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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10747#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1442 fasta sequence
[AGCAAGGCTAGGGATCATGGCTGCTGGATGTTATGGCCTTCCACAATTTCGGATGCGTGTATTTTTATTAGGCTGTCATTCTAAGGAGAAATTACCCCCTTTTCCACTGCCTACGCATGAGGCGATTGTGAAGAATGGCTGCCCGTTGGCTTTTGAGCGTAATTTGGTTGGTTGGCCCAATGACACACCAATGCAACTAGCAAGACCAATTGTCCTTGAAGACATTCTTTCTGATCTCCCAGAAGTGGCAAATGGGGAAAGCCGTGATGAAATGCTGTATGTAAAGGGTCCTCAAACTGAATTCCAAAGATACATTCGGTCATTTAATGTTGAAGTGCATGGTCCCAGAGCTCATGTTACAAAAGATTCCAAATCCTCAAAATTGTATGATCATCGACCATTGGTACTGGATAATGATAACTACCAAAGGATATTGCAAATTCCCAAGAGAAAGGGAGCTAATTTTAGAGACCTTTCAGGAGTCATAGTTGGTCCTGACAATGTGGCTAGATTAGATCCAACGAAAGAAAGAGTACTTTTGCCATCTGGTCGTCCTCTGGTGCTTGATTGCATACTAGCTTATGAGAATGGTAAATCTTTAAGACCTTTTGGTCGAGTATGGTGGGATGAGGTAGTGGGAACCGTGCTGACAGTTCCAAATGCCCGTATGCAGGCCTTGATACATCCTGCACAAGACAGACTGCTTACTATTCGTGAAAGTGCTCGGTTGCAAGGCTTTCCTGACAATTACAGGTTTCGTGGAACAGTCAAAGACAGGTATCG--CCA-GA--TTGGAAATGCGGTGG-CCGTA--CCTGTTGGA-CGA-GCA--CTTGGATACG-CCCTGGCGATGGCCTACCTGAAGAAGTCTGGAGACGATCCCCTTATGTTGCT-GCCGCCCAACTTTGCATTCTCCCATGACTTAAGAGGGTTTGCCTAGTCAAACACCCTTGTCAGAAGGCACAAATTTGAGTTCCTTCCCTCGTTGG-TTTGATTGAAATTCACCATCTACATTAATGCTCTGCTACAAAAGCTGCTCCTCTTCTTGTT-GCCACCCTTTCTCGT-GAATAGTGAATAGCATTAGGAGTTAGGACATGCCA-TTTATCT-G-TTGGGATCAGATCAAGGAATCTGGGTTCCCCAATCTGATGATCAGCTGTTTGTTGTAGCAAAATCATTCCTTGAT-TTACAGTAGTTGTGACATCCACCACACTAGTTAATTAGAAGGATTCCATAGGGCAAGTGTAG-TGACTCATATCGGGAGCCTATGTTGTAGTGTAAAAG-AATGTATGTACAAGTTAGATGATTAGGA-AAATAAAATGTATGGACATCATCTTACCTGTTGTTGTGTTAGCCAGC-GATGAACACAAATGTAACGACTT-CAATAAATCTACATTGAGCTGCAGATTTCCAATGGAACAAAATTAATCTA-------AT---AGA--AAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL AK111685 [AGCAAGGCTAGGGATCATGGCTGCTGGATGTTATGGCCTTCCACAATTTCGGATGCGTGTATTTTTATTAGGCTGTCATTCTAAGGAGAAATTACCCCCTTTTCCACTGCCTACGCATGAGGCGATTGTGAAGAATGGCTGCCCGTTGGCTTTTGAGCGTAATTTGGTTGGTTGGCCCAATGACACACCAATGCAACTAGCAAGACCAATTGTCCTTGAAGACATTCTTTCTGATCTCCCAGAAGTGGCAAATGGGGAAAGCCGTGATGAAATGCTGTATGTAAAGGGTCCTCAAACTGAATTCCAAAGATACATTCGGTCATTTAATGTTGAAGTGCATGGTCCCAGAGCTCATGTTACAAAAGATTCCAAATCCTCAAAATTGTATGATCATCGACCATTGGTACTGGATAATGATAACTACCAAAGGATATTGCAAATTCCCAAGAGAAAGGGAGCTAATTTTAGAGACCTTTCAGGAGTCATAGTTGGTCCTGACAATGTGGCTAGATTAGATCCAACGAAAGAAAGAGTACTTTTGCCATCTGGTCGTCCTCTGGTGCTTGATTGCATACTAGCTTATGAGAATGGTAAATCTTTAAGACCTTTTGGTCGAGTATGGTGGGATGAGGTAGTGGGAACCGTGCTGACAGTTCCAAATGCCCGTATGCAGGCCTTGATACATCCTGCACAAGACAGACTGCTTACTATTCGTGAAAGTGCTCGGTTGCAAGGCTTTCCTGACAATTACAGGTTTCGTGGAACAGTCAAAGACAGGTATCG CCA GA TTGGAAATGCGGTGG CCGTA CCTGTTGGA CGA GCA CTTGGATACG CCCTGGCGATGGCCTACCTGAAGAAGTCTGGAGGCGATCCCCTTATGTTGCT GCCGCCCAACTTTGCATTCTCCCATGACTTAAGAGGGTTTGCCTAGTCAAACACCCTTGTCAGAAGGCACAAATTTGAGTTCCTTCCCTCGTTGG TTTGATTGAAATTCACCATCTACATTAATGCTCTGCTACAAAAGCTGCTCCTCTTCTTGTT GCCACCCTTTCTCGT GAATAGTGAATAGCATTAGGAGTTAGGACATGCCA TTTATCT G TTGGGATCAGATCAAGGAATCTGGGTTCCCCAATCTGATGATCAGCTGTTTGTTGTAGCAAAATCATTCCTTGAT TTACAGTAGTTGTGACATCCACCACACTAGTTAATTAGAAGGATTCCATAGGGCAAGTGTAG TGACTCATATCGGGAGCCTATGTTGTAGTGTAAAAG AATGTATGTACAAGTTAGATGATTAGGA AAATAAAATGTATGGACATCATCTTACCTGTTGTTGTGTTAGCCAGC GATGAACACAAATGTAACGACTT CAATAAATCTAC ]
[+] EMBL CA753055 [ GATGTTATGGCCTTCCACAATTTCGGATGCGTGTATTTTTATTAGGCTGTCATTCTAAGGAGAAATTACCCCCTTTTCCACTGCCTACGCATGAGGCGATTGTGAAGAATGGCTGCCCGTTGGCTTTTGAGCGTAATTTGGTTGGTTGGCCCAATGACACACCAATGCAACTAGCAAGACCAATTGTCCTTGAAGACATTCTTTCTGATCTCCCAGAAGTGGCAAATGGGGAAAGCCGTGATGAAATGCTGTATGTAAAGGGTCCTCAAACTGAATTCCAAAGATACATTCGGTCATTTAATGTTGAAGTGCATGGTCCCAGAGCTCATGTGACAAAAGATTCCAAATCCTCAAAATTGTATGATCATCGACCATTGGTACTGGATAATGATAACTACCAAAGGATATTGCAAATNCCCCAGAGAAAGGGAGCTAATNTTAGAGACCTTTCAGGAGTCATAGTTGGTCCTGACAATGTGGCTAGATAAGATCCAACGAAAGAAAGAGTACTTTTGCCATCTGGTCGTCCTCTGGT ]
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[-] EMBL CA759429 [ CGTGGAACAGTCAAAGACAGGTATCG CCA GA TTGGAAATGCGGTGG CCGTA CCTGTTGGA CGA GCA CTGGGATACG CCCTTGCGATGGCCTACCTGAAGAAGTCTGGAGACGATCCCCTTATGTTGCT GCCGCCCAACTTTGCATTCTCCCATGACTTAAGAGGGTTTGCCTAGTCAAACACCCTTGTCAGAAGGCACAAATTTGAGTTCCTTCCCTCGTTGG TTTGATTGAAATTCACCATCTACATTAATGCTTTGCTACAAAAGCTGCTCCTCTTCTTGTT GCCACCCTTTCTCGT GAATAGTGAATAGCATTAGGAGTTAGGACATGCCA TTTATCT G TTGGGATCAGATCAAGGAATCTGGGTTCCCCAATTTGATGATCAGCTGTTTGTTGTAGCAAAATCATTCCTTGAT TTACAGTAGTTGTGACATCCCCCCCACTAGTTAATTAGAAGGATTCCATAGGGCAAGTGTAG TGACTCATATCGGGAGCCTATGTTGTAGTGTAAAAG AATGTATGTACAAGTTAGATGATTAGGA AAATAAAATGTATGGACATCATCTTACCTGTTGTTGTGTTAGCCAGC GATGAACACAAATGTAACGACTT CAATAAATCTACATTGAGCTGCAGATTTCCAATGGAACAAAATTAATCTATTGCGTGAT AGATTAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL BQ908804 [ ATCGCCCCANGAATTTGGAAATCCGGTGGCCCGTAACCCTGTTGGACCGATGCAACCTTGGATACGCCCCTTGCGATGGCCTACCTGAAGAAGTCTGGAGACGATCCCCTTATGTTGCTCGCCGCCCAACTTTGCATTCTCCCATGACTTAAGAGGGTTTGCCTAGTCAAACACCCTTGTCAGAAGGCACAAATTTGAGTTCCTTCCCTCGTTGGCTTTGATTGAAATTCACCATCTACATTAATGCTCTGCTACCAAAGCTGCTCCTCTTCTTGTTGGCCACCCTTTCTCGTCGAATAGTGAATAGCATTAGGAGTTAGGACATGCCACTTTATCTCGCTTGGGATCAGATCAAGGAATCTGGGTTCCCCAATCTGATGATCAGCTGTTTGTTGTAGCCAAATCATTCCTTGATNTTACAGTAGTTGTGACATCCACCACACTAGTTAATTAGAAGGATTCCATAGGGCAAGTGTAGCTGACTCATATCGGGAGCCTATGTTGTAGTGTAAAAG AATGTATGTACAAGTTAGATGATTAGGACAAATAAAATGTATGGACATCATCTTACCTGTTGTTGTGTTAGCCAGC GATGAACAC AATGTAACGACTTCCAATAAATCTACATTGAGCTGCAGATTTCC ATGGAAAAAA ]
[+] EMBL CA766261 [ GAGACGATCCCCTTATGTTGCT GCCGCCCAACTTTGCATTCTCCCATGACTTAAGAGGGTTTGCCCAGTCAAACACCCTTGTCAGAAGGCACAAATTTGAGTTCCTTCCCTCGTTGG TTTGATTGAAATTCACCATCTACATTAATGCTCTGCTACAAAAGCTGCTCCTCTTCTTGTT GCCACCCTTTCTCGT GAATAGTGAATAGCATTAGGAGTTAGGACATGCCA TTTATCT G TTGGGATCAGATCAAGGAATCTGGGTTCCCCAATCTGATGATCAGCTGTTTGTTGTAGCAAAATCATTCCTTGAT TTACAGTAGTTGTGACATCCACCACACTAGTTAATTAGAAGGATTCCATAGGGCAAGTGTAG TGACTCATATCGGGAGCCTATGTTGTAGTGTAAAAG AATGTATGTACAAGTTAGATGATTAGGA AAATAAAATGTATGGACATCATCTTACCTGTTGTTGTGTTAGCCAGC GATGAACACAAATGTAACGACTT CAATAAATCTACATTGAGCTGCAGAT ]
[+] EMBL BM420110 [ GATCCCCTTATGTT CT GCCGCCCAACTTTGCATTCTCCCATGACTTAAGAGGGTTTGCCTAGTC AACACCCTTGTCAGAAGGCACAAATTTGAGTTCCTTCCCTCGTTGG TTTGATTGAAATTCACCATCTACATTAATGCTCTGCTAC AAAGCTGCTCCTCTTCTTGTT GCCACCCTTTCTCGT GAATAGTGAATAGCATTAGGAGTTAGGACATGCCA TTTATCT G TTGGGATCAGATCAAGGAATCTGGGTTCCCC ATCTGATGATCAGCTGTTTGTTGTAGCAAAATCATTCCTTGAT TTACAGTAGTTGTGACATCC CCACACTAGTTAATTAGAAGGATTCCATAGGGCAAGTGTAG TGACTCATATCGGGAGCCTATGTTGTAGTGTAAAAG AATGTATGTACAAGTTAGATGATTAGGA AAATAAAATGTATGGACATCATCTTACCTGTTGTTGTGTTAGCCAGC GATGAACAC AATGTAACGACTT C ATAAATCTACATTGAGCTGCAGATTTCC ATGGAAC AAATTAATCTA TTGCGTGA TAAAAAAAA ]
[-] EMBL CF326157 [ GCATTCTCCCATGACTTAAGAGGGTTTGCCTAGTCAAACACCCTTG CAGAAGGCACAAATTTGAGTTCCTTCCCTCGTTGG TTTGATTGAAATTCACCATCTACATTAATGCTCTGCTACAAAAGCTGCTCCTCTTCTTGTT GCCACCCTTTCTCGT GAATAGTGAATAGCATTAGGAGTTAGGACATGCCA TTTATCT G TTGGGATCAGATCAAGGAATCTGGGTTCCCCAATCTGATGATCAGCTGTTTGTTGTAGCAAAATCATTCCTTGAT TTACAGTAGTTGTGACATCCACCACACTAGTTAATTAGAAGGATTCCATAGGGCAAGTGTAG TGACTCATATCGGGAGCCTATGTTGTAGTGTAAAAG AATGTATGTACAAGTTAGATGATTAGGA AAATAAAATGTATGGACATCATCTTACCTGTTGTTGTGTTAGCCAGC GATGAACACAAATGTAACGACTT CAATAAATCTACATTGAGCTGCAGATTTCCAATGGAACAAAATTAATCTA AA AAA AAAAAAAAAAAActcga]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||