cluster # 1090

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Oryza sativa
cluster # 1090 cluster # 1090 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1090#0 length = 823 sequences # 2

consensusID : consensus_1090#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 823
fasta sequence

                              [TTATCCTCCTCTATCCTTATCCCCAAGAATCGGAGCAAACCGTTGAGTATTTTATCCGAATCGAACTCGTTTTTGAGTTTATCTCCAAAACCGAGTTTTTGATTTCCCGGATCGATTTCTTGCGGGAGGAGTCCGATCTCTTCAATCCAAGGCTATAAATAGGACCCCCTAGTCCTTCTCTTTCGTTTGCCCCCTCTCCCGTCCTCTCCCGTGCTCTGTAGCGTCGCCGCCGCGCGTGTCAAGCCGCACCACCGCGTCCGCCGTCGTTGCCGCCGTTAGGTGTGCACGGGAGCGGGGAAGCTCGGCCGCCCCTTCTCCGCCGTCGCCGGCCGTCGTAGCGCCATCACCGCCGTTCAACCGAGCCGCCGCCGCCTCTTGCGTCGTTGCCGACTGCCGTCGGTCGTCGTTGGACGCATTGTTTCCGACGTTCTGAAGGAGAGCGTTTTCGTTGAGCAAGGTTCGGAAGTGTTTGCGGAAGTCCAAGGCAAGTCACACAGATCCCAAACAACCCTTTGAGCATGTTGAACCCGTTTAAAGCTATTATTTTATTTCAACTTTGCATTATTTTTGAATGTCATCGGGTGGTGAACCTCTCCCCGTTAATTAATGGCCGAAGGTGATCTTATTTTCCTATGGGTTATAATTTGATTAGCATGAATCTTATATATTGGATTGGTTCAGCTAAATGCTATATGTAAGTTTGCTTAGCTATGCTTAGAAACATTAGCTAACTAAAGGGGTTAATTATAAACTATATTATATTATATTATTATTATGGTTATATTTAATGGTCGCTCACGATGGTTAGTCGTGTGATGTTAAT]

[+] EMBL CB622487             [TTATCCTCCTCTATCCTTATCCCCAAGAATCGGAGCAAACCGTTGAGTATTTTATCCGAATCGAACTCGTTTTTGAGTTTATCTCCAAAACCGAGTTTTTGATTTCCCGGATCGATTTCTTGCGGGAGGAGTCCGATCTCTTCAATCCAAGGCTATAAATAGGACCCCCTAGTCCTTCTCTTTCGTTTGCCCCCTCTCCCGTCCTCTCCCGTGCTCTGTAGCGTCGCCGCCGCGCGTGTCAAGCCGCACCACCGCGTCCGCCGTCGTTGCCGCCGTTAGGTGTGCACGGGAGCGGGGAAGCTCGGCCGCCCCTTCTCCGCCGTCGCCGGCCGTCGTAGCGCCATCACCGCCGTTCAACCGAGCCGCCGCCGCCTCTTGCGTCGTTGCCGACTGCCGTCGGTCGTCGTTGGACGCATTGTTTCCGACGTTCTGAAGGAGAGCGTTTTCGTTGAGCAAGGTTCGGAAGTGTTTGCGGAAGTCCAAGGCAAGTCACACAGATCCCAAACAACCCTTTGAGCATGTTGAACCCGTTTAAAGCTATTATTTTATTTCAACTTTGCATTATTTTTGAATGTCATCGGGTGGTGAACCTCTCCCCGTTAATTAATGGCCGAAGGTGATCTTATTTTCCTATGGGTTATAATTTGATTAGCATGAATCTTATATATTGGATTGGTTCAGCTAAATGCTATATGTAAGTTTGCTTAGCTATGCTTAGAAACATTAGCTAACTAAAGGGGTTAATTATAAACTATATTATATTATATTATTATTATGGTTATATTTAATGGTCGCTCACGATGGTTAGTCGTGTGATGTTAAT]
[+] EMBL CB617834             [TTATCCTCCTCTATCCTTATCCCCAAGAATCGGAGCAAACCGTTGAGTATTTTATCCGAATCGAACTCGTTTTTGAGTTTATCTCCAAAACCGAGTTTTTGATTTCCCGGATCGATTTCTTGCGGGAGGAGTCCGATCTCTTCAATCCAAGGCTATAAATAGGACCCCCTAGTCCTTCTCTTTCGTTTGCCCCCTCTCCCGTCCTCTCCCGTGCTCTGTAGCGTCGCCGCCGCGCGTGTCAAGCCGCACCACCGCGTCCGCCGTCGTTGCCGCCGTTAGGTGTGCACGGGAGCGGGGAAGCTCGGCCGCCCCTTCTCCGCCGTCGCCGGCCGTCGTAGCGCCATCACCGCCGTTCAACCGAGCCGCCGCCGCCTCTTGCGTCGTTGCCGACTGCCGTCGGTCGTCGTTGGACGCATTGTTTCCGACGTTCTGAAGGAGAGCGTTTTCGTTGAGCAAGGTTCGGAAGTGTTTGCGGAAGTCCAAGGCAAGTCACACAGATCCCAAACAACCCTTTGAGCATGTTGAACCCGTTTAAAGCTATTATTTTATTTCAACTTTGCATTATTTTTGAATGTCATCGGGTGGTGAACCTCTCCCCGTTAATTAATGGCCGAAGGTGATCTTATTTTCCTATGGGTTATAATTTGATTAGCATGAATCTTATATATTGGATTGGTTCAGCTAAATGCTATATGTAAGTTTGCTTAGCTATGCTTAGAAACATTAGCTAACTAAAGGGGGTCAATATAAACTATATTATATTATATTATTATTATGGct                                           ]




>consensus_1090#0
TTATCCTCCTCTATCCTTATCCCCAAGAATCGGAGCAAACCGTTGAGTATTTTATCCGAA
TCGAACTCGTTTTTGAGTTTATCTCCAAAACCGAGTTTTTGATTTCCCGGATCGATTTCT
TGCGGGAGGAGTCCGATCTCTTCAATCCAAGGCTATAAATAGGACCCCCTAGTCCTTCTC
TTTCGTTTGCCCCCTCTCCCGTCCTCTCCCGTGCTCTGTAGCGTCGCCGCCGCGCGTGTC
AAGCCGCACCACCGCGTCCGCCGTCGTTGCCGCCGTTAGGTGTGCACGGGAGCGGGGAAG
CTCGGCCGCCCCTTCTCCGCCGTCGCCGGCCGTCGTAGCGCCATCACCGCCGTTCAACCG
AGCCGCCGCCGCCTCTTGCGTCGTTGCCGACTGCCGTCGGTCGTCGTTGGACGCATTGTT
TCCGACGTTCTGAAGGAGAGCGTTTTCGTTGAGCAAGGTTCGGAAGTGTTTGCGGAAGTC
CAAGGCAAGTCACACAGATCCCAAACAACCCTTTGAGCATGTTGAACCCGTTTAAAGCTA
TTATTTTATTTCAACTTTGCATTATTTTTGAATGTCATCGGGTGGTGAACCTCTCCCCGT
TAATTAATGGCCGAAGGTGATCTTATTTTCCTATGGGTTATAATTTGATTAGCATGAATC
TTATATATTGGATTGGTTCAGCTAAATGCTATATGTAAGTTTGCTTAGCTATGCTTAGAA
ACATTAGCTAACTAAAGGGGTTAATTATAAACTATATTATATTATATTATTATTATGGTT
ATATTTAATGGTCGCTCACGATGGTTAGTCGTGTGATGTTAAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case