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Oryza sativa
cluster # 11105 cluster # 11105       Sequences # 8       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_11105#0 length = 1376 sequences # 8  
consensusID : consensus_11105#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1376
fasta sequence 
                              [GCTGTCGCTGTCCACCCGTCCGTCCGTCGTCGATGGCGTCGTCGTCGCCGCCGGTCCGGCCATGGGCGGACCTGCAGCACGACCTGCTCGTGATGATCATGTCCCGGGTGGGCCTCCCCGATCTCCTCTCCGGCGGCGCCACCCGCGCCTGCTCCGCATGGCGGGCCTCGGCGCGCGACCCGCTCGTGTGGCGCCGCGTTGACCTCCGCGACTGGGCCGTCCTGACCTCGGCCCGGCGCCGGCTCGCTGCGGGAGACGGTGAAGCAGCAGCCGCCGGGCGCGGGCGTGTCCCTCTTCAAGCCGCTCTCTGCAGTGTGCTGGAGATCGTCGTGCGGCGGGCGGCCGGTCGGATGGAGGCCTTGCTCCTACCGGAGTTCGCCGATGAGGAGCACCTCCTCTTCCTCGCTCAGAGGAATCCAAATCTGCACTATTTCAGCCTTCCTGCCACATGTATAACTTATGATCAGTTCCGTAAGGCAATTGACAAATTACAATTTCTTAAAGGCATGGCAGTGGATGAGGGTCTTATTAATCACGATGTTCTCAGCCATGTACATCAGTGTTGTCCAGATTTTCTGGAGTTGAAGGTGTTTGCTCTTTATGTCGACGAAGAGATGGCTTCAATCATTTGCAACTCCCTTCCACGTCTGAAGAAGCTTGAGATACCAAACTCTGATATGTCTTGTGCTGCAATAATAAAATTCCTT-GATTGCCTAGAGGAGCTTG-AGTACTTGGACATATCTGGTTATGAGACTTCGGCAATATC-AAGTGCTGTGCTCC-AAAAAGCTTCTCGGCTGAACATCTTCATCTGGAACTCAAAATTTGAGCTTGGGGAGTTCACGGACTGTTCGAATTGTGGTGAACATTGCATTAATCCTCAAGAG-CCTTGTAAGTGCGTGATGGAGCA-CAGAGTCATGGACTGGCTGGCTGGACCTTCACAACCTTCCTGATGCAGTAAACTGTGACTTAAGTTAAATTGACAATCCTACCTGCTCGTCAAATTTCAACATTTGTCTGGGTTACTTGTCAATCAAATGGTGGGTAAGGTGGTACCACGCTTTGATGTGCCTTATGTGGCACTTTATTTTGGAGTTTAATATGTATGTGATATCACGATTTCCAGCATTTTATTGTCAATGATGTCTTGTGAGAACGAAGCAACGCACGCTACTTGGTGCAGTGTTGAGCCTTGTTTTACAATAAATTTTAAGTCGTTGCAGTCTCTTGGGCCTGAGCGAGCTGGCAACGCATGGCTGTTCGGCTGTTCCGCCTGTGCAGAGTACTCTGCTTTGTACTCTTTTGTTAACCAAAGATGCCCTGTGTTTCCNCGAGAGGCATTTACGTTGGAGATCTCCATGATTGCACTCTTTAAAAAA]

[+] EMBL AK072991             [GCTGTCGCTGTCCACCCGTCCGTCCGTCGTCGATGGCGTCGTCGTCGCCGCCGGTCCGGCCATGGGCGGACCTGCAGCACGACCTGCTCGTGATGATCATGTCCCGGGTGGGCCTCCCCGATCTCCTCTCCGGCGGCGCCACCCGCGCCTGCTCCGCATGGCGGGCCTCGGCGCGCGACCCGCTCGTGTGGCGCCGCGTTGACCTCCGCGACTGGGCCGTCCTGACCTCGGCCCGGCGCCGGCTCGCTGCGGGAGACGGTGAAGCAGCAGCCGCCGGGCGCGGGCGTGTCCCTCTTCAAGCCGCTCTCTGCAGTGTGCTGGAGATCGTCGTGCGGCGGGCGGCCGGTCGGATGGAGGCCTTGCTCCTACCGGAGTTCGCCGATGAGGAGCACCTCCTCTTCCTCGCTCAGAGGAATCCAAATCTGCACTATTTCAGCCTTCCTGCCACATGTATAACTTATGATCAGTTCCGTAAGGCAATTGACAAATTACAATTTCTTAAAGGCATGGCAGTGGATGAGGGTCTTATTAATCACGATGTTCTCAGCCATGTACATCAGTGTTGTCCAGATTTTCTGGAGTTGAAGGTGTTTGCTCTTTATGTCGACGAAGAGATGGCTTCAATCATTTGCAACTCCCTTCCACGTCTGAAGAAGCTTGAGATACCAAACTCTGATATGTCTTGTGCTGCAATAATAAAATTCCTT GATTGCCTAGAGGAGCTTG AGTACTTGGACATATCTGGTTATGAGACTTCGGCAATATC AAGTGCTGTGCTCC AAAAAGCTTCTCGGCTGAACATCTTCATCTGGAACTCAAAATTTGAGCTTGGGGAGTTCACGGACTGTTCGAATTGTGGTGAACATTGCATTAATCCTCAAGAG CCTTGTAAGTGCGTGATGGAGCA CAGAGTCATGGACTGGCTGGCTGGACCTTCACAACCTTCCTGATGCAGTAAACTGTGACTTAAGTTAAATTGACAATCCTACCTGCTCGTCAAATTTCAACATTTGTCTGGGTTACTTGTCAATCAAATGGTGGGTAAGGTGGTACCACGCTTTGATGTGCCTTATGTGGCACTTTATTTTGGAGTTTAATATGTATGTGATATCACGATTTCCAGCATTTTATTGTCAATGATGTCTTGTGAGAACGAAGCAACGCACGCTACTTGGTGCAGTGTTGAGC                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AK061175             [                                  GGCGTCGTCGTCGCCGCCGGTCCGGCCATGGGCGGACCTGCAGCACGACCTGCTCGTGATGATCATGTCCCGGGTGGGCCTCCCCGATCTCCTCTCCGGCGGCGCCACCCGCGCCTGCTCCGCATGGCGGGCCTCGGCGCGCGACCCGCTCGTGTGGCGCCGCGTTGACCTCCGCGACTGGGCCGTCCTGACCTCGGCCCGGCGCCGGCTCGCTGCGGGAGACGGTGAAGCAGCAGCCGCCGGGCGCGGGCGTGTCCCTCTTCAAGCCGCTCTCTGCAGTGTGCTGGAGATCGTCGTGCGGCGGGCGGCCGGTCGGATGGAGGCCTTGCTCCTACCGGAGTTCGCCGATGAGGAGCACCTCCTCTTCCTCGCTCAGAGGAATCCAAATCTGCACTATTTCAGCCTTCCTGCCACATGTATAACTTATGATCAGTTCCGTAAGGCAATTGACAAATTACAATTTCTTAAAGGCATGGCAGTGGATGAGGGTCTTATTAATCACGATGTTCTCAGCCATGTACATCAGTGTTGTCCAGATTTTCTGGAGTTGAAGGTGTTTGCTCTTTATGTCGACGAAGAGATGGCTTCAATCATTTGCAACTCCCTTCCACGTCTGAAGAAGCTTGAGATACCAAACTCTGATATGTCTTGTGCTGCAATAATAAAATTCCTT GATTGCCTAGAGGAGCTTG AGTACTTGGACATATCTGGTTATGAGACTTCGGCAATATC AAGTGCTGTGCTCC AAAAAGCTTCTCGGCTGAACATCTTCATCTGGAACTCAAAATTTGAGCTTGGGGAGTTCACGGACTGTTCGAATTGTGGTGAACATTGCATTAATCCTCAAGAG CCTTGTAAGTGCGTGATGGAGCA CAGAGTCATGGACTGGCTGGCTGGACCTTCACAACCTTCCTGATGCAGTAAACTGTGACTTAAGTTAAATTGACAATCCTACCTGCTCGTCAAATTTCAACATTTGTCTGGGTTACTTGTCAATCAAATGGTGGGTAAGGTGGTACCACGCTTTGATGTGCCTTATGTGGCACTTTATTTTGGAGTTTAATATGTATGTGATATCACGATTTCCAGCATTTTATTGTCAATGATGTCTTGTGAGAACGAAGCAACGCACGCTACTTGGTGCAGTGTTGAGCCTTGTTTTACAATAAATTTT                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CA757702             [                                              GCCGCCGGTCCGGCCATGGGCGGACCTGCAGCACGACCTGCTCGTGATGATCATGTCCCGGGTGGGCCTCCCCGATCTCCTCTCCGGCGGCGCCACCCGCGCCTGCTCCGCATGGCGGGCCTCGGCGCGCGACCCGCTCGTGTGGCGCCGCGTTGACCTCCGCGACTGGGCCGTCCTGACCTCGGCCCGGCGCCGGCTCGCTGCGGGAGACGGTGAAGCAGCAGCCGCCGGGCGCGGGCGTGTCCCTCTTCAAGCCGCTCTCTGCAGTGTGCTGGAGATCGTCGTGAGGCGGGCGGCCGGTCGGATGGAGGCCCTGCTCCTACCGGAGTTCGCCGATGAGGAGCACCTCCTCTTCCTCGCTCAGAGGAATCCAAATCTGCACTATTTCAGCCTTCCTGCCACATGTATAACTTATGATCAGTTCCGTAAGGCAATTGACAAATTACAGTTTCTTAAAGGCATGGCAGTGGATGAGGGTCTTATTAATCACGATGTTCTCAGCCATGTACATCAGTGTTGTCCAGATTTTCTGGAGTTGAAGGTGTTTGCTCTTTATGTCGACGAAGAGATGGCTTCAATCATTTGCAACTCCCTTCCACGTCTGAAGAAGCTTGAGATACCAAACTCTGATATGTCTTGGGCTGCAATAAT AAATTCCTT GATTGCCTAGAGGAGCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AU095144             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTACCGGAGTTCGCCGATGAGGAGCACCTCCTCTTCCTCGCTCAGAGGAATCCAAATCTGCACTATTTCAGCCTTCCTGCCACATGTATAACTTATGATCAGTTCCGTAAGGCAATTGACAAATTACAATTTCTTAAAGGCATGGCAGTGGATGAGGGTCTTATTAATCACGATGTTCTCAGCCATGTACATCAGTGTTGTCCAGATTTTCTGGAGTTGAAGGTGTTTGCTCTTTATGTCGACGAAGAGATGGCTTCAATCATTTGCAACTCCCTTCCACGTCTGAAGAAGCTTGAGATACCAAACTCTGATATGTCTTGTGCTGCAATAATAAAATTCCTTGGATTGCCTAGAGGAGCTTGAAGTACTTGGACATATCTGGGTATGAGACTTCGGCAATATCAAAGTGCTGTGCTCCAAAAAAGCTTCTCGGCTGGACATCTTCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL AU030796             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATTACAATTTCTTAAAGGCATGGCANTGGATGAGGGTCTTATTAATCACGATGTTCTCAGCCATNTACATCAGTGTTGTCCAGATTTTCTGGAGTTGAAGGTGTTTGCTCTTTATGTCGACGAAGAGATGGCTTCAATCATTTGCAACTCCCTTCCACGTCTGAAGAAGCTTGAGATACCAAACTCTGATATGTCTTGTGCTGCAATAATAAAATTCCTT GATTGCCTAGAGGAGCTTG AGTACTTGGACATATCTGGTTATGAGACTTCGGCAATATC AAGTGCTGTGCTCC AAAAAGCTTCTCGGCTGAACATCTTCATCTGGAACTCAAAATTTGAGCTTGGGGAGTTCACGGACTGTTCGAATTGTGGTGAACATTGCATTAATCCTCAAGAG CCTTGTAAGTGCGTGATGGAGCA CAGAGTCATGGACTGGCTGGCTGGACCTTCACAACCTTCCTGATGCAGTAAACTGTGACTTAAGTTAAATTGACAATCCTACCTGCTCGTCAAATTTCAACATTTGTCTGGGTTACTTGTCAATCAAATGGTGGGTAAGGTGGTACCACGCTTTGATGTGCCTTATGTGGCACTTTATTTTGGAGTTTAATATGTATGTGATATCACGATTTCCAGCATTTTATTGTCAATGATGTCTTGTGAGAAaaa                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CF332378             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CTTATTAATCACGATGTTCTCAGCCATGTACATCAGTGTTGTCCAGATTTTCTGGAGTTGAAGGTGTTTGCTCTTTATGTCGACGAAGAGATGGCTTCAATCATTTGCAACTCCCTTCCACGTCTGAAGAAGCTTGAGATACCAAACTCTGATATGTCTTGTGCTGCAATAATAAAATTCCTT GATTGCCTANAGGAGCTTG TGTACTTGGACATATCTGGTTATGAGACTTCGGCAATATC AAGTGCTGTGCTCC AAAAAGCTTCTCGGCTGAACATCTTCATCTGGAACTCAAAATTTGAGCTTGGGGAGTTCACGGACTGTTCGAATTGTGGTGAACATTGCATTAATCCTCAAGAG CCTTGTAAGTGCGTGATGGAGCA CAGAGTCATGGACTGGCTGGCTGGACCTTCACAACCTTCCTGATGCAGTAAACTGTGACTTAAGTTAAATTGACAATCCTACCTGCTCGTCAAATTTCAACATTTGTCTGGGTTACTTGTCAATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BQ907396             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CTGGAACTCCAAATTTGAGCTTGGGGAGTTCACGGACTGTTCGAATTGTGGTGAACATTGCATTAATCCTCAAGAGCCCTTGTAAGTGCGTGATGGAGCACCAGAGTCATGGACTGGCTGGCTGGACCTTCAC ACCTTCCTGATGCAGTAAACTGTGACTTAAGTTAAATTGACTATCCTACCTGCTCGTCAAATTTCAACATTTGTCTGGGTTACTTGTCAATCAAATGGTGGGTAAGGTGTTACCACGCTTTGATGTGCCTTATGTGGCACTTTATTTTGGAGTTTAATATGTATGTGATATCACGATTTCCAGCATTTTATTGTCAATGATGTCTTGTGAGAACGAAGC ACGCACGCTACTTGGTGCAGTGTTGAGCCTTGTTTTACAATAAATTTTAAGTCGTTGCAGTCTCTTGGGCCTGAGCGAGCTGGCAACGCATGGCTGTTCGGCTGTTCCGCCTGTGCAGAGTACTCTGCTTTGTACTCTTTTGTTAACCAAAGATGCCCTGTGTTTCCNCGAGAGGCATTTACGTTGGAGATCTCCATGATTGCACTCTTTAAAAAA]
[+] EMBL BI808786             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATGGACTGGCTGGCTGGACCTTCACAACCTTCCTGATGCAGTAAACTGTGACTTAAGTTAAATTGACTATCCTACCTGCTCGTCAAATTTCAACATTTGTCTGGGTTACTTGTCAATCAAATGGTGGGTAAGGTGTTACCACGCTTTGATGTGCCTTATGTGGCACTTTATTTTGGAGTTTAATATGTATGTGATATCACGATTTCCAGCATTTTATTGTC ATGATGTCTTGTGAGAACGAAGC ACGCACGCTACTTGGTGCAGTGTTGAGCCTTGTTTTACAATAAAaaaaaa                                                                                                                                                                      ]




>consensus_11105#0
GCTGTCGCTGTCCACCCGTCCGTCCGTCGTCGATGGCGTCGTCGTCGCCGCCGGTCCGGC
CATGGGCGGACCTGCAGCACGACCTGCTCGTGATGATCATGTCCCGGGTGGGCCTCCCCG
ATCTCCTCTCCGGCGGCGCCACCCGCGCCTGCTCCGCATGGCGGGCCTCGGCGCGCGACC
CGCTCGTGTGGCGCCGCGTTGACCTCCGCGACTGGGCCGTCCTGACCTCGGCCCGGCGCC
GGCTCGCTGCGGGAGACGGTGAAGCAGCAGCCGCCGGGCGCGGGCGTGTCCCTCTTCAAG
CCGCTCTCTGCAGTGTGCTGGAGATCGTCGTGCGGCGGGCGGCCGGTCGGATGGAGGCCT
TGCTCCTACCGGAGTTCGCCGATGAGGAGCACCTCCTCTTCCTCGCTCAGAGGAATCCAA
ATCTGCACTATTTCAGCCTTCCTGCCACATGTATAACTTATGATCAGTTCCGTAAGGCAA
TTGACAAATTACAATTTCTTAAAGGCATGGCAGTGGATGAGGGTCTTATTAATCACGATG
TTCTCAGCCATGTACATCAGTGTTGTCCAGATTTTCTGGAGTTGAAGGTGTTTGCTCTTT
ATGTCGACGAAGAGATGGCTTCAATCATTTGCAACTCCCTTCCACGTCTGAAGAAGCTTG
AGATACCAAACTCTGATATGTCTTGTGCTGCAATAATAAAATTCCTTGATTGCCTAGAGG
AGCTTGAGTACTTGGACATATCTGGTTATGAGACTTCGGCAATATCAAGTGCTGTGCTCC
AAAAAGCTTCTCGGCTGAACATCTTCATCTGGAACTCAAAATTTGAGCTTGGGGAGTTCA
CGGACTGTTCGAATTGTGGTGAACATTGCATTAATCCTCAAGAGCCTTGTAAGTGCGTGA
TGGAGCACAGAGTCATGGACTGGCTGGCTGGACCTTCACAACCTTCCTGATGCAGTAAAC
TGTGACTTAAGTTAAATTGACAATCCTACCTGCTCGTCAAATTTCAACATTTGTCTGGGT
TACTTGTCAATCAAATGGTGGGTAAGGTGGTACCACGCTTTGATGTGCCTTATGTGGCAC
TTTATTTTGGAGTTTAATATGTATGTGATATCACGATTTCCAGCATTTTATTGTCAATGA
TGTCTTGTGAGAACGAAGCAACGCACGCTACTTGGTGCAGTGTTGAGCCTTGTTTTACAA
TAAATTTTAAGTCGTTGCAGTCTCTTGGGCCTGAGCGAGCTGGCAACGCATGGCTGTTCG
GCTGTTCCGCCTGTGCAGAGTACTCTGCTTTGTACTCTTTTGTTAACCAAAGATGCCCTG
TGTTTCCNCGAGAGGCATTTACGTTGGAGATCTCCATGATTGCACTCTTTAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)