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Oryza sativa
cluster # 10955 cluster # 10955       Sequences # 8       consensus # 3


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10955#0 length = 2265 sequences # 2  
consensus_10955#1 length = 845 sequences # 2  
consensus_10955#2 length = 845 sequences # 4  

consensusID : consensus_10955#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 2265
fasta sequence
                              [CTCCTGACACCAACAATGGACGAAGAAAAGCTCAAGTGGTGTGAGAGTGGATGCAAGGGGTGTATGCAAGTGAAGCAAGTGCCAAGAGGGTCCCCTTCCTGCTGGTGGGGGAGTATACCCACCAAAACTAGTTGTTGGGGTCGAAATCGCCAACCTCAGTTGCCTGCCAGTCAGATCGCCCACCAATGTTACTGTGCACTTAATGCACGGGCAGCAGCTAGCCAGTCAGACCACCATCGGCTCCAGTCAAACCGCCGGCGGCCCGGTTAGACCGGCGTTAGCTCTAGCGGCTCTAGATCGTCAAGCCAAGGCACACATCCCGGCTCACCAACCGCCCGGTTAGACCAACCAAGAAATGCTAGTTAGACCAGCATGAAGCCCTCGGTCAGACCGTCCTCAAGCAGAAAATGATGTATGAAATGAACTCGAACCAAGTGACAATGCAAATGACCTAATGTGGCATTTTGATCAACTCTTTACCTAGGTCATTACCTCTCTTGATAGTGCGACAAAGCTAGAAATAAACCTAGCAAAATTTGATCACCTAACACTTCGATCAAATTAAAATAAAATGCTAGATTTACCATCTTTGTTCCATTGCTTTGTGCCATTAATTTTAATCCGCGGTGATCATCCATGGCATGTACATCATGTGGTCCTAACTCAAATATATCGCTCAATAGAATAGTTAGTCCACAATTAGCGCTTGTCATTAATTACCAAAATTAACAACGGGGGCTATGATGCTTCGAAGTGCTATATATAATATGACCGTAGTACATTGAATATTTTATTTCATTGCACTCAAATATAATCAATGTTGGCCTATTTTACAAATATATTATTCTGGCATATCACTACAAGATCTAAATAATACTGACATTTTGATCCATGTGTGCTTTGCAGACAATTTTTGTAAATTGGTACGATCTAAGAAATTAATTATACTTGACCTCAGGGTCTAAAGAAATTAAGCCTTAACAACATTGTGAAATGCAGTGAGACTGAATCTTGGAGATAAATTACCGAAGAACTGAACTTTTATTGTGAGTATAATTTACTTTTTGATCTTTTAACAAATAAGGATATTGTTTGTTAGTGGTTCTAGATTTGGTTACCCTGGTCTTTTCTCATGAGTGCAATTAGGGCCGAACTTTTGTGTGGCCTTGTCAGAGTGATAAAAAAGTACATAGGCACTTAGGCAGTGCATCACTTATCTGAAAAATTGGTTCTGAATTTTCCTTCTCTATATCCCTCAGGAATGATACTAAAATCTGATTTGTGTACTGACTTATTTCAGTCATTTGAATTTGCTATGATACAGTCCATTTTTAATAAAATCTGGAATACATTTTGAGGTTAAGATAATCCAGTTGTTTATAGACTCAAAAACAGTATATGTGCTCTAGAAACATCAAAACTATTTTATCATATCAAAACACAGATGTTCGTATGGTATAATTTTTAACTCTCCAAAATTTACCATATTTGATTATAATTTAAATTGCATCCACGTGTTTAATAAAAATATTCGAGCATCCATTTTGCTATTTTGCACACTTGCAGTTAGGTTTTGAGATATATAATGATATTTGGCTGACATGCTCATTGGACATTTTTCCTTAAGCTATACTTCTGTCTTTTAACTGAAGTTGCTTTCTGTTTCGTAAGATCAGCCCTCCAGCAAGTGGAGGTAATCCAGTAGGAGTCCTCCATTTCTCTATATATCTCTTTGATTGCTTTAAAACCTAACAAAAAGGTTTAAAGAAAGCAAAAGAAGCGAATGTGTCCATTTATCTTTCGAAACAATATACTTCTTTCTTGGTGCATGGAGGACCAGACAACCATATAGAGAAATGGAGACTATCAGAGTTGTATGTTCAGCAAAGATGAGGTGGCTGATTAAGAGTTGTCTAATTACAACCAGTGCATTGTTGACAATATTGATTTTTTTTAATCCTTTTGTGCATCTGGGGCAAAGTTATTTGGTAAATTTGAATATGATTTTAGAATTTGGTGAAGATACCTGATTTTTAACTGATTTCGGATGCTACATGCAATGCATTGTGCTTCTGTAATATCAAAATTCACGATTGTATATTTTTATTTTGGTGATATATATGCCCTCAATAGACTTTTAAACTTTGACATGTTGATCACTCCGTAATAATTGTGTGCCATTCTATTTCTTTTATATTATGTTTTTCCACCGTTCATGTTACTAATATGTGAAAACCATAGAAATGGAATATAGCTATTGTCTGT]

[+] EMBL AK108592             [CTCCTGACACCAACAATGGACGAAGAAAAGCTCAAGTGGTGTGAGAGTGGATGCAAGGGGTGTATGCAAGTGAAGCAAGTGCCAAGAGGGTCCCCTTCCTGCTGGTGGGGGAGTATACCCACCAAAACTAGTTGTTGGGGTCGAAATCGCCAACCTCAGTTGCCTGCCAGTCAGATCGCCCACCAATGTTACTGTGCACTTAATGCACGGGCAGCAGCTAGCCAGTCAGACCACCATCGGCTCCAGTCAAACCGCCGGCGGCCCGGTTAGACCGGCGTTAGCTCTAGCGGCTCTAGATCGTCAAGCCAAGGCACACATCCCGGCTCACCAACCGCCCGGTTAGACCAACCAAGAAATGCTAGTTAGACCAGCATGAAGCCCTCGGTCAGACCGTCCTCAAGCAGAAAATGATGTATGAAATGAACTCGAACCAAGTGACAATGCAAATGACCTAATGTGGCATTTTGATCAACTCTTTACCTAGGTCATTACCTCTCTTGATAGTGCGACAAAGCTAGAAATAAACCTAGCAAAATTTGATCACCTAACACTTCGATCAAATTAAAATAAAATGCTAGATTTACCATCTTTGTTCCATTGCTTTGTGCCATTAATTTTAATCCGCGGTGATCATCCATGGCATGTACATCATGTGGTCCTAACTCAAATATATCGCTCAATAGAATAGTTAGTCCACAATTAGCGCTTGTCATTAATTACCAAAATTAACAACGGGGGCTATGATGCTTCGAAGTGCTATATATAATATGACCGTAGTACATTGAATATTTTATTTCATTGCACTCAAATATAATCAATGTTGGCCTATTTTACAAATATATTATTCTGGCATATCACTACAAGATCTAAATAATACTGACATTTTGATCCATGTGTGCTTTGCAGACAATTTTTGTAAATTGGTACGATCTAAGAAATTAATTATACTTGACCTCAGGGTCTAAAGAAATTAAGCCTTAACAACATTGTGAAATGCAGTGAGACTGAATCTTGGAGATAAATTACCGAAGAACTGAACTTTTATTGTGAGTATAATTTACTTTTTGATCTTTTAACAAATAAGGATATTGTTTGTTAGTGGTTCTAGATTTGGTTACCCTGGTCTTTTCTCATGAGTGCAATTAGGGCCGAACTTTTGTGTGGCCTTGTCAGAGTGATAAAAAAGTACATAGGCACTTAGGCAGTGCATCACTTATCTGAAAAATTGGTTCTGAATTTTCCTTCTCTATATCCCTCAGGAATGATACTAAAATCTGATTTGTGTACTGACTTATTTCAGTCATTTGAATTTGCTATGATACAGTCCATTTTTAATAAAATCTGGAATACATTTTGAGGTTAAGATAATCCAGTTGTTTATAGACTCAAAAACAGTATATGTGCTCTAGAAACATCAAAACTATTTTATCATATCAAAACACAGATGTTCGTATGGTATAATTTTTAACTCTCCAAAATTTACCATATTTGATTATAATTTAAATTGCATCCACGTGTTTAATAAAAATATTCGAGCATCCATTTTGCTATTTTGCACACTTGCAGTTAGGTTTTGAGATATATAATGATATTTGGCTGACATGCTCATTGGACATTTTTCCTTAAGCTATACTTCTGTCTTTTAACTGAAGTTGCTTTCTGTTTCGTAAGATCAGCCCTCCAGCAAGTGGAGGTAATCCAGTAGGAGTCCTCCATTTCTCTATATATCTCTTTGATTGCTTTAAAACCTAACAAAAAGGTTTAAAGAAAGCAAAAGAAGCGAATGTGTCCATTTATCTTTCGAAACAATATACTTCTTTCTTGGTGCATGGAGGACCAGACAACCATATAGAGAAATGGAGACTATCAGAGTTGTATGTTCAGCAAAGATGAGGTGGCTGATTAAGAGTTGTCTAATTACAACCAGTGCATTGTTGACAATATTGATTTTTTTTAATCCTTTTGTGCATCTGGGGCAAAGTTATTTGGTAAATTTGAATATGATTTTAGAATTTGGTGAAGATACCTGATTTTTAACTGATTTCGGATGCTACATGCAATGCATTGTGCTTCTGTAATATCAAAATTCACGATTGTATATTTTTATTTTGGTGATATATATGCCCTCAATAGACTTTTAAACTTTGACATGTTGATCACTCCGTAATAATTGTGTGCCATTCTATTTCTTTTATATTATGTTTTTCCACCGTTCATGTTACTAATATGTGAAAACCATAGAAATGGAATATAGCTATTGTCTGT]
[-] EMBL CB646048             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAATCCAGTTGTTTATAGACTCAAAAACAGTATATGTGCTCTAGAAACATCAAAACTATTTTATCATATCAAAACACAGATGTTCGTATGGTATAATTTTTAACTCTCCAAAATTTACCATATTTGATTATAATTTAAATTGCATCCACGTGTTTAATAAAAATATTCGAGCATCCATTTTGCTATTTTGCACACTTGCAGTTAGGTTTTGAGATATATAATGATATTTGGCTGACATGCTCATTGGACATTTTTCCTTAAGCTATACTTCTGTCTTTTAACTGAAGTTGCTTTCTGTTTCGTAAGATCAGCCCTCCAGCAAGTGGAGGTAATCCAGTAGGAGTCCTCCATTTCTCTATATATCTCTTTGATTGCTTTAAAACCTAACAAAAAGGTTTAAAGAAAGCAAAAGAAGCGAATGTGTCCATTTATCTTTGGAAACAATATACTTCTTTCTTGGTGCATGGAGGACCAGACAACCATATAGAGAAATGGAGACTATCAGAGTTGTATGTTCAGCAAAGATGAGGTGGCTGATTAAGAGTTGTCTAATTACAACCAGTGCATTGTTGACAATATTGATTTTTTTTAATCCTTTTGTGCATCTGGGGCAAAGTTATTTGGTAAATTTGAATATGATTTTAGAATTTGGTGAAGATACCTGATTTTTAACTGATTTCGGATGCTACATGCAATGCATTGTGCTTCTGTAATATCAAAATTCACGATTGTATATTTTTATTTTGGTGATATATATGCCCTCAATAGACTT                                                                                                                                ]


>consensus_10955#0 CTCCTGACACCAACAATGGACGAAGAAAAGCTCAAGTGGTGTGAGAGTGGATGCAAGGGG TGTATGCAAGTGAAGCAAGTGCCAAGAGGGTCCCCTTCCTGCTGGTGGGGGAGTATACCC ACCAAAACTAGTTGTTGGGGTCGAAATCGCCAACCTCAGTTGCCTGCCAGTCAGATCGCC CACCAATGTTACTGTGCACTTAATGCACGGGCAGCAGCTAGCCAGTCAGACCACCATCGG CTCCAGTCAAACCGCCGGCGGCCCGGTTAGACCGGCGTTAGCTCTAGCGGCTCTAGATCG TCAAGCCAAGGCACACATCCCGGCTCACCAACCGCCCGGTTAGACCAACCAAGAAATGCT AGTTAGACCAGCATGAAGCCCTCGGTCAGACCGTCCTCAAGCAGAAAATGATGTATGAAA TGAACTCGAACCAAGTGACAATGCAAATGACCTAATGTGGCATTTTGATCAACTCTTTAC CTAGGTCATTACCTCTCTTGATAGTGCGACAAAGCTAGAAATAAACCTAGCAAAATTTGA TCACCTAACACTTCGATCAAATTAAAATAAAATGCTAGATTTACCATCTTTGTTCCATTG CTTTGTGCCATTAATTTTAATCCGCGGTGATCATCCATGGCATGTACATCATGTGGTCCT AACTCAAATATATCGCTCAATAGAATAGTTAGTCCACAATTAGCGCTTGTCATTAATTAC CAAAATTAACAACGGGGGCTATGATGCTTCGAAGTGCTATATATAATATGACCGTAGTAC ATTGAATATTTTATTTCATTGCACTCAAATATAATCAATGTTGGCCTATTTTACAAATAT ATTATTCTGGCATATCACTACAAGATCTAAATAATACTGACATTTTGATCCATGTGTGCT TTGCAGACAATTTTTGTAAATTGGTACGATCTAAGAAATTAATTATACTTGACCTCAGGG TCTAAAGAAATTAAGCCTTAACAACATTGTGAAATGCAGTGAGACTGAATCTTGGAGATA AATTACCGAAGAACTGAACTTTTATTGTGAGTATAATTTACTTTTTGATCTTTTAACAAA TAAGGATATTGTTTGTTAGTGGTTCTAGATTTGGTTACCCTGGTCTTTTCTCATGAGTGC AATTAGGGCCGAACTTTTGTGTGGCCTTGTCAGAGTGATAAAAAAGTACATAGGCACTTA GGCAGTGCATCACTTATCTGAAAAATTGGTTCTGAATTTTCCTTCTCTATATCCCTCAGG AATGATACTAAAATCTGATTTGTGTACTGACTTATTTCAGTCATTTGAATTTGCTATGAT ACAGTCCATTTTTAATAAAATCTGGAATACATTTTGAGGTTAAGATAATCCAGTTGTTTA TAGACTCAAAAACAGTATATGTGCTCTAGAAACATCAAAACTATTTTATCATATCAAAAC ACAGATGTTCGTATGGTATAATTTTTAACTCTCCAAAATTTACCATATTTGATTATAATT TAAATTGCATCCACGTGTTTAATAAAAATATTCGAGCATCCATTTTGCTATTTTGCACAC TTGCAGTTAGGTTTTGAGATATATAATGATATTTGGCTGACATGCTCATTGGACATTTTT CCTTAAGCTATACTTCTGTCTTTTAACTGAAGTTGCTTTCTGTTTCGTAAGATCAGCCCT CCAGCAAGTGGAGGTAATCCAGTAGGAGTCCTCCATTTCTCTATATATCTCTTTGATTGC TTTAAAACCTAACAAAAAGGTTTAAAGAAAGCAAAAGAAGCGAATGTGTCCATTTATCTT TCGAAACAATATACTTCTTTCTTGGTGCATGGAGGACCAGACAACCATATAGAGAAATGG AGACTATCAGAGTTGTATGTTCAGCAAAGATGAGGTGGCTGATTAAGAGTTGTCTAATTA CAACCAGTGCATTGTTGACAATATTGATTTTTTTTAATCCTTTTGTGCATCTGGGGCAAA GTTATTTGGTAAATTTGAATATGATTTTAGAATTTGGTGAAGATACCTGATTTTTAACTG ATTTCGGATGCTACATGCAATGCATTGTGCTTCTGTAATATCAAAATTCACGATTGTATA TTTTTATTTTGGTGATATATATGCCCTCAATAGACTTTTAAACTTTGACATGTTGATCAC TCCGTAATAATTGTGTGCCATTCTATTTCTTTTATATTATGTTTTTCCACCGTTCATGTT ACTAATATGTGAAAACCATAGAAATGGAATATAGCTATTGTCTGT



consensusID : consensus_10955#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
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fasta sequence
                              [GGCACTT-TAAAGAATCTTCTCGAAGAGATCACCGGGCAACTCCTCCAAGCCATCTAGGAGGCGTCAACCTAAAAGAGCAACAAGTAACCACCCTGGTAGGAGATGATCAAGTGCCACACTAACTCGTAACAATGCAAGCAATGCACTTGTCTTGGCTCAATCAACCCTCCCGACACCAACAATGGATGAACAAAAGCTCAAGTGGTGTGAGAGTGGATGCAAGGGGTGTATGCAAGTGAAGCAAGTGCCAAGAGGGTCCCCTTCCTACTCGTTGGGGAGTATTTATACCCCCACCCACCAAAACTAGTCGTTGGGGTCGAAATCGCCAACCTTAGTTGCCTGCCAGTCAGATCGCCCAAGGCTAGAAACTAGCCTTTACTGTGCACTTAATGCACGGGCAGCAGCTAGCCAGTCAGATCGCCATCGGCTCCAGTCAAGCTGTCGGCGGCCCGGTCAGACTGGCGTCGGCTCTAGCGGCTCTAGATCGTCAAGCCAAGGCACACATCCCGGCTCACCAACCGCCCGGTCAGACCAGCCAAGAAATGCCAGTCAGGCCGGCATGAAGCCCTCGGTCAGACCGGCCTCAAGCAGAAAATGATGTATGAAATGAACTCGAACGAAGTGACAATGCAAGTGACCTAATGTGGCATTTTGATCAACTCTTTACCTAGGTCATTACCTCTCTTGATAGTACGGCAAAGCTAGAAATAAACCTAGCAAAATTTGATCACCTAACACTTCAATCAATTTAAAACAAAACGCTAGATTTACCATCTTTGTTCCATTGCTTTGTGCCATTAATTTTAATCCGCGGTGATCATCCATGGCATGTACATCATGTGGTC]

[+] EMBL CB633436             [GGCACTT TAAAGAATCTTCTCGAAGAGATCACCGGGCAACTCCTCCAAGCCATCTAGGAGGCGTCAACCTAAAAGAGCAACAAGTAACCACCCTGGTAGGAGATGATCAAGTGCCACACTAACTCGTAACAATGCAAGCAATGCACTTGTCTTGGCTCAATCAACCCTCCCGACACCAACAATGGATGAACAAAAGCTCAAGTGGTGTGAGAGTGGATGCAAGGGGTGTATGCAAGTGAAGCAAGTGCCAAGAGGGTCCCCTTCCTACTCGTTGGGGAGTATTTATACCCCCACCCACCAAAACTAGTCGTTGGGGTCGAAATCGCCAACCTTAGTTGCCTGCCAGTCAGATCGCCCAAGGCTAGAAACTAGCCTTTACTGTGCACTTAATGCACGGGCAGCAGCTAGCCAGTCAGATCGCCATCGGCTCCAGTCAAGCTGTCGGCGGCCCGGTCAGACTGGCGTCGGCTCTAGCGGCTCTAGATCGTCAAGCCAAGGCACACATCCCGGCTCACCAACCGCCCGGTCAGACCAGCCAAGAAATGCCAGTCAGGCCGGCATGAAGCCCTCGGTCAGACCGGCCTCAAGCAGAAAATGATGTATGAAATGAACTCGAACGAAGTGACAATGCAAGTGACCTAATGTGGCATTTTGATCAACTCTTTACCTAGGTCATTACCTCTCTTGATAGTACGGCAAAGCTAGAAATAAACCTAGCAAAATTTGATCACCTAACACTTCAATCAATTTAAAACAAAACGCTAGATTTACCATCTTTGTTCCATTGCTTTGTGCCATTAATTTTAATCCGCGGTGATCATCCATGGCATGTACATCATGTGGTC]
[+] EMBL CB633479             [GGC CTTCTCCACAATCTTCTCGAAGAGATCACCGGGCAACTCCTCCAAGCCATCTAGGAGGCGTCAACCTAAAAGAGTAACAAGTAACCACCCTGGTAGGAGATGATCAAGTGCCACACTAACTCGTAACAATG AAGCAATGCACTTGTCTTGGCTCAATCAACCCTCCCGACACCAACAATGGATGAACAAAAGCTCAAGTGGTGTGAGAGTGGATGCAAGGGGTGTATGCAAGTGAAGCAAGTGCCAAGAGGGTCCCCTTCCTACTCGTTGGGGAGTATTTATACCCCCACCCACCAAAACTAGTCGTTGGGGTCGAAATCGCCAACCTTAGTTGCCTGCCAGTCAGATCGCCCAAGGCTAGAAACTAGCCTTTACTGTGCACTTAATGCACGGGCAGCAGCTAGCCAGTCAGATCGCCATCGGCTCCAGTCAAGCTGTCGGCGGCCCGGTCAGACTGGCGTCGGCTCTAGCGGCTCTAGATCGTCAAGCCAAGGCACACATCCCGGCTCACCAACCGCCCGGTCAGACCAGCCAAGAAATGCCAGTCAGGCCGGCATGAAGCCCTCGGTCAGACCGGCCTCAAGCAGAAAATGATGTATGAAATGAACTCGAACGAAGTGACAATGCAAGTGACCTAATGTGGCATTTTGATCAACTCTTTACCTAGGTCATTACCTCTCTTGATAGTACGGCAAAGCTAGAAATAAACCTAGCAAAATTTGATCACCTAACACTTCAATCAATTTAAAACAAAACGCTAGATTTACCATCTTTGTTCCATTGCTTTGTGCCATTAATTTTAATCCGCGGTGATCATCCATGGCATGTACATCATGTG   ]


>consensus_10955#1 GGCACTTTAAAGAATCTTCTCGAAGAGATCACCGGGCAACTCCTCCAAGCCATCTAGGAG GCGTCAACCTAAAAGAGCAACAAGTAACCACCCTGGTAGGAGATGATCAAGTGCCACACT AACTCGTAACAATGCAAGCAATGCACTTGTCTTGGCTCAATCAACCCTCCCGACACCAAC AATGGATGAACAAAAGCTCAAGTGGTGTGAGAGTGGATGCAAGGGGTGTATGCAAGTGAA GCAAGTGCCAAGAGGGTCCCCTTCCTACTCGTTGGGGAGTATTTATACCCCCACCCACCA AAACTAGTCGTTGGGGTCGAAATCGCCAACCTTAGTTGCCTGCCAGTCAGATCGCCCAAG GCTAGAAACTAGCCTTTACTGTGCACTTAATGCACGGGCAGCAGCTAGCCAGTCAGATCG CCATCGGCTCCAGTCAAGCTGTCGGCGGCCCGGTCAGACTGGCGTCGGCTCTAGCGGCTC TAGATCGTCAAGCCAAGGCACACATCCCGGCTCACCAACCGCCCGGTCAGACCAGCCAAG AAATGCCAGTCAGGCCGGCATGAAGCCCTCGGTCAGACCGGCCTCAAGCAGAAAATGATG TATGAAATGAACTCGAACGAAGTGACAATGCAAGTGACCTAATGTGGCATTTTGATCAAC TCTTTACCTAGGTCATTACCTCTCTTGATAGTACGGCAAAGCTAGAAATAAACCTAGCAA AATTTGATCACCTAACACTTCAATCAATTTAAAACAAAACGCTAGATTTACCATCTTTGT TCCATTGCTTTGTGCCATTAATTTTAATCCGCGGTGATCATCCATGGCATGTACATCATG TGGTC



consensusID : consensus_10955#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 845
fasta sequence
                              [AATTTGCTATGTCAATACAGTCCATTTTTAATAAAATCTGGAATACATTTTGAGGTTAAGATAATCCAGTTGTTTATAGACTCAAAAACAGTATATGTGCTCTAGAAACATCGAAACTATTTTATCATATCAAAACACATATGTTCGTATGGTATAATTTTTAACTCTCCAAAATTTACCATCTTTAATTATAATTTAAATTGCATCCACGTGTTTAATAAAAATATTTGAGCATCCATTTTGCTATTTTGCACACTTGCAGTTAAGTTCTGAGATATATAATGATATTTGGCTGACATGCTCATTGGACCTT-TTTCCTT-AAGCTATACTTCTGTGT-CTT-TTAA-CTGAA-GTTGC-TTTCTGTTTCGTAAGATCA-GCCCTCCAGCA-AGTGGAGGTAA-TCCA-GTAGGAGTCCTCCATTTCTCTATATATCTCTTTGATTGCTTTA-AAACCGA-A-CAAAAAGGTTTAAAGAAAGCAAAAGAAGCA-AATGTGTCCA-TTTATCTTTCGAAACAATATACTTCTTTCTTGGTGCATGGAGGGCCAGACAA-CCAGATAGAGAAATGGAGACTCTATCAGAGTTGTATGTTCA-GCAAAGATGAGGTGGCTGA-TTAAGA-GTTGTCTAATTACAACCAGTGCATTGTTAACAATCTTGAT-TTTTTTTAATCCTTTTGTGCATCTGGGGCAAAGTTAT-TTGGTAAATTTGAATATGATTTTAGAATTTGGTGAAGATACCTGATTTTTAACTGATTTCGGATGCTACATGCAATGCATTGTGCTTCTGTCACGATTGTATATTTTTATTTTAGGGATATATATGCCCTCAATAGACTTAAACTTTAAAAAAAAAAAGA]

[-] EMBL CB633437             [AATTTGCTATGTCAATACAGTCCATTTTTAATAAAATCTGGAATACATTTTGAGGTTAAGATAATCCAGTTGTTTATAGACTCAAAAACAGTATATGTGCTCTAGAAACATCGAAACTATTTTATCATATCAAAACACATATGTTCGTATGGTATAATTTTTAACTCTCCAAAATTTACCATCTTTAATTATAATTTAAATTGCATCCACGTGTTTAATAAAAATATTTGAGCATCCATTTTGCTATTTTGCACACTTGCAGTTAAGTTCTGAGATATATAATGATATTTGGCTGACATGCTCATTGGACCTT TTTCCTT AAGCTATACTTCTGTGT CTT TTAA CTGAA GTTGC TTTCTGTTTCGTAAGATCA GCCCTCCAGCA AGTGGAGGTAA TCCA GTAGGAGTCCTCCATTTCTCTATATATCTCTTTGATTGCTTTA AAACCGA A CAAAAAGGTTTAAAGAAAGCAAAAGAAGCA AATGTGTCCA TTTATCTTTCGAAACAATATACTTCTTTCTTGGTGCATGGAGGGCCAGACAA CCAGATAGAGAAATGGAGACTCTATCAGAGTTGTATGTTCA GCAAAGATGAGGTGGCTGA TTAAGA GTTGTCTAATTACAACCAGTGCATTGTTAACAATCTTGAT TTTTTTTAATCCTTTTGTGCATCTGGGGCAAAGTTAT TTGGTAAATTTGAATATGATTTTAGAATTTGGTGAAGATACCTGATTTTTAACTGATTTCGGATGCTACATGCAATGCATTGTGCTTCTGTCACGATTGTATATTTTTATTTTAGGGATATATATGCCCTCAATAGACTTAA                  ]
[-] EMBL CB633480             [                             AATAAAATCTGGAATACATTTTGAGGTTAAGATAATCCAGTTGTTTATAGACTCAAAAACAGTATATGTGCTCTAGAAACATCGAAACTATTTTATCATATCAAAACACATATGTTCGTATGGTATAATTTTTAACTCTCCAAAATTTACCATCTTTAATTATAATTTAAATTGCATCCACGTGTTTAATAAAAATATTTGAGCATCCATTTTGCTATTTTGCACACTTGCAGTTAAGTTCTGAGATATATAATGATATTTGGCTGACATGCTCATTGGACCTT TTTCCTT AAGCTATACTTCTGTGT CTT TTAA CTGAA GTTGC TTTCTGTTTCGTAAGATCA GCCCTCCAGCA AGTGGAGGTAA TCCA GTAGGAGTCCTCCATTTCTCTATATATCTCTTTGATTGCTTTA AAACCGA A CAAAAAGGTTTAAAGAAAGCAAAAGAAGCA AATGTGTCCA TTTATCTTTCGAAACAATATACTTCTTTCTTGGTGCATGGAGGGCCAGACAA CCAGATAGAGAAATGGAGACTCTATCAGAGTTGTATGTTCA GCAAAGATGAGGTGGCTGA TTAAGA GTTGTCTAATTACAACCAGTGCATTGTTAACAATCTTGAT TTTTTTTAATCCTTTTGTGCATCTGGGGCAAAGTTAT TTGGTAAATTTGAATATGATTTTAGAATTTGGTGAAGATACCTGATTTTTAACTGATTTCGGATGCTACATGCAATGCATTGTGCTTCTGTCACGATTGTATATTTTTATTTTGGTGATATATATGCCCTCAATAGACTTAAACTTTAAAAAAAAAAAGA]
[+] EMBL BM420875             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GCTGACATGCTCATTGGACCTTGTTTCCTTGAAGCTATACTTCTGTGTGCTTGTTAACCTGAAGGTTGCGTTTCTGTTTCGTAAGATCA GCCCTCCAGCACAGTGGAGGTAAGTCCACGTAGGAGTCCTCCATTTCTCTATATATCTCTTTGATTGCTTTAGAAACCGAGACCGAAAAGGTTTAAAGAAAGCCAAAGAAGCC AATGTGTCCAGTTTATCTTTCGAAACAATATACTTCTTTCTTGGTGCATGGAGGGCCAGACAA CCAGATAGAGAAATGGAGACTCTATCAGAGTTGTATGTTCACGCAAAGATGAGGTGGCTGA TTAAGA GTTGTCTAATTACAACCAGTGCATTGTTAAC ATCTTGATGTTTTTTTAATCCTTTTGTGCATCTGGGGCAAAGTTATCTTGGTAAATTTGAATATGATTTTAGAATTTGGTGAAGATACCTGATTTTTAACTGATTTCGGATGCTACANGC ATGCATTGTGCTTCTGTaaaaaaa                                                              ]
[+] EMBL BM420670             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATACTTCTGTTT CTT TTAA CTGAA GTTGC TTTCTGTTTCGTAAGATCACCCCCTCCAGCA AGTGGAGGTAA TCCA GTAGGAGTCCTCCATTTCTCTATATATCTCTTTGATTGCTTTA AAACCGA A CCAAAAGGTTTAAAGAAA CCAAAGAA CACAATGTGTCCA TTTATCTTTCGAAAC ATATACTTCTTTCTTGGTGCATGGAGGGCCAGACAACCCAGATAGAGAAATGGAGACTCTATCAGAGTTGTATGTTCA GCAAAGATGAGGTGGCTGACTTAAGACGTTGTCTAATTACAACCAGTGCATTGTTAACAATCTTGAT TTTTTTTAATCCTTTTGTGCATCTGGGGC AAGTTAT TTGGTAAATTTGAATATGATTTTAGAATTTGGTGAAGATACCTGATTTTTAACTGATTTCGGATGCTACAT C ATGC TTGTGCTTCTGTaaaaaaa                                                              ]


>consensus_10955#2 AATTTGCTATGTCAATACAGTCCATTTTTAATAAAATCTGGAATACATTTTGAGGTTAAG ATAATCCAGTTGTTTATAGACTCAAAAACAGTATATGTGCTCTAGAAACATCGAAACTAT TTTATCATATCAAAACACATATGTTCGTATGGTATAATTTTTAACTCTCCAAAATTTACC ATCTTTAATTATAATTTAAATTGCATCCACGTGTTTAATAAAAATATTTGAGCATCCATT TTGCTATTTTGCACACTTGCAGTTAAGTTCTGAGATATATAATGATATTTGGCTGACATG CTCATTGGACCTTTTTCCTTAAGCTATACTTCTGTGTCTTTTAACTGAAGTTGCTTTCTG TTTCGTAAGATCAGCCCTCCAGCAAGTGGAGGTAATCCAGTAGGAGTCCTCCATTTCTCT ATATATCTCTTTGATTGCTTTAAAACCGAACAAAAAGGTTTAAAGAAAGCAAAAGAAGCA AATGTGTCCATTTATCTTTCGAAACAATATACTTCTTTCTTGGTGCATGGAGGGCCAGAC AACCAGATAGAGAAATGGAGACTCTATCAGAGTTGTATGTTCAGCAAAGATGAGGTGGCT GATTAAGAGTTGTCTAATTACAACCAGTGCATTGTTAACAATCTTGATTTTTTTTAATCC TTTTGTGCATCTGGGGCAAAGTTATTTGGTAAATTTGAATATGATTTTAGAATTTGGTGA AGATACCTGATTTTTAACTGATTTCGGATGCTACATGCAATGCATTGTGCTTCTGTCACG ATTGTATATTTTTATTTTAGGGATATATATGCCCTCAATAGACTTAAACTTTAAAAAAAA AAAGA



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10955#0      CTCCTGACACCAACAATGGACGAAGAAAAGCTCAAGTGGTGTGAGAGTGGATGCAAGGGG 60
consensus_10955#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10955#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10955#0      TGTATGCAAGTGAAGCAAGTGCCAAGAGGGTCCCCTTCCTGCTGGTGGGGGAGTATACCC 120
consensus_10955#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10955#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10955#0      ACCAAAACTAGTTGTTGGGGTCGAAATCGCCAACCTCAGTTGCCTGCCAGTCAGATCGCC 180
consensus_10955#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10955#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10955#0      CACCAATGTTACTGTGCACTTAATGCACGGGCAGCAGCTAGCCAGTCAGACCACCATCGG 240
consensus_10955#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10955#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10955#0      CTCCAGTCAAACCGCCGGCGGCCCGGTTAGACCGGCGTTAGCTCTAGCGGCTCTAGATCG 300
consensus_10955#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10955#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10955#0      TCAAGCCAAGGCACACATCCCGGCTCACCAACCGCCCGGTTAGACCAACCAAGAAATGCT 360
consensus_10955#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10955#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10955#0      AGTTAGACCAGCATGAAGCCCTCGGTCAGACCGTCCTCAAGCAGAAAATGATGTATGAAA 420
consensus_10955#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10955#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10955#0      TGAACTCGAACCAAGTGACAATGCAAATGACCTAATGTGGCATTTTGATCAACTCTTTAC 480
consensus_10955#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10955#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10955#0      CTAGGTCATTACCTCTCTTGATAGTGCGACAAAGCTAGAAATAAACCTAGCAAAATTTGA 540
consensus_10955#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10955#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10955#0      TCACCTAACACTTCGATCAAATTAAAATAAAATGCTAGATTTACCATCTTTGTTCCATTG 600
consensus_10955#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10955#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10955#0      CTTTGTGCCATTAATTTTAATCCGCGGTGATCATCCATGGCATGTACATCATGTGGTCCT 660
consensus_10955#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10955#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10955#0      AACTCAAATATATCGCTCAATAGAATAGTTAGTCCACAATTAGCGCTTGTCATTAATTAC 720
consensus_10955#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10955#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10955#0      CAAAATTAACAACGGGGGCTATGATGCTTCGAAGTGCTATATATAATATGACCGTAGTAC 780
consensus_10955#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10955#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10955#0      ATTGAATATTTTATTTCATTGCACTCAAATATAATCAATGTTGGCCTATTTTACAAATAT 840
consensus_10955#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10955#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10955#0      ATTATTCTGGCATATCACTACAAGATCTAAATAATACTGACATTTTGATCCATGTGTGCT 900
consensus_10955#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10955#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10955#0      TTGCAGACAATTTTTGTAAATTGGTACGATCTAAGAAATTAATTATACTTGACCTCAGGG 960
consensus_10955#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10955#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10955#0      TCTAAAGAAATTAAGCCTTAACAACATTGTGAAATGCAGTGAGACTGAATCTTGGAGATA 1020
consensus_10955#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10955#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10955#0      AATTACCGAAGAACTGAACTTTTATTGTGAGTATAATTTACTTTTTGATCTTTTAACAAA 1080
consensus_10955#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10955#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10955#0      TAAGGATATTGTTTGTTAGTGGTTCTAGATTTGGTTACCCTGGTCTTTTCTCATGAGTGC 1140
consensus_10955#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10955#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10955#0      AATTAGGGCCGAACTTTTGTGTGGCCTTGTCAGAGTGATAAAAAAGTACATAGGCACTTA 1200
consensus_10955#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10955#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10955#0      GGCAGTGCATCACTTATCTGAAAAATTGGTTCTGAATTTTCCTTCTCTATATCCCTCAGG 1260
consensus_10955#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10955#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10955#0      AATGATACTAAAATCTGATTTGTGTACTGACTTATTTCAGTCATTTGAATTTGCTATG-- 1318
consensus_10955#2      -----------------------------------------------AATTTGCTATGTC 13
consensus_10955#1      ----------------------------------------------------GGCACTTT 8
                                                                           *  *    

consensus_10955#0      -ATACAGTCCATTTTTAATAAAATCTGGAATACATTTTGAGGTTAAG-ATAATCCAGTTG 1376
consensus_10955#2      AATACAGTCCATTTTTAATAAAATCTGGAATACATTTTGAGGTTAAG-ATAATCCAGTTG 72
consensus_10955#1      -AAAGAATCTTCTCGAAGAGATCACCGGGCAACTCCTCCAAGCCATCTAGGAGGCGTCAA 67
                        * * * **   *   *   *   * **   **   *  * *  *   *  *  *     

consensus_10955#0      TTTATAGACTCAA-AAACAGTATATGTGCTCTAGAAACATCAAA-ACTATTTTATCATAT 1434
consensus_10955#2      TTTATAGACTCAA-AAACAGTATATGTGCTCTAGAAACATCGAA-ACTATTTTATCATAT 130
consensus_10955#1      CCTAAAAGAGCAACAAGTAACCACCCTGGTAGGAGATGATCAAGTGCCACACTAACTCGT 127
                         ** *    *** **  *       ** *     *  *** *   * *   ** *   *

consensus_10955#0      CAAAACACAGATGTT-CGTATGGTATAATTT--TTAACTCTCCAAAATTTACCATAT--T 1489
consensus_10955#2      CAAAACACATATGTT-CGTATGGTATAATTT--TTAACTCTCCAAAATTTACCATCT--T 185
consensus_10955#1      AACAATGCAAGCAATGCACTTGTCTTGGCTCAATCAACCCTCCCGACACCAACAATGGAT 187
                        * **  **     * *   **   *   *   * *** ****  *    * **     *

consensus_10955#0      TGATTATAATTTAAATTGCATCCACGTG--TTTAATAAAAATATTCGAGC-ATCCATTTT 1546
consensus_10955#2      TAATTATAATTTAAATTGCATCCACGTG--TTTAATAAAAATATTTGAGC-ATCCATTTT 242
consensus_10955#1      GAACAAAAGCTCAAGTGGTGTGAGAGTGGATGCAAGGGGTGTATGCAAGTGAAGCAAGTG 247
                         *  * *  * ** * *  *    ***  *  **      ***   **  *  **  * 

consensus_10955#0      GCTATTTTGCACACTTGCAGTTAGGTTTTGAG-ATATATAATGATATTTGGCTGACATGC 1605
consensus_10955#2      GCTATTTTGCACACTTGCAGTTAAGTTCTGAG-ATATATAATGATATTTGGCTGACATGC 301
consensus_10955#1      CCAAGAGGGTCCCCTTCCTACTCGTTGGGGAGTATTTATACCCCCACCCACCAAAACTAG 307
                        * *    *  * *** *   *   *   *** ** ****     *     *  *  *  

consensus_10955#0      TCATTGGACATTTTTCCTTAAGCTATACTTCTGT--CTTTTAA-----CTGAAGTTGCTT 1658
consensus_10955#2      TCATTGGACCTTTTTCCTTAAGCTATACTTCTGTGTCTTTTAA-----CTGAAGTTGCTT 356
consensus_10955#1      TCGTTGGGGTCGAAATCGCCAACCTTAGTTGCCTGCCAGTCAGATCGCCCAAGGCTAGAA 367
                       ** ****         *   * *  ** **   *  *  * *      *  * * *    

consensus_10955#0      TCTGTTTCGTAAGATCAGCCCTCCA-GCAAGTGGAGGTAATCCAGTAGGAGTCCTCCATT 1717
consensus_10955#2      TCTGTTTCGTAAGATCAGCCCTCCA-GCAAGTGGAGGTAATCCAGTAGGAGTCCTCCATT 415
consensus_10955#1      ACTAGCCTTTACTGTGCACTTAATGCACGGGCAGCAGCTAGCCAGTCAGA-TCGCCATCG 426
                        **      **   *   *        *  *  *  *  * *****  ** **  *    

consensus_10955#0      TCTCTATATATCTCTTTGATTGCTTTAAAACCTAACAAAAA--GGTTTAAAGAAAGCAAA 1775
consensus_10955#2      TCTCTATATATCTCTTTGATTGCTTTAAAACCGAACAAAAA--GGTTTAAAGAAAGCAAA 473
consensus_10955#1      GCTCCAGTCAAGCTGTCGGCGGCCC---GGTCAGACTGGCGTCGGCTCTAGCGGCTCTAG 483
                        *** *   *     * *   **        *  **       ** *  *      * * 

consensus_10955#0      AGAAGCGAATGTGTCCATTTATCTTT-CGAAACAATATACTTCTTTCTTGGTGCATGGAG 1834
consensus_10955#2      AGAAGCAAATGTGTCCATTTATCTTT-CGAAACAATATACTTCTTTCTTGGTGCATGGAG 532
consensus_10955#1      ATCGTCAAGCCAAGGCACACATCCCGGCTCACCAACCGCCCGGTCAGACCAGCCAAGAAA 543
                       *    * *       **   ***    *  * ***    *   *         ** * * 

consensus_10955#0      GACCAGACAACCATATAGAGAAATGGAGACT--ATCAGAGTTGTATGTTCAGCAAAG-AT 1891
consensus_10955#2      GGCCAGACAACCAGATAGAGAAATGGAGACTCTATCAGAGTTGTATGTTCAGCAAAG-AT 591
consensus_10955#1      TGCCAGTCAGGCCGGCATGAAGCCCTCGGTCAGACCGGCCTCAAGCAGAAAATGATGTAT 603
                         **** **  *    *   *      *     * * *  *         *   * * **

consensus_10955#0      GAGGTGGCTGATTAAGAGTTGTCTAATTACAACCAGTGCATTGTTGACAATATTGATTTT 1951
consensus_10955#2      GAGGTGGCTGATTAAGAGTTGTCTAATTACAACCAGTGCATTGTTAACAATCTTGATTTT 651
consensus_10955#1      GAAATGA--ACTCGAACGAAGTGACAATGCAAGTGACCTAATGTGGC--ATTTTGATCAA 659
                       **  **     *  *  *  **   * * ***       * ***     ** *****   

consensus_10955#0      TTTTAATCCTTTTGTGCATCTGGGGCAAAGTTATTTGGTAAATTTGAATATGATTTTAGA 2011
consensus_10955#2      TTTTAATCCTTTTGTGCATCTGGGGCAAAGTTATTTGGTAAATTTGAATATGATTTTAGA 711
consensus_10955#1      CTCTT-TACCTAGGTCATTACCTCTCTTGATAGTACGGCAAAGCTAGAAATAAACCTAGC 718
                        * *  * * *  **   *      *    *  *  ** ***  *  * ** *   *** 

consensus_10955#0      ATTTGGTGAAGATACCTGAT-TTTTAACTGATTTCGGATGCTACATGCAATGCATTGTGC 2070
consensus_10955#2      ATTTGGTGAAGATACCTGAT-TTTTAACTGATTTCGGATGCTACATGCAATGCATTGTGC 770
consensus_10955#1      AA--AATTTGATCACCTAACACTTCAATCAATTTAAAACAAAACGCTAGATTTACCATCT 776
                       *     *      **** *   ** **   ****   *    **     **  *   *  

consensus_10955#0      TTCTGTAATATCAAAATTCACGATTGTATATTTTTATTTTGGTGATATATATGCCCTCAA 2130
consensus_10955#2      TTCTG------------TCACGATTGTATATTTTTATTTTAGGGATATATATGCCCTCAA 818
consensus_10955#1      TTGTT------------CCATTGCTTTGTGCCATTAATTTTAATCCGCGGTGATCATCCA 824
                       ** *              **    * * *    *** ***              * ** *

consensus_10955#0      TAGACTTTTAAACTTTGACATGTTGATCACTCCGTAATAATTGTGTGCCATTCTATTTCT 2190
consensus_10955#2      TAGACTT--AAACTTTAAAAAAAAAAAGA------------------------------- 845
consensus_10955#1      TGG-CATGTACATCATGTGGTC-------------------------------------- 845
                       * * * *  * *   *                                            

consensus_10955#0      TTTATATTATGTTTTTCCACCGTTCATGTTACTAATATGTGAAAACCATAGAAATGGAAT 2250
consensus_10955#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10955#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10955#0      ATAGCTATTGTCTGT 2265
consensus_10955#2      ---------------
consensus_10955#1      ---------------
                                      




Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)