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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10653#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1143 fasta sequence
[GAGGCAGGAGTTTGTACCAATGATTCCACCAAAATACATCATCCATCGCTGGTGCAAGGATTGCAAACAAACTTGTTCTTCCATGTCACAGCCTGTATCATTAAGTAATCAGGAAACAGGAGGCTATGATGATCTCTACAAACTCACTCACCAATATTTCACAGAAGTAGTGGAATTTGGTTCTGTGAACTCAGAATCAAAGGGCTATGCTTTATCAATCATGAGGGAGATAAGGGATAAAGTGATTTCTTATGAGAAGTCACTAAGAGATCAGAGGGTTGATAGTCATGTTTCAACCGCAAATTTTGCATACAATCCAGTGAATGAGGATTTTAATGATGACACTTTGCCCATTTCTCTTAGTACAAAAGGATGGGATGTTGTACAAGGTCAGTCAAAACGTTCCCGCAAGAAGAAACTGGCAACCCCGAATGTTCTTGACACCTTGAAGAAGAAAACTAAAAGAGCATATAACAAGAGAAGGAATGCCATGGCAAATACCTTAAACACGGCAGTCACCACAACCGAAAGCATAACTGACGCCACAAAT------CATAAT-CAAGTTAATGAGGGATGGCCATTGACATCTACTGGTGCACACGAAACCTTCCCTTATGGAGTGGAGACTATTT-CATTCGATTTGTCTCAATACAACAGTGCACCTAGCTTCCACTGGCCTGAAAGCAGTAGCAGGTCTCAGCTTCAGTGAGATGAGGTGAAAAATGCAATGGTCCATGCGTTGAGAATATTCTAAGTTTGACAGACTTGCAAGATGGGCAAAGTTATTAATTACCTTGTTTCATGCT-GGAGGGTTCCTGAATCCTGACCATCTGAGGAATGTGAGAAAAGGCTCAACCTGGCGAAAACCAGTAATAACAACCGGCTTTTAACGGATTCGGTCTATATTGGTTGTCCCCTGATATTTTAGATATATGTAATGGCTGAGATGTACATAATCATTTCCCCTTTTTCTCATCCTCAGATAAATTGTAGCTTCCACTAGGTAATGTGTAATGTTAATCCTGATCATTCACGTGGTCACGTCTTAAATAATTAGACTGAATGTTACTCCTGTAAACCCCATAGTCATGGAATGTACATTGCTCAGAACTATGCCCTTCCGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL CA764712 [GAGGCAGGAGTTTGTACCAATGATTCCACCAAAATACATCATCCATCGCTGGTGCAAGGATTGCAAACAAACTTGTTCTTCCATGTCACAGCCTGTATCATTAAGTAATCAGGAAACAGGAGGCTATGATGATCTCTACAAACTCACTCACCAATATTTCACAGAAGTAGTGGAATTTGGTTCTGTGAACTCAGAATCAAAGGGCTATGCTTTATCAATCATGAGGGAGATAAGGGATAAAGTGATTTCTTATGAGAAGTCACTAAGAGATCAGAGGGTTGATAGTCATGTTTCAACCGCAAATTTTGCATACAATCCAGTGAATGAGGATTTTAATGATGACACTTTGCCCATTTCTCTTAGTACAAAAGGATGGGATGTTGTACAAGGTCAGTCAAAACGTTCCCGCAAGAAGAAACTGGCAACCCCGAATGTTCTTGACACCTTGAAGAAGAAAACTAAAAGAGCATATAACAAGAGAAGGAATGCCATGGCAAATACCTTAAACACGGCAGTCACCACAACCGAAAGCATAACTGACGCCACAAATGTGCAGCATAAT CAAGTTAATGAGGGATGGCCATTGACATCTACTGGTGCACACGAAACCTTCCCTTATGGAGTGGAGACTATTT CATTCGATTTGTCTCAATACAACAGTGCACCTAGCTTNCACTGGCCTGAAAGCAGTAGCAGGTCTCAGCTTCAGTGAGATGANGTGAAAAATGCGATGGTCCATGCGTTGAGAATATTCTAAGTTTGACAGACTTGCAAGATGGGCCAAGGTATTAANTACCCTGGTTCATGCTGGGAGGGTTCCTGNATNCTGACCATCTG ]
[+] EMBL AI978518 [ GGCAACCCCGAATGTTCTTGACACCTTGAAGAAGAAAACTAAAAGAGCATATAACAAGAGAAGGAATGCCATGGCAAATACCTTAAACACGGCAGTCACCACAACCGAAAGCATAACTGACGCCACAAAT CATAAT CAAGTTAATGAGGGATGGCCATTGACATCTACTGGTGCACACGAAACCTTCCCTTATGGAGTGGAGACTATTT CATTCGATTTGTCTCAATACAACAGTGCACCTAGCTTCCACTGGCCTGAAAGCAGTAGCAGGTCTCAGCTTCAGTGAGATGAGGTGAAAAATGCAATGGTCCATGCGTTGAGAATATTCTAAGTTTGACAGACTTGCAAGATGGGCAAAGTTATTAATTACCTTGTTTCATGCT GGAGNNTTCCTGAATCCTGACCANCNGNNNAATGTGAGAAAAGGCTCNNCCTNNCGAAAAnnng ]
[+] EMBL OSS11250A [ AATGCCATGGCAAATACCTTAAACACGGCAGTCACCACAACCGAAAGCATAACTGACGCCACAAAT CATAAT CAAGTTAATGAGGGATGGCCATTGACATCTACTGGTGCACACGAAACCTTCCCTTATGGAGTNGAGACTATTT CATTCGATTTGTCTCAATACAACAGTTCACCTAGCTTCCACTGGCCTTAAAGCAGTAGCAGGTCTNAGCTTCAGTNAGATGAGGTGAAAAATGCAATNGTCCATGCGTTGAGAATATTCTAA ]
[+] EMBL AU032602 [ CCACAACCGAAAGCATAACTGACGCCACAAAT CATAATCCAAGTNAATGAGGGATGGCCNTTGACATCTACTGGTNCACACG AACTTCCCCTTNTGGAGTGGAGACTATTTCCATTCGATTTGTCTCAATACAACAGTGCACCTAGCTTCCACTGGCCTGAAAGCAGTAGCAGGTCTCAGCTTCANTGAGATGAGGTGAAAAATGCAATGGTCCATGCGTTGAGAATATTCTAAGTTTGACAGACTTGCAAGATGGGCAAAGTTATTAATTACCTTGTTTCATGCT GGAGGGTTCCTGAATCCTGACCATCTGAGGAATGTGAGAAAAGGCTCAACCTGGCGAAAACCAGTAATAACAACCGGCTTTTAACGGATTCGGTCTATATTGGTTGTCCCCTGATATTTTAGATATATGTAATGGCTGAGATGTACATAATCATTTCCCCTTTTTCTCATCCTCAGATAAATTGTAGCTTCCACTAGGTAATGTGTAATGTTAATCCTGATCATTCACGTGGTCACGTCTTAAATAATTAGACTGAATGTTACTCCTGTAAACCCCATAGTCATGGAATGTACATTGCTCAGAACTATGCCCTT CAAAAAAAAAAAA ]
[-] EMBL CA762956 [ gccaaggggGGAGTGGAGACTATTT CATTCGATTTGTCTCAATACAACAGTGCACCTAGCTTCCACTGGCCTGAAAGCAGTAGCAGGTTTCAGCTTCAGTGAGATGAGGTGAAAAATGCAATGGTCCATGCGTTGAGAATATTCTAAGTTTGACAGACTTGCAAGATGGGCAAAGTTATTAATTACCTTGTTTCATGCT GGAGGGTTCCTGAATCCTGACCATTTGAGGAATGTGAGAAAAGGCTCAACCTGGCGAAAACCAGTAATAACAACCGGCTTTTAACGGATTCGGTCTATATTGGTTGTCCCCTGATATTTTAGATATATGTAATGGCTGAGATGTACATAATCATTTCCCCTTTTTCTCATCCTCAGATAAATTGTAGCTTCCCCTAGGTAATGTGTAATGTTAATCCTGATCATTCACGTGGTCACGTCTTAAATAATTAGACTGAATGTTACTCCTGTAAACCCCATAGTCATGGAACGTACATTGCTCAGAACTATGCCCTTCCGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[-] EMBL CA762957 [ gccaaggggGGAGTGGAGACTATTT CATTCGATTTGTCTCAATACAACAGTGCACCTAGCTTCCACTGGCCTGAAAGCAGTAGCAGGTTTCAGCTTCAGTGAGATGAGGTGAAAAATGCAATGGTCCATGCGTTGAGAATATTCTAAGTTTGACAGACTTGCAAGATGGGCAAAGTTATTAATTACCTTGTTTCATGCT GGAGGGTTCCTGAATCCTGACCATTTGAGGAATGTGAGAAAAGGCTCAACCTGGCGAAAACCAGTAATAACAACCGGCTTTTAACGGATTCGGTCTATATTGGTTGTCCCCTGATATTTTAGATATATGTAATGGCTGAGATGTACATAATCATTTCCCCTTTTTCTCATCCTCAGATAAATTGTAGCTTCCCCTAGGTAATGTGTAATGTTAATCCTGATCATTCACGTGGTCACGTCTTAAATAATTAGACTGAATGTTACTCCTGTAAACCCCATAGTCATGGAACGTACATTGCTCAGAACTATGCCCTTCCGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL AI978519 [ CGTTGAGAATATNNNAAGTTTGACNNNNTTGNAAGATGGGCAAAGTTATTAATTANNNTGTTTCATGCT GGAGGGTTCCTGAATCCTGACCATCTGAGGAATGTGAGAAAAGGCTCAACCTGGCGAAAACCAGTAATAACAACCGGCTTTTAACGGATTCGGTCTATATTGGTTGTCCCCTGATATTTTAGATATATGTAATGGCTGAGATGTACATAATCATTTCCCCTTTTTCTCATCCTCAGATAAATTGTAGCTTCCACTAGGTAATGTGTAATGTTAATCCTGATCATTCACGTGGTCACGTCTTAAATAATTAGACTGAATGTTACTCCTGTAAACCCCATAGTCATGGAATGTACATTGCTCAGAACTATG ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||