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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10158#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 573 fasta sequence
[CATGGACTGAGGAGTAGAAAATCCTCCAGGCCTTCACCCCCAAATGAGGAGTTCTTCAGGTGTTGGAGTGTTAGCAATGGCTGCCAATGGAGGAAGATGAAAAGACTGTTCGTCGACGCGACTTACCTCTCTTTTTTGGGATCGGAGTAGGCTGTGAATGGTGGTGGTGTATTGGGATGTAATTGTGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAA---AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCCTTTTTCCCCCTTCCTAAAAAAAGGGGAAATTTTTTAAAACCCGGGAAAATATCCCCTTTAGGGGGGGGAAATTTTGACCCGGGGGAAAAAAGGGGAAAAACTTTTCCCGGGGAAAAAATTTTTCCCCCCAAAAATTCCCAAAAAAAAAAAACCCGAAAAAAAAAAGGGAAAACCCCGGGGGCCCCAAAAGGG]
[+] EMBL CF307733 [CATGGACTGAGGAGTAGAAAATCCTCCAGGCCTTCACCCCCAAATGAGGAGTTCTTCAGGTGTTGGAGTGTTAGCAATGGCTGCCAATGGAGGAAGATGAAAAGACTGTTCGTCGACGCGACTTACCTCTCTTTTTTGGGATCGGAGTAGGCTGTGAATGGTGGTGGTGTATTGGGATGTAATTGGGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAAgtgaagt ]
[+] EMBL CF298667 [ GGTGGTGGTGTATTGGGATGTAATTGTGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAAGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCCTTTTTCCCCCTTCCTAAAAAAAGGGGAAATTTTTTAAAACCCGGGAAAATATCCCCTTTAGGGGGGGGAAATTTTGACCCGGGGGAAAAAAGGGGAAAAACTTTTCCCGGGGAAAAAATTTTTCCCCCCAAAAATTCCCAAAAAAAAAAAACCCGAAAAAAAAAAGGGAAAACCCCGGGGGCCCCAAAAGGG]
[+] EMBL CF301363 [ GGTGGTGGTGTATTGGGATGTAATTGTGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAA ]
[+] EMBL CF336946 [ GGTGGTGGTGTATTGGGATGTAATTGTGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA ]
[+] EMBL CF301271 [ GGTGGTGGTGTATTGGGATGTAATTGTGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA ]
[+] EMBL CF299439 [ GTATTGGGATGTAATTGTGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGAAAAGACAAAA ]
[+] EMBL CF299339 [ GTATTGGGATGTAATTGTGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAgag ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||