cluster # 10264

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 10264 cluster # 10264 Sequences # 7 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10264#0 length = 1607 sequences # 7
consensusID : consensus_10264#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1607
fasta sequence
                              [TTTGTTCTTACTGCCACCCGCTCAAACTAGATGGAAGTCCCAGTGTTGGAGGGAAGACAACAGGCAAAGAGAAGCAGGGAATGGCAGTTGAACTGATCGGGATGCCTCAGTGGAACGAATGTAGTGCCCTTGCAAAATTAACAGTGAATCTTTCTGAGTGGTCCAATGCAAGCTCAGTTGACTGCAACACTAAACCTTGTGCTCTTCCTAGTACCTTTCCGCAACCACATGGGCAGTTTTATGCTATGTCTGGTTTCTATGTGGTTTTTAAATTTTTCAATTTGACTGCCGATGCCACTCTCATTGATGTTCTAAATAGAGGCCAGGAATTTTGTGAAAAAACATGGAAGGTTGCAAAGAGTAGTGTTCCACCACAACCTTTTATAGAACAGTATTGTTTCAGGGCTCCTTATATTACATCACTTCTGAGAGAGGGGCTGCAGATCAAAGATAACCAGGTGATAATTGACTCTGGTAGTATAACTTGGACTCTTGGGGTTGCTTTGTTAGAGGCTGGACAGGTGTTGTCTACACGAATCGATATTCAAGGATACAGAATACTCCACCGAGAGATAAATCCAAATATTCTTATTGTGTTGTTTCTGATTTCAATTGTGTTAGTCATATGTGCCATATTGTGTGTCAGCAATTCAATCCCAAGATCATTCCGCAAGTCTTATCTGCCACTTTTTAGGCAGAACAGTGCAGGCAGTCCTGTGCTTAGCATGGGATCACCTTTCAGATTTCATCTATGGAGTCATATTACTTCAGGTGATGCAAGAACAAAGACACCTCTGAGTCCTACTGTTGCTGGGTCAGAGCCCCATCCATTCAGCATGAGCCATGGATTAGGAGGCAGCAGTGTTCAGCTTATGGAGTCCTCCAGGCAGTCATTGGGCGTCTATCACAGCTATTCTGTTGGAAGCTTAGGTCAGATGCAGTTTTCTAGTGGAATGTGGAAGCCAGGTCAAACAACACTCCAAAGTCGGAGATCCCAATCGAGAGAAGATCTCACTTCGTCACTAG-CCGATCTTCATCTTCCAAAGGTGTAGCCTTACATTTCAGAATGACATGACTAGTATGAGAATACCATCCCATAACAAACCTTGTGTAAATAATAGCTCCGGACTATTTGATTTCTTCTCTAATCAAAAGTCAAA-TTTTGTCGGTATACTGACACTTCA-GTGAGATCTAGCATTCACAGAATT-GGAGGTATGACTTGGTGCCTGCTGCCTAGTCCTGGGCATGATATTTTCATTACGATGTATGCGCAACAGTACATGTCACAAGGTGAAATTGCAAGAAGAAATTTATATGGTTCACCAAAGTGGTTGGCCGTGGGCTGGAGGTATATAAATCAGCTCCTAGCCCCAAAATGTCACTGTTTCTAAATTGTGATATCAATTCAACCGAGCAGGCTGTGTACTTCAAATGTTTCTTATTCTTTTGTTCTACAACATAATAAAGCTGCCTATGGGCTATGGTCTTGTGTCTGTAGAATTGCTGTACGACACCATGTAAGAGTTTTCCCTTGTGGAAGGACATTTGGTACCAACAGAAAACATGAATTATTAGTAATTCCAGTGCTCTTATGTTTACTCATAAAA]

[+] EMBL AK070298             [TTTGTTCTTACTGCCACCCGCTCAAACTAGATGGAAGTCCCAGTGTTGGAGGGAAGACAACAGGCAAAGAGAAGCAGGGAATGGCAGTTGAACTGATCGGGATGCCTCAGTGGAACGAATGTAGTGCCCTTGCAAAATTAACAGTGAATCTTTCTGAGTGGTCCAATGCAAGCTCAGTTGACTGCAACACTAAACCTTGTGCTCTTCCTAGTACCTTTCCGCAACCACATGGGCAGTTTTATGCTATGTCTGGTTTCTATGTGGTTTTTAAATTTTTCAATTTGACTGCCGATGCCACTCTCATTGATGTTCTAAATAGAGGCCAGGAATTTTGTGAAAAAACATGGAAGGTTGCAAAGAGTAGTGTTCCACCACAACCTTTTATAGAACAGTATTGTTTCAGGGCTCCTTATATTACATCACTTCTGAGAGAGGGGCTGCAGATCAAAGATAACCAGGTGATAATTGACTCTGGTAGTATAACTTGGACTCTTGGGGTTGCTTTGTTAGAGGCTGGACAGGTGTTGTCTACACGAATCGATATTCAAGGATACAGAATACTCCACCGAGAGATAAATCCAAATATTCTTATTGTGTTGTTTCTGATTTCAATTGTGTTAGTCATATGTGCCATATTGTGTGTCAGCAATTCAATCCCAAGATCATTCCGCAAGTCTTATCTGCCACTTTTTAGGCAGAACAGTGCAGGCAGTCCTGTGCTTAGCATGGGATCACCTTTCAGATTTCATCTATGGAGTCATATTACTTCAGGTGATGCAAGAACAAAGACACCTCTGAGTCCTACTGTTGCTGGGTCAGAGCCCCATCCATTCAGCATGAGCCATGGATTAGGAGGCAGCAGTGTTCAGCTTATGGAGTCCTCCAGGCAGTCATTGGGCGTCTATCACAGCTATTCTGTTGGAAGCTTAGGTCAGATGCAGTTTTCTAGTGGAATGTGGAAGCCAGGTCAAACAACACTCCAAAGTCGGAGATCCCAATCGAGAGAAGATCTCACTTCGTCACTAG CCGATCTTCATCTTCCAAAGGTGTAGCCTTACATTTCAGAATGACATGACTAGTATGAGAATACCATCCCATAACAAACCTTGTGTAAATAATAGCTCCGGACTATTTGATTTCTTCTCTAATCAAAAGTCAAA TTTTGTCGGTATACTGACACTTCA GTGAGATCTAGCATTCACAGAATT GGAGGTATGACTTGGTGCCTGCTGCCTAGTCCTGGGCATGATATTTTCATTACGATGTATGCGCAACAGTACATGTCACAAGGTGAAATTGCAAGAAGAAATTTATATGGTTCACCAAAGTGGTTGGCCGTGGGCTGGAGGTATATAAATCAGCTCCTAGCCCCAAAATGTCACTGTTTCTAAATTGTGATATCAATTCAACCGAGCAGGCTGTGTACTTCAAATGTTTCTTATTCTTTTGTTCTACAACATAATAAAGCTGCCTATGGGCTATGGTCTTGTGTCTGTAGAATTGCTGTACGACACCATGTAAGAGTTTTCCCTTGTGGAAGGACATTTGGTACCAACAGAAAACATGAATTATTAGTAATTCCAGTGCTCTTATGT            ]
[+] EMBL CB678062             [                                                                                                                                     AAAATTAACAGTGAATCTTTCTGAGTGGTCCAATGCAAGCTCAGTTGACTGCAACACTAAACCTTGTGCTCTTCCTAGTACCTTTCCGCAACCACATGGGCAGTTTTATGCTATGTCTGGTTTCTATGTGGTTTTTAAATTTTTCAATTTGACTGCCGATGCCACTCTCATTGATGTTCTAAATAGAGGCCAGGAATTTTGTGAAAAAACATGGAAGGTTGCAAAGAGTAGTGTTCCACCACAACCTTTTATAGAACAGTATTGTTTCAGGGCTCCTTATATTACATCACTTCTGAGAGAGGGGCTGCAGATCAAAGATAACCAGGTGATAATTGACTCTGGTAGTATAACTTGGACTCTTGGGGTTGCTTTGTTAGAGGCTGGACAGGTGTTGTCTACACGAATCGATATTCAAGGATACAGAATACTCCACCGAGAGATAAATCCAAATATTCTTATTGTGTTGTTTCTGATTTCAATTGTGTTAGTCATATGTGCCATATTGTGTGTCAGCAATTCAATCCCAAGATCATTCCGCAAGTCTTATCTGCCACTTTTTAGGCAGAACAGTGCAGGCAGTCCTGTGCTTAGCATGGGATCACCTTTCAGATTTCATCTATGGAGTCATATTACTTCAGGTGATGCAAGAACAAAGACACCTCTGAGTCCTACTGTTGCTGGGTCAGAGCCCCATCCATTCAGCATGAGCCATGGATTANGAGGCAGCAGTGTTCAGCTTATGGAGTCCTCCAGGCAGTCATTGGGCGTCTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CA765725             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCTGCAGATC AAGATAACCAGGTGATAATTGACTCTGGTAGTATAACTTGGACTCTTGGGGTTGCTTTGTTAGAGGCTGGACAGGTGTTGTCTACACGAATCGATATTCAAGGATACAGAATACTCCACCGAGAGATAAATCCAAATATTCTTATTGTGTTGTTTCTGATTTCAATTGTGTTAGTCATATGTGCCATATTGTGTGTCAGCAATTCAATCCCAAGATCATTCCGCAAGTCTTATCTGCCACTTTTTAGGCAGAACAGTGCAGGCAGTCCTGTGCTTAGCATGGGATCACCTTTCAGATTTCATCTATGGAGTCATATTACTTCAGGTGATGCAAGAACAAAGACACCTCTGAGTCCTACTGTTGCTGGGTCAGAGCCCCATCCATTCAGCATGAGCCATGGATTAGGAGGCAGCAGTGTTCAGCTTATGGAGTCCTCCAGGCAGTCATTGGGCGTCTATCACAGCTATTCTGTTGGAAGCTTAGGTCAGATGCAGTTTTCTAGTGGAATGTGGAAGCCAGGTCAAACAACACTCCAAAGTCGGAGATCCCAATCGAGAGAAGATCTCACTTCGTCACTAGCCCGATCTTCATCTTCCAAAGGTGTAGCCTTACATTTCAGAATGACATGACTAGTATGAGAATACCATCCCATAACAAACCTTGTGTAAATAATAGCTCCGGACTATTTGATTTCTTCTCTAATC AAAGTCAAANTTTTGTCGGTATACTGACACTTCAGGNGAGATCTAGCATTCACAGAATTGGGAGGTATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CB636259             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTGCAGGCAGTCTTGTGCTTAGCATGGGATCACCTTTCAGATTTCATCTATGGAGTCATATTACTTCAGGTGATGCAAGAACAAAGACACCTCTGAGTCCTACTGTTGCTGGGTCAGAGCCCCATCCATTCAGCATGAGCCATGGATTAGGAGGCAGCAGTGTTCAGCTTATGGAGTCCTCCAGGCAGTCATTGGGCGTCTATCACAGCTATTCTGTTGGAAGCTTAGGTCAGATGCAGTTTTCTAGTGGAATGTGGAAGCCAGGTCAAACAACACTCCAAAGTCGGAGATCCCAATCGAGAGAAGATCTCACTTCGTCACTAG CCGATCTTCATCTTCCAAAGGTGTAGCCTTACATTTCAGAATGACATGACTAGTATGAGAATACCATCCCATAACAAACCTTGTGTAAATAATAGCTCCGGACTATTTGATTTCTTCTCTAATCAAAAGTCAAA TTTTGTCGGTATACTGACACTTCT GTGAGATCTAGCATTCACAGAATT GGAGGTATGACTTGGTGCCTGCTGCCTAGTCCTGGGCATGATATTTTCATTACGATGTATGCGCAACAGTACATGTCACAAGGTGAAATTGCAAGAAGAAATTTATATGGTTCAC                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CB678063             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CATCCATTCAGCATGAGCCATGGATTAGGAGGCAGCAGTGTTCAGCTTATGGAGTCCTCCAGGCAGTCATTGGGCGTCTATCACAGCTATTCTGTTGGAAGCTTAGGTCAGATGCAGTTTTCTAGTGGAATGTGGAAGCCAGGTCAAACAACACTCCAAAGTCGGAGATCCCAATCGAGAGAAGATCTCACTTCGTCACTAG CCGATCTTCATCTTCCAAAGGTGTAGCCTTACATTTCAGAATGACATGACTAGTATGAGAATACCATCCCATAACAAACCTTGTGTAAATAATAGCTCCGGACTATTTGATTTCTTCTCTAATCAAAAGTCAAA TTTTGTCGGTATACTGACACTTCA GTGAGATCTAGCATTCACAGAATT GGAGGTATGACTTGGTGCCTGCTGCCTAGTCCTGGGCATGATATTTTCATTACGATGTATGCGCAACAGTACATGTCACAAGGTGAAATTGCAAGAAGAAATTTATATGGTTCACCAAAGTGGTTGGCCGTGGGCTGGAGGTATATAAATCAGCTCCTAGCCCCAAAATGTCACTGTTTCTAAATTGTGATATCAATTCAACCGAGCAGGCTGTGTACTTCAAATGTTTCTTATTCTTTTGTTCTACAACATAATAAAGCTGCCTATGGGCTATGGTCTTGTGTCTGTAGAATTGCTGTACGACACCATGTAAGAGTTTTCCCTTGTGGAAGGACATTTGGTACCAACAGAAAACATGAAAGATTAGTAATTCCAGTGCTCTTATGTTTACTCAT    ]
[-] EMBL CB636232             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATCCATTCAGCATGAGCCATGGATTAGGAGGCAGCAGTGTTCAGCTTATGGAGTCCTCCAGGCAGTCATTGGGCGTCTATCACAGCTATTCTGTTGGAAGCTTAGGTCAGATGCAGTTTTCTAGTGGAATGTGGAAGCCAGGTCAAACAACACTCCAAAGTCGGAGATCCCAATCGAGAGAAGATCTCACTTCGTCACTAG CCGATCTTCATCTTCCAAAGGTGTAGCCTTACATTTCAGAATGACATGACTAGTATGAGAATACCATCCCATAACAAACCTTGTGTAAATAATAGCTCCGGACTATTTGATTTCTTCTCTAATCAAAAATAAAA TTTTGTCGGTATACTGACACTTCA GTGAGATCTAGCATTCACAGAATT GGAGGTATGACTTGGTGCCTGCTGCCTAGTCCTGGGCATGATATTTTCATTACGATGTATGCGCAACAGTACATGTCACAAGGTGAAATTGCAAGAAGAAATTTATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL AU101190             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTGNCGGTATACTGACACTTCA GTGAGATCTAGCATTCACAGAATT GGAGGTATGACTTGGTGCCTGCTGCCTAGTCCTGGGCATGATATTTTCATTACGATGTATGCGCANCAGTACATGTCACAAGGTGAAATTGCAAGAAGAAATTTATATGGTTCACCAAAGTGGTTGGCCGTGGGCTGGAGGTATATNAATCAGCTCCTAGCCCCAAAATGTCACTGTTTCTAAATTGTGATATCAATTCAACCGAGCAGGCTGTGTACTTCAAATGTTTCTTATTCTTTTGTTCTACAACATAATAAAGCTGCCTATGGGCTATGGTCTTGTGTCTGTAGAATTGCTGTACGACACCATGTAAGAGTTTTCCCTTGTGGAAGGACATTTGGTACCAACAGAAAACATGAATTATTAGTAATTCCAGTGCTCTTATGTTTACTCAAAAAA]




>consensus_10264#0
TTTGTTCTTACTGCCACCCGCTCAAACTAGATGGAAGTCCCAGTGTTGGAGGGAAGACAA
CAGGCAAAGAGAAGCAGGGAATGGCAGTTGAACTGATCGGGATGCCTCAGTGGAACGAAT
GTAGTGCCCTTGCAAAATTAACAGTGAATCTTTCTGAGTGGTCCAATGCAAGCTCAGTTG
ACTGCAACACTAAACCTTGTGCTCTTCCTAGTACCTTTCCGCAACCACATGGGCAGTTTT
ATGCTATGTCTGGTTTCTATGTGGTTTTTAAATTTTTCAATTTGACTGCCGATGCCACTC
TCATTGATGTTCTAAATAGAGGCCAGGAATTTTGTGAAAAAACATGGAAGGTTGCAAAGA
GTAGTGTTCCACCACAACCTTTTATAGAACAGTATTGTTTCAGGGCTCCTTATATTACAT
CACTTCTGAGAGAGGGGCTGCAGATCAAAGATAACCAGGTGATAATTGACTCTGGTAGTA
TAACTTGGACTCTTGGGGTTGCTTTGTTAGAGGCTGGACAGGTGTTGTCTACACGAATCG
ATATTCAAGGATACAGAATACTCCACCGAGAGATAAATCCAAATATTCTTATTGTGTTGT
TTCTGATTTCAATTGTGTTAGTCATATGTGCCATATTGTGTGTCAGCAATTCAATCCCAA
GATCATTCCGCAAGTCTTATCTGCCACTTTTTAGGCAGAACAGTGCAGGCAGTCCTGTGC
TTAGCATGGGATCACCTTTCAGATTTCATCTATGGAGTCATATTACTTCAGGTGATGCAA
GAACAAAGACACCTCTGAGTCCTACTGTTGCTGGGTCAGAGCCCCATCCATTCAGCATGA
GCCATGGATTAGGAGGCAGCAGTGTTCAGCTTATGGAGTCCTCCAGGCAGTCATTGGGCG
TCTATCACAGCTATTCTGTTGGAAGCTTAGGTCAGATGCAGTTTTCTAGTGGAATGTGGA
AGCCAGGTCAAACAACACTCCAAAGTCGGAGATCCCAATCGAGAGAAGATCTCACTTCGT
CACTAGCCGATCTTCATCTTCCAAAGGTGTAGCCTTACATTTCAGAATGACATGACTAGT
ATGAGAATACCATCCCATAACAAACCTTGTGTAAATAATAGCTCCGGACTATTTGATTTC
TTCTCTAATCAAAAGTCAAATTTTGTCGGTATACTGACACTTCAGTGAGATCTAGCATTC
ACAGAATTGGAGGTATGACTTGGTGCCTGCTGCCTAGTCCTGGGCATGATATTTTCATTA
CGATGTATGCGCAACAGTACATGTCACAAGGTGAAATTGCAAGAAGAAATTTATATGGTT
CACCAAAGTGGTTGGCCGTGGGCTGGAGGTATATAAATCAGCTCCTAGCCCCAAAATGTC
ACTGTTTCTAAATTGTGATATCAATTCAACCGAGCAGGCTGTGTACTTCAAATGTTTCTT
ATTCTTTTGTTCTACAACATAATAAAGCTGCCTATGGGCTATGGTCTTGTGTCTGTAGAA
TTGCTGTACGACACCATGTAAGAGTTTTCCCTTGTGGAAGGACATTTGGTACCAACAGAA
AACATGAATTATTAGTAATTCCAGTGCTCTTATGTTTACTCATAAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case