|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11195#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1578 fasta sequence
[ACCTCCCGCCTCCTCCCTTCCTCCGCCTCCGCGCCCTAGAACCTTCCAGAAGCGGCGGCCAAGGCGGCGTGGAAGCTCCAGGTGCGCGCCACCCCGCCCTCCGGAACCTTCTGGAAGCTCTCGGGGAGGGGGGAAGAGGTGGGTGGGTGGGAGGATGGGGACGTCGGATCTGGACCGGCAGATCGAGCAGCTGAAGCGGTGCGAGCCGCTGACGGAGGCGGAGGTCAAGGCGCTCTGCCTCAAGGCCATGGAGATCCTCGTCGAGGAGAGCAACGTCCAGCGCGTCGACGCCCCCGTCACGATATGTGGAGATATTCATGGACAATTCTATGACATGAAAGAACTATTCAAAGTTGGGGGTGACTGCCCAAAGACAAACTACTTGTTCCTTGGGGATTTTGTTGATCGAGGATTTTATTCTGTTGAAACATTTTTGCTTCTGTTGGCCTTAAAGGTTAGATACCCAGATCGTATAACTTTAATACGAGGAAACCATGAGAGCAGACAGATTACACAAGTCTATGGTTTCTATGATGAGTGTCTTCGTAAATACGGCTCAGTGAATGTCTGGAGATATTGCACAGATATATTCGACTATTTAAGTTTGTCTGCACTCATTGAGAACAAGATATTTAGTGTCCATGGAGGCCTTTCTCCTAATATTACAACTCTTGATCAGATAAGAGTAATAGATCGCAAGCAAGAAGTACCTCATGATGGGGCCATGTGTGACCTTCTTTGGTCTGATCCAGAGGATGCTGTAGATGGTTGGGGATTAAGTCCACGAGGTGCAGGATTCCTATTTGGTGGAAATGTTGTTTCTTCTTTTAACCACACAAACAACATAGACTATATTTGCCGTGCTCATCAACTAGTCATGGAAGGGTTTAAGTGGATGTTCAATAACAAGATTGTCACTGTATGGTCTGCTCCTAACTACTGCTACAGGTGTGGCAATGTTGCTGCAATCCTAGAGCTTGATGAGAATTTGAATAAGCAGTT-CCGTGTATTTG--AAGCTG--CCCCA-CAT-GAAT--CAAGAGGTGTTCCTG-CAAAGA-GGCCAGCGCCAGATTACTTTCTGTGAGGCCGCAGATTCAGCAGTGGGTACAGCGTATCCTGCAAACAAGCACCGGCGGATTAAGTCTTGCGAGCTCCCATTTTC-----TGAGATGAGCTGAGCTCATGC-TTTACAAGACTCTTAAGCCAGGAGTGCTTTCGAGATGTATAAATTGATTTTATGTCCCCAGTCCTATCATTTGTAAGCCAAGAGAGTGGCTCACATTTGAGCTTGAGAAAATGCCCCTGTGAAGGGAGTGGTGTAGATGAGGCCACTCCTTTGATTCCATGGGTGTGCGTTGGTCCATGAT-GTAAAATTTTGTTGCTAGCCCGTTTGCCCCCTAGGAAATCCTGTGCTGGAGAATGATATGCAAATGCTGTGCCTGAGTATTTATTGTTGTCAGAATGCAAATGCAGGAAGTTTTGTAGTTGGCATTTGTACAAACTGTCCGAAGAATGCATATCCATTCCTGCTAGGAAATGCCAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTGAGACTAGTTCTTCCCTCGTGC]
[+] EMBL AK073644 [ACCTCCCGCCTCCTCCCTTCCTCCGCCTCCGCGCCCTAGAACCTTCCAGAAGCGGCGGCCAAGGCGGCGTGGAAGCTCCAGGTGCGCGCCACCCCGCCCTCCGGAACCTTCTGGAAGCTCTCGGGGAGGGGGGAAGAGGTGGGTGGGTGGGAGGATGGGGACGTCGGATCTGGACCGGCAGATCGAGCAGCTGAAGCGGTGCGAGCCGCTGACGGAGGCGGAGGTCAAGGCGCTCTGCCTCAAGGCCATGGAGATCCTCGTCGAGGAGAGCAACGTCCAGCGCGTCGACGCCCCCGTCACGATATGTGGAGATATTCATGGACAATTCTATGACATGAAAGAACTATTCAAAGTTGGGGGTGACTGCCCAAAGACAAACTACTTGTTCCTTGGGGATTTTGTTGATCGAGGATTTTATTCTGTTGAAACATTTTTGCTTCTGTTGGCCTTAAAGGTTAGATACCCAGATCGTATAACTTTAATACGAGGAAACCATGAGAGCAGACAGATTACACAAGTCTATGGTTTCTATGATGAGTGTCTTCGTAAATACGGCTCAGTGAATGTCTGGAGATATTGCACAGATATATTCGACTATTTAAGTTTGTCTGCACTCATTGAGAACAAGATATTTAGTGTCCATGGAGGCCTTTCTCCTAATATTACAACTCTTGATCAGATAAGAGTAATAGATCGCAAGCAAGAAGTACCTCATGATGGGGCCATGTGTGACCTTCTTTGGTCTGATCCAGAGGATGCTGTAGATGGTTGGGGATTAAGTCCACGAGGTGCAGGATTCCTATTTGGTGGAAATGTTGTTTCTTCTTTTAACCACACAAACAACATAGACTATATTTGCCGTGCTCATCAACTAGTCATGGAAGGGTTTAAGTGGATGTTCAATAACAAGATTGTCACTGTATGGTCTGCTCCTAACTACTGCTACAGGTGTGGCAATGTTGCTGCAATCCTAGAGCTTGATGAGAATTTGAATAAGCAGTT CCGTGTATTTG AAGCTG CCCCA CAT GAAT CAAGAGGTGTTCCTG CAAAGA GGCCAGCGCCAGATTACTTTCTGTGAGGCCGCAGATTCAGCAGTGGGTACAGCGTATCCTGCAAACAAGCACCGGCGGATTAAGTCTTGCGAGCTCCCATTTTC TGAGATGAGCTGAGCTCATGC TTTACAAGACTCTTAAGCCAGGAGTGCTTTCGAGATGTATAAATTGATTTTATGTCCCCAGTCCTATCATTTGTAAGCCAAGAGAGTGGCTCACATTTGAGCTTGAGAAAATGCCCCTGTGAAGGGAGTGGTGTAGATGAGGCCACTCCTTTGATTCCATGGGTGTGCGTTGGTCCATGAT GTAAAATTTTGTTGCTAGCCCGTTTGCCCCCTAGGAAATCCTGTGCTGGAGAATGATATGCAAATGCTGTGCCTGAGTATTTATTGTTGTCAGAATGCAAATGCAG ]
[-] EMBL CA882854 [ GGGGCCATGTGTGACCTTCTTTGGTCTGATCCAGAGGATGCTGTAGATGGTTGGGGATTAAGTCCACGAGGTGCAGGATTCCTATTTGGTGGAAATGTTGTTTCTTCTTTTAACCACACAAACAACATAGACTATATTTGCCGTGCTCATCAACTAGTCATGGAAGGGTTTAAGTGGATGTTCAATAACAAGATTGTCACCGTATGGTCTGCTCCTAACTACTGCTACAGGTGTGGCAATGTTGCTGCAATCCTAGAGCTTGATGAGAATTTGAATAAGCAGTT CCGTGTATTTG AAGCTG CCCCA CAT GAAT CAAGAGGTGTTCCTG CAAAGA GGCCAGCGCCAGATTACTTTCTGTGAGGCCGCAGATTCA ]
[-] EMBL CA882888 [ GGGGCCATGTGTGACCTTCTTTGGTCTGATCCAGAGGATGCTGTAGATGGTTGGGGATTAAGTCCACGAGGTGCAGGATTCCTATTTGGTGGAAATGTTGTTTCTTCTTTTAACCACACAAACAACATAGACTATATTT CCGTGCTCATCAACTAGTCATGGAAGGGTTTAAGTGGATGTTCAATAACAAGATTGTCACCGTATGGTCTGCTCCTAACTACTGCTACAGGTGTGGCAATGTTGCTGCAATCCTAGAGCTTGATGAGAATTTGAATAAGCAGTT CCGTGTATTTG AAGCTG CCCCA CAT GAAT CAAGAGGTGTTCCTG CAAAGA GGCCAGCGCCAGATTACTTTCTGTGAGGCCGCAGATTCA ]
[-] EMBL CF326539 [ TGGATGTTCAATAACAAGATTGTCACTGTATGGTCTGCTCCTAACTACTGCTACAGGTGTGGCAATGTTGCTGCAATCCTAGAGCTTGATGAGAATTTGAATAAGCAGTT CCGTGTATTTG AAGCTG CCCCA CAT GAAT CAAGAGGTGTTCCTG CAAAGA GGCCAGCGCCAGATTACTTTCTGTGAGGCCGCAGATTCAGCAGTGGGTACAGCGTATCCTGCAAACAAGCACCGGCGGATTAAGTCTTGCGAGCTCCCATTTTC TGAGATGAGCTGAGCTCATGC TTTACAAGACTCTTAAGCCAGGAGTGCTTTCGAGATGTATAAATTGATTTTATGTCCCCAGTCCTATCATTTGTAAGCCAAGAGAGTGGCTCACATTTGAGCTTGAGAAAATGCCCCTGTGAAGGGAGTGGTGTAGATGAGGCCACTCCTTTGATTCCATGGGTGTGCGTTGGTCCATGAT GTAAAATTTTGTTGCTAGCCCGTTTGCCCCCTAGGAAATCCTGTGCTGGAGAATGATATGCAAATGCTGTGCCTGAGTATTTATTGTTGTCAGAATGCAAATGCAGGAAGTTTTGTAGTTGGCATTTGTACAAACTGTCCGAAGAATGCATATCCATTCCTGCTAGGAAATGCCAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTGAGACTAGTTCTTCCCTCGTGC]
[+] EMBL BQ906919 [ AATGTTGCTGCAATCCTAGAGCTTGATGAGAATTTGAATAAGCAGTT CCGTGTATTTG AAGCTG CCCCA CAT GAAT CAAGAGGTGTTCCTG CAAAGA GGCCAGCGCCAGATTACTTTCTGTGAGGCTGCAGATTCAGCAGTGGGTACAGCGTATCCTGCAAACAAGCACCGGCAGATTAAGTCTTGCGAGCTCCCATTTTCTGAGATGAGATGAGCTGAGCTCATGC TTTACAAGACTCTTAAGCCAGGAGTGCTTTCGAGATGTATAAATTGATTTTATGTCCCCAGTCCTATCATTTGTAAGCCAAGAGAGTGGCTCACATTTGAGCTTGAGAAAATGCCCCTGTGAAGGGAGTGGTGTAGATGAGGCCACTCCTTTGATTCCATGGGTGTGCGTTGGTCCATGAT GTAAAATTTTGTTTCTAGCCCGTTTGCCCCCTAGGAAATCCTGTGCTGGAGAATGATATGCAAATGGTGTGCCTGAGTATTTATTGTTGTCAGAATGCAAATGCAGGAAGTTTTGTAaaaaaaa ]
[+] EMBL AK063810 [ TAAGCAGTT CCGTGTATTTG AAGCTG CCCCA CAT GAAT CAAGAGGTGTTCCTG CAAAGA GGCCAGCGCCAGATTACTTTCTGTGAGGCCGCAGATTCAGCAGTGGGTACAGCGTATCCTGCAAACAAGCACCGGCGGATTAAGTCTTGCGAGCTCCCATTTTC TGAGATGAGCTGAGCTCATGC TTTACAAGACTCTTAAGCCAGGAGTGCTTTCGAGATGTATAAATTGATTTTATGTCCCCAGTCCTATCATTTGTAAGCCAAGAGAGTGGCTCACATTTGAGCTTGAGAAAATGCCCCTGTGAAGGGAGTGGTGTAGATGAGGCCACTCCTTTGATTCCATGGGTGTGCGTTGGTCCATGAT GTAAAATTTTGTTGCTAGCCCGTTTGCCCCCTAGGAAATCCTGTGCTGGAGAATGATATGCAAATGCTGTGCCTGAGTATTTATTGTTGTCAGAATGCAAATGCAGGAAGTTTTGTAGTTGGCATTTGTACAAACTGTCCGAAGAATGCATATCCATTCCTGCTAGGAAATGCCAGT ]
[+] EMBL BI813190 [ AGTTCCCGTGTATTTGGAAAGCTGCCCCCCACCATGGAATTCCAAGAGGTGTTCCTGCCAAAGAGGGCCAGCGCCAGA TACTTTCTGTGAGGCTCCAGATTCACCAGTGGGTACAGCGTATCCTGCAAACAAGCACCGGCAGATTAAGTCTTGCGAGCTCCCATTTTCTGAGATGAGATGAGCTGAGCTCATGC TTTACAAGACTCTTAAGCCAGGAGTGCTTTCGAGATGTATAAATTGATTTTATGTCCCCAGTCCTATCATTTGTAAGCCAAGAGAGTGGCTCACATTTGAGCTTGAGAAAATGCCCCTGTGAAGGGAGTGGTGTAGATGA GCCACTCCTTTGATTCCATGGGTGTGCGTTGGTCCATGATCCTAAAATTTTGTTTCTAGCCCGTTTGCCCCCTAGGAAATCCTGTGCTGGAGAATGATATGC AATGGTGTGCCTGAGTATTTATTGTTGTCAGAATGC AATGCAGGAAGTTTTGTAGTT GCATTTGTAC AACTGTCCGAAGAATGCATACCCATTCCTGCTAGGAAAaaaaaaaa ]
[+] EMBL CA305658 [ AACAAGCACCGGCAGATTAAGTCTTGCGAGCTCCCATTTTCTGAGATGAGATGAGCTGAGCTCATGCTTTTACAAGACTCTTAAGCCAGGAGTGCTTTCGAGATGTATAAATTGATTTTATGTCCCCAGTCCTATCATTTGTAAGCCAAGAGAGTGGCTCACATTTGAGCTTGAGAAAATGCCCCTGTGAAGGGAGTGGTGTAGATGAGGCCACTCCTTTGATTCCATGGGTGTGCGTTGGTCCATGAT GTAAAATTTTGTTTCTAGCCCGNTTGCCCCCTAGGAAATCCTGTGCTGGAGAATGATATGCAAATGGTGTGCCTGAGTATTTATTGTTGNCAGAATGCAAATG ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||