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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10410#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1189 fasta sequence
[CGCCGCTCGCTCACTACTCGCGCCGCCGCTTCCGCCGCCGCTCCGCTCCAGTCGCGTCGGCTTCCCGCCTCCTCGCCGGCGAGCCGTGCCTCGACGCTCTCCCTCTGTTGCTCCGCCGGCCAGCAGCATGCCGCGCTTCTGCTCCCACTAGCTCCCGCCACCGCCGCCCCTACTGAGCCCGGTGAGACCGTGAGGCGGTGGTGTGCACCAGTCCGGCAGTTCGCCCCCCTCCTCCTCCCAATCCGGCCGCCGCTTCATCACCGCCGGCGA-GGCTCCGCGTCTCCTCCTAGGTCGCGCTGCTTCGTATCACAGAGAGAGGCCAGCTCGGTCTCCGGATAAGCAAGAACCATGGCGTCTGCTGCTGCCGCTTACGGCGTCGGGGCTCCACTCAAGCTCGCTGCAAGGCGGCATGGGGCACTCGCGCTGGCCGGTAGCCATCGCTGCAGTGGATGGAAGTCTTCAGTGTCTTGCCCTGTTCCTCAGGCTTGGATGGGCAGTTGCTCTTCTGTCGCAATGCGCCGTGTCGCCTCCGGTTCTCGATTGATTGTTCAGGCTTCAAACAGCGGGGGCTCAAGCTTGAAGGCATCATTGGCTGATGCTAGCCTGCTTACTGAAGAGAGGATAACTGTTTTGGTGATTGGAGGTGGAGGAAGGGAGCACGCTCTCTGTTACGCCTTGAATCGCTCTCCGTCTTGTGATGCGGTCCTATGTGCCCCTGGGAACGCAGGTATTGCTCAGTCTGGAGATGCGACCTGTATATCGGACTTAGACGTCTCCGATAGCGATGCCGTTATCGCGTTCTGCTGCAAGAGGGGAGTGGGAATGGTTGTAGTAGGTCCTGAAGCTCCTCTTGTTGCCGGTCTTGTGAATGACCTTGTGAAAGCTGAGATACCAGCATTTGGTCCTTCCTCAGAAGCTGCGGCTTTAGAAGGATCGAAGGACTTTATGAAGAAATTATGCGATAAGTACAATATTCCTACAGCTAAGTATCGCACATTCACAGATCCTGCAGAAGCTAAACAATATGTCAAAGATCAAGGCGCCCCTATTGTTGTCAAAGCTGATGGATTGGCAGCTGGAAAAGGCGTGGTTGTTGCTATGACTTTGGATGAGGCATTTGAAGCCAT-AGACTCTATGCT-GGTTCAAGGGTCATTTGGGTTCTGCTGGTTCACGGGTTATCCATTGGAAG]
[+] EMBL OSS3063A [CGCCGCTCGCTCACTACTCGCGCCGCCGCTTCCGCCGCCGCTCCGCTCCAGTCGCGTCGGCTTCCCGCCTCCTCGCCGGCGAGCCGTGCCTCGACGCTCTCCCTCTGTTGCTCCGCCGGCCAGCAGCATGCCGCGCTTCTGCTCCCACTAGCTCCNGNNACCGNCGCCCCTACTGAGCCCGGTGAGACCGTAAGGCGGTG ]
[+] EMBL OSS3157A [CGCCGCTCGCTCACTACTCGCGCCGCCGCTTCCGCCGCCGCTCCGCTCCAGTCGCGTCGGCTTCCCGCCTCCTCGCCGGCGAGCCGTGCCTCGACGCTCTCCCTCTGTTGCTCCGCCGGCCAGCAGCATGCCGCGCTTCTGCTCCCACTAGCTCCNGNCACCGCCGCCCCTACTGAGCCCG ]
[+] EMBL AK067808 [ CGCTCGCTCACTACTCGCGCCGCCGCTTCCGCCGCCGCTCCGCTCCAGTCGCGTCGGCTTCCCGCCTCCTCGCCGGCGAGCCGTGCCTCGACGCTCTCCCTCTGTTGCTCCGCCGGCCAGCAGCATGCCGCGCTTCTGCTCCCACTAGCTCCCGCCACCGCCGCCCCTACTGAGCCCGGTGAGACCGTGAGGCGGTGGTGTGCACCAGTCCGGCAGTTCGCCCCCCTCCTCCTCCCAATCCGGCCGCCGCTTCATCACCGCCGGCGA GGCTCCGCGTCTCCTCCTAGGTCGCGCTGCTTCGTATCACAGAGAGAGGCCAGCTCGGTCTCCGGATAAGCAAGAACCATGGCGTCTGCTGCTGCCGCTTACGGCGTCGGGGCTCCACTCAAGCTCGCTGCAAGGCGGCATGGGGCACTCGCGCTGGCCGGTAGCCATCGCTGCAGTGGATGGAAGTCTTCAGTGTCTTGCCCTGTTCCTCAGGCTTGGATGGGCAGTTGCTCTTCTGTCGCAATGCGCCGTGTCGCCTCCGGTTCTCGATTGATTGTTCAGGCTTCAAACAGCGGGGGCTCAAGCTTGAAGGCATCATTGGCTGATGCTAGCCTGCTTACTGAAGAGAGGATAACTGTTTTGGTGATTGGAGGTGGAGGAAGGGAGCACGCTCTCTGTTACGCCTTGAATCGCTCTCCGTCTTGTGATGCGGTCCTATGTGCCCCTGGGAACGCAGGTATTGCTCAGTCTGGAGATGCGACCTGTATATCGGACTTAGACGTCTCCGATAGCGATGCCGTTATCGCGTTCTGCTGCAAGAGGGGAGTGGGAATGGTTGTAGTAGGTCCTGAAGCTCCTCTTGTTGCCGGTCTTGTGAATGACCTTGTGAAAGCTGAGATACCAGCATTTGGTCCTTCCTCAGAAGCTGCGGCTTTAGAAGGATCGAAGGACTTTATGAAGAAATTATGCGATAAGTACAATATTCCTACAGCTAAGTATCGCACATTCACAGATCCTGCAGAAGCTAAACAATATGTCAAAGATCAAGGCGCCCCTATTGTTGTCAAAGCTGATGGATTGGCAGCTGGAAAAGGCGTGGTTGTTGCTATGACTTTGGATGAGGCATTTGAAGCCAT AGACTCTATGCT GGTTCAAGGGTCATT ]
[+] EMBL AK106101 [ GCCGCTTCCGCCGCCGCTCCGCTCCAGTCGCGTCGGCTTCCCGCCTCCTCGCCGGCGAGCCGTGCCTCGACGCTCTCCCTCTGTTGCTCCGCCGGCCAGCAGCATGCCGCGCTTCTGCTCCCACTAGCTCCCGCCACCGCCGCCCCTACTGAGCCCGGTGAGACCGTGAGGCGGTGGTGTGCACCAGTCCGGCAGTTCGCCCCCCTCCTCCTCCCAATCCGGCCGCCGCTTCATCACCGCCGGCGA GGCTCCGCGTCTCCTCCTAGGTCGCGCTGCTTCGTATCACAGAGAGAGGCCAGCTCGGTCTCCGGATAAGCAAGAACCATGGCGTCTGCTGCTGCCGCTTACGGCGTCGGGGCTCCACTCAAGCTCGCTGCAAGGCGGCATGGGGCACTCGCGCTGGCCGGTAGCCATCGCTGCAGTGGATGGAAGTCTTCAGTGTCTTGCCCTGTTCCTCAGGCTTGGATGGGCAGTTGCTCTTCTGTCGCAATGCGCCGTGTCGCCTCCGGTTCTCGATTGATTGTTCAGGCTTCAAACAGCGGGGGCTCAAGCTTGAAGGCATCATTGGCTGATGCTAGCCTGCTTACTGAAGAGAGGATAACTGTTTTGGTGATTGGAGGTGGAGGAAGGGAGCACGCTCTCTGTTACGCCTTGAATCGCTCTCCGTCTTGTGATGCGGTCCTATGTGCCCCTGGGAACGCAGGTATTGCTCAGTCTGGAGATGCGACCTGTATATCGGACTTAGACGTCTCCGATAGCGATGCCGTTATCGCGTTCTGCTGCAAGAGGGGAGTGGGAATGGTTGTAGTAGGTCCTGAAGCTCCTCTTGTTGCCGGTCTTGTGAATGACCTTGTGAAAGCTGAGATACCAGCATTTGGTCCTTCCTCAGAAGCTGCGGCTTTAGAAGGATCGAAGGACTTTATGAAGAAATTATGCGATAAGTACAATATTCCTACAGCTAAGTATCGCACATTCACAGATCCTGCAGAAGCTAAACAATATGTCAAAGATCAAGGCGCCCCTATTGTTGTCAAAGCTGATGGATTGGCAGCTGGAAAAGGCGTGGTTGTTGCTATGACTTTGGATGAGGCATTTGAAGCCAT AGACTCTATGCT GGTTCAAGGGTCATT ]
[+] EMBL CB640974 [ CCGCTCCGCTCCAGTCGCGTCGGCTTCCCGCCTCCTCGCCGGCGAGCCGTGCCTCGACGCTCTCCCTCTGTTGCTCCGCCGGCCAGCAGCATGCCGCGCTTCTGCTCCCACTAGCTCCCGCCACCGCCGCCCCTACTGAGCCCGGTGAGACCGTGAGGCGGTGGTGTGCACCAGTCCGGCAGTTCGCCCCCCTCCTCCTCCCAATCCGGCCGCCGCTTCATCACCGCCGGCGA GGCTCCGCGTCTCCTCCTAGGTCGCGCTGCTTCGTATCACAGAGAGAGGCCAGCTCGGTCTCCGGATAAGCAAGAACCATGGCGTCTGCTGCTGCCGCTTACGGCGTCGGGGCTCCACTCAAGCTCGCTGCAAGGCGGCATGGGGCACTCGCGCTGGCCGGTAGCCATCGCTGCAGTGGATGGAAGTCTTCAGTGTCTTGCCCTGTTCCTCAGGCTTGGATGGGCAGTTGCTCTTCTGTCGCAATGCGCCGTGTCGCCTCCGGTTCTCGATTGATTGTTCAAGCTTCAAACAGCGGGGG ]
[+] EMBL CB640989 [ TCCTCGCCGGCGAGCCGTGCCTCGACGCTCTCCCTCTGTTGCTCCGCCGGCCAGCAGCATGCCGCGCTTCTGCTCCCACTAGCTCCCGCCACCGCCGCCCCTACTGAGCCCGGTGAGACCGTGAGGCGGTGGTGTGCACCAGTCCTGCAGTTCGCCCCCCTCCTCCTCCCAATCCGGCCGCCGCTTCATCACCGCCGGCCACCGCTCCGCGTCTCCTCCTAGGTCGCGCTGCTTCGTATCACAGAGAGAGGCCAGCTCGGTCTCCGGATAACCAAGAACCATGGCGTCTGCTGCTGCCACTCACGGCGT ]
[+] EMBL AU095153 [ AGACGTCTCCGATAGCGATGCCGTTATCGCGTTCTGCTGCAAGAGGGGAGTGGGAATGGTTGTAGTAGGTCCTGAAGCTCCTCTTGTTGCCGGTCTTGTGAATGACCTTGTGAAAGCTGAGATACCAGCATTTGGTCCTTCCTCAGAAGCTGCGGCTTTAGAAGGATCGAAGGACTTTATGAAGAAATTATGCGATAAGTACAATATTCCTACAGCTAAGTATCGCACATTCACAGATCCTGCAGAAGCTAAACAATATGTCAAAGATCAAGGCGCCCCTATTGTTGTCAAAGCTGATGGATTGGCAGCTGGAAAAGGCGTGGTTGTTGCTATGACTTTGGATGAGGCATTTGAAGCCATAAGACTCTATGCTGGGTTCAAGGGTCATTTGGGTTCTGCTGGTTCACGGGTTATCCATTGGAAG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||