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Apis mellifera
cluster # 598 cluster # 598       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_598#0 length = 822 sequences # 4  

consensusID : consensus_598#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 822
fasta sequence
                              [ATGTTTTTTCTAAATGTTACGCTTTTCTTTTATACAAAAAATATTTTTTTCTGTATCAAAACAAATTATTTTATTGTTACGATGTATTAATTTAATTTTTATCTATATTAATGTTAAAAATAATTTCTTAATTATTTAAATTAAAATATTAATATTAATTTATATTACTCAAGTCATCTTCACCAGAAGTGATAATGGAACGAGATGTATTTCTCTATCGTGCATATATAGCACAAAGAAAATTCCGTGTTGTGCTAGATGAAATTAATAATTCTTCTCCTCCTGACTTACAACCATTGAAGATGTTGGCAGACTATTTTGCAAATCCATGTCGCAGAGAAGCGATTGTCGCAGAATTGCAACAAGCGACTAATCGCACTAATTATGATAATCACAATTTTCTGATTGTTGCTGCAACTATCTATTATCATGAAAAAAACTTAGAAGCAGCACTTAGGATACTTCGTAATGTAGATCATCTAGAATGTTTAGCCTTAACTCTGCAAATTTATTTAAAAATGGATCGATTGGATCTTGCAAAGAAAGAATTAGTTACTATGCAGGAGAAAGATGATGATGCTACTCTAACTCAGTTGGCACAAGCATGGTTAAATATAAGCAGTGNNGGAGATAAGTTACAAGATGCTTATTATATATTTCAAGATATGATAGATAAACATTCCAGTACAAGTATGTTATTAAATGGTCAAGCTACTTGTTTTATTGGACAAGCTAAATATGAAGAAGCTGAAACAGCTTTACAAGAATCTTTGGATAAAGATAGTAATAATCCAGATACTTTAATCAATATGATTGTACTTT]

[+] EMBL BI505961             [ATGTTTTTTCTAAATGTTACGCTTTTCTTTTATACAAAAAATATTTTTTTCTGTATCAAAACAAATTATTTTATTGTTACGATGTATTAATTTAATTTTTATCTATATTAATGTTAAAAATAATTTCTTAATTATTTAAATTAAAATATTAATATTAATTTATATTACTGTAGTCATCTTCACCAGAAGTGATAATGGAACGAGATGTATTTCTCTATCGTGCATATATAGCACAAAGAAAATTCCGTGTTGTGCTAGATGAAATTAATAATTCTTCTCCTCCTGACTTACAACCATTGAAGATGTTGGCAGACTATTTTGCAAATCCATGTCGCAGAGAAGCGATTGTCGCAGAATTGCAACAAGCGACTAATCGCACTAATTATGATAATCACAATTTTCTGATTGTTGCTGCAACTATCTATTATCATGAAAAAAACTTAGAAGCAGCACTTNNNATACTTCGTAATGTAGATCATCTAGAATGTTTAGCCTTAACTCTGCAAATTTATTTAAAAATGGATCGATTGGATCTTGCAAAGAAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BI506167             [                                                                                                                                                                         CAAGTCATCTTCACCAGAAGTGATAATGGAACGAGATGTATTTCTCTATCGTTCATATATAGCACAAAGAAAATTCCGTGTTGTGCTAGATGAAATTAATAATTCTTCTCCTCCTGACTTACAACCATTGAAGATGTTGGCAGACTATTTTGCAAATCCATGTCGCAGAGAAGCGATTGTCGCAGAATTGCAACAAGCGACTAATCGCACTAATTATGATAATCACAATTTTCTGATTGTTGCTGCAACTATCTATTATCATGAAAAAAACTTAGAAGCAGCACTTAGGATACTTCGTAATGTAGATCATCTAGAATGTTTAGCCTTAACTCTGCAAATTTATTTAAAAATGGATCGATTGGATCTTGCAAAGAAAGAATTAGTTACTATGCAGGAGAAAGATGATGATGCTACTCTAACTCAGTTGGCACAAGCATGGTTAAATATAAGCAGTGGTGGAGATAAGTTACAAGATGCTTATTATATATTTCAAGATATGATAGATAAACATTCCAGTACAAGTATGTTATTAAATGGTCAAGCTACTTGTTTTATTGGACAAGCTAAATATGAAGAAGCTGAAACAGCTTTACAAGAATCTTTGGATAAAGATAGTAATAATCCAGATACTTTAATCAATATGATTGTACTTT]
[+] EMBL BI512590             [                                                                                                                                                                         CAAGTCATCTTCACCAGAAGTGATAATGGAACGAGATGTATTTCTCTATCGTGCATATATAGCACAAAGAAAATTCCGTGTTGTGCTAGATGAAATTAATAATTCTTCTCCTCCTGACTTACAACCATTGAAGATGTTGGCAGACTATTTTGCAAATCCATGTCGCAGAGAAGCGATTGTCGCAGAATTGCAACAAGCGACTAATCGCACTAATTATGATAATCACAATTTTCTGATTGTTGCTGCAACTATCTATTATCATGAAAAAAACTTAGAAGCAGCACTTAGGATACTTCGTAATGTAGATCATCTAGAATGTTTAGCCTTAACTCTGCAAATTTATTTAAAAATGGATCGATTGGATCTTGCAAAGAAAGAATTAGTTACTATGCAGGAGAAAGATGATGATGCTACTCTAACTCAGTTGGCACAAGCATGGTTAAATATAAGCAGTGNNGGAGATAAGTTACAAGATGCTTATTATATATTTCAAGAT                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BI512006             [                                                                                                                                                                                TCTTCACCAGAAGTGATAATGGAACGAGATGTATTTCTCTATCGTGCATATATAGCACAAAGAAAATTCCGTGTTGTGCTAGATGAAATTAATAATTCTTCTCCTCCTGACTTACAACCATTGAAGATGTTGGCAGACTATTTTGCAAATCCATGTCGCAGAGAAGCGATTGTCGCAGAATTGCAACAAGCGACTAATCGCACTAATTATGATAATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]


>consensus_598#0 ATGTTTTTTCTAAATGTTACGCTTTTCTTTTATACAAAAAATATTTTTTTCTGTATCAAA ACAAATTATTTTATTGTTACGATGTATTAATTTAATTTTTATCTATATTAATGTTAAAAA TAATTTCTTAATTATTTAAATTAAAATATTAATATTAATTTATATTACTCAAGTCATCTT CACCAGAAGTGATAATGGAACGAGATGTATTTCTCTATCGTGCATATATAGCACAAAGAA AATTCCGTGTTGTGCTAGATGAAATTAATAATTCTTCTCCTCCTGACTTACAACCATTGA AGATGTTGGCAGACTATTTTGCAAATCCATGTCGCAGAGAAGCGATTGTCGCAGAATTGC AACAAGCGACTAATCGCACTAATTATGATAATCACAATTTTCTGATTGTTGCTGCAACTA TCTATTATCATGAAAAAAACTTAGAAGCAGCACTTAGGATACTTCGTAATGTAGATCATC TAGAATGTTTAGCCTTAACTCTGCAAATTTATTTAAAAATGGATCGATTGGATCTTGCAA AGAAAGAATTAGTTACTATGCAGGAGAAAGATGATGATGCTACTCTAACTCAGTTGGCAC AAGCATGGTTAAATATAAGCAGTGNNGGAGATAAGTTACAAGATGCTTATTATATATTTC AAGATATGATAGATAAACATTCCAGTACAAGTATGTTATTAAATGGTCAAGCTACTTGTT TTATTGGACAAGCTAAATATGAAGAAGCTGAAACAGCTTTACAAGAATCTTTGGATAAAG ATAGTAATAATCCAGATACTTTAATCAATATGATTGTACTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)