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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11023#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 966 fasta sequence
[GACGCCGATCAACCTCTCCTTCGCCATGAACGCCCGGCCGCTCCTCCTCCCGCGCGGCGGCGCCGGGTTCTACGGCAACTGCTACTACATCATGCGGGTGGCCTCCACCGCCGGGAGGGTGGCGACGGCGAGCGTCACCGACGTGGTGAGGATGATCCGGGAGGGGAAGAAGCGGCTCCCGTCGGAGTTCGCGCGGTGGGCCGCCGGAGAGATGGCCGGAGTCGACCCGTACCAGATCACCTCCGACTACCGGACGCTGC-TGGTCTCCG-ACTGG-AC-GCGGCTGGGCTTCGCCGAGGTGGACTACGGGTGGGGCCCACCGGGCCACGTCGTGCCGCTCACGAACCTGGACTACATCGCCACGTGTATCCTCGTCAAGCCCTGGGCCCACAAACCAGGGGCACGGCTCATCACCCAGTGCGTCACACCCGACCGCGTCACCGCCTTCCACGACGCCATGGTGGACATCAACTAATTTATTATTATAATTATAATTATTATTATTATTATTATTCCCTTTTCTTTTTATTTTATTTTTTTTACCACGCCACCTTTTTCACTTTGTTTTTTTACCACTACTTCCTTATAATTAATTAATTAATTAATTAGATATTAATAATGAAGAATTAAGGGTAAAAAAAGGAGAGGATAAAGAAAGGTGAAAAGTACATATTGATATTGAGGGTACAGGTAGATGGTAGTAGTTGTTGGCATTATTAGTGGGATTGGTATTGGATTCCTTTGGTGTTGTTTGGTCAAGTGTATACTGGAGAACAGCTACTACATGCTGGGTATTCCTTTTA-TTTTTTTTTCTTTTTTTTGGGATCAAAAGCTGGAATTGGTGGGAAGCCACCAACTAACCAGTATGTCCCCCTTGATAAGTGTACCATATATTGTATTCAATTTTTATCTTATTTTCAGAATGGTATATATAAGCTGGCAAGGTGTACAGCCTCTTTAGTTGTACCA]
[-] EMBL CB669648 [GACGCCGATCAACCTCTCCTTCGCCATGAACGCCCGGCCGCTCCTCCTCCCGCGCGGCGGCGCCGGGTTTTACGGCAACTGCTACTACATCATGCGGGTGGCCTCCACCGCCGGGAGGGTGGCGACGGCGAGCGTCACCGACGTGGTGAGGATGATCCGGGAGGGGAAGAAGCGGCTCCCGTCGGAGTTCGCGCGGTGGGCCGCCGGAGAGATGGCCGGAGTCGACCCGTACCAGATCACCTCCGACTACCGGACGCTGG TGGTTTCCG ACTGG AC GCGGCTGGGCTTCGCCGAGGTGGACTACGGGTGGGGCCCACCGGGCCACGTCGTGCCGCTCACGAACCTGGACTACATCGCCACGTGTATCCTCGTCAAGCCCTGGGCCCACAAACCAGGGGCACGGCTCATCACCCAGTGCGTCACACCCGACCGGGTCACCGCCTTCCACGACGCCATGGTGGACATCAACTAATTTATTATTATAATTATAATTATTATTATTATTATTATTCCCTTTTCTTTTTATTTTATTTTTTTTACCACGCCACCTTTTTCACTTTGTTTTTTTACCACTACTTCCTTATAATTAATTAATTAATTAATTAGATATTAATAATGAA ]
[+] EMBL AK100028 [ ACGCCGATCAACCTCTCCTTCGCCATGAACGCCCGGCCGCTCCTCCTCCCGCGCGGCGGCGCCGGGTTCTACGGCAACTGCTACTACATCATGCGGGTGGCCTCCACCGCCGGGAGGGTGGCGACGGCGAGCGTCACCGACGTGGTGAGGATGATCCGGGAGGGGAAGAAGCGGCTCCCGTCGGAGTTCGCGCGGTGGGCCGCCGGAGAGATGGCCGGAGTCGACCCGTACCAGATCACCTCCGACTACCGGACGCTGC TGGTCTCCG ACTGG AC GCGGCTGGGCTTCGCCGAGGTGGACTACGGGTGGGGCCCACCGGGCCACGTCGTGCCGCTCACGAACCTGGACTACATCGCCACGTGTATCCTCGTCAAGCCCTGGGCCCACAAACCAGGGGCACGGCTCATCACCCAGTGCGTCACACCCGACCGCGTCACCGCCTTCCACGACGCCATGGTGGACATCAACTAATTTATTATTATAATTATAATTATTATTATTATTATTATTCCCTTTTCTTTTTATTTTATTTTTTTTACCACGCCACCTTTTTCACTTTGTTTTTTTACCACTACTTCCTTATAATTAATTAATTAATTAATTAGATATTAATAATGAAGAATTAAGGGTAAAAAAAGGAGAGGATAAAGAAAGGTGAAAAGTACATATTGATATTGAGGGTACAGGTAGATGGTAGTAGTTGTTGGCATTATTAGTGGGATTGGTATTGGATTCCTTTGGTGTTGTTTGGTCAAGTGTATACTGGAGAACAGCTACTACATGCTGGGTATTCCTTTTA TTTTTTTTTCTTTTTTTTGGGATCAAAAGCTGGAATTGGTGGGAAGCCACCAACTAACCAGTATGTCCCCCTTGATAAGTGTACCATATATTGTATTCAATTTTTATCTTATTTTCAGAATGGTATATATAAGCTGGCAAGGTGTACAGCCT ]
[+] EMBL OSR07341A [ ACGCCGATCAACCTCTCCTTCGCCATGAACGCCCGGCCGCTCCTCCTCCCGNGCGGCGGCGCCGGGTTCTACGGCAACTGCTACTACATCATGCGGGTGGCCTCCACCGCCGGGAGGGTGGCGACGGCGAGCNTCACCGACGTGGTGAGGATGATCCGGGAGGGGAAGAAGCGGCTCCCGTCGGAGTTCGCGCGGTGGGCCGCCGGAGAGATGGCCGGAGTCGACCCGTACCAGATNAACTTCGACTACCGGACGNTGCTTGGTGTTCGAATTGGAACGGCGGNTGGGTTTNGGCGAGGTGGAtt ]
[-] EMBL CB684363 [ GATCACCTCCGACTACCGGACGCTGC TGGTCTCCG ACTGG AC GCGGCTGGGCTTCGCCGAGGTGGACTACGGGTGGGGCCCACCGGGCCACGTCGTGCCGCTCACGAACCTGGACTACATCGCCACGTGTATCCTCGTCAAGCCCTGGGCCCACAAACCAGGGGCACGGCTCATCACCCAGTGCGTCACACCCGACCGCGTCACCGCCTTCCACGACGCCATGGTGGACATCAACTAATTTATTATTATAATTATAATTATTATTATTATTATTATTCCCTTTTCTTTTTATTTTATTTTTTTTACCACGCCACCTTTTTCACTTTGTTTTTTTACCACTACTTCCTTATAATTAATTAATTAATTAATTAGATATTAATAATGAAGAATTAAGGGTAAAAAAAGGAGAGGATAAAGAAAGGTGAAAAGTACATATTGATATTGAGGGTACAGGTAGATGGTAGTAGTTGTTGGCATTATTAGTGGGATTGGTATTGGATTCCTTTGGTGTTGTTTGGTCAAGTGTATACTGGAGAACAGCTACTACATGCTGGGTATTCCTTTTATTTTTTTTTTCTTTTTTTTGGGATCAAAAGCTGGAATTGGTGGGAAGCCACCAACTAACCAGTATGTCCCCCTTGATAAGTGTACCATATATTGTATTCAATTTTTATCTTATTTTCAGAATGGTATATATAAGCTGGCAAGGTGTACAGCCTCTTTAGTTGTA ]
[-] EMBL CB680108 [ GAACCTGGACTACATCGCCACGTGTATCCTCGTCAAGCCCTGGGCCCACAAACCAGGGGCACGGCTCATCACCCAGTGCGTCACACCCGACCGCGTCACCGCCTTCCACGACGCCATGGTGGACATCAACTAATTTATTATTATAATTATAATTATTATTATTATTATTATTCCCTTTTCTTTTTATTTTATTTTTTTTACCACGCCACCTTTTTCACTTTGTTTTTTTACCACTACTTCCTTATAATTAATTAATTAATTAATTAGATATTAATAATGAAGAATTAAGGGTAAAAAAAGGAGAGGATAAAGAAAGGTGAAAAGTACATATTGATATTGAGGGTACAGGTAGATGGTAGTAGTTGTTGGCATTATTAGTGGGATTGGTATTGGATTCCTTTGGTGTTGTTTGGTCAAGTGTATACTGGAGAACAGCTACTACATGCTGGGTATTCCTTTTA TTTTTTTTTCTTTTTTTTGGGATCAAAAGCTGGAATTGGTGGGAAGCCACCAACTAACCAGTATGTCCCCCTTGATAAGTGTACCATATATTGTATTCAATTTTTATCTTATTTTCAGAATGGTATATATAAAGGGGCAAGGTGTACAGCCTCTTTAGTTGTACCA]
[+] EMBL CB680107 [ ACTACATCGCCACGTGTATCCTCGTCAAGCCCTGGGCCCACAAACCAGGGGCACGGCTCATCACCCAGTGCGTCACACCCGACCGCGTCACCGCCTTCCACGACGCCATGGTGGACATCAACTAATTTATTATTATAATTATAATTATTATTATTATTATTATTCCCTTTTCTTTTTATTTTATTTTTTTTACCACGCCACCTTTTTCACTTTGTTTTTTTACCACTACTTCCTTATAATTAATTAATTAATTAATTAGATATTAATAATGAAGAATTAAGGGTAAAAAAAGGAGAGGATAAAGAAAGGTGAAAAGTACATATTGATATTGAGGGTACAGGTAGATGGTAGTAGTTGTTGGCATTATTAGTGGGATTGGTATTGGATTCCTTTGGTGTTGTTTGGTCAAGTGTATACTGGAGAACAGCTACTACATGCTGGGTATTCCTTTTA TTTTTTTTTCTTTTTTTTGGGATCAAAAGCTGGAATTGGTGGGAAGCCACCAACTAACCAGTATGTCCCCCTTGATAAGTGTACCATATATTGTATTCAATTTTTATCTTATTTTCAGAATGGTATATATAAGCTGGCAAGGTGTACAGCCTCTTT ]
[-] EMBL CB641874 [ CACCCAGTGGGTCACACCCGACGGGGTCACCGCCTTCCAGGACGCCATGGTGGACATCAACTAATTTATTATTATAATTATAATTATTATTATTATTATTATTCCCTTTTCTTTTTATTTTATTTTTTTTACCACGCCACCTTTTTCACTTTGTTTTTTTACCACTACTTCCTTATAATTAATTAATTAATTAATTAGATATTAATAATGAAGAATTAAGGGTAAAAAAAGGAGAGGATAAAGAAAGGTGAAAAGTACATATTGATATTGAGGGTACAGGTAGATGGTAGTAGTTGTTGGCATTATTAGTGGGATTGGTATTGGATTCCTTTGGTGTTGTTTGGTCAAGTGTATACTGGAGAACAGCTACTACATGCTGGGTATTCCTTTTA TTTTTTTTTCTTTTTTTTGGGATCAAAAGCTGGAATTGGTGGGAAGCCACCAACTAACCAGTATGTCCCCCTTGATAAGGGTACCATATATTGTATTCAATTTTTATCTTATTTTCAGAATGGTATATATAAn ]
[+] EMBL BI812308 [ TTTTTTTACCACTACTTCCTTATAATTAATTAATTAATTAATTAGATATTAATAATGAAGAATTAAGGGTAAAAAAAGGAGAGGATAAAGAAAGGTGAAAAGTACATATTGATATTGAGGGTACAGTTAGATGGTA TTTTTGTTGCCATTATTAGTGGGATTGGTATTGGATTCCTTTGGTGTTGTTTGGTCAAGTGTATACTGGAGAACAGCTACTACATGCTGGGTATTCCTTTTC TTTTTTTTTCTTTTTTTTGGGATCAAAAGCTGGAATTGGTGGGAAGCCACCAACTAACCAGTATGTCCCCCTTGATAAGTGTACCATATATTGTATTCAATTTTTATCTTATTTTCAGAATGGTATATATAAGCTGGCAAaaaaaaaa ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||