These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10873#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1297 fasta sequence [GCCGCTCACAAACCCTAGCCCCCATGTCATCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGACGGAAATGGCGGAGGGCGAGGTCGAGAGCCGCGACTGGGCGGAGATGCCGTCGGACGCGCTCGCGGCGGTGTTCGGGAAGCTGGACGTGACCGACCTCCTGGTCGGGGCCGGGGTGGTGTGCCGCGCGTGGCGCCGGCTCGCGGCGATCGACCCCACGCTGTGGCGCCGCGTGGATATGAGCCACCAGGGAGACATCATGGAGGTCGACGAGGCGGTGGCCATGGCGCGCGCCGCGG-TGGACCGAGCCGCCGGCACCATGGAAGCTTTCTGGGCCGACTCCTTCGTCACCGATGGCCTCCTCCTCTACATCTCCGAGAGAGCCTCCTCATTGAAGAGCCTTCAACTCAGCATGTGCCTTAATGTCAGTAATGAAGGGATGGCAGAGGCAATGAAGGGCTTTCCTCGGCTTGAGGAGCTGGATATTACATTCTGTTCTTTGTATGGTGATGTGTGTGCATCCGTTGGCAAAGCTTGCCCAGAGCTCAAATGCTTCAGGCTGAACGAACGTTATACTTTACAAATGGATTATGCAGCCCCTGATATCATGGATGATGACA-CTGAAGCATTAGGGATTGC-AA-GCAATATGCCCAAGCTCAGAGAGCTTCAGCTGATTGGCAACAAGCTAACTAATGATGGGCTGATGTCAATCCTTGACCACTGCCAGCACCTTGAATCCCTGGACATACGCCAGTGCTACAGCATTCAAATGGATGATGCTCTGAAATCAAAGTGTTCTAGAATAAGTGATCTTAAGCTTCCTCATGACTCGATCTCTGATTTCAAGTACCGGGCTTACATTTTCAGCAGCAGTGCCTTTTCTGGTTCTGATTTAGAGCTTGATATGTATGATGATCTGCTGGATGTGGTCACTGATGATGATGATGCTGACTTTGATGATATGGATGATTATGATGATGGGGGCTCAGATGGTGGCATGTACGATGAATTTGATATCTGATGAGAATTACACTGTGCATGTGAAAATCGAGAGCTAGAACAGTTTGGTGCTTCTGTGTGTTGAGAATATGGAATTAGGTCTTCATATCAGCGGCAATGTTTATCACTTAGCTACAGCAGATCTGCTGGTGTTTATATTCAGTGTTCTTTTCTGGCCTCATTTTCCAAGAATCTGTAATTGATTATATGTTGACTTTGCTACGAGTAGTAGTTTTGCAGACATGTTCTGAGTAGGATGCTTGCAAATGTGATAATATTGCATTCCTGAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL AU225653 [GCCGCTCACAAACCCTAGCCCCCATGTCATCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGACGGAAATGGCGGAGGGCGAGGTCGAGAGCCGCGACTGGGCGGAGATGCCGTCGGACGCGCTCGCGGCGGTGTTCGGGAAGCTGGACGTGACCGACCTCCTGGTCGGGGCCGGGGTGGTGTGCCGCGCGTGGCGCCGGCTCGCGGCGATCGACCCCACGCTGTGGCGCCGCGTGGATATGAGCCACCAGGGAGACATCATGGAGGTCGACGAGGCGGTGGCCATGGCGCGCGCCGCGG TGGACCGAGCCGCCGGCACCATGGAAGCTTTCTGGGCCGACTCCTTCGTCACCGATGGCCTCCTCCTCTACATCTCCGAGAGAGCCTCCTCATTGAAGAGCCTTCAACTCAGCATGTGCCTTAGTGTCAGTATTGAAGG ] [+] EMBL AK071724 [ AAACCCTAGCCCCCATGTCATCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGACGGAAATGGCGGAGGGCGAGGTCGAGAGCCGCGACTGGGCGGAGATGCCGTCGGACGCGCTCGCGGCGGTGTTCGGGAAGCTGGACGTGACCGACCTCCTGGTCGGGGCCGGGGTGGTGTGCCGCGCGTGGCGCCGGCTCGCGGCGATCGACCCCACGCTGTGGCGCCGCGTGGATATGAGCCACCAGGGAGACATCATGGAGGTCGACGAGGCGGTGGCCATGGCGCGCGCCGCGG TGGACCGAGCCGCCGGCACCATGGAAGCTTTCTGGGCCGACTCCTTCGTCACCGATGGCCTCCTCCTCTACATCTCCGAGAGAGCCTCCTCATTGAAGAGCCTTCAACTCAGCATGTGCCTTAATGTCAGTAATGAAGGGATGGCAGAGGCAATGAAGGGCTTTCCTCGGCTTGAGGAGCTGGATATTACATTCTGTTCTTTGTATGGTGATGTGTGTGCATCCGTTGGCAAAGCTTGCCCAGAGCTCAAATGCTTCAGGCTGAACGAACGTTATACTTTACAAATGGATTATGCAGCCCCTGATATCATGGATGATGACA CTGAAGCATTAGGGATTGC AA GCAATATGCCCAAGCTCAGAGAGCTTCAGCTGATTGGCAACAAGCTAACTAATGATGGGCTGATGTCAATCCTTGACCACTGCCAGCACCTTGAATCCCTGGACATACGCCAGTGCTACAGCATTCAAATGGATGATGCTCTGAAATCAAAGTGTTCTAGAATAAGTGATCTTAAGCTTCCTCATGACTCGATCTCTGATTTCAAGTACCGGGCTTACATTTTCAGCAGCAGTGCCTTTTCTGGTTCTGATTTAGAGCTTGATATGTATGATGATCTGCTGGATGTGGTCACTGATGATGATGATGCTGACTTTGATGATATGGATGATTATGATGATGGGGGCTCAGATGGTGGCATGTACGATGAATTTGATATCTGATGAGAATTACACTGTGCATGTGAAAATCGAGAGCTAGAACAGTTTGGTGCTTCTGTGTGTTGAGAATATGGAATTAGGTCTTCATATCAGCGGCAATGTTTATCACTTAGCTACAGCAGATCTGCTGGTGTTTATATTCAGTGTTCTTTTCTGGCCTCATTTTCCAAGAATCTGTAATTGATTATATGTTGACTTTGCTACGAGTAGTAGTTTTGCAGACATGTTCTGAGTAGGATGCTTGCAAATGTGATAATATTGCATT ] [+] EMBL CB654278 [ TAGCCCCCCTGTCATCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGACGGAAATGGCGGAGGGCGAGGTCGAGAGCCGCGACTGGGCGGAGATGCCGTCGGACGCGCTCGCGGCGGTGTTCGGGAAGCTGGACGTGACCGACCTCCTGGTCGGGGCCGGGGTGGTGTGCCGCGCGTGGCGCCGGCTCGCGGCGATCGACCCCACGCTGTGGCGCCGCGTGGATATGAGCCACCAGGGAGACATCATGGAGGTCGACGAGGCGGTGGCCATGGCGCGCGCCGCGG TGGACCGAGCCGCCGGCACCATGGAAGCTTTCTGGGCCGACTCCTTCGTCACCGATGGCCTCCTCCTCTACATCTCCGAGAGAGCCTCCTCATTGAAGAGCCTTCAACTCAGCATGTGCCTTAATGTCAGTAATGAAGGGATGGCAGAGGCAATGAAGGGCTTTCCTCGGCTTGAGGAGCTGGATATTACATTCTGTTCTTTGTATGGTGATGTGTGTGCATCCGTTGGCAAAGCTTGCCCAGAGCTCAAATGCTTCAGGCTGAACGAACGTTATACTTTACAAATGGATTATGCAGCCCCTGATATCATGGATGATGACA CTGAAGCATTAGGGATTGC AA GCAATATGCCCAAGCTCAGAGAGCTTCAGCTGATTGGCAACAAGCTAACTAATGATGGGCTGATGTCAATCCTTGACCACTGCCAGCACCTTGAATCCCTGGACATACGCCAGTGCTACAGCATTCAAATGGATGATGCTCTGAAAT AAAGTGTTCTAGAATAAGTGATCTTTAGCTTCCTCATGACTCGATCTCTGATTTCAAGTACCGGGCTTACATTTTCAGCAGCAGTGCCTTTT ] [+] EMBL AU055964 [ TCGCGGCGATCGACCCCACGCTGT GCGCCGCGTGGATATGAGCCACCAGGGAGACATCATGGAGGTCGACGAGGCGGTGGCCATGGCGCGCGCCGCGGNTGGACCGAGCCGCCGGCACCATGGAAGCTTTCTGGGCCGACTCCTTCGTCACCGATGGCCTCCTCCTCTACATCTCCGAGAGAGCCTCCTCATTGAAGAGCCTTCAACTCAGCATGTGCCTTAATGTCAGTAATGAAGGGATGGCAGAGGCAATGAAGGGCTTTCCTCGGCTTGAGGAGCTGGATATTACATTCTGTTCTTTGTATGGTGATGTGTGTGCATCCGTTGGCAAAGCTTGCCCAGAGCTCAAATGCTTCAGGCTGAACGAACGTTATACTTTACAAATGGATTATGCAGCCCCTGATATCATGGATGATGACA CTGAAGCATTAGGGATTGCAAA GCAATATGCCCAAGCTCAGAGAGCTTCAGCTGATTGGCAACAAGCTAACTAATGATGGGCTGATGTCAATCCTTGACCACTGCCAGCACCTTGAATCCCTGGACATACGCCAGTGCTACAGCATTCAAATGGATGATGCTCTGAAATCAAAGTGTTCTAGAATAAGTGATCTTAAGCTTCCTCATGACTCGATCTCTGATTTCAAGTACCGGGNTTACATTTTCAGAAGCAGTG CTTTTCTGGTNCTGATTTA ] [-] EMBL CB654279 [ CAAAGCTTGCCCAGAGCTCAAATGCTTCAGGCTGAACGAACGTTATACTTTACAAATGGATTATGCAGCCCCTGATATCATGGATGATGACA CTGAAGCATTAGGGATTGC AA GCAATATGCCCAAGCTCAGAGAGCTTCAGCTGATTGGCAACAAGCTAACTAATGATGGGCTGATGTCAATCCTTGACCACTGCCAGCACCTTGAATCCCTGGACATACGCCAGTGCTACAGCATTCAAATGGATGATGCTCTGAAATCAAAGTGTTCTAGAATAAGTGATCTTAAGCTTCCTCATGACTCGATCTCTGATTTCAAGTACCGGGCTTACATTTTCAGCAGCAGTGCCTTTTCTGGTTCTGATTTAGAGCTTGATATGTATGATGATCTGCTGGATGTGGTCACTGATGATGATGATGCTGACTTTGATGATATGGATGATTATGATGATGGGGGCTCAGATGGTGGCATGTACGATGAATTTGATATCTGATGAGAATTACACTGTGCATGTGAAAATCGAGAGCTAGAACAGTTTGGTGCTTCTGTGTGTTGAGAATATGGAATTAGGTCTTCATATCAGCGGCAATGTTTATCACTTAGCTACAGCAGATCTGCTGGTGTTTATATTCAGTGTTCTTTTCTGGCCTCATTTTCCAAGAATCTGTAATTGATTATATGTTGACTTTGCTACGAGTAGTAGTTTTGCAGACATGTTCTGAGTAGGAAGGGGGCAAATGTGATAATATTGCATTCCTGAGAAAACTTAAAA ] [+] EMBL AT003380 [ GCANCCCCTGATNTCATGGNTGATGNCN CTGAAGCNTTAGGGATTGC AANCCAATATGCCCAAGCTAAGAGANCTTNAGCTGATNGGCACCAAGCTAACTAATGATGGGCTGATGTCAATCCTTGACCNCTGCCAGCNCCTTGAATCCCTGGACATACGCCAGTGCTACAGCATTCAAATGGATGATGCTCTGAAATCAAAGTGTTCTAGAATAAGTGATCTTAAGCTTCCTCATGACTCGATCTCTGATTTCAAGTACCGGGCTTACATTTTCAGCAGCAGTGCCTTTTCTGGTTCTGATTTAGAGCCTGATATGTATGATGATCTGCTGGATGTGGTCACTGATGATGATGATGCTGACTTTGATGATATGGATGATTATGATGATGGGGGCTCAGATGGTGGCATGTACGATGAATTTGATATCTGATGAGAATTACACTGTGCATGTGAAAATCGAGAGCTAGAACAGTTTGGTGCTTCTGTGTGTTGAGAATATGGAATTAGGTCTTCATATCAGCGGCAATGTTTATCACTTAGCTACAGCAGATCTGCTGGTGTTTATATTCAGTGTTCTTTTCTGGCCTCATTTTCCAAGAATCTGTAATTGATTATATGTTGACTTTGCTACGAGTAGTAGTTTTGCAGACATGTTCTGAGTAGGATGCTTGCAAATGTGATAATATTGCATTCCTGAGAAAAAAAAAA ] [+] EMBL AU055965 [ GATGACACCTGANGCATTAGGGATTGC AA GCNATATGCCCAAGCTCAGAGAGCTTCAGCTGATTGGCAACAAGCTAACTAATGATGGNCTGATGTCAANCCTTGACCACTGCCAGCACCTTGAATCCCTGGACATACNCCAGTGCTACAGCATTCAAATGGATGATNCTCTGAAATCAAAGTGTTCTAGAATAAGTGATCTTAAGCTTCCTCATGACTCGATCTCTGATTTCAAGTACCGGGCTTACATTTTCAGCAGCAGTNCCTTTTCTGGTTCTGATTTAGAGCTTGATATGTATGATGATCTGCTGGATGTGGTCACTGATGATGATGATGCTGACTTTGATGATATGGATGATTATGATGATGGGGGCTCAGATGGTGGCATGTACGATGAATTTGATATCTGATGAGAATTACACTGTGCATGTGAAAATCGAGAGCTAGAACAGTTTGGTGCTTCTGTGTGTTGAGAATATGGAATTAGGTCTTCATATCAGCGGCAATGTTTATCACTTAGCTACAGCAGATCTGCTGGTGTTTATATTCAGTGTTCTTTTCTGGCCTCATTTTCCAAGAATCTGTAATTGATTATATGTTGACTTTGCTACGAGTAGTAGTTTTGCAGACATGTTCTGAGTAGGATGCTTGCAAATGTGATAATATTGCATTCCTGNGAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL AT003682 [ GTGCTTCTGTGTGTTGAGAATATGGAATTAGGTGTTCATATCAGCGGCAATGTTTATCACTTAGCGNCAGCAGATCTGGTGGNGTTTATATTCAGTGTTCTTTTCTGGCCTCATTTTCCAAGAATCTGTAATTGATTATATGTTGGCTTTGNTGCGAGTAGTAGTTTTGCAAACATGTTCTGAGTAGGATGCTTGCAAATGTGATAATATTGCATTCCTGAGAAAAAAAAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||