These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11023#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 966 fasta sequence [GACGCCGATCAACCTCTCCTTCGCCATGAACGCCCGGCCGCTCCTCCTCCCGCGCGGCGGCGCCGGGTTCTACGGCAACTGCTACTACATCATGCGGGTGGCCTCCACCGCCGGGAGGGTGGCGACGGCGAGCGTCACCGACGTGGTGAGGATGATCCGGGAGGGGAAGAAGCGGCTCCCGTCGGAGTTCGCGCGGTGGGCCGCCGGAGAGATGGCCGGAGTCGACCCGTACCAGATCACCTCCGACTACCGGACGCTGC-TGGTCTCCG-ACTGG-AC-GCGGCTGGGCTTCGCCGAGGTGGACTACGGGTGGGGCCCACCGGGCCACGTCGTGCCGCTCACGAACCTGGACTACATCGCCACGTGTATCCTCGTCAAGCCCTGGGCCCACAAACCAGGGGCACGGCTCATCACCCAGTGCGTCACACCCGACCGCGTCACCGCCTTCCACGACGCCATGGTGGACATCAACTAATTTATTATTATAATTATAATTATTATTATTATTATTATTCCCTTTTCTTTTTATTTTATTTTTTTTACCACGCCACCTTTTTCACTTTGTTTTTTTACCACTACTTCCTTATAATTAATTAATTAATTAATTAGATATTAATAATGAAGAATTAAGGGTAAAAAAAGGAGAGGATAAAGAAAGGTGAAAAGTACATATTGATATTGAGGGTACAGGTAGATGGTAGTAGTTGTTGGCATTATTAGTGGGATTGGTATTGGATTCCTTTGGTGTTGTTTGGTCAAGTGTATACTGGAGAACAGCTACTACATGCTGGGTATTCCTTTTA-TTTTTTTTTCTTTTTTTTGGGATCAAAAGCTGGAATTGGTGGGAAGCCACCAACTAACCAGTATGTCCCCCTTGATAAGTGTACCATATATTGTATTCAATTTTTATCTTATTTTCAGAATGGTATATATAAGCTGGCAAGGTGTACAGCCTCTTTAGTTGTACCA] [-] EMBL CB669648 [GACGCCGATCAACCTCTCCTTCGCCATGAACGCCCGGCCGCTCCTCCTCCCGCGCGGCGGCGCCGGGTTTTACGGCAACTGCTACTACATCATGCGGGTGGCCTCCACCGCCGGGAGGGTGGCGACGGCGAGCGTCACCGACGTGGTGAGGATGATCCGGGAGGGGAAGAAGCGGCTCCCGTCGGAGTTCGCGCGGTGGGCCGCCGGAGAGATGGCCGGAGTCGACCCGTACCAGATCACCTCCGACTACCGGACGCTGG TGGTTTCCG ACTGG AC GCGGCTGGGCTTCGCCGAGGTGGACTACGGGTGGGGCCCACCGGGCCACGTCGTGCCGCTCACGAACCTGGACTACATCGCCACGTGTATCCTCGTCAAGCCCTGGGCCCACAAACCAGGGGCACGGCTCATCACCCAGTGCGTCACACCCGACCGGGTCACCGCCTTCCACGACGCCATGGTGGACATCAACTAATTTATTATTATAATTATAATTATTATTATTATTATTATTCCCTTTTCTTTTTATTTTATTTTTTTTACCACGCCACCTTTTTCACTTTGTTTTTTTACCACTACTTCCTTATAATTAATTAATTAATTAATTAGATATTAATAATGAA ] [+] EMBL AK100028 [ ACGCCGATCAACCTCTCCTTCGCCATGAACGCCCGGCCGCTCCTCCTCCCGCGCGGCGGCGCCGGGTTCTACGGCAACTGCTACTACATCATGCGGGTGGCCTCCACCGCCGGGAGGGTGGCGACGGCGAGCGTCACCGACGTGGTGAGGATGATCCGGGAGGGGAAGAAGCGGCTCCCGTCGGAGTTCGCGCGGTGGGCCGCCGGAGAGATGGCCGGAGTCGACCCGTACCAGATCACCTCCGACTACCGGACGCTGC TGGTCTCCG ACTGG AC 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GCGGCTGGGCTTCGCCGAGGTGGACTACGGGTGGGGCCCACCGGGCCACGTCGTGCCGCTCACGAACCTGGACTACATCGCCACGTGTATCCTCGTCAAGCCCTGGGCCCACAAACCAGGGGCACGGCTCATCACCCAGTGCGTCACACCCGACCGCGTCACCGCCTTCCACGACGCCATGGTGGACATCAACTAATTTATTATTATAATTATAATTATTATTATTATTATTATTCCCTTTTCTTTTTATTTTATTTTTTTTACCACGCCACCTTTTTCACTTTGTTTTTTTACCACTACTTCCTTATAATTAATTAATTAATTAATTAGATATTAATAATGAAGAATTAAGGGTAAAAAAAGGAGAGGATAAAGAAAGGTGAAAAGTACATATTGATATTGAGGGTACAGGTAGATGGTAGTAGTTGTTGGCATTATTAGTGGGATTGGTATTGGATTCCTTTGGTGTTGTTTGGTCAAGTGTATACTGGAGAACAGCTACTACATGCTGGGTATTCCTTTTATTTTTTTTTTCTTTTTTTTGGGATCAAAAGCTGGAATTGGTGGGAAGCCACCAACTAACCAGTATGTCCCCCTTGATAAGTGTACCATATATTGTATTCAATTTTTATCTTATTTTCAGAATGGTATATATAAGCTGGCAAGGTGTACAGCCTCTTTAGTTGTA ] [-] EMBL CB680108 [ 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CACCCAGTGGGTCACACCCGACGGGGTCACCGCCTTCCAGGACGCCATGGTGGACATCAACTAATTTATTATTATAATTATAATTATTATTATTATTATTATTCCCTTTTCTTTTTATTTTATTTTTTTTACCACGCCACCTTTTTCACTTTGTTTTTTTACCACTACTTCCTTATAATTAATTAATTAATTAATTAGATATTAATAATGAAGAATTAAGGGTAAAAAAAGGAGAGGATAAAGAAAGGTGAAAAGTACATATTGATATTGAGGGTACAGGTAGATGGTAGTAGTTGTTGGCATTATTAGTGGGATTGGTATTGGATTCCTTTGGTGTTGTTTGGTCAAGTGTATACTGGAGAACAGCTACTACATGCTGGGTATTCCTTTTA TTTTTTTTTCTTTTTTTTGGGATCAAAAGCTGGAATTGGTGGGAAGCCACCAACTAACCAGTATGTCCCCCTTGATAAGGGTACCATATATTGTATTCAATTTTTATCTTATTTTCAGAATGGTATATATAAn ] [+] EMBL BI812308 [ TTTTTTTACCACTACTTCCTTATAATTAATTAATTAATTAATTAGATATTAATAATGAAGAATTAAGGGTAAAAAAAGGAGAGGATAAAGAAAGGTGAAAAGTACATATTGATATTGAGGGTACAGTTAGATGGTA TTTTTGTTGCCATTATTAGTGGGATTGGTATTGGATTCCTTTGGTGTTGTTTGGTCAAGTGTATACTGGAGAACAGCTACTACATGCTGGGTATTCCTTTTC TTTTTTTTTCTTTTTTTTGGGATCAAAAGCTGGAATTGGTGGGAAGCCACCAACTAACCAGTATGTCCCCCTTGATAAGTGTACCATATATTGTATTCAATTTTTATCTTATTTTCAGAATGGTATATATAAGCTGGCAAaaaaaaaa ] clustalw multiple alignements is not computed in this case 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Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||