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Oryza sativa
cluster # 11134 cluster # 11134       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_11134#0 length = 1710 sequences # 8  

consensusID : consensus_11134#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1710
fasta sequence
                              [GTCGGCGTCGCCGCCGCCGGCGTCTTCTCCACCTCCTCCGCGCCGCGCTCGCAACCACCTTCCAGATTGGATGGGACTATAACTGAAACCTTCTGTATTAAGCTTCCGCGAGGGCTCACCTGCAGAACGTGATGGTCACCATTTACTGGTGCAGCAGGCAAAAAGTTGCATGGAGCGCTACAGGCTGTACACTTTTGATTTCCCTGCTGTTCTTTTTCTCTGGTTCACCGCATAGGATCCTCTTGAACAAGAAACCTCTCAATTTCAAAACAGCACCATCTAGGTTATTGCGTGAGATTAGCATCAGTTCAAGTCGTGTTCAGAGGGTTAACAATTCATCCGCGGAGTTTGTTGCAAACCTGAATGACCGTAATGTAGAAATTGTACAACATATGGAAGACAACGATCATAACATCATCAATGCAACTGCAAATGTGACTTCTGACTGGAGCATTGTCAAGGAGGAATTCACATTTCCAGCTGGAAGTGCCCCTTTCAATAGCTGCCATGCTTCTACTA-TTGTA-GAGACTGAGAAGGATAGTTTTTT-GGTGGCTT-ATTTCGGTGGAT-CCAAGGAAGGTGCTCCTGATGTGAAGATCTGGCTGCAGAGATACAGTGATGGCTGCTGGCATACT-CCACAAGTGGCTGATGAACAGGATGAGGTACCTATGTGGAATCCTGTTCTGTTTCAGCTCCCTTCTCATGAGCTTCTTCTCTTCTACAAGATTGGCCAAGAAGTTCAGAAGTGGAGTGGTGCCATGAAAAGATCTCTAGATGGAGGAAAAACCTGGTCGGCAAGAGAACAGCTACCACCTGGCATCCTTGGTCCTATTAAGAATAAGCCTTTCTTGGTTGAAGATGGGCGCTTGCTATGTGGGTCATCTGTTGAAAGCTGGAACTCTTGGGGTGCATGGCTTGAGGTCACAAAAGATGCCGGACAAACATGGCGGAAGTATGGCCCTATATATATTGAAGGCGAAACACTA-GGGGTGATCCAG-CCAGTTCCCTACATGACTGCCAATGGGACTATT-CGAGTGTTGCTGCGATCTTTTGAGACAATTGGTCGTGT-CTGCATGGCTGATTCTGCTGATGGGGGTGTAACATGGAGTTATGTGCACGAGACTGACCTTCCTAACCCAAACTCTGGGATTGATGGAGTTAAGATGAAGGATGGGAGAGTACTCCTTGCTTACAAC-ACCTTCT-CCAGAGGAACACTAAAAGTTGCAGTCTCCATGGATGATGGTGATTCAT-GGAACGATGTAATGACATTGGAAGATACTGAAGGCATGGAGTTTTCATATCCTGCAGTGATCCAGACCATGGATGATCTCATACATATCACGTACACATACAACCGGACACAAATTAAGCATGTTGTTCTTCAACCTAGCGGGAAAGTGAGGTGGTGAGTGTGCAACTATTGGGAGAGTTATTGCTGCCA-ATTGCAAGGCACGCAAGTTTTTCTCTATGTGTGTCACATCATATTGGCTGGACCGTGGTGCTAAATTGGTCATCA-ATGATTCTTTTTTTGGGTATATTTGGTCATTTGCATAATTTCTTGCAATTGTAACCTAATTAATAATCTCCCTGATTCCTATCAACAATGATATTGAACATCTGTACATATGCCCCAAAGTTTAACATAAGTTGTTCCGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAANAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK106685             [GTCGGCGTCGCCGCCGCCGGCGTCTTCTCCACCTCCTCCGCGCCGCGCTCGCAACCACCTTCCAGATTGGATGGGACTATAACTGAAACCTTCTGTATTAAGCTTCCGCGAGGGCTCACCTGCAGAACGTGATGGTCACCATTTACTGGTGCAGCAGGCAAAAAGTTGCATGGAGCGCTACAGGCTGTACACTTTTGATTTCCCTGCTGTTCTTTTTCTCTGGTTCACCGCATAGGATCCTCTTGAACAAGAAACCTCTCAATTTCAAAACAGCACCATCTAGGTTATTGCGTGAGATTAGCATCAGTTCAAGTCGTGTTCAGAGGGTTAACAATTCATCCGCGGAGTTTGTTGCAAACCTGAATGACCGTAATGTAGAAATTGTACAACATATGGAAGACAACGATCATAACATCATCAATGCAACTGCAAATGTGACTTCTGACTGGAGCATTGTCAAGGAGGAATTCACATTTCCAGCTGGAAGTGCCCCTTTCAATAGCTGCCATGCTTCTACTA TTGTA GAGACTGAGAAGGATAGTTTTTT GGTGGCTT ATTTCGGTGGAT CCAAGGAAGGTGCTCCTGATGTGAAGATCTGGCTGCAGAGATACAGTGATGGCTGCTGGCATACT CCACAAGTGGCTGATGAACAGGATGAGGTACCTATGTGGAATCCTGTTCTGTTTCAGCTCCCTTCTCATGAGCTTCTTCTCTTCTACAAGATTGGCCAAGAAGTTCAGAAGTGGAGTGGTGCCATGAAAAGATCTCTAGATGGAGGAAAAACCTGGTCGGCAAGAGAACAGCTACCACCTGGCATCCTTGGTCCTATTAAGAATAAGCCTTTCTTGGTTGAAGATGGGCGCTTGCTATGTGGGTCATCTGTTGAAAGCTGGAACTCTTGGGGTGCATGGCTTGAGGTCACAAAAGATGCCGGACAAACATGGCGGAAGTATGGCCCTATATATATTGAAGGCGAAACACTA GGGGTGATCCAG CCAGTTCCCTACATGACTGCCAATGGGACTATT CGAGTGTTGCTGCGATCTTTTGAGACAATTGGTCGTGT CTGCATGGCTGATTCTGCTGATGGGGGTGTAACATGGAGTTATGTGCACGAGACTGACCTTCCTAACCCAAACTCTGGGATTGATGGAGTTAAGATGAAGGATGGGAGAGTACTCCTTGCTTACAAC ACCTTCT CCAGAGGAACACTAAAAGTTGCAGTCTCCATGGATGATGGTGATTCAT GGAACGATGTAATGACATTGGAAGATACTGAAGGCATGGAGTTTTCATATCCTGCAGTGATCCAGACCATGGATGATCTCATACATATCACGTACACATACAACCGGACACAAATTAAGCATGTTGTTCTTCAACCTAGCGGGAAAGTGAGGTGGTGAGTGTGCAACTATTGGGAGAGTTATTGCTGCCA ATTGCAAGGCACGCAAGTTTTTCTCTATGTGTGTCACATCATATTGGCTGGACCGTGGTGCTAAATTGGTCATCA ATGATTCTTTTTTTGGGTATATTTGGTCATTTGCATAATTTCTTGCAATTGTAACCTAATTAATAATCTCCCTGATTCCTATCAACAATGATATTGAACATCTGTACATATGCCCCAAAGTTTAACATAAGTTGTTCCGTAtatg                                                    ]
[+] EMBL CA999759             [                                                                                                                                                                                                                                                             ACCTCTCAATTTCAAAACAGCACCATCTAGGTTATTGCGTGAGATTAGCATCAGTTCAAGTCGTGTTCAGAGGGTTAACAATTCATCCGCGGAGTTTGTTGCAAACCTGAATGACCGTAATGTAGAAATTGTACAACATATGGAAGACAACGATCATAACATCATCAATGCAACTGCAAATGTGACTTCTGACTGGAGCATTGTCAAGGAGGAATTCACATTTCCAGCTGGAAGTGCCCCTTTCAATAGCTGCCATGCTTCTACTA TTGTA GAGACTGAGAAGGATAGTTTTTT GGTGGCTT ATTTCGGTGGAT CCAAGGAAGGTGCTCCTGATGTGAAGATCTGGCTGCAGAGATACAGTGATGGCTGCTGGCATACTCCCAC AGTGGCTGATGAACAGGATGAGGTACCTATGTGGAATCCTGTTCTGTTTCAGCTCCCTTCTCATGAGCTTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL OSS12288A            [                                                                                                                                                                                                                                                               CTCTCAATTTCAAAACAGCACCATCTAGGTTATTGCGTGAGATTAGCATCAGTTCAAGTCGTGTTCAGAGGGTTAACAATTCATCCGCGGAGTTTGTTGCAAACCTGAATGACCGTAATGTAGAAATTGTACAACATATGGAAGACAACGATCATAACATCATCAATGCAACTGCAAATGTGACTTCTGACTGGAGCATTGTCAAGGAGGAATTCACATTTCCAGCTGGAGGTGCCCTTTTCAATAGCTGCCATGCTTCTACTATTTGTAGGNGCCTTA AAGGGTNGTTTTTTGGGTGGNTTAATTTCGGGGGGTCCCAAGGAgg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CA998769             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGAAGATGGGCGCTTGCTATGTGGGTCATCTGTTGAAAGCTGGAACTCTTGGGGTGCATGGCTTGAGGTCACAAAAGATGCCGGACGAACATGGCGGAAGTATGGCCCTATATATATTGAAGGCGAAACACTA GGGGTGATCCAG CCAGTTCCCTACATGACTGCCAATGGGACTATT CGAGTGTTGCTGTTATCTTTTGAGACAATTGGTCGTGT CTGCATGGCTGATTCTGCTGATGGGGGTGTAACATGGAGTTATGTGCACGAGACTGACCTTCCTAACCCAAACTCTGGGATTGATGGAGTTAAGATGAAGGATGGGAGAGTACTCCTTGCTTACAAC ACCTTCT CCAAAGGAACACTAAAAGTTGCAGTCTCCATGGATGATGGTGATTCAT GGAACGATGTAATGACATTGGAAGATACTGAAGGCATGGAGTTTTCATATCCTGCAGTGATCCAGACCATGGATGATCTCATACATATCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AU032626             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atntTTGAAGGCNAACCACTAGGGGGTGANCCAGCCCAGTCCCCTACATGACTCCCAATGGGACTATTCCGAGTNTTGCTGCGATCTTTTGAGACAATTGGTCGTGTCCTGCNTGGCTGATCCTGCTGATGGGGGTGTAACATGGAGTTATGTGCACGAGACTGCCCTCCCTACCCCAAACTCTGGGATTGATGGAGTTAAGATGAAGGATGGGAGAGTACTCCTGGCTTACAACNACCTTCTCCCAGAGGAACACTAAAAGTTGCAGTCCCCATGGATGATGGTGATTCATGGGANCGATGTAATGACATTGGAAGATACTGAAGGCATGGAGTTTTCATATCCTGCAGTGATCCAGACCATGGATGATCTCATACATATCACGTACACATACAACCGGACACAAATTAAGCATGTTGTTCTTCAACCTAGCGGGAAAGTGAGGTGGTGAGTGTGCAACTATTGGGAGAGTTATTGCTGCCA ATTGCAAGGCACGCAAGTTTTTCTCTATGTGTGTCACATCATATTGGCTGGACCGTGGTGCTAAATTGGTCATCA ATGATTCTTTTTTTGGGTATATTTGGTCATTTGCATAATTTCTTGCAATTGTAACCTAATTAATAATCTCCCTGATTCCTATCAACAATGATATTGAACATCTGTACATATGCCCCAAAGTTTAAAAAAAaaa                                                                ]
[+] EMBL C97008               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTCGTGT CTGCATGGCTGATTCTGCTGATGGGGGTGTAACATGGAGTTATGTGCACGAGACTGACCTTCCTAACCCAAACTCTGGGATTGATGGAGTTAAGATGAAGGATGGGAGAGTACTCCTTGCTTACAAC ACCTTCT CCAGAGGAACACTAAAAGTTGCAGTCTCCATGGATGATGGTGATTCAT GGAACGATGTAATGACATTGGAAGATACTGAAGGCATGGAGTTTTCATATCCTGCAGTGATCCAGACCATGGATGATCTCATACATATCACGTACACATACAACCGGACACAAATTAAGCATGTTGTTCTTCAACCTAGCGGGAAAGTGAGGTGGTGAGTGTGCAACTATTGGGAGAGTTATTGCTGCCA ATTGCAAGGCACGCAAGTTTTTCTCTATGTGTGTCACATCATATTGGCTGGA                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BI805754             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atAGTGAGGTGGTGAGTGTGCAACTATTGGGAGAGTTATTGCTGCCACATTGCAAGGCACGCAAG  TTTCTCTATGTGTATCACATCATATTGGCTGGACCGTGGTGCTAAATTGGTCATCACATGATTCTTTTTTTGGGTATATTTGGTCATTTGCATAATTTCTT C ATTGTAACCTAATTAATAATCTCCCTGATTCCTATC AC ATGATATTGAACATCTGTACATATGCCCC AAGTTTAACATAAGGTGTTCCGTAAAAAA                                                   ]
[+] EMBL C97009               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CTNTTGGGAGAGTTATTGCTGCCA ATTGCAAGGCACGCAAGTTTTTCTCTATGNGTGTCACATCATATTGGCTGGNCCGTGGTNCTAAATTGGTCATCA ANGATTCTTTTTTTGGGTATATTTGGTCATTTGCATAATTTCTTGCAATTGTANCCTAATTAATAATCTCCCTGATTCCTATCAACAATGATATTGAACATCTGTACATATNCCCCAAAGTTTAACATAAGTTGTTCCGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAANAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]


>consensus_11134#0 GTCGGCGTCGCCGCCGCCGGCGTCTTCTCCACCTCCTCCGCGCCGCGCTCGCAACCACCT TCCAGATTGGATGGGACTATAACTGAAACCTTCTGTATTAAGCTTCCGCGAGGGCTCACC TGCAGAACGTGATGGTCACCATTTACTGGTGCAGCAGGCAAAAAGTTGCATGGAGCGCTA CAGGCTGTACACTTTTGATTTCCCTGCTGTTCTTTTTCTCTGGTTCACCGCATAGGATCC TCTTGAACAAGAAACCTCTCAATTTCAAAACAGCACCATCTAGGTTATTGCGTGAGATTA GCATCAGTTCAAGTCGTGTTCAGAGGGTTAACAATTCATCCGCGGAGTTTGTTGCAAACC TGAATGACCGTAATGTAGAAATTGTACAACATATGGAAGACAACGATCATAACATCATCA ATGCAACTGCAAATGTGACTTCTGACTGGAGCATTGTCAAGGAGGAATTCACATTTCCAG CTGGAAGTGCCCCTTTCAATAGCTGCCATGCTTCTACTATTGTAGAGACTGAGAAGGATA GTTTTTTGGTGGCTTATTTCGGTGGATCCAAGGAAGGTGCTCCTGATGTGAAGATCTGGC TGCAGAGATACAGTGATGGCTGCTGGCATACTCCACAAGTGGCTGATGAACAGGATGAGG TACCTATGTGGAATCCTGTTCTGTTTCAGCTCCCTTCTCATGAGCTTCTTCTCTTCTACA AGATTGGCCAAGAAGTTCAGAAGTGGAGTGGTGCCATGAAAAGATCTCTAGATGGAGGAA AAACCTGGTCGGCAAGAGAACAGCTACCACCTGGCATCCTTGGTCCTATTAAGAATAAGC CTTTCTTGGTTGAAGATGGGCGCTTGCTATGTGGGTCATCTGTTGAAAGCTGGAACTCTT GGGGTGCATGGCTTGAGGTCACAAAAGATGCCGGACAAACATGGCGGAAGTATGGCCCTA TATATATTGAAGGCGAAACACTAGGGGTGATCCAGCCAGTTCCCTACATGACTGCCAATG GGACTATTCGAGTGTTGCTGCGATCTTTTGAGACAATTGGTCGTGTCTGCATGGCTGATT CTGCTGATGGGGGTGTAACATGGAGTTATGTGCACGAGACTGACCTTCCTAACCCAAACT CTGGGATTGATGGAGTTAAGATGAAGGATGGGAGAGTACTCCTTGCTTACAACACCTTCT CCAGAGGAACACTAAAAGTTGCAGTCTCCATGGATGATGGTGATTCATGGAACGATGTAA TGACATTGGAAGATACTGAAGGCATGGAGTTTTCATATCCTGCAGTGATCCAGACCATGG ATGATCTCATACATATCACGTACACATACAACCGGACACAAATTAAGCATGTTGTTCTTC AACCTAGCGGGAAAGTGAGGTGGTGAGTGTGCAACTATTGGGAGAGTTATTGCTGCCAAT TGCAAGGCACGCAAGTTTTTCTCTATGTGTGTCACATCATATTGGCTGGACCGTGGTGCT AAATTGGTCATCAATGATTCTTTTTTTGGGTATATTTGGTCATTTGCATAATTTCTTGCA ATTGTAACCTAATTAATAATCTCCCTGATTCCTATCAACAATGATATTGAACATCTGTAC ATATGCCCCAAAGTTTAACATAAGTTGTTCCGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA AAAAAANAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)