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Oryza sativa
cluster # 10566 cluster # 10566       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10566#0 length = 2238 sequences # 7  

consensusID : consensus_10566#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 2238
fasta sequence
                              [TTCAACAGTACAAGAAAGCGTCAATCAGTGGTCTGCCGTTTCCCAAATGGAAGGCTTGTTCTCTATTGCAAGGGCGCTGACAATGTCGTTTATGAAAGATTAGCTGATGGCAATAATGACATTAAAAAGATCAGCAGAGAACATCTAGAACAATTTGGCTCTGCTGGCTTGCGCACACTTTGCCTCGCTTATCGAGATCTCAGCAGGGAGCAATATGAAAGCTGGAATGAGAAGTTTATTCAAGCTAAATCTTCTTTACGTGATCGCGATAAGAAGCTTGATGAGGTGGCTGAGTTGATTGAAAAAGACCTTGTATTGGTAGGGTGTACTGCTATTGAGGACAAACTGCAAGAAGGGGTTCCTGCCTGCATTCAAACTCTTTCTGCAGCTGGCATAAAAATTTGGGTTTTAACAGGAGATAAGATGGAAACAGCAATTAATATAGCATATGCCTGCAGCCTGGTGAACAATGATATGAAACAATTCATCATCAGCTCGGAGACAGATGTAATTAGAGAGGCTGAAGACAGGGGAGACCCAGTGGAAATTGCACGTGTTATAAAAGAATCAGTAAAACAGAGCCTTAAAAGTTACCATGAGGAAGCCCGCGGTTCTCTAATTAGCACACCGGGACAAAAATTGGCGCTCATTATTGATGGGAGATGCTTGATGTATGCTCTAGACCCAACTCTGCGTGTAGATCTTCTTGGTTTGAGTTTAATTTGCCACTCAGTTGTATGTTGCCGGGTTTCTCCATTGCAGAAAGCACAGGTTGCTAGCTTAGTTAAGAAAGGTGCCCATAAGATAACTCTCAGTATTGGTGATGGTGCTAATGATGTGAGTATGATTCAAGCTGCTCATGTGGGGATTGGCATCAGTGGACAAGAAGGAATGCAAGCTGTTATGGCTAGCGATTTTGCCATTGCTCAGTTTCGATATCTTACCGACTTGCTCCTTGTACATGGAAGATGGTCATATTTGAGATTGTGCAAGGTTATCACATATTTTTTCTACAAGAATCTGACATTTACGCTAACTCAGTTCTGGTTCACTTTCCAAACTGGTTTTTCCGGTCAGCGATTTTATGATGACTGGTTCCAGTCCCTTTATAATGTCATTTTCACGGCCCTACCTGTAATTATGGTTGGATTGTTTGATAAGGATGTGAGTGCGTCTCTGTCAAAAAAATATCCGAAGCTTTACCAGGAAGGAATCAGGAATACATTCTTCAAGTGGAGGGTGATAGCAGTGTGGGCTTTCTTTGCCTTCTATCAGTCGATAGTGTTCTATTACTTCACTGCAGCTGCAAGTCGGTATGGTCATGGTTCATCCGGCAAGATTCTTGGTCTTTGGGATGTTAGTACAATGGCTTTCACCTGTGTTGTGGTGACTGTGAATCTCCGACTTCTAATGTCATGCAACTCTATAACAAGATGGCACTATATCAGTGTAGCTGGCAGTATAACAGCCTGGTTTATGTTCATCTTCATCTACTCTGCAATAATGACATCATTCGACAGACAGGAAAATGTATATTTTGTGATTTATGTTTTGATGAGCACGTTTTTCTTCTACCTCACACTATTGCTTGTTCCAATCATCGCTCTCTTTGGCGACTTCTTATATTTATCAATTCAAAGGTGGTTCTTCCCCTATGACTACCAAGTAATCCAGGAGATGCACAGGGATGAACCCCACGAGTACAGCAGGATACAACTTCCAGAGACAAGCCATCTAAGCCCAGAAGAAGCAAGGAGCTATGCGATCTCCATGCTTCCCCGAGAGAGCTCGAAGCACACCGGGTTCG-CCTTCGACT-CCCCGGGATACGAGTCGTTCTTTGCATCGCAGCAAGGTGTCGGTGT-GCCGCACAAGCCGTGGGACGTAGCGCGGAGAGCTAGCATGAAGCAGCGGCAGAAAACGGGAGGATCATAACCCTAGTAGCGCCCCTACCTTCCTGGCCCCCCCCATTTTGTGTAAAGTTTTTGTACATCACATGCTTTTGCTGGCAGACCACAGGAGAGTGTGTATAAGCTTGTAGCTTTGTAGCCATTTTTCGTGTTTTGTCACCGATATGTTGTGTTGGCGATGTTAGCAGAGGCCATTGATCCAGTTGGCTGCAGAATTACTTAGGACACGCCCTTTAGTT-AAAAACAAAGTTGGAAACTGGGAATGCAGTTAGTAGTGAAATTCTTTCTGACGCTATTGCAATGTTTAGTCCAATTCTGCTTAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK066864             [TTCAACAGTACAAGAAAGCGTCAATCAGTGGTCTGCCGTTTCCCAAATGGAAGGCTTGTTCTCTATTGCAAGGGCGCTGACAATGTCGTTTATGAAAGATTAGCTGATGGCAATAATGACATTAAAAAGATCAGCAGAGAACATCTAGAACAATTTGGCTCTGCTGGCTTGCGCACACTTTGCCTCGCTTATCGAGATCTCAGCAGGGAGCAATATGAAAGCTGGAATGAGAAGTTTATTCAAGCTAAATCTTCTTTACGTGATCGCGATAAGAAGCTTGATGAGGTGGCTGAGTTGATTGAAAAAGACCTTGTATTGGTAGGGTGTACTGCTATTGAGGACAAACTGCAAGAAGGGGTTCCTGCCTGCATTCAAACTCTTTCTGCAGCTGGCATAAAAATTTGGGTTTTAACAGGAGATAAGATGGAAACAGCAATTAATATAGCATATGCCTGCAGCCTGGTGAACAATGATATGAAACAATTCATCATCAGCTCGGAGACAGATGTAATTAGAGAGGCTGAAGACAGGGGAGACCCAGTGGAAATTGCACGTGTTATAAAAGAATCAGTAAAACAGAGCCTTAAAAGTTACCATGAGGAAGCCCGCGGTTCTCTAATTAGCACACCGGGACAAAAATTGGCGCTCATTATTGATGGGAGATGCTTGATGTATGCTCTAGACCCAACTCTGCGTGTAGATCTTCTTGGTTTGAGTTTAATTTGCCACTCAGTTGTATGTTGCCGGGTTTCTCCATTGCAGAAAGCACAGGTTGCTAGCTTAGTTAAGAAAGGTGCCCATAAGATAACTCTCAGTATTGGTGATGGTGCTAATGATGTGAGTATGATTCAAGCTGCTCATGTGGGGATTGGCATCAGTGGACAAGAAGGAATGCAAGCTGTTATGGCTAGCGATTTTGCCATTGCTCAGTTTCGATATCTTACCGACTTGCTCCTTGTACATGGAAGATGGTCATATTTGAGATTGTGCAAGGTTATCACATATTTTTTCTACAAGAATCTGACATTTACGCTAACTCAGTTCTGGTTCACTTTCCAAACTGGTTTTTCCGGTCAGCGATTTTATGATGACTGGTTCCAGTCCCTTTATAATGTCATTTTCACGGCCCTACCTGTAATTATGGTTGGATTGTTTGATAAGGATGTGAGTGCGTCTCTGTCAAAAAAATATCCGAAGCTTTACCAGGAAGGAATCAGGAATACATTCTTCAAGTGGAGGGTGATAGCAGTGTGGGCTTTCTTTGCCTTCTATCAGTCGATAGTGTTCTATTACTTCACTGCAGCTGCAAGTCGGTATGGTCATGGTTCATCCGGCAAGATTCTTGGTCTTTGGGATGTTAGTACAATGGCTTTCACCTGTGTTGTGGTGACTGTGAATCTCCGACTTCTAATGTCATGCAACTCTATAACAAGATGGCACTATATCAGTGTAGCTGGCAGTATAACAGCCT GTTTATGTTCATCTTCATCTACTCTGCAATAATGACATCATTCGACAGACAGGAAAATGTATATTTTGTGATTTATGTTTTGATGAGCACGTTTTTCTTCTACCTCACACTATTGCTTGTTCCAATCATCGCTCTCTTTGGCGACTTCTTATATTTATCAATTCAAAGGTGGTTCTTCCCCTATGACTACCAAGTAATCCAGGAGATGCACAGGGATGAACCCCACGAGTACAGCAGGATACAACTTCCAGAGACAAGCCATCTAAGCCCAGAAGAAGCAAGGAGCTATGCGATCTCCATGCTTCCCCGAGAGAGCTCGAAGCACACCGGGTTCG CCTTCGACT CCCCGGGATACGAGTCGTTCTTTGCATCGCAGCAAGGTGTCGGTGT GCCGCACAAGCCGTGGGACGTAGCGCGGAGAGCTAGCATGAAGCAGCGGCAGAAAACGGGAGGATCATAACCCTAGTAGCGCCCCTACCTTCCTGGCCCCCCCCATTTTGTGTAAAGTTTTTGTACATCACATGCTTTTGCTGGCAGACCACAGGAGAGTGTGTATAAGCTTGTAGCTTTGTAGCCATTTTTCGTGTTTTGTCACCGATATGTTGTGTTGGCGATGTTAGCAGAGGCCATTGATCCAGTTGGCTGCAGAATTACTTAGGACACGCCCTTTAGTT AAAAACAAAGTTGGAAACTGGGAATGCAGTTAGTAGTGAAATTCTTTCTGACGCTATTGCAATGTTTAGTCC                    ]
[+] EMBL C28597               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTGCACGTGTTATAAAAGAATCAGTAAAACAGAGCCTTAAAAGTTACCATGAGGAAGCCCGCGGTTCTCTAATTAGCACACCGGGACAAAAATTGGCGCTCATTATTGATGGGAGATGCTTGATGTATGCTCTAGACCCAACTCTGCGTGTAGATCTTCTTGGTTTGAGTTTAATTTGCCACTCAGTTGTATGTTGCCGGGTTTCTCCATTGCAGAAAGCACAGGTTGCTAGCTTAGTTAAGAAAGGTGCCCATAAGATAACTCTCAGTATTGGTGATGGTGCTAATGATGTGAGTATGATTCAAGCTGCTCATGTGGGGATTGGCATCAGTGGACAAGAAGGAATGCAAGCTGTTATGGCTAGCGATTTTGCCATTGCTCAGTTTCGATATCTTACCGACTTGNTCCTTGTACATGGAAGATGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AK062158             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TATTGGTGATGGTGCTAATGATGTGAGTATGATTCAAGCTGCTCATGTGGGGATTGGCATCAGTGGACAAGAAGGAATGCAAGCTGTTATGGCTAGCGATTTTGCCATTGCTCAGTTTCGATATCTTACCGACTTGCTCCTTGTACATGGAAGATGGTCATATTTGAGATTGTGCAAGGTTATCACATATTTTTTCTACAAGAATCTGACATTTACGCTAACTCAGTTCTGGTTCACTTTCCAAACTGGTTTTTCCGGTCAGCGATTTTATGATGACTGGTTCCAGTCCCTTTATAATGTCATTTTCACGGCCCTACCTGTAATTATGGTTGGATTGTTTGATAAGGATGTGAGTGCGTCTCTGTCAAAAAAATATCCGAAGCTTTACCAGGAAGGAATCAGGAATACATTCTTCAAGTGGAGGGTGATAGCAGTGTGGGCTTTCTTTGCCTTCTATCAGTCGATAGTGTTCTATTACTTCACTGCAGCTGCAAGTCGGTATGGTCATGGTTCATCCGGCAAGATTCTTGGTCTTTGGGATGTTAGTACAATGGCTTTCACCTGTGTTGTGGTGACTGTGAATCTCCGACTTCTAATGTCATGCAACTCTATAACAAGATGGCACTATATCAGTGTAGCTGGCAGTATAACAGCCTGGTTTATGTTCATCTTCATCTACTCTGCAATAATGACATCATTCGACAGACAGGAAAATGTATATTTTGTGATTTATGTTTTGATGAGCACGTTTTTCTTCTACCTCACACTATTGCTTGTTCCAATCATCGCTCTCTTTGGCGACTTCTTATATTTATCAATTCAAAGGTGGTTCTTCCCCTATGACTACCAAGTAATCCAGGAGATGCACAGGGATGAACCCCACGAGTACAGCAGGATACAACTTCCAGAGACAAGCCATCTAAGCCCAGAAGAAGCAAGGAGCTATGCGATCTCCATGCTTCCCCGAGAGAGCTCGAAGCACACCGGGTTCG CCTTCGACT CCCCGGGATACGAGTCGTTCTTTGCATCGCAGCAAGGTGTCGGTGT GCCGCACAAGCCGTGGGACGTAGCGCGGAGAGCTAGCATGAAGCAGCGGCAGAAAACGGGAGGATCATAACCCTAGTAGCGCCCCTACCTTCCTGGCCCCCCCCATTTTGTGTAAAGTTTTTGTACATCACATGCTTTTGCTGGCAGACCACAGGAGAGTGTGTATAAGCTTGTAGCTTTGTAGCCATTTTTCGTGTTTTGTCACCGATATGTTGTGTTGGCGATGTTAGCAGAGGCCATTGATCCAGTTGGCTGCAGAATTACTTAGGACACGCCCTTTAGTT AAAAACAAAGTTGGAAACTGGGAATGCAGTTAGTAGTG                                                      ]
[+] EMBL OSR24471A            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CATCCGGCAAGATTCTTGGTCTTTGGGATGTTAGTACAATGGCTTTCACCTGTGTTGTGGTGACTGTGAATCTCCGACTTCTAATGTCATGCAACTCTATAACAAGATGGCACTATATCAGTGTAGCTGGCAGTATAACAGCCTGGTTTATGTTCATCTTCATCTACTCTGCAATAATGACATCATTCGACAGACAGGAAAATGTATATTTTGTGATTTATGTTTTGATGAGCACGTTTTTCTTCTACCTCACACTATTGCTTGTTCCAATCATCGNTCTCTTTGGCGGCTTCTTATA TTATCAATTCAAAGGTGGTcc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AU093037             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGGATACAACTTCCAGAGACAAGCCATCTAAGCCCAGAAGAAGCAAGGAGNTATGCGATCTCCATGCTTCCCCGAGAGAGCTCGAAGCACACCGGGTTCG CCTTCGACT CCCCGGGATACGAGTCGTTCTTTGCATCGCAGCAAGGTGTCGGTGT GCCGCACAAGCCGTGGGACGTAGCGCGGAGAGCTAGCATGAAGCAGCGGCAGAAAACGGGAGGATCATAACCCTAGTAGCGCCCNTACCTTCCTGGCCCCCCCCATTTTGTGTAAAGTTTTTGTACATCACATGCTTTTGCTGGCAGACCACAGGAGAGTGTGTATAAGCTTGTAGCTTTGTAGCCATTTTTCGTGTTTTGTCACCGATATGTTGTGTTGGCGATGTTAGCAGAGGCCATTGATCCAGTTGGCTGCAGAATTACTTAGGACACGCCCTTTAGTT AAAAACAAAGTTGGAAACTGGGAATGCAGTTAGTAGTGAAATTCTTTCTGACGCTATTGCAATGTTTAaaaaaa                  ]
[+] EMBL AU031896             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGCTATGCGATCTCCATGCTTCCCCGAGAGAGCTCGAAGCACACCGGGTTCGCCCTTCGACTCCCCCGGGATACGAGTCGTTCTTTGCATCGCAGCAAGGTGTCGGTGTNCCCGCACAAGCCGTGGGACGTAGCGCGGAGAGCTAGCATGAAGCAGCGGCAGAAAACGGGAGGATCATAACCCTAGTAGCGCCCCTACCTTCCTGGCCCCCCCCATTTTGTGTAAAGTTTTTGTACATCACATGCTTTTGCTGGCAGACCACAGGAGAGTGTGTATAAGCTTGTAGCTTTGTAGCCATTTTTCGTGTTTTGTCACCGATATGTTGTGTTGGCGATGTTAGCAGAGGCCATTGATCCAGTTGGCTGCAGAATTACTTAGGACACGCCCTTTAGTT AAAAACAAAGTTGGAAACTGGGAATGCAGTTAGTAGTGAAATTCTTTCTaaaaaa                                     ]
[+] EMBL BI811457             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGTAAAATTTTTGTACATCACATGCTTTTGCTGGCAGACCACAGGAGAGTGTGTATAAGCTTGTAGCTTTGTAGCCATTTTTCGTGTTTTGTCACCGATATGTTGTGTTGGCGATGTTAGCAGAGGCCATTGATCCAGTTGGCTGCAGAATTACTTAGGACACGCCCTTTAGTTAAAAAACCAAGTTGGAAACTGGGAATGCAGTTAGTAGTGAAATTCTTTCTGACGCTATTGC ATGTTTAGTCCTTTTCTGCTTAAAAAAAAAA]


>consensus_10566#0 TTCAACAGTACAAGAAAGCGTCAATCAGTGGTCTGCCGTTTCCCAAATGGAAGGCTTGTT CTCTATTGCAAGGGCGCTGACAATGTCGTTTATGAAAGATTAGCTGATGGCAATAATGAC ATTAAAAAGATCAGCAGAGAACATCTAGAACAATTTGGCTCTGCTGGCTTGCGCACACTT TGCCTCGCTTATCGAGATCTCAGCAGGGAGCAATATGAAAGCTGGAATGAGAAGTTTATT CAAGCTAAATCTTCTTTACGTGATCGCGATAAGAAGCTTGATGAGGTGGCTGAGTTGATT GAAAAAGACCTTGTATTGGTAGGGTGTACTGCTATTGAGGACAAACTGCAAGAAGGGGTT CCTGCCTGCATTCAAACTCTTTCTGCAGCTGGCATAAAAATTTGGGTTTTAACAGGAGAT AAGATGGAAACAGCAATTAATATAGCATATGCCTGCAGCCTGGTGAACAATGATATGAAA CAATTCATCATCAGCTCGGAGACAGATGTAATTAGAGAGGCTGAAGACAGGGGAGACCCA GTGGAAATTGCACGTGTTATAAAAGAATCAGTAAAACAGAGCCTTAAAAGTTACCATGAG GAAGCCCGCGGTTCTCTAATTAGCACACCGGGACAAAAATTGGCGCTCATTATTGATGGG AGATGCTTGATGTATGCTCTAGACCCAACTCTGCGTGTAGATCTTCTTGGTTTGAGTTTA ATTTGCCACTCAGTTGTATGTTGCCGGGTTTCTCCATTGCAGAAAGCACAGGTTGCTAGC TTAGTTAAGAAAGGTGCCCATAAGATAACTCTCAGTATTGGTGATGGTGCTAATGATGTG AGTATGATTCAAGCTGCTCATGTGGGGATTGGCATCAGTGGACAAGAAGGAATGCAAGCT GTTATGGCTAGCGATTTTGCCATTGCTCAGTTTCGATATCTTACCGACTTGCTCCTTGTA CATGGAAGATGGTCATATTTGAGATTGTGCAAGGTTATCACATATTTTTTCTACAAGAAT CTGACATTTACGCTAACTCAGTTCTGGTTCACTTTCCAAACTGGTTTTTCCGGTCAGCGA TTTTATGATGACTGGTTCCAGTCCCTTTATAATGTCATTTTCACGGCCCTACCTGTAATT ATGGTTGGATTGTTTGATAAGGATGTGAGTGCGTCTCTGTCAAAAAAATATCCGAAGCTT TACCAGGAAGGAATCAGGAATACATTCTTCAAGTGGAGGGTGATAGCAGTGTGGGCTTTC TTTGCCTTCTATCAGTCGATAGTGTTCTATTACTTCACTGCAGCTGCAAGTCGGTATGGT CATGGTTCATCCGGCAAGATTCTTGGTCTTTGGGATGTTAGTACAATGGCTTTCACCTGT GTTGTGGTGACTGTGAATCTCCGACTTCTAATGTCATGCAACTCTATAACAAGATGGCAC TATATCAGTGTAGCTGGCAGTATAACAGCCTGGTTTATGTTCATCTTCATCTACTCTGCA ATAATGACATCATTCGACAGACAGGAAAATGTATATTTTGTGATTTATGTTTTGATGAGC ACGTTTTTCTTCTACCTCACACTATTGCTTGTTCCAATCATCGCTCTCTTTGGCGACTTC TTATATTTATCAATTCAAAGGTGGTTCTTCCCCTATGACTACCAAGTAATCCAGGAGATG CACAGGGATGAACCCCACGAGTACAGCAGGATACAACTTCCAGAGACAAGCCATCTAAGC CCAGAAGAAGCAAGGAGCTATGCGATCTCCATGCTTCCCCGAGAGAGCTCGAAGCACACC GGGTTCGCCTTCGACTCCCCGGGATACGAGTCGTTCTTTGCATCGCAGCAAGGTGTCGGT GTGCCGCACAAGCCGTGGGACGTAGCGCGGAGAGCTAGCATGAAGCAGCGGCAGAAAACG GGAGGATCATAACCCTAGTAGCGCCCCTACCTTCCTGGCCCCCCCCATTTTGTGTAAAGT TTTTGTACATCACATGCTTTTGCTGGCAGACCACAGGAGAGTGTGTATAAGCTTGTAGCT TTGTAGCCATTTTTCGTGTTTTGTCACCGATATGTTGTGTTGGCGATGTTAGCAGAGGCC ATTGATCCAGTTGGCTGCAGAATTACTTAGGACACGCCCTTTAGTTAAAAACAAAGTTGG AAACTGGGAATGCAGTTAGTAGTGAAATTCTTTCTGACGCTATTGCAATGTTTAGTCCAA TTCTGCTTAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)