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Apis mellifera
cluster # 988 cluster # 988       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_988#0 length = 628 sequences # 3  

consensusID : consensus_988#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 628
fasta sequence
                              [TACGATCTTATATTTTAAGTATTTTATACATCTTAATAATTTTATTGTCTAAGATATTACAACTTCATTGTTTTTGTTTCTTAAAATATAACGATAGTTTTTAATTATTGTCATTGATCAAATCTGATGATCACAAAAGATAATTTAAATTGCAACAATAGAGATTGAAGAAATTGATCCTATAAAAAAGAAAAATTAAGAAAATATTATCTTTTCTATTTCGTTGATTAAACTCATATTTAATATACGTG----TATATATATATATATATCGTGATATTATGTTAGATTAAAAAAAAATTTAGCCACCGAATATTAAGGAACAAAACCTTTATAAGAAATAGACTATTTACCACTCGTCTCTTGCATCACATCGTTCATTGTGAATGCGGCATTATTGACTGCGGAGTTACATGTTTACATATTCACCGTGATACATCCGTCGACGAACATCGTGCGCGACATACGCGTGCACGTACAAAATGGCTACGTGCCCTTGTATGTCCTGCTGTTGCAATCTATACACGTATATATATATCTTCGTACCTTTTGAACAATTTCTTTTTTGCTGGTCTCTTTCGAAAAATGGTTAATCGTAAATCATAATTCTGTTTACACATTAATTTCGCTTT]

[+] EMBL BI511159             [TACGATCTTATATTTTAAGTATTTTATACATCTTAATAATTTTATTGTCTAAGATATTACAACTTCATTGTTTTTGTTTCTTAAAATATAACGATAGTTTTTAATTATTGTCATTGATCAAATCTGATGATCACAAAAGATAATTTAAATTGCAACAATAGAGATTGAAGAAATTGATCGTATAAAAAAGAAAAATTAAGAAAATATTATCTTTTCTATTTCGTTGATTAAACTCATATTTAATATACGTGTATATATATATATATATATATCNNNATATTATGTTAGATTAAAAAAAAATTTANCCACCGAATATTAAGGAACAAAACCTTTATAAGAAATAGACTATTTACCACTCGTCTCTTGCATCACATCGTTCATTGTGAATGCGGCATTATTGACTGCGGAGTTACATGTTTACATATTCACCGTGATACATCCGTCG                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BI511152             [                                                                                                                     TCAAATCTGATGATCACAAAAGATAATTTAAATTGCAACAATAGAGATTGAAGAAATTGATCCTATAAAAAAGAAAAATTAAGAAAATATTATCTTTTCTATTTCGTTGATTAAACTCATATTTAATATACGTG    TATATATATATATATATCGTGATATTATGTTAGATTAAAAAAAAATTTAGCCACCGAATATTAAGGAACAAAACCTTTATAAGAAATAGACTATTTACCACTCGTCTCTTGCATCACATCGTTCATTGTGAATGCGGCATTATTGACTGCGGAGTTACATGTTTACATATTCACCGTGATACATCCGTCGACGAACATCGTGCGCGACATACGCGTGCACGTACAAAATGGCTACGTGCCCTTGTATGTCCTGCTGTTGCAATCTATACACGTATATATATATCTTCGTACCTTTTGAACAATTTCTTTTTTGCTGGTCTCTTTCGAAAAATGGTTAATCGTAAATCATAATTCTGTTTACACATTAATTTCGCTTT]
[+] EMBL BI515751             [                                                                                                                                             AATTTAAATTGCAACAATAGAGATTGAAGAAATTGATCCTATAAAAAAGAAAAATTAAGAAAATATTATCTTTTCTATTTCGTTGATTAAACTCATATTTAATATACGTG    TATATATATATATATATCGTGATATTATGTTAGATT  AAAAAAATTTAGCCACCGAATATTAAGGAACAAAACCTTTATAAGAAATAGACTATTTACCACTCGTCTCTTGCATCACATCGTTCATTGTGAATGCGGCATTATTGACTGCGGAGTTACATGTTTACATATTCACCGTGATACATCCGTCGACGAACATCGTGCGCGACATACGCGTGCACGTACAAAATGGCTACGTGCCCTTGTATGTCCTGCTGTTGCAATCTATACACGTATATATATATCTTCGTACCTTTTGAACA                                                                            ]


>consensus_988#0 TACGATCTTATATTTTAAGTATTTTATACATCTTAATAATTTTATTGTCTAAGATATTAC AACTTCATTGTTTTTGTTTCTTAAAATATAACGATAGTTTTTAATTATTGTCATTGATCA AATCTGATGATCACAAAAGATAATTTAAATTGCAACAATAGAGATTGAAGAAATTGATCC TATAAAAAAGAAAAATTAAGAAAATATTATCTTTTCTATTTCGTTGATTAAACTCATATT TAATATACGTGTATATATATATATATATCGTGATATTATGTTAGATTAAAAAAAAATTTA GCCACCGAATATTAAGGAACAAAACCTTTATAAGAAATAGACTATTTACCACTCGTCTCT TGCATCACATCGTTCATTGTGAATGCGGCATTATTGACTGCGGAGTTACATGTTTACATA TTCACCGTGATACATCCGTCGACGAACATCGTGCGCGACATACGCGTGCACGTACAAAAT GGCTACGTGCCCTTGTATGTCCTGCTGTTGCAATCTATACACGTATATATATATCTTCGT ACCTTTTGAACAATTTCTTTTTTGCTGGTCTCTTTCGAAAAATGGTTAATCGTAAATCAT AATTCTGTTTACACATTAATTTCGCTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)