These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10882#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1492 fasta sequence [ATCTGTTATCCTTCGCTTGTCCATGGACATGGCTGCCCCGACTGTTCCCTACAGGACCACGGCTCCTCCCCTTCCAGAGTCCGACGGCCATGAAGACGGCTCATCAGGGGGCATGGTCCTCCTCGACAGGTGGTGCCTCATCGCTGACCTGCCCAACGCCAGCACCGGCGTGGGCACCACGA-GCACCGGCTTGCGCATCCAGGCGACCTTCCACCCCGCCCGCCCGCCGCTTCTCTCCCGCTTCTGCGTCCACTGCCCCGGCCTCGACTTCCGCCGCGTGGTGCCTAAGATCATCGCCTCCGACGCCGATCTCGTCCTCCTCTGCGTCCCCGTCAACCCCGACAGCATCGCCAACGCACGAGGTTTGGACTACTTTGTCTACAGGCCGCGCGCCCATCGGCTAGATCTGCTCCCGAACCCGCACCCCGTGTACCTCCACGACTCTATGACTGCCCTCCTCAGCCGCCAAGACGGCGCCTGGTATGCAGTCGCCGCCCTGGGTCTTGGCCCCCCGGTGTACAAAGGCGGTGCGCCCGTTAGCTGGGATTTCTACCTCCACCTCTACAGATCCACCTCCAGTTCCAAAGGTTGGACCTCCAAGCGGTTATCGGTGACCGAGTTCATCAGAGACAAGTTTATCCCTATACCTGCCTCTGTCGACAGGCTGTACCACGAGACAGGGAAGACCATCACGGTCGGCGGCGAGGGTGGCACCGTCGCCTGGGTGGACCTCTGGCGTGGCATCTTCCTCTGCGACGTGCTCGATGAGTTCCCTGCGCTCCGGGACATCCCTCTGCCGTGCCCAGCGAGGAGCAACAGGGATCTCTTCCTGATACAATATGACCCCAGCTATTTCCGGGATGTGACCATCAGCCGAAACAGAGACTCTATCAAGTATATTGAGATGGAAATGTGGTCACC--AAAAGAGCCGATGAATACCACCAGCACTCCTGTTTCTTATGTGGATTGCGTGCTCAATAACACAAGGAAATCCCAGGTAATCCGTGACGACTGGAAGGCCACAACATGGAGCATGCCAATGCCGGTGATTGGTTCTTCGTGCGAGCACTGGCACCGTGACTGTGAGGTTGGTGTTAAAGACATCACCTTGGGTGCCAGCAACCCATGTCGTTCTAACTTGAGCTTCAGCGAGATCGTGGAAATGTTCAAGGAACTTCCAATGGTAAACCCCACCATAAGCATGGATGATGATGTTGTTTTCTTGCTTTCTAGAACCAGTCCCAGTCCCATGGACAAGTTGCATTTGGTGTTTGCTATTGATGTGAGGAAGAGGACGCTGCAAGGATTAACCAAGCTTGATGTCAGCCGCAGAACTCCGTTTGCATGGTCACCTTATGCACCAGTGAGATTTGCAGGTATCTGAGGAATATTACAGGTAACTTCAACTCATCACCTTGNGGTTTTACATGTGACCATATGTATGAATGCAATGCTTGNCATTTTTAAGATCTAAGGGAATTATTGGTTTTGN] 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AAAAGAGCCGATGAATACCACCAGCACTCCTGTTTCTTATGTGGATTGCGTGCTCAATAACACAAGGAAATCCCAGGTAATCCGTGACGACTGGAAGGCCACAACATGGAGCATGCCAATGCCGGTGATTGGTTCTTCGTGCGAGCACTGGCACCGTGACTGTGAGGTTGGTGTTAAAGACATCACCTTGGGTGCCAGCAACCCATGTCGTTCTAACTTGAGCTTCAGCGAGATCGTGGAAATGTTCAAGGAACTTCCAATGGTAAACCCCACCATAAGCATGGATGATGATGTTGTTTTCTTGCTTTCTAGAACCAGTCCCAGTCCCATGGACAAGTTGCATTTGGTGTTTGCTATTGATGTGAGGAAGAGGACGCTGCAAGGA ] [+] EMBL OSS3922A [ TTCGCTTGTCCATGGACATGGCTGCCCCGACTGTTCCCTACAGGACCACGGCTCCTCCCCTTCCAGAGTCCGACGGCCATGAAGACGGCTCATCAGGGGGCATGGTCCTCCTCGACAGGTGGTGCCTCATCGCTGACCTGCCCAACGCCAGCACCGGCGTGGGCACCA GAGGCACCGGCTTGCGCATCCAGGCGACCTTCCACCCCGCCCGCCCGCCGCTTCTTTCCCGCTTCTGCGTCCACTGCCCCGGCCTCGACTTCCGCCGCGTGGTGCCTAANATCATCGNCTCCGACGGCG ] [+] EMBL OSS3030A [ TTCGCTTGTCCATGGACATGGCTGCCCCGACTGTTCCCTACAGGACCACGGCTCCTCCCCTTCCAGAGTCCGACGGCCATGAAGACGGCTCATCAGGGGGCATGGTCCTCCTCGACAGGTGGTGCCTCATCGCTGACCTGCCCAACGCCAGCACCGGCGTGGGCACCA GAGGCACCGGCTTGCGCATCCAGGCGACCTTCCACCCCGCCCGCC ] [+] EMBL OSC104271 [ 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AAAAGAGCCGATGAATACCACCAGCACTCCTGTTTCTTATGTGGATTGCGTGCTCAATAACACAAGGAAATCCCAGGTAATCCGTGACGACTGGAAGGCCACAACATGGAGCATGCCAATGCCGGTGATTGGTTCTTCGTGCGAGCACTGGCACCGTGACTGTGAGGTTGGTGTTAAAGACATCACCTTGGGTGCCAGCAACCCATGTCGTTCTAACTTGAGCTTCAGCGAGATCGTGGAAATGTTCAAGGAACTTCCAATGGTAAACCCCACCATAAGCATGGATGATGATGTTGTTTTCTTGCTTTCTAGAACCAGTCCCAGTCCCATGGACAAGTTGCATTTGGTGTTTGCTATTGATGTGAGGAAGAGGACGCTGCAAGGA ] [+] EMBL CA764656 [ CGGTCGGCGGCGAGGGTGGCACTGTCGCCTGGGTGGACCTCTGGCGTGGCATCTTCCTCTGCGACGTGCTCGATGAGTTCCCTGCGCTCCGGGACATCCCTCTGCCGTGCCCAGCGAGGAGCAACAGGGATCTCTTCCTGATACAATATGACCCCATCTATTTCCGGGATGTGACCATCAGCCGAAACAGAGACTCTATCAAGTATATTGAGATGGAAATGTGGTCACC AAAAGAGCCGATGAATACCACCAGCACTCCTGTTTCTTATGTGGATTGCGTGCTCAATAACACAAGGAAATCCCAGGTAATCCGTGACGACTGGAAGGCCACAACATGGAGCATGCCAATGCCGGTGATTGGTTCTTCGTGCGAGCACTGGCACCGTGACTGTGAGGTTGGTGTTAAAGACATCACCTTGGGTGCCAGCAACCCATGTCGTTCTAACTTGAGCTTCAGCGAGATCGTGGAAATGTTCAAGGAACTTCCAATGGCAAACCCCACCATAAGCATGGATGATGATGTTGTTTACTTGCTTTCTAGAACCAGTCCCAGTCCCATGGACAAGTTGCATGTGGTGTTTGCTATTGATGTGAGGAAGAGGACGCTGCAAGGATTAACCAAGCTTGATGTCAGCCGCAGAACTCCGTTTGCATGGTCACCTTATGCACCAGTGAGATTTGCAGGTATCTGAGGAATATTACAGGTAACTTCAACTCATCACCTTGNGGTTTTACATGTGACCATATGTATGAATGCAATGCTTGNCATTTTTAAGATCTAAGGGAATTATTGGTTTTGN] [+] EMBL AU075558 [ TGGTCACCNGAAAAGAGCCGATGAATNCCACCAGCACTCCTGTTTCTTATGTGGATTGCGTGCTCAATAACNCAAGGAAATCCCAGGTAATCCGTGACGACTGGAAGGCCACAACATGGAGCATGCCAATGCCGGTGATTGGTTCTTCGTGCGAGCACTGGCACCGTGACTGTGAGGTTGGTGTTAAAGACATCACCTTGGGTGCCAGCAACCCATGTCGTTCTAACTTGAGCTTCAGCGAGATCGTGGAAATGTTCAAGGAACTTCCAATGGTAAACCCCACCATAAGCATGGATGATGATGTTGTTTTCTTGCTTTCTAGAACCAGTCCCAGTCCCATGGACAAGTTGCATTTGGTGTTTGCTATTGATGTGAGGAAGAGGACGCTGCAAGGA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||