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Oryza sativa
cluster # 11165 cluster # 11165       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_11165#0 length = 1904 sequences # 8  

consensusID : consensus_11165#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1904
fasta sequence
                              [GATAACAAACGCACGGTTCTCATCTTCCATCGTCACTCACCGACACCATCCGTAGGTCTTCCAGGAGCTCCTTCCTGCCACGTCATCAATGGCGATGATGGGTGGCTGACAGTCAAACGCACCCCACGCCTCCTCCCCTTCCCCCCTCTCTCCCTCCATGGCTTCCCTCGCCTCCCCTCCTCTCCCCTGCCGCGCCGCCGCCACCGCCAGCCGCAGCGGGCGTCCTGCTCCGCGCCTCCTCGGCCCTCCGCCGCCGCCCGCTTCCCCTCTCCTCTCCTCCGCTTCGGCGCGCTTCCCGCGTGCCCCCTGCAACGCCGCACGCTGGAGCCGGCGCGACGCCGTGCGGGTTTGCTCTCAAGCTGGTGCAGCTGGACCAGCCCCATTATCGAAGACATTGTCAGACCTCAAGGATTCCTGCTGGAGATTTTTACGGCCACATACAATTCGAGGAACTGCCTTGGGATCCATATCATTAGTTGGCTAGAGCTTTGATAGAGAACCCCCAACTGATAAATTGGTGGTTGGGATTCAAAGTGTTCTATGGGCTCGTGGCGTTAATCTGTGGCAATGGTTACATCGCGTGGGATCAATCATATCTATGACATTAGAATCGATAAGGTATACATGCCATATTTACCAATTGCTGCCGGTGATCTCTCAGTTCATACAGCATGGCTATTGGTGATATTATTTGCGTTTGCCGGATTTTCAATTGTTGCGACCAACTTTGGACCTTTCATTACCTCTTTATCTCGCCTTGGTCTATTTCTTGGCACCATATACTCTGTTCCTCCATTCAGACTTAAGAGATATCCTGATGCTGCTTGTCTTATCATTGCAACGGTCCGTGGTTTTCTTCTCAACTTTGGTGTGTACTATGATACTAGAGCAGCACTGGGTCTTACATTCCAATGGAGCTCGCCTGTTGCTTTCATTACATGCTTCGTGACTTTATTTGCTTTGGTCATTGCTATAACCAAAGATCTCCCAGATGTTGAAGGGGATCGGAAGTATCAAATATCAACTTTGGCGACAAAGCTCGGTGTCAGAAACATTGCATTTCTTGGCTCTGGTTTATTGATAGCAAATTATGTTGCTGCTATTGCTGTAGCTTTTCTCATGCCTCAGGCTTTCAGGCGCACTGTAATGGTGCCTGTGCATGCTGCCCTTGCCGTTGGTATAATTTTCCAGACATGGGTTCTGGAGCAAGCAAAATATACTAAGGATGCTATTTCACAGTACTACCGGTTCATTTGGAATCTCTTCTATGCTGAATACATCTTCTTCCCGTTGATATAGAGACCAAGCAATCTGATATGGTCTGCATGTTGAGTGCGGCAAAAACTAGAAGCCCATATGAACAGTGGGAGTAAGGGAACGAACATGCCATCCATGGGAAGACTCTGATAACTCTCTCTCGCCCGGGCTGTAAAGGGTAAGCACTGTTGTGCATATATATGAAAGGAAGGTGATAAAGCAGGGATGCTAAATTGCTACTGGGATCCTTAAAGGCTTATAGTGGTCACCAGTGGAATGTGCCTTAATAATTTGGTTACCTAGCAGAGCAAGTTTTTGCAGGTTATTAGGTAATATCTTTGAGGGAATGAACTTAGATTTCATTGTTTTAAGGTCTGGTCACACAACGGGTAGTAGTTCTGGAGCGGCAAAAGACGACCTTGTTTTACACTACCAAGGGAGGTTAACTCTAGTTTTCATGTGACCACTTACCTTGAGAGTTGAGACCATGGAATCACTTGTCGACTCCTCGGCTTGTATATTTCTAGTGTCAGCATTTGCATTCTCCTCCACACTTGTACTTGAAGAGTTGAAGACAACTTTTTTGTTTGTGTATTTCTGGAGTGTCAGCATTTGCATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK072012             [GATAACAAACGCACGGTTCTCATCTTCCATCGTCACTCACCGACACCATCCGTAGGTCTTCCAGGAGCTCCTTCCTGCCACGTCATCAATGGCGATGATGGGTGGCTGACAGTCAAACGCACCCCACGCCTCCTCCCCTTCCCCCCTCTCTCCCTCCATGGCTTCCCTCGCCTCCCCTCCTCTCCCCTGCCGCGCCGCCGCCACCGCCAGCCGCAGCGGGCGTCCTGCTCCGCGCCTCCTCGGCCCTCCGCCGCCGCCCGCTTCCCCTCTCCTCTCCTCCGCTTCGGCGCGCTTCCCGCGTGCCCCCTGCAACGCCGCACGCTGGAGCCGGCGCGACGCCGTGCGGGTTTGCTCTCAAGCTGGTGCAGCTGGACCAGCCCCATTATCGAAGACATTGTCAGACCTCAAGGATTCCTGCTGGAGATTTTTACGGCCACATACAATTCGAGGAACTGCCTTGGGATCCATATCATTAGTTGGCTAGAGCTTTGATAGAGAACCCCCAACTGATAAATTGGTGGTTGGGATTCAAAGTGTTCTATGGGCTCGTGGCGTTAATCTGTGGCAATGGTTACATCGCGTGGGATCAATCATATCTATGACATTAGAATCGATAAGGTATACATGCCATATTTACCAATTGCTGCCGGTGATCTCTCAGTTCATACAGCATGGCTATTGGTGATATTATTTGCGTTTGCCGGATTTTCAATTGTTGCGACCAACTTTGGACCTTTCATTACCTCTTTATCTCGCCTTGGTCTATTTCTTGGCACCATATACTCTGTTCCTCCATTCAGACTTAAGAGATATCCTGATGCTGCTTGTCTTATCATTGCAACGGTCCGTGGTTTTCTTCTCAACTTTGGTGTGTACTATGATACTAGAGCAGCACTGGGTCTTACATTCCAATGGAGCTCGCCTGTTGCTTTCATTACATGCTTCGTGACTTTATTTGCTTTGGTCATTGCTATAACCAAAGATCTCCCAGATGTTGAAGGGGATCGGAAGTATCAAATATCAACTTTGGCGACAAAGCTCGGTGTCAGAAACATTGCATTTCTTGGCTCTGGTTTATTGATAGCAAATTATGTTGCTGCTATTGCTGTAGCTTTTCTCATGCCTCAGGCTTTCAGGCGCACTGTAATGGTGCCTGTGCATGCTGCCCTTGCCGTTGGTATAATTTTCCAGACATGGGTTCTGGAGCAAGCAAAATATACTAAGGATGCTATTTCACAGTACTACCGGTTCATTTGGAATCTCTTCTATGCTGAATACATCTTCTTCCCGTTGATATAGAGACCAAGCAATCTGATATGGTCTGCATGTTGAGTGCGGCAAAAACTAGAAGCCCATATGAACAGTGGGAGTAAGGGAACGAACATGCCATCCATGGGAAGACTCTGATAACTCTCTCTCGCCCGGGCTGTAAAGGGTAAGCACTGTTGTGCATATATATGAAAGGAAGGTGATAAAGCAGGGATGCTAAATTGCTACTGGGATCCTTAAAGGCTTATAGTGGTCACCAGTGGAATGTGCCTTAATAATTTGGTTACCTAGCAGAGCAAGTTTTTGCAGGTTATTAGGTAATATCTTTGAGGGAATGAACTTAGATTTCATTGTTTTAAGGTCTGGTCACACAACGGGTAGTAGTTCTGGAGCGGCAAAAGACGACCTTGTTTTACACTACCAAGGGAGGTTAACTCTAGTTTTCATGTGACCACTTACCTTGAGAGTTGAGACCATGGAATCACTTGTCGACTCCTCGGCTTGTATATTTCTAGTGTCAGCATTTGCATTCTCCTCCACACTTGTACTTGAAGAGTTGAAGACAACTTTT                                                                ]
[+] EMBL AK102382             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATGACATTAGAATCGATAAGGTAAACAAGCCATATTTACCAATTGCTGCCGGTGATCTCTCAGTTCAGACAGCATGGTTATTGGTGGTATTATTTGCAGCTGCGGGATTTTCAATTGTTGTGACAAACTTTGGACCTTTCATTACCTCTCTATATTGCCTTGGTCTATTTCTTGGCACCATATACTCTGTTCCTCCATTCAGACTTAAGAGATATCCTGTTGCTGCTTTTCTTATCATTGCAACGGTCCGTGGTTTTCTTCTCAACTTTGGTGTGTACTATGCTACTAGAGCAGCACTGGGTCTTACATTCCAATGGAGCTCGCCTGTTGCTTTCATTACATGCTTCGTGACTTTATTTGCTTTGGTCATTGCTATAACCAAAGATCTCCCAGATGTTGAAGGGGATCGGAAGTATCAAATATCAACTTTGGCGACAAAGCTCGGTGTCAGAAACATTGCATTTCTTGGCTCTGGTTTATTGATAGCAAATTATGTTGCTGCTATTGCTGTAGCTTTTCTCATGCCTCAGGCTTTCAGGCGCACTGTAATGGTGCCTGTGCATGCTGCCCTTGCCGTTGGTATAATTTTCCAGACATGGGTTCTGGAGCAAGCAAAATATACTAAGGATGCTATTTCACAGTACTACCGGTTCATTTGGAATCTCTTCTATGCTGAATACATCTTCTTCCCGTTGATATAGAGACCAGGCAATCTGATATGGTCTGCATGTTGAGTGCGGCAAAAACTAGAAGCCCATATGAACAGTGGGAGTAAGGGAACGAACATGCCATCCATGGGAAGACTCTGATAACTCTCTCTCGCCCGGGCTGTAAAGGGTAAGCACTGTTGTGCATATATATGAAAGGAAGGTGATAAAGCAGGGATGCTAAATTGCTACTGGGATCCTTAAAGGCTTATAGTGGTCACCAGTGGAATGTGCCTTAATAATTTGGTTACCTAGCAGAGCAAGTTTTTGCAGGTTATTAGGTAATATCTTTGAGGGAATGAACTTAGATTTCATTGTTTTAAGGTCTGGTCACACAACGGGTAGTAGTTCTGGAGCGGCAAAAGACGACCTTGTTTTACACTACCAAGGGAGGTTAACTCTAGTTTTCATGTGACCACTTACCTTGAGAGTTGAGACCATGGAATCACTTGTCGACTCCTCGGCTTGTATATTTCTAGTGTCAGCATTTGCATTCTCCTCCACACTTGTACTTGAAGAGTTGAAGACAACTTT                                                                 ]
[-] EMBL CB669678             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTGCATTTCTTGGCTCTGGTTTATTGATAGCAAATTATGTTGCTGCTATTGCTGTAGCTTTTCTCATGCCTCAGGCTTTCAGGCGCACTGTAATGGTGCCTGTGCATGCTGCCCTTGCCGTTGGTATAATTTTCCAGACATGGGTTCTGGAGCAAGCAAAATATACTAAGGATGCTATTTCACAGTACTACCGGTTCATTTGGAATCTCTTCTATGCTGAATACATCTTCTTCCCGTTGATATAGAGACCAAGCAATCTGATATGGTCTGCATGTTGAGTGCGGCAAAAACTAGAAGCCCATATGAACAGTGGGAGTAAGGGAACGAACATGCCATCCATGGGAAGACTCTGATAACTCTCTCTCGCCCGGGCTGTAAAGGGTAAGCACTGTTGTGCATATATATGAAAGGAAGGTGATAAAGCAGGGATGCTAAATTGCTACTGGGATCCTTAAAGGCTTATAGTGGTCACCAGTGGAATGTGCCTTAATAATTTGGTTACCTAGCAGAGCAAGTTTTTGCAGGTTATTAGGTAATATCTTTGAGGGAATGAACTTAGATTTCATTGTTTTAAGGTCTGGTCACACAACGGGTAGTAGTTCTGGAGCGGCAAAAGACGCCCTTGTTTTACACTACCAAGGGAGGTTAACTTTAGTTTTCATGTGACCACTTACCTTGAGAGTTGAGACCATGGAATCACTTGTCGACTCCTCGGCTTGTATATTTATAGTGTCAGCATTT                                                                                                             ]
[+] EMBL AK063129             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CATCTTCTTCCCGTTGATATAGAGACCAAGCAATCTGATATGGTCTGCATGTTGAGTGCGGCAAAAACTAGAAGCCCATATGAACAGTGGGAGTAAGGTAACGAACATGCCATCCATGGGAAGACTCTGATAACTCTCTCTCGCCCGGGCTGTAAAGGGTAAGCACTGTTGTGCATATATATGAAAGGAAGGTGATAAAGCAGGGATGCTAAATTGCTACTGGGATCCTTAAAGGCTTATAGTGGTCACCAGTGGAATGTGCCTTAATAATTTGGTTACCTAGCAGAGCAAGTTTTTGCAGGTTATTAGGTAATATCTTTGAGGGAATGAACTTAGATTTCATTGTTTTAAGGTCTGGTCACACAACGGGTAGTAGTTCTGGAGCGGCAAAAGACGACCTTGTTTTACACTACCAAGGGAGGTTAACTCTAGTTTTCATGTGACCACTTACCTTGAGAGTTGAGACCATGGAATCACTTGTCGACTCCTCGGCTTGTATATTTCTAGTGTCAGCATTTGCATTCTCCTCCACACTTGTACTTGAAGAGTTGAAGACAACTTTT                                                                ]
[+] EMBL OSC0061              [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GCAATCTGATATGGTCTGCATGTTGAGTGCGGCAAAAACTAGAAGCCCATATGAACAGTGGGAGTAAGGGAACGAACATGCCATCCATGGGAAGACTCTGATAACTCTCTCTCGCCCGGGCTGTAAAGGGTAAGCACTGTTGTGCATATATATGAAAGGAAGGTGATAAAGCAGGGATGCTAAATTGCTACTGGGATCCTTAAAGGCTTATAGTGGTCACCAGTGGAATGTGCCTTAATAATTTGGTTACCTAGCAGAGCAAGTTTTTGCAGGTTATTAGGTAATATCTTTGAGGGAATGAACTTAGATTTCATTGTTTTAAGGTCTGGTCACACAACGng                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CF303620             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GGAACGAACATGCCATCCATGGGAAGACTCTGATAACTCTCTCTCGCCCGGGCTGTAAAGGGTAAGCACTGTTGTGCATATATATGAAAGGAAGGTGATAAAGCAGGGATGCTAAATTGCTACTGGGATCCTTAAAGGCTTATAGTGGTCACCAGTGGAATGTGCCTTAATAATTTGGTTACCTAGCAGAGCAAGTTTTTGCAGGTTATTAGGTAATATCTTTGAGGGAATGAACTTAGATTTCATTGTTTTAAGGTCTGGTCACACAACGGGTAGTAGTTTTGGAGCGGCAAAAGACGACCTTGTTTTACACTACCAAGGGAGGTTAACTCTAGTTTTCATGTGACCACTTACCTTGAGAGTTGAGACCATGGAATCACTTGTCGACTCCTCGGCTTGTATATTTCTAGTGTCAGCATTTGCATTTTCCTCCACACTTGTACTTGAAGAGTTGAAGACAACTTTTTTGTTTGTGTATTTCTGGAGTGTCAGCATTTGCATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL BE228305             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cgagCTGGGATCCTCAAAGGCTTATANTGGTCATCAGTGGAATGTGCCTTAATAATTTGGTTACCTAGCAGANCAAGTTTTTGCAGGTTATTAGGTAATATCTTTGANGGAATGAACTTAGATTTCATTGTTTTAAGGTCTGGTCACACAACGGGTAGTANTGCTGGAGCGGCAAAAGACGACCTTGTTTTACACTACCAAGGGAGGTTAACTCTAGTTTTCATGTGACCACTTACCTTGAGAGTTGAGACCATGGAATCACTTGTCGACTCCTCGGCTTGTATATTTCTAGTGTCAGCATTTGCATTCTCCTCCACACTTGTACTTGAAGANTTGAANACAACTTTTTTGTTTGTGTATTTCTGGAGTGTCAGCA                                    ]
[+] EMBL AU096950             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTAATAATTTGGTTACCTAGCAGAGCAAGTTTTTGCAGGTTATTAGGTAATATCTTTGAGGGAATGAACTTAGATTTCATTGTTTTAAGGTCTGGTCACACAACGGGTAGTAGTTCTGNANCGGCAAAAGACGACCTTGTTTTACACTACCAAGGGAGGTTAACTCTAGTTTTCATGTGACCACTTACCTTGAGAGTTGAGACCATGGAATCACTTGTCGACTCCTCGGCTTGTATATTTCTAGTGTCAGCATTTGCATTCTCCTCCACACTTGTACTTGAAGAGTTGAAGACAACTTTTTTGTTTGTGTAaaaaaa                                               ]


>consensus_11165#0 GATAACAAACGCACGGTTCTCATCTTCCATCGTCACTCACCGACACCATCCGTAGGTCTT CCAGGAGCTCCTTCCTGCCACGTCATCAATGGCGATGATGGGTGGCTGACAGTCAAACGC ACCCCACGCCTCCTCCCCTTCCCCCCTCTCTCCCTCCATGGCTTCCCTCGCCTCCCCTCC TCTCCCCTGCCGCGCCGCCGCCACCGCCAGCCGCAGCGGGCGTCCTGCTCCGCGCCTCCT CGGCCCTCCGCCGCCGCCCGCTTCCCCTCTCCTCTCCTCCGCTTCGGCGCGCTTCCCGCG TGCCCCCTGCAACGCCGCACGCTGGAGCCGGCGCGACGCCGTGCGGGTTTGCTCTCAAGC TGGTGCAGCTGGACCAGCCCCATTATCGAAGACATTGTCAGACCTCAAGGATTCCTGCTG GAGATTTTTACGGCCACATACAATTCGAGGAACTGCCTTGGGATCCATATCATTAGTTGG CTAGAGCTTTGATAGAGAACCCCCAACTGATAAATTGGTGGTTGGGATTCAAAGTGTTCT ATGGGCTCGTGGCGTTAATCTGTGGCAATGGTTACATCGCGTGGGATCAATCATATCTAT GACATTAGAATCGATAAGGTATACATGCCATATTTACCAATTGCTGCCGGTGATCTCTCA GTTCATACAGCATGGCTATTGGTGATATTATTTGCGTTTGCCGGATTTTCAATTGTTGCG ACCAACTTTGGACCTTTCATTACCTCTTTATCTCGCCTTGGTCTATTTCTTGGCACCATA TACTCTGTTCCTCCATTCAGACTTAAGAGATATCCTGATGCTGCTTGTCTTATCATTGCA ACGGTCCGTGGTTTTCTTCTCAACTTTGGTGTGTACTATGATACTAGAGCAGCACTGGGT CTTACATTCCAATGGAGCTCGCCTGTTGCTTTCATTACATGCTTCGTGACTTTATTTGCT TTGGTCATTGCTATAACCAAAGATCTCCCAGATGTTGAAGGGGATCGGAAGTATCAAATA TCAACTTTGGCGACAAAGCTCGGTGTCAGAAACATTGCATTTCTTGGCTCTGGTTTATTG ATAGCAAATTATGTTGCTGCTATTGCTGTAGCTTTTCTCATGCCTCAGGCTTTCAGGCGC ACTGTAATGGTGCCTGTGCATGCTGCCCTTGCCGTTGGTATAATTTTCCAGACATGGGTT CTGGAGCAAGCAAAATATACTAAGGATGCTATTTCACAGTACTACCGGTTCATTTGGAAT CTCTTCTATGCTGAATACATCTTCTTCCCGTTGATATAGAGACCAAGCAATCTGATATGG TCTGCATGTTGAGTGCGGCAAAAACTAGAAGCCCATATGAACAGTGGGAGTAAGGGAACG AACATGCCATCCATGGGAAGACTCTGATAACTCTCTCTCGCCCGGGCTGTAAAGGGTAAG CACTGTTGTGCATATATATGAAAGGAAGGTGATAAAGCAGGGATGCTAAATTGCTACTGG GATCCTTAAAGGCTTATAGTGGTCACCAGTGGAATGTGCCTTAATAATTTGGTTACCTAG CAGAGCAAGTTTTTGCAGGTTATTAGGTAATATCTTTGAGGGAATGAACTTAGATTTCAT TGTTTTAAGGTCTGGTCACACAACGGGTAGTAGTTCTGGAGCGGCAAAAGACGACCTTGT TTTACACTACCAAGGGAGGTTAACTCTAGTTTTCATGTGACCACTTACCTTGAGAGTTGA GACCATGGAATCACTTGTCGACTCCTCGGCTTGTATATTTCTAGTGTCAGCATTTGCATT CTCCTCCACACTTGTACTTGAAGAGTTGAAGACAACTTTTTTGTTTGTGTATTTCTGGAG TGTCAGCATTTGCATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)