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Apis mellifera
cluster # 748 cluster # 748       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_748#0 length = 822 sequences # 3  

consensusID : consensus_748#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 822
fasta sequence
                              [TTATTTAACTATAAAATTTAGTGTGAAAGTTTCATTATAGTTTTTCAGAAATGAATTAATATAGTTAATGTTTTGAAGTTTTTAAAAAAATCTAATGTCAGTTTTTATTAGTTCTTGTGCTTGTGAATACACATCAATACTGTGTAACATGTCTATAAACAGTTCTTGTTGGTGTTACTTGATACAATTTTGATACATTATAGCAAGAATTGTAATACTTTATTATAATTGTACAAACATGGGTCGTTACACTGGAAAAAAATGTCGTTTATTAACGATGTTATGGCTCACTGCTCTATTTTTCTTAGTAGAAATAGTTGTGGGATATGTGACTAACTGTATGGCTTTAATAGCTGACAGTTTTCATATGTTATCTGATGTAGCAGCTTTGGTCGTTGCATTTCTTTCTGTAAAGATGTCACCAAAGAAATGGTCT-AAGAATACATTT-GGTTGGG-CCAGAGCTGAAGTTTTAGGAGCTTTGGTAAACGCCGTTTTTTTAGTCGCATTGTGTTTCAGTATTACAGTGGAAGCATGTAAAAGATTTATCGAAGTAGAAGAAATACATGAAGCTAAATTGCTTGTGGCAGTTGGAGCTCTTGGTTTATTAGTAAATATTATTGGATTGTGCTTGTTTCATGAACA-AGAAGTTCTCATGCACATTCACATGGCATATCTCGAAGTCACAATCGATTAAGTACTCTNNTTGGAACAGATGACAATGAAAATGATGAATCTTATAGGCCAGCGACGCCGCAAGTAAAAAGAACACATGGTCATACACATGATGCGAGTCAAATGAATATGCGTGGTGTATTTCTTCAT]

[+] EMBL BI946438             [TTATTTAACTATAAAATTTAGTGTGAAAGTTTCATTATAGTTTTTCAGAAATGAATTAATATAGTTAATGTTTTGAAGTTTTTAAAAAAATCTAATGTCAGTTTTTATTAGTTCTTGTGCTTGTGAATACACATCAATACTGTGTAACATGTCTATAAACAGTTCTTGTTGGTGTTACTTGATACAATTTTGATACATTATAGCAAGAATTGTAATACTTTATTATAATTGTACAAACATGGGTCGTTACACTGGAAAAAAATGTCGTTTATTAACGATGTTATGGCTCACTGCTCTATTTTTCTTAGTAGAAATAGTTGTGGGATATGTGACTAACTGTATGGCTTTAATAGCTGACAGTTCTCATATGTTATCTGATGTAGCAGCTTTGGTCGTTGCATTTCTTTCTGTAAAGATGTCACCAAAGAAATGGTCTAAAGAATACATTTCGGTTGGGCCCAGAGCTGAAGTTTTAGGAGCTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BI504360             [                                                                                                                                                                   TCTTGTTGGTGTTACTTGATACAATTTTGATACATTATAGCAAGAATTGTAATACTTTATTATAATTGTACAAACATGGGTCGTTACACTGGAAAAAAATGTCGTTTATTAACGATGTTATGGCTCACTGCTCTATTTTTCTTAGTAGAAATAGTTGTGGGATATGTGACTAACTGTATGGCTTTAATAGCTGACAGTTTTCATATGTTATCTGATGTAGCAGCTTTGGTCGTTGCATTTCTTTCTGTAAAGATGTCACCAAAGAAATGGTCT AAGAATACATTT GGTTGGG CCAGAGCTGAAGTTTTAGGAGCTTTGGTAAACGCCGTTTTTTTAGTCGCATTGTGTTTCAGTATTACAGTGGAAGCATGTAAAAGATTTATCGAAGTAGAAGAAATACATGAAGCTAAATTGCTTGTGGCAGTTGGAGCTCTTGGTTTATTAGTAAATATTATTGGATTGTGCTTGTTTCATGAACATAGAAGTTCTCATGCACATTCACATGGCATATCTCGAAGTCACAATCGATTAAGTACTCTNNTTGGAACAGATGACAATGAAAATGATGAATCTTATAGGCCAG                                                                             ]
[+] EMBL BI509782             [                                                                                                                                                                     TTGTTGGTGTTACTTGATACAATTTTGATACATTATAGCAAGAATTGTAATACTTTATTATAATTGTACAAACATGGGTCGTTACACTGGAAAAAAATGTCGTTTATTAACGATGTTATGGCTCACTGCTCTATTTTTCTTAGTAGAAATAGTTGTGGGATATGTGACTAACTGTATGGCTTTAATAGCTGACAGTTTTCATATGTTATCTGATGTAGCAGCTTTGGTCGTTGCATTTCTTTCTGTAAAGATGTCACCAAAGAAATGGTCT AAGAATACATTT GGTTGGG CCAGAGCTGAAGTTTTAGGAGCTTTGGTAAACGCCGTTTTTTTAGTCGCATTGTGTTTCAGTATTACAGTGGAAGCATGTAAAAGATTTATCGAAGTAGAAGAAATACATGAAGCTAAATTGCTTGTGGCAGTTGGAGCTCTTGGTTTATTAGTAAATATTATTGGATTGTGCTTGTTTCAT       GAAGTTCTCATGCACATTCACATGGCATATCTCGAAGTCACAATCGATTAAGTACTCTAGTTGGAACAGATGACAATGAAAATGATGAATCTTATAGGCCAGCGACGCCGCAAGTAAAAAGAACACATGGTCATACACATGATGCGAGTCAAATGAATATGCGTGGTGTATTTCTTCAT]


>consensus_748#0 TTATTTAACTATAAAATTTAGTGTGAAAGTTTCATTATAGTTTTTCAGAAATGAATTAAT ATAGTTAATGTTTTGAAGTTTTTAAAAAAATCTAATGTCAGTTTTTATTAGTTCTTGTGC TTGTGAATACACATCAATACTGTGTAACATGTCTATAAACAGTTCTTGTTGGTGTTACTT GATACAATTTTGATACATTATAGCAAGAATTGTAATACTTTATTATAATTGTACAAACAT GGGTCGTTACACTGGAAAAAAATGTCGTTTATTAACGATGTTATGGCTCACTGCTCTATT TTTCTTAGTAGAAATAGTTGTGGGATATGTGACTAACTGTATGGCTTTAATAGCTGACAG TTTTCATATGTTATCTGATGTAGCAGCTTTGGTCGTTGCATTTCTTTCTGTAAAGATGTC ACCAAAGAAATGGTCTAAGAATACATTTGGTTGGGCCAGAGCTGAAGTTTTAGGAGCTTT GGTAAACGCCGTTTTTTTAGTCGCATTGTGTTTCAGTATTACAGTGGAAGCATGTAAAAG ATTTATCGAAGTAGAAGAAATACATGAAGCTAAATTGCTTGTGGCAGTTGGAGCTCTTGG TTTATTAGTAAATATTATTGGATTGTGCTTGTTTCATGAACAAGAAGTTCTCATGCACAT TCACATGGCATATCTCGAAGTCACAATCGATTAAGTACTCTNNTTGGAACAGATGACAAT GAAAATGATGAATCTTATAGGCCAGCGACGCCGCAAGTAAAAAGAACACATGGTCATACA CATGATGCGAGTCAAATGAATATGCGTGGTGTATTTCTTCAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)