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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10566#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 2238 fasta sequence
[TTCAACAGTACAAGAAAGCGTCAATCAGTGGTCTGCCGTTTCCCAAATGGAAGGCTTGTTCTCTATTGCAAGGGCGCTGACAATGTCGTTTATGAAAGATTAGCTGATGGCAATAATGACATTAAAAAGATCAGCAGAGAACATCTAGAACAATTTGGCTCTGCTGGCTTGCGCACACTTTGCCTCGCTTATCGAGATCTCAGCAGGGAGCAATATGAAAGCTGGAATGAGAAGTTTATTCAAGCTAAATCTTCTTTACGTGATCGCGATAAGAAGCTTGATGAGGTGGCTGAGTTGATTGAAAAAGACCTTGTATTGGTAGGGTGTACTGCTATTGAGGACAAACTGCAAGAAGGGGTTCCTGCCTGCATTCAAACTCTTTCTGCAGCTGGCATAAAAATTTGGGTTTTAACAGGAGATAAGATGGAAACAGCAATTAATATAGCATATGCCTGCAGCCTGGTGAACAATGATATGAAACAATTCATCATCAGCTCGGAGACAGATGTAATTAGAGAGGCTGAAGACAGGGGAGACCCAGTGGAAATTGCACGTGTTATAAAAGAATCAGTAAAACAGAGCCTTAAAAGTTACCATGAGGAAGCCCGCGGTTCTCTAATTAGCACACCGGGACAAAAATTGGCGCTCATTATTGATGGGAGATGCTTGATGTATGCTCTAGACCCAACTCTGCGTGTAGATCTTCTTGGTTTGAGTTTAATTTGCCACTCAGTTGTATGTTGCCGGGTTTCTCCATTGCAGAAAGCACAGGTTGCTAGCTTAGTTAAGAAAGGTGCCCATAAGATAACTCTCAGTATTGGTGATGGTGCTAATGATGTGAGTATGATTCAAGCTGCTCATGTGGGGATTGGCATCAGTGGACAAGAAGGAATGCAAGCTGTTATGGCTAGCGATTTTGCCATTGCTCAGTTTCGATATCTTACCGACTTGCTCCTTGTACATGGAAGATGGTCATATTTGAGATTGTGCAAGGTTATCACATATTTTTTCTACAAGAATCTGACATTTACGCTAACTCAGTTCTGGTTCACTTTCCAAACTGGTTTTTCCGGTCAGCGATTTTATGATGACTGGTTCCAGTCCCTTTATAATGTCATTTTCACGGCCCTACCTGTAATTATGGTTGGATTGTTTGATAAGGATGTGAGTGCGTCTCTGTCAAAAAAATATCCGAAGCTTTACCAGGAAGGAATCAGGAATACATTCTTCAAGTGGAGGGTGATAGCAGTGTGGGCTTTCTTTGCCTTCTATCAGTCGATAGTGTTCTATTACTTCACTGCAGCTGCAAGTCGGTATGGTCATGGTTCATCCGGCAAGATTCTTGGTCTTTGGGATGTTAGTACAATGGCTTTCACCTGTGTTGTGGTGACTGTGAATCTCCGACTTCTAATGTCATGCAACTCTATAACAAGATGGCACTATATCAGTGTAGCTGGCAGTATAACAGCCTGGTTTATGTTCATCTTCATCTACTCTGCAATAATGACATCATTCGACAGACAGGAAAATGTATATTTTGTGATTTATGTTTTGATGAGCACGTTTTTCTTCTACCTCACACTATTGCTTGTTCCAATCATCGCTCTCTTTGGCGACTTCTTATATTTATCAATTCAAAGGTGGTTCTTCCCCTATGACTACCAAGTAATCCAGGAGATGCACAGGGATGAACCCCACGAGTACAGCAGGATACAACTTCCAGAGACAAGCCATCTAAGCCCAGAAGAAGCAAGGAGCTATGCGATCTCCATGCTTCCCCGAGAGAGCTCGAAGCACACCGGGTTCG-CCTTCGACT-CCCCGGGATACGAGTCGTTCTTTGCATCGCAGCAAGGTGTCGGTGT-GCCGCACAAGCCGTGGGACGTAGCGCGGAGAGCTAGCATGAAGCAGCGGCAGAAAACGGGAGGATCATAACCCTAGTAGCGCCCCTACCTTCCTGGCCCCCCCCATTTTGTGTAAAGTTTTTGTACATCACATGCTTTTGCTGGCAGACCACAGGAGAGTGTGTATAAGCTTGTAGCTTTGTAGCCATTTTTCGTGTTTTGTCACCGATATGTTGTGTTGGCGATGTTAGCAGAGGCCATTGATCCAGTTGGCTGCAGAATTACTTAGGACACGCCCTTTAGTT-AAAAACAAAGTTGGAAACTGGGAATGCAGTTAGTAGTGAAATTCTTTCTGACGCTATTGCAATGTTTAGTCCAATTCTGCTTAAAAAAAAAA]
[+] EMBL AK066864 [TTCAACAGTACAAGAAAGCGTCAATCAGTGGTCTGCCGTTTCCCAAATGGAAGGCTTGTTCTCTATTGCAAGGGCGCTGACAATGTCGTTTATGAAAGATTAGCTGATGGCAATAATGACATTAAAAAGATCAGCAGAGAACATCTAGAACAATTTGGCTCTGCTGGCTTGCGCACACTTTGCCTCGCTTATCGAGATCTCAGCAGGGAGCAATATGAAAGCTGGAATGAGAAGTTTATTCAAGCTAAATCTTCTTTACGTGATCGCGATAAGAAGCTTGATGAGGTGGCTGAGTTGATTGAAAAAGACCTTGTATTGGTAGGGTGTACTGCTATTGAGGACAAACTGCAAGAAGGGGTTCCTGCCTGCATTCAAACTCTTTCTGCAGCTGGCATAAAAATTTGGGTTTTAACAGGAGATAAGATGGAAACAGCAATTAATATAGCATATGCCTGCAGCCTGGTGAACAATGATATGAAACAATTCATCATCAGCTCGGAGACAGATGTAATTAGAGAGGCTGAAGACAGGGGAGACCCAGTGGAAATTGCACGTGTTATAAAAGAATCAGTAAAACAGAGCCTTAAAAGTTACCATGAGGAAGCCCGCGGTTCTCTAATTAGCACACCGGGACAAAAATTGGCGCTCATTATTGATGGGAGATGCTTGATGTATGCTCTAGACCCAACTCTGCGTGTAGATCTTCTTGGTTTGAGTTTAATTTGCCACTCAGTTGTATGTTGCCGGGTTTCTCCATTGCAGAAAGCACAGGTTGCTAGCTTAGTTAAGAAAGGTGCCCATAAGATAACTCTCAGTATTGGTGATGGTGCTAATGATGTGAGTATGATTCAAGCTGCTCATGTGGGGATTGGCATCAGTGGACAAGAAGGAATGCAAGCTGTTATGGCTAGCGATTTTGCCATTGCTCAGTTTCGATATCTTACCGACTTGCTCCTTGTACATGGAAGATGGTCATATTTGAGATTGTGCAAGGTTATCACATATTTTTTCTACAAGAATCTGACATTTACGCTAACTCAGTTCTGGTTCACTTTCCAAACTGGTTTTTCCGGTCAGCGATTTTATGATGACTGGTTCCAGTCCCTTTATAATGTCATTTTCACGGCCCTACCTGTAATTATGGTTGGATTGTTTGATAAGGATGTGAGTGCGTCTCTGTCAAAAAAATATCCGAAGCTTTACCAGGAAGGAATCAGGAATACATTCTTCAAGTGGAGGGTGATAGCAGTGTGGGCTTTCTTTGCCTTCTATCAGTCGATAGTGTTCTATTACTTCACTGCAGCTGCAAGTCGGTATGGTCATGGTTCATCCGGCAAGATTCTTGGTCTTTGGGATGTTAGTACAATGGCTTTCACCTGTGTTGTGGTGACTGTGAATCTCCGACTTCTAATGTCATGCAACTCTATAACAAGATGGCACTATATCAGTGTAGCTGGCAGTATAACAGCCT GTTTATGTTCATCTTCATCTACTCTGCAATAATGACATCATTCGACAGACAGGAAAATGTATATTTTGTGATTTATGTTTTGATGAGCACGTTTTTCTTCTACCTCACACTATTGCTTGTTCCAATCATCGCTCTCTTTGGCGACTTCTTATATTTATCAATTCAAAGGTGGTTCTTCCCCTATGACTACCAAGTAATCCAGGAGATGCACAGGGATGAACCCCACGAGTACAGCAGGATACAACTTCCAGAGACAAGCCATCTAAGCCCAGAAGAAGCAAGGAGCTATGCGATCTCCATGCTTCCCCGAGAGAGCTCGAAGCACACCGGGTTCG CCTTCGACT CCCCGGGATACGAGTCGTTCTTTGCATCGCAGCAAGGTGTCGGTGT GCCGCACAAGCCGTGGGACGTAGCGCGGAGAGCTAGCATGAAGCAGCGGCAGAAAACGGGAGGATCATAACCCTAGTAGCGCCCCTACCTTCCTGGCCCCCCCCATTTTGTGTAAAGTTTTTGTACATCACATGCTTTTGCTGGCAGACCACAGGAGAGTGTGTATAAGCTTGTAGCTTTGTAGCCATTTTTCGTGTTTTGTCACCGATATGTTGTGTTGGCGATGTTAGCAGAGGCCATTGATCCAGTTGGCTGCAGAATTACTTAGGACACGCCCTTTAGTT AAAAACAAAGTTGGAAACTGGGAATGCAGTTAGTAGTGAAATTCTTTCTGACGCTATTGCAATGTTTAGTCC ]
[+] EMBL C28597 [ ATTGCACGTGTTATAAAAGAATCAGTAAAACAGAGCCTTAAAAGTTACCATGAGGAAGCCCGCGGTTCTCTAATTAGCACACCGGGACAAAAATTGGCGCTCATTATTGATGGGAGATGCTTGATGTATGCTCTAGACCCAACTCTGCGTGTAGATCTTCTTGGTTTGAGTTTAATTTGCCACTCAGTTGTATGTTGCCGGGTTTCTCCATTGCAGAAAGCACAGGTTGCTAGCTTAGTTAAGAAAGGTGCCCATAAGATAACTCTCAGTATTGGTGATGGTGCTAATGATGTGAGTATGATTCAAGCTGCTCATGTGGGGATTGGCATCAGTGGACAAGAAGGAATGCAAGCTGTTATGGCTAGCGATTTTGCCATTGCTCAGTTTCGATATCTTACCGACTTGNTCCTTGTACATGGAAGATGG ]
[+] EMBL AK062158 [ TATTGGTGATGGTGCTAATGATGTGAGTATGATTCAAGCTGCTCATGTGGGGATTGGCATCAGTGGACAAGAAGGAATGCAAGCTGTTATGGCTAGCGATTTTGCCATTGCTCAGTTTCGATATCTTACCGACTTGCTCCTTGTACATGGAAGATGGTCATATTTGAGATTGTGCAAGGTTATCACATATTTTTTCTACAAGAATCTGACATTTACGCTAACTCAGTTCTGGTTCACTTTCCAAACTGGTTTTTCCGGTCAGCGATTTTATGATGACTGGTTCCAGTCCCTTTATAATGTCATTTTCACGGCCCTACCTGTAATTATGGTTGGATTGTTTGATAAGGATGTGAGTGCGTCTCTGTCAAAAAAATATCCGAAGCTTTACCAGGAAGGAATCAGGAATACATTCTTCAAGTGGAGGGTGATAGCAGTGTGGGCTTTCTTTGCCTTCTATCAGTCGATAGTGTTCTATTACTTCACTGCAGCTGCAAGTCGGTATGGTCATGGTTCATCCGGCAAGATTCTTGGTCTTTGGGATGTTAGTACAATGGCTTTCACCTGTGTTGTGGTGACTGTGAATCTCCGACTTCTAATGTCATGCAACTCTATAACAAGATGGCACTATATCAGTGTAGCTGGCAGTATAACAGCCTGGTTTATGTTCATCTTCATCTACTCTGCAATAATGACATCATTCGACAGACAGGAAAATGTATATTTTGTGATTTATGTTTTGATGAGCACGTTTTTCTTCTACCTCACACTATTGCTTGTTCCAATCATCGCTCTCTTTGGCGACTTCTTATATTTATCAATTCAAAGGTGGTTCTTCCCCTATGACTACCAAGTAATCCAGGAGATGCACAGGGATGAACCCCACGAGTACAGCAGGATACAACTTCCAGAGACAAGCCATCTAAGCCCAGAAGAAGCAAGGAGCTATGCGATCTCCATGCTTCCCCGAGAGAGCTCGAAGCACACCGGGTTCG CCTTCGACT CCCCGGGATACGAGTCGTTCTTTGCATCGCAGCAAGGTGTCGGTGT GCCGCACAAGCCGTGGGACGTAGCGCGGAGAGCTAGCATGAAGCAGCGGCAGAAAACGGGAGGATCATAACCCTAGTAGCGCCCCTACCTTCCTGGCCCCCCCCATTTTGTGTAAAGTTTTTGTACATCACATGCTTTTGCTGGCAGACCACAGGAGAGTGTGTATAAGCTTGTAGCTTTGTAGCCATTTTTCGTGTTTTGTCACCGATATGTTGTGTTGGCGATGTTAGCAGAGGCCATTGATCCAGTTGGCTGCAGAATTACTTAGGACACGCCCTTTAGTT AAAAACAAAGTTGGAAACTGGGAATGCAGTTAGTAGTG ]
[+] EMBL OSR24471A [ CATCCGGCAAGATTCTTGGTCTTTGGGATGTTAGTACAATGGCTTTCACCTGTGTTGTGGTGACTGTGAATCTCCGACTTCTAATGTCATGCAACTCTATAACAAGATGGCACTATATCAGTGTAGCTGGCAGTATAACAGCCTGGTTTATGTTCATCTTCATCTACTCTGCAATAATGACATCATTCGACAGACAGGAAAATGTATATTTTGTGATTTATGTTTTGATGAGCACGTTTTTCTTCTACCTCACACTATTGCTTGTTCCAATCATCGNTCTCTTTGGCGGCTTCTTATA TTATCAATTCAAAGGTGGTcc ]
[+] EMBL AU093037 [ AGGATACAACTTCCAGAGACAAGCCATCTAAGCCCAGAAGAAGCAAGGAGNTATGCGATCTCCATGCTTCCCCGAGAGAGCTCGAAGCACACCGGGTTCG CCTTCGACT CCCCGGGATACGAGTCGTTCTTTGCATCGCAGCAAGGTGTCGGTGT GCCGCACAAGCCGTGGGACGTAGCGCGGAGAGCTAGCATGAAGCAGCGGCAGAAAACGGGAGGATCATAACCCTAGTAGCGCCCNTACCTTCCTGGCCCCCCCCATTTTGTGTAAAGTTTTTGTACATCACATGCTTTTGCTGGCAGACCACAGGAGAGTGTGTATAAGCTTGTAGCTTTGTAGCCATTTTTCGTGTTTTGTCACCGATATGTTGTGTTGGCGATGTTAGCAGAGGCCATTGATCCAGTTGGCTGCAGAATTACTTAGGACACGCCCTTTAGTT AAAAACAAAGTTGGAAACTGGGAATGCAGTTAGTAGTGAAATTCTTTCTGACGCTATTGCAATGTTTAaaaaaa ]
[+] EMBL AU031896 [ AGCTATGCGATCTCCATGCTTCCCCGAGAGAGCTCGAAGCACACCGGGTTCGCCCTTCGACTCCCCCGGGATACGAGTCGTTCTTTGCATCGCAGCAAGGTGTCGGTGTNCCCGCACAAGCCGTGGGACGTAGCGCGGAGAGCTAGCATGAAGCAGCGGCAGAAAACGGGAGGATCATAACCCTAGTAGCGCCCCTACCTTCCTGGCCCCCCCCATTTTGTGTAAAGTTTTTGTACATCACATGCTTTTGCTGGCAGACCACAGGAGAGTGTGTATAAGCTTGTAGCTTTGTAGCCATTTTTCGTGTTTTGTCACCGATATGTTGTGTTGGCGATGTTAGCAGAGGCCATTGATCCAGTTGGCTGCAGAATTACTTAGGACACGCCCTTTAGTT AAAAACAAAGTTGGAAACTGGGAATGCAGTTAGTAGTGAAATTCTTTCTaaaaaa ]
[+] EMBL BI811457 [ TGTAAAATTTTTGTACATCACATGCTTTTGCTGGCAGACCACAGGAGAGTGTGTATAAGCTTGTAGCTTTGTAGCCATTTTTCGTGTTTTGTCACCGATATGTTGTGTTGGCGATGTTAGCAGAGGCCATTGATCCAGTTGGCTGCAGAATTACTTAGGACACGCCCTTTAGTTAAAAAACCAAGTTGGAAACTGGGAATGCAGTTAGTAGTGAAATTCTTTCTGACGCTATTGC ATGTTTAGTCCTTTTCTGCTTAAAAAAAAAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||