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Oryza sativa
cluster # 10311 cluster # 10311       Sequences # 7       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10311#0 length = 962 sequences # 7  
consensusID : consensus_10311#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 962
fasta sequence 
                              [GTCCGTGTGCGAGTTGCGACCTTGCTGGAAAACTTGTACCTAGAGCTAGCTGAA-GGAAGCAATATGGCCACCGTGGATGGCACAACGGCGCCGAGCTCCGGCGGCAAGACGGCGACGGTGGCGTTGGAGTCGGGCGGCGGCCGCTAC---GGTGGGCCG---GCTCCGGCGAAATGCTCCGGCGCCAACCTGGCCCTGAGGGCGCTGCTCTTCGCCGTGTCGCTGTCCGCGCTCGTGGTGCTTGTCACCGCCAAGCAGACGGTGATGATCCCGTTCGTCATCCGCCCGCCGCAGTTCATCCTCGCGCCGGTCCCCGCCAAGTACACGCACTCACCGGCGCTCATATATCTGCTGGCTGCGCTGTGCGCGACGTGCTTTTACAGCCTGATCACGGCCATCAGCTCGGTGAGGTTGCTCTCCAGCTCGGCTTGCTCTGCCAAGACGCTCTTCTACCTCATCCTGCTTGATGTGTTCTACGC-AGCCGTG--ATGGCGTCGGCGACCGGGACAGC-GGGGGCCGT-GGCGTGGGTG-GGGCTGAAGGGGAACTCCCACACCCGGT-GGAACAAGATA-TGCAACGTCTACGGCAAGTTCTGCCGCCACATCGGCAGCTCCACCTTCCTCGCCCTCATCGCCGCCATCGTTCTCGTCCTCCTCGCCTTCCTCAACGCCTACTCCCTCTACCGCCGAAGCCGTTGATTCATTCCCCATGAACTTGTTTGCTGCCGCCGCCCCCGGACCGTAGAGTTGCTTGCTTCCGTCGTCGCATCGACCGTCCGTGTGTGGATGGATTCTTGTGTTTAATTAGTTTTTGTCCCTAAGTGTTTGAAACATTTGGGTGGTGTGATGTTTTTTTAGTGCTTGCCGGCCGTATATGTTAGCTGTTGTCTCACATCTCCGGAAATTCAACGTTATCCTCTCAGTGATATATAATGTTTCATGGTTGAACTAATGAACTAGAACATGTACGTTAA]

[+] EMBL AK073296             [GTCCGTGTGCGAGTTGCGACCTTGCTGGAAAACTTGTACCTAGAGCTAGCTGAA GGAAGCAATATGGCCACCGTGGATGGCACAACGGCGCCGAGCTCCGGCGGCAAGACGGCGACGGTGGCGTTGGAGTCGGGCGGCGGCCGCTAC   GGTGGGCCG   GCTCCGGCGAAATGCTCCGGCGCCAACCTGGCCCTGAGGGCGCTGCTCTTCGCCGTGTCGCTGTCCGCGCTCGTGGTGCTTGTCACCGCCAAGCAGACGGTGATGGTCCCGTTCGTCATCCGGCCGCCGCAGTTCATCCTCGCGCCGGTCCCCGCCAAGTACACGCACTCACCGGCGCTCATATATCTGCTGGCTGCGCTGTGCGCGACGTGCTTTTACAGCCTGATCACGGCCATCAGCTCGGTGAGGTTGCTCTCCAGCTCGGCTTGCTCTGCCAAGACGCTCTTCTACCTCATCCTGCTTGATGTGTTCTACGC AGCCGTG  ATGGCGTCGGCGACCGGGACAGC GGGGGCCGT GGCGTGGGTG GGACTGAAGGGGAACTCCCACACCCGGT GGAACAAGATA TGCAACGTCTACGGCAAGTTCTGCCGCCACATCGGCAGCTCCACCTTCCTCGCCCTCATCGCCGCCATCGTTCTCGTCCTCCTCGCCTTCCTCAACGCCTACTCCCTCTACCGCCGAAGCCGTTGATTCATTCCCCATGAACTTGTTTGCTGCCGCCGCCCCCGGACCGTAGAGTTGCTTGCTTCCGTCGTCGCATCGACCGTCCGTGTGTGGATGGATTCTTGTGTTTAATTAGTTTTTGTCCCTAAGTGTTTGAAACATTTGGGTGGTGTGATGTTTTTTTAGTGCTTGCCGGCCGTATATGTTAGCTGTTGTCTCACATCTCCGGAAATTCAACGTTATCCTCTCAGTGATATATAATGTTTCAT                                 ]
[+] EMBL CB630607             [                 GACCTTGCTGGAAAACTTGTACCTAGAGCTAGCTGAAGGGAAGCAATATGGCCACCGTGGATGGCACAACGGCGCCGAGCTCCGGCGGCAAGACGGCGACGGTGGCGTCGGAGTCGGGCGGCGGCCGCTACGGTGGTGGGCCGCCTCCTCCGGCGAGATGCTCCGGCGCGAACCTGGCCCTGAGGGCGCTGCTCTTCGCCGTGTCGCTGTCCGCGCTCGTGGTGCTTGTCACCGCCAAGCAGACGGTGATGATCCCGTTCGTCATCCGCCCGCCGCAGTTCATCCTCGCGCCGGTCCCCGCCAAGTACACGCACTCACCGGCGCTCATATATCTGCTGGCTGCGCTGTGCGCGACGTGCTTTTACAGCCTGATCACGGCCATCAGCTCGGTGAGGTTGCTCTCCAGCTCGGCTTGCTCTGCCAAGACGCTCTTCTACCTCATCCTGCTTGATGTGTTCTACGC AGCCGTG  ATGGCGTCGGCGACCGGGACAGC GGGGGCCGT GGCGTGGGTG GGGCTGAAGGGGAACTCCCACACCCGGT GGAACAAGATA TGCAACGTCTACGGCAAGTTCTGCCGCCACATCGGCAGCTCCACCTTCCTCGCCCTCATCGCCGCCATCGTTCTCGTCCTCCTCGCCTTCCTCAACGCCTACTCCCTCTACCGCCGAAGCCGTTGATTCATTCCCCATGAACTTGTTTGCTGCCGCCGCCCCCGGACCGTAGAGTTGCTTGCTTCCGTCGTCGCATCGACCGTCCGTGTGTGGATGGATTCTTGTGTTTAATTAGT                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CA758780             [                       GCTGGAAAACTTGTACCTAGAGCTAGCTGAA GGAAGCAATATGGCCACCGTGGATGGCACAACGGCGCCGAGCTCCGGCGGCAAGACGGCGACGGTGGCGTTGGAGTCGGGCGGCGGCCGCTAC   GGTGGGCCG   GCTCCGGCGAAATGCTCCGGCGCCAACCTGGCCCTGAGGGCGCTGCTCTTCGCCGTGTCGCTGTCCGCGCTCGTGGTGCTTGTCACCGCCNAGCAGACGGTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BE040799             [                                  TGTGCCTAGAGCTAGCTGAAGGGAAGCAATATGGCCACCGTGGATGGCACAACGGCGCCGAGCTCCGGCGGCAAGACGGCGACGGTGGCGTCGGAGTCGGGCGGCGGCCGCTACGGTGGTGGGCCGCCTCCTCCGGCGAGATGCTCCGGCGCGAACCTGGCCCTGAGGGCGCTGCTCTTCGCCGTGTCGCTGTCCGCGCTCGTGGTGCTTGTCACCGCCAAGCAGACGGTGATGATCCCGTTCGTCATCCGCCCGCCGCAGTTCATTCTCGCGCCGGTCCCCGCCAAGTACACGCACTCACCGGCTCTCATATATCTGCTGGCTGCGCTGTGCGCGACGTGTTTTTACAGCTGGATCACGGCCATCAGCTCGGTGAGGTTGCTCTCCAGCTCGGCTTGCTCTGCCAAGACGCTCTTCTACCTCATCCTGCTTGATGGGTTCTACGCAACCCGTGAAATGGCGTCGGCGACCGGGACGGCGGGGGGCCGTGGGCTTGGGTGTGGGCTGAAGGGGAACTCCCACACCCGGTGGGAACAGGATATTGCAACGTCTACGGGAAGTTCTtg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CB001067             [                                                                                                                                                                                                                            TCGCTGTCCGCGCTCGTGGTGCTTGTCTCCGTTAACCAGACGGTGATGGACCCGTTCGTCATCCGGCCGCCGCAGTTCATCCTCGCGCCGGTCCCCGCCAAGTACACGCACTCACCGGCGCTCATATATCTGCTGGCTGCGCTGTGCGCGACGTGCTTTTACAGCCTGATCACGGCCATCAGCTCGGTGAGGTTGCTCTCCAGCTCGGCTTGCTCTGCCAAGACGCTCTTCTACCTCATCCTGCTTGATGTGTTCTACGC AGCCGTG  ATGGCGTCGGCGACCGGGACAGC GGGGGCCGT GGCGTGGGTG GGACTGAAGGGGAACTCCCACACCCGGT GGAACAAGATA TGCAACGTCTACGGCAAGTTCTGCCGCCACATCGGCAGCTCCACCTTCCTCGCCCTCATCGCCGCCATCGTTCTCGTCCTCCTCGCCTTCCTCAACGCCTACTCCCTCTACCGCCGAAGCCGTTGATTCATTCCCCATGAACTTGTTTGCTGCCGCCGCCCCCGGACCGTAGAGTTGCTTGCTTCCGTCGTCGCATCGACCGTCCGTGTGTGGA                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CB630608             [                                                                                                                                                                                                                                    CGCGCTCGTGGTGCTTGTCACCGCCAAGCAGACGGTGATGATCCCGTTCGTCATCCGCCCGCCGCAGTTCATCCTCGCGCCGGTCCCCGCCAAGTACACGCACTCACCGGCGCTCATATATCTGCTGGCTGCGCTGTGCGCGACGTGCTTTTACAGCCTGATCACGGCCATCAGCTCGGTGAGGTTGCTCTCCAGCTCGGCTTGCTCTGCCAAGACGCTCTTCTACCTCATCCTGCTTGATGTGTTCTACGC AGCCGTG  ATGGCGTCGGCGACCGGGACAGC GGGGGCCGT GGCGTGGGTG GGGCTGAAGGGGAACTCCCACACCCGGT GGAACAAGATA TGCAACGTCTACGGCAAGTTCTGCCGCCACATCGGCAGCTCCACCTTCCTCGCCCTCATCGCCGCCATCGTTCTCGTCCTCCTCGCCTTCCTCAACGCCTACTCCCTCTACCGCCGAAGCCGTTGATTCATTCCCCATGAACTTGTTTGCTGCCGCCGCCCCCGGACCGTAGAGTTGCTTGCTTCCGTCGTCGCATCGACCGTCCGTGTGTGGATGGATTCTTGTGTTTAATTAGTTTTTGTCCCTAAGTGTTTGAAACATTTGGGTGGTGTGATGTTTTTTTAGTGCTTGCCGGCCGTATATGTTAGCTGTTGTCTCACATCTCCGGAAATTCAACGTTATCCTCTCAGTGATATATAATGTTTCATGGTTGAACTAATGAACTAGAACATGTACGTTAA]
[+] EMBL BE040543             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGTTCATCCTCGCGCCGGTCCCCGCCAAGTACACGCACTCACCGGCTCTCATATATCTGCTGGCTGCGCTGTGCGCGACGTGTTTTTACAGCTTGATCACGGCCATCAGCTCGGTGAGGTTGCTCTCCAGCTCGGCTTGCTCTGCCAAGACGCTCTTCTACCTCATCCTGCTTGATGTGTTCTACGC AGCCGTG  ATGGCGTCGGCGACCGGGACGGC GGGGGCCGT GGCTTGGGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]




>consensus_10311#0
GTCCGTGTGCGAGTTGCGACCTTGCTGGAAAACTTGTACCTAGAGCTAGCTGAAGGAAGC
AATATGGCCACCGTGGATGGCACAACGGCGCCGAGCTCCGGCGGCAAGACGGCGACGGTG
GCGTTGGAGTCGGGCGGCGGCCGCTACGGTGGGCCGGCTCCGGCGAAATGCTCCGGCGCC
AACCTGGCCCTGAGGGCGCTGCTCTTCGCCGTGTCGCTGTCCGCGCTCGTGGTGCTTGTC
ACCGCCAAGCAGACGGTGATGATCCCGTTCGTCATCCGCCCGCCGCAGTTCATCCTCGCG
CCGGTCCCCGCCAAGTACACGCACTCACCGGCGCTCATATATCTGCTGGCTGCGCTGTGC
GCGACGTGCTTTTACAGCCTGATCACGGCCATCAGCTCGGTGAGGTTGCTCTCCAGCTCG
GCTTGCTCTGCCAAGACGCTCTTCTACCTCATCCTGCTTGATGTGTTCTACGCAGCCGTG
ATGGCGTCGGCGACCGGGACAGCGGGGGCCGTGGCGTGGGTGGGGCTGAAGGGGAACTCC
CACACCCGGTGGAACAAGATATGCAACGTCTACGGCAAGTTCTGCCGCCACATCGGCAGC
TCCACCTTCCTCGCCCTCATCGCCGCCATCGTTCTCGTCCTCCTCGCCTTCCTCAACGCC
TACTCCCTCTACCGCCGAAGCCGTTGATTCATTCCCCATGAACTTGTTTGCTGCCGCCGC
CCCCGGACCGTAGAGTTGCTTGCTTCCGTCGTCGCATCGACCGTCCGTGTGTGGATGGAT
TCTTGTGTTTAATTAGTTTTTGTCCCTAAGTGTTTGAAACATTTGGGTGGTGTGATGTTT
TTTTAGTGCTTGCCGGCCGTATATGTTAGCTGTTGTCTCACATCTCCGGAAATTCAACGT
TATCCTCTCAGTGATATATAATGTTTCATGGTTGAACTAATGAACTAGAACATGTACGTT
AA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)