATTTATTAATTATTAATTGTCAATAACAAATAGTC  ATATATATATGTGGAACTGATAATTTAATTA                                        ]
[+] EMBL BI509249             [     TCACCGAGAATTGGAAGAACATTTTAAACGTCTTAGTACTAGAGATGATTTTTGGAAACCACCACCAATGCCATCCTTCAATGAATTTTTCCAACCATGGAGGAATATGATGGAACAATTGGAACATCAAGTTGGAGGTTCGACCACCATTGAACGAGATCAAAACAAATATCAAGTAATTGTTGATGTGCAACAATTTGCACCAGAAGAAATCACCGTCAGAACCGATGATAAATGTATTACCATTGAGGGGAAACACGAAGAGAAAAAAGATGAACATGGTTACGTATCGAGGCATTTTGTGCGTCGATATGTGCTTCCACAAGGATATGATATTGGCCACGTTAAACCAAGTTTGTCATCTGATGGTATTCTTACTATTACTGCTCCAAGATTAGCTCTGCCAGCACCTGGAGAAAGAATTATACCGATCGAACGAAGTAATGCACCAGCTATTAAGGCAGCATAATTTGTAAATAATATCGTCTAATAGATTCTTATATATTTAAGATTCGTTATATACAATTTATTTTTTTAACTTTTCTTTCTGCGTATACTTCGAAATTGTTCGTTTATTAATTTATTAATTATTAATTGTTAATAACAAATAGTCATATATATATATGTGGAACTGATAATTTAATTACATTATATTTTTAACTCTTTAG                  ]
[+] EMBL BI504166             [         CGAGAATTGGAAGAACATTTTAAACGTCTTAGTACTAGAGATGATTTTTGGAAACCACCACCAATGCCATCCTTCAATGAATTTTTCCAACCATGGAGGAATATGATGGAACAATTGGAACATCAAGTTGGAGGTTCGACCACCATTGAACGAGATCAAAACAAATATCAAGTAATT TTGATGTGCAACAATTTGCACCAGAAGAAATCACCGTCAGAACCGATGATAAATGTATTACCATTGAGGGGAAACACGAAGAGAAAAAAGATGAACATGGTTACGTATCGAGGCATTTTGTGCGTCGATATGTGCTTCCACAAGGATATGATATTGGCCACGTTAAACCAAGTTTGTCATCTGATGGTATTCTTACTATTACTGCTCCAAGATTAGCTCTGCCAGCACCTGGAGAAAGAATTATACCGATCGAACGAAGTAATGCACCAGCTATTAAGGCAGCATAATTTGTAAATAATATCGTCTAATAGATTCTTATATATTTAAGNTTCGTTATATACAATTTATTTTTTTAACTTTTCTTTC                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BI504164             [            GAATTGGAAGAACATTTTAAACGTCTTAGTACTAGAGATGATTTTTGGAAACCACCACCAATGCCATCCTTCAATGAATTTTTCCAACCATGGAGGAATATGATGGAACAATTGGAACATCAAGTTGGAGGTTCGACCACCATTGAACGAGATCAAAACAAATATCAAGTAATTGTTGATGTGCAACAATTTGCACCAGAAGAAATCACCGTCAGAACCGATGATAAATGTATTACCATTGAGGGGAAACACGAAGAGAAAAAAGATGAACATGGTTACGTATCGAGGCATTTTGTGCGTCGATATGTGCTTCCACAAGGATATGATATTGGCCACGTTAAACCAAGTTTGTCATCTGATGGTATTCTTACTATTACTGCTCCAAGATTAGNTCTGCCAGCACCTGGAGAAAGAATTATACCGATCGAACGAAGTAATGCACCAGCTATTAAGGCAGCATAATTTGTAAATAATATCGTCTAATAGATTCTTATATATTTAAGATTCGTNATATACAATTTATTTTTTTAACTTTTCTTTCTGCGTATA                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BI504112             [                         ATTTTAAACGTCTTAGTACTAGAGATGATTTTTGGAAACCACCACCAATGCCATCCTTCAATGAATTTTTCCAACCATGGAGGAATATGATGGAACAATTGGAACATCAAGTTGGAGGTTCGACCACCATTGAACGAGATCAAAACAAATATCAAGTAATTGTTGATGTGCAACAATTTGCACCAGAAGAAATCACCGTCAGAACCGATGATAAATGTATTACCATTGAGGGGAAACACGAAGAGAAAAAAGATGAACATGGTTACGTATCGAGGCATTTTGTGCGTCGATATGTGCTTCCACAAGGATATGATATTGGCCACGTTAAACCAAGTTTGTCATCTGATGGTATTCTTACTATTACTGCTCCAAGATTAGCTCTGCCAGCACCTGGAGAAAGAATTATACCGATCGAACGAAGTAATGCACCAGCTATTAAGGCAGCATAATTTGTAAATAATATTGTCTAATAGATTCTTATATATTTAAGATTCGTTATATACAATTTATTTTTTTAACTTTTCTTTCTGCGTATACTTCGAAATTGTTCGTTTATTAATTTATTAATTATTAATTGTCAATAACAAATAGTC  ATATATATATGTGGAACTGATAATTTAATTACATTATATTTTTAACTCTTTAGATATATAAGATTATATTA]


>consensus_314#0 CGTTATCACCGAGAATTGGAAGAACATTTTAAACGTCTTAGTACTAGAGATGATTTTTGG AAACCACCACCAATGCCATCCTTCAATGAATTTTTCCAACCATGGAGGAATATGATGGAA CAATTGGAACATCAAGTTGGAGGTTCGACCACCATTGAACGAGATCAAAACAAATATCAA GTAATTGTTGATGTGCAACAATTTGCACCAGAAGAAATCACCGTCAGAACCGATGATAAA TGTATTACCATTGAGGGGAAACACGAAGAGAAAAAAGATGAACATGGTTACGTATCGAGG CATTTTGTGCGTCGATATGTGCTTCCACAAGGATATGATATTGGCCACGTTAAACCAAGT TTGTCATCTGATGGTATTCTTACTATTACTGCTCCAAGATTAGCTCTGCCAGCACCTGGA GAAAGAATTATACCGATCGAACGAAGTAATGCACCAGCTATTAAGGCAGCATAATTTGTA AATAATATCGTCTAATAGATTCTTATATATTTAAGATTCGTTATATACAATTTATTTTTT TAACTTTTCTTTCTGCGTATACTTCGAAATTGTTCGTTTATTAATTTATTAATTATTAAT TGTCAATAACAAATAGTCATATATATATGTGGAACTGATAATTTAATTACATTATATTTT TAACTCTTTAGATATATAAGATTATATTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)