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Apis mellifera
cluster # 384 cluster # 384       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_384#0 length = 918 sequences # 4  

consensusID : consensus_384#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 918
fasta sequence
                              [TTTTTTTTAGAAGTTTATTATTTTTATTTTAAATTTTATATTTCATTTTATTTATGAAAAACTATAAGATATTTGAGAATCTTTAACCTAAATTCTAAATTTTAAATATAAAATCAAATGAAGAATCAAATTCAGTGAAATCTAGTTAGCTTCGATAATACCACAAGCCCAACGATCTCCCGAGTTTCCAGTGGTTGTAGAAAGACTACTGTTCCCTTTTCCTAAATCATCTTCATCAGAATGAACAACTATTGCACGTCCAAGAATATTATTCTTTCCAGTCAAAGAAATAATGAAATCTTTGATGTGTACATCTGCTTCACCTTTAGCGTTTGCTCGAATATTACCTAAATCGCCAACATGTCTTATTGGACTATCTTGTCCACCATGGGTAACATTCTCAGGATTAAAATGTGGGCCAGTAGATGTGCAACCATTTCGTAAATCTCCTTTTTCATGTACATGGAAACCATGTAACCCTTCTGTAAGTCCACTTATTTTTCCAGTAATATGAACAGAATTATCATCATTTTGAACAATAGTTAGTTTACCCGTTACATTTCTTATTTGGGCATTATGAGGTATCAAGTTGACATTTGCAGTTTTTTTCTTCTCAGTCTCAGTGACAGATTCGACAATTAGAATTCCAAGTAGTAATACAATTATTCTATTCATAATGAATGTTATAATAAAATATTAAAATTAACAATTTAAACAAAAATTTATAAATGTAATATAAATTTATATTATTATTTATAAATTTTAATAATTTTTTAAATCAAATTTTGAAATAAAATTATTATAATTGTATTAATTGTAAAATTATATAAAATTATTATAATTTTTTTTATAAATTATTAAATAGCAAAATTATTAAAAATGTAATAGTTATAAATCAAAAAAAAGTTTTCAACCTCG]

[+] EMBL BI505217             [TTTTTTTTAGAAGTTTATTATTTTTATTTTAAATTTTATATTTCATTTTATTTATGAAAAACTATAAGATATTTGAGAATCTTTAACCTAAATTCTAAATTTTAAATATAAAATCAAATGAAGAATCAAATTCAGTGAAATCTAGTTAGCTTCGATAATACCACAAGCCCAACGATCTCCCGAGTTTGCAGTGGTTGTAGAAAGACTACTGGTCCCTTTTCCTAAATCATCTTCATCAGAATGAACAACTATTGCACGTCCAAGAATATTATTCTTTCCAGTCAAAGAAATAATGAAATTTTTGATGTGTACATCTGCTTCACCTTTAGCGTTTGCTCGAATATTACCTAAATCGCCAACATGTCTTATTGGACTATCTTGTCCACCATGGGTAACATTCTCAGGATTAAAATNNNGGCCAGTAGATGTGCAACCATTTCGTAAATCTCCTTTTTCATGTACATGGAAACCATGNNACCCTTCTGTAAGTCCACTTATTTTTCCAGTAATATGAACAGAATTATCATCATTTTGAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI503925             [                                                            ACTATAAGATATTTGAGAATCTTTAACCTAAATTCTAAATTTTAAATATAAAATCAAATGAAGAATCAAATTCAGTGAAATCTAGTTAGCTTCGATAATACCACAAGCCCAACGATCTCCCGAGTTTCCAGTGGTTGTAGAAAGACTACTGTTCCCTTTTCCTAAATCATCTTCATCAGAATGAACAACTATTGCACGTCCAAGAATATTATTCTTTCCAGTCAAAGAAATAATGAAATCTTTGATGTGTACATCTGCTTCACCTTTAGCGTTTGCTCGAATATTACCTAAATCGCCAACATGTCTTATTGGACTATTTTGTCCACCATGGGTAACATTCTCAGGATTAAAATGTGGGCCAGTAGATGTGCAACCATTTCGTAAATCTCCTTTTTCATGTACATGGAAACCATGTAACCCTTCTGTAAGTCCACTTATTTTTCCAGTAATATGAACAGAATTATCATCATTTTGAACAATAGTTAGTTTACCCGTTACATTTCTTATTTGGGCATTATGAGGTATCAAGTTGACATTTGCAGTTTTTTTCTTCTCAGTCTCAGTGACAGATTCGACAATTAGAATTCCAAGTAGTAATACA                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BI510600             [                                                                    ATATTTGAGAATCTTTAACCTAAATTCTAAATTTTAAATATAAAATCAAATGAAGAATCAAATTCAGTGAAATCTAGTTAGCTTCGATAATACCACAAGCCCAACGATCTCCCGAGTTTCCAGTGGTTGTAGAAAGACTACTGTTCCCTTTTCCTAAATCATCTTCATCAGAATGAACAACTATTGCACGTCCAAGAATATTATTCTTTCCAGTCAAAGAAATAATGAAATCTTTGATGTGTACATCTGCTTCACCTTTAGCGTTTGCTCGAATATTACCTAAATCGCCAACATGTCTTATTGGACTATCTTGTCCACCATGGGTAACATTCTCAGGATTAAAATGTGGGCCAGTAGATGTGCAACCATTTCGTAAATCTCCTTTTTCATGTACATGGAAACCATGTAACCCTTCTGTAAGTCCACTTATTTTTCCAGTAATATGAACAGAATTATCATCATTTTGAACAATAGTTAGTTTACCCGTTACATTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL BI512178             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTTTCCAGTAATATGAACAGAATTATCATCATTTTGAACAATAGTTAGTTTACCCGTTACATTTCTTATTTGGGCATTATGAGGTATCAAGTTGACATTTGCAGTTTTTTTCTTCTCAGTCTCAGTGACAGATTCGACAATTAGAATTCCAAGTAGTAATACAATTATTCTATTCATAATGAATGTTATAATAAAATATTAAAATTAACAATTTAAACAAAAATTTATAAATGTAATATAAATTTATATTATTATTTATAAATTTTAATAATTTTTTAAATCAAATTTTGAAATAAAATTATTATAATTGTATTAATTGTAAAATTATATAAAATTATTATAATTTTTTTTATAAATTATTAAATAGCAAAATTATTAAAAATGTAATAGTTATAAATCAAAAAAAAGTTTTCAACCTCG]


>consensus_384#0 TTTTTTTTAGAAGTTTATTATTTTTATTTTAAATTTTATATTTCATTTTATTTATGAAAA ACTATAAGATATTTGAGAATCTTTAACCTAAATTCTAAATTTTAAATATAAAATCAAATG AAGAATCAAATTCAGTGAAATCTAGTTAGCTTCGATAATACCACAAGCCCAACGATCTCC CGAGTTTCCAGTGGTTGTAGAAAGACTACTGTTCCCTTTTCCTAAATCATCTTCATCAGA ATGAACAACTATTGCACGTCCAAGAATATTATTCTTTCCAGTCAAAGAAATAATGAAATC TTTGATGTGTACATCTGCTTCACCTTTAGCGTTTGCTCGAATATTACCTAAATCGCCAAC ATGTCTTATTGGACTATCTTGTCCACCATGGGTAACATTCTCAGGATTAAAATGTGGGCC AGTAGATGTGCAACCATTTCGTAAATCTCCTTTTTCATGTACATGGAAACCATGTAACCC TTCTGTAAGTCCACTTATTTTTCCAGTAATATGAACAGAATTATCATCATTTTGAACAAT AGTTAGTTTACCCGTTACATTTCTTATTTGGGCATTATGAGGTATCAAGTTGACATTTGC AGTTTTTTTCTTCTCAGTCTCAGTGACAGATTCGACAATTAGAATTCCAAGTAGTAATAC AATTATTCTATTCATAATGAATGTTATAATAAAATATTAAAATTAACAATTTAAACAAAA ATTTATAAATGTAATATAAATTTATATTATTATTTATAAATTTTAATAATTTTTTAAATC AAATTTTGAAATAAAATTATTATAATTGTATTAATTGTAAAATTATATAAAATTATTATA ATTTTTTTTATAAATTATTAAATAGCAAAATTATTAAAAATGTAATAGTTATAAATCAAA AAAAAGTTTTCAACCTCG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)