These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11195#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1578 fasta sequence [ACCTCCCGCCTCCTCCCTTCCTCCGCCTCCGCGCCCTAGAACCTTCCAGAAGCGGCGGCCAAGGCGGCGTGGAAGCTCCAGGTGCGCGCCACCCCGCCCTCCGGAACCTTCTGGAAGCTCTCGGGGAGGGGGGAAGAGGTGGGTGGGTGGGAGGATGGGGACGTCGGATCTGGACCGGCAGATCGAGCAGCTGAAGCGGTGCGAGCCGCTGACGGAGGCGGAGGTCAAGGCGCTCTGCCTCAAGGCCATGGAGATCCTCGTCGAGGAGAGCAACGTCCAGCGCGTCGACGCCCCCGTCACGATATGTGGAGATATTCATGGACAATTCTATGACATGAAAGAACTATTCAAAGTTGGGGGTGACTGCCCAAAGACAAACTACTTGTTCCTTGGGGATTTTGTTGATCGAGGATTTTATTCTGTTGAAACATTTTTGCTTCTGTTGGCCTTAAAGGTTAGATACCCAGATCGTATAACTTTAATACGAGGAAACCATGAGAGCAGACAGATTACACAAGTCTATGGTTTCTATGATGAGTGTCTTCGTAAATACGGCTCAGTGAATGTCTGGAGATATTGCACAGATATATTCGACTATTTAAGTTTGTCTGCACTCATTGAGAACAAGATATTTAGTGTCCATGGAGGCCTTTCTCCTAATATTACAACTCTTGATCAGATAAGAGTAATAGATCGCAAGCAAGAAGTACCTCATGATGGGGCCATGTGTGACCTTCTTTGGTCTGATCCAGAGGATGCTGTAGATGGTTGGGGATTAAGTCCACGAGGTGCAGGATTCCTATTTGGTGGAAATGTTGTTTCTTCTTTTAACCACACAAACAACATAGACTATATTTGCCGTGCTCATCAACTAGTCATGGAAGGGTTTAAGTGGATGTTCAATAACAAGATTGTCACTGTATGGTCTGCTCCTAACTACTGCTACAGGTGTGGCAATGTTGCTGCAATCCTAGAGCTTGATGAGAATTTGAATAAGCAGTT-CCGTGTATTTG--AAGCTG--CCCCA-CAT-GAAT--CAAGAGGTGTTCCTG-CAAAGA-GGCCAGCGCCAGATTACTTTCTGTGAGGCCGCAGATTCAGCAGTGGGTACAGCGTATCCTGCAAACAAGCACCGGCGGATTAAGTCTTGCGAGCTCCCATTTTC-----TGAGATGAGCTGAGCTCATGC-TTTACAAGACTCTTAAGCCAGGAGTGCTTTCGAGATGTATAAATTGATTTTATGTCCCCAGTCCTATCATTTGTAAGCCAAGAGAGTGGCTCACATTTGAGCTTGAGAAAATGCCCCTGTGAAGGGAGTGGTGTAGATGAGGCCACTCCTTTGATTCCATGGGTGTGCGTTGGTCCATGAT-GTAAAATTTTGTTGCTAGCCCGTTTGCCCCCTAGGAAATCCTGTGCTGGAGAATGATATGCAAATGCTGTGCCTGAGTATTTATTGTTGTCAGAATGCAAATGCAGGAAGTTTTGTAGTTGGCATTTGTACAAACTGTCCGAAGAATGCATATCCATTCCTGCTAGGAAATGCCAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTGAGACTAGTTCTTCCCTCGTGC] [+] EMBL AK073644 [ACCTCCCGCCTCCTCCCTTCCTCCGCCTCCGCGCCCTAGAACCTTCCAGAAGCGGCGGCCAAGGCGGCGTGGAAGCTCCAGGTGCGCGCCACCCCGCCCTCCGGAACCTTCTGGAAGCTCTCGGGGAGGGGGGAAGAGGTGGGTGGGTGGGAGGATGGGGACGTCGGATCTGGACCGGCAGATCGAGCAGCTGAAGCGGTGCGAGCCGCTGACGGAGGCGGAGGTCAAGGCGCTCTGCCTCAAGGCCATGGAGATCCTCGTCGAGGAGAGCAACGTCCAGCGCGTCGACGCCCCCGTCACGATATGTGGAGATATTCATGGACAATTCTATGACATGAAAGAACTATTCAAAGTTGGGGGTGACTGCCCAAAGACAAACTACTTGTTCCTTGGGGATTTTGTTGATCGAGGATTTTATTCTGTTGAAACATTTTTGCTTCTGTTGGCCTTAAAGGTTAGATACCCAGATCGTATAACTTTAATACGAGGAAACCATGAGAGCAGACAGATTACACAAGTCTATGGTTTCTATGATGAGTGTCTTCGTAAATACGGCTCAGTGAATGTCTGGAGATATTGCACAGATATATTCGACTATTTAAGTTTGTCTGCACTCATTGAGAACAAGATATTTAGTGTCCATGGAGGCCTTTCTCCTAATATTACAACTCTTGATCAGATAAGAGTAATAGATCGCAAGCAAGAAGTACCTCATGATGGGGCCATGTGTGACCTTCTTTGGTCTGATCCAGAGGATGCTGTAGATGGTTGGGGATTAAGTCCACGAGGTGCAGGATTCCTATTTGGTGGAAATGTTGTTTCTTCTTTTAACCACACAAACAACATAGACTATATTTGCCGTGCTCATCAACTAGTCATGGAAGGGTTTAAGTGGATGTTCAATAACAAGATTGTCACTGTATGGTCTGCTCCTAACTACTGCTACAGGTGTGGCAATGTTGCTGCAATCCTAGAGCTTGATGAGAATTTGAATAAGCAGTT CCGTGTATTTG AAGCTG CCCCA CAT GAAT CAAGAGGTGTTCCTG CAAAGA GGCCAGCGCCAGATTACTTTCTGTGAGGCCGCAGATTCAGCAGTGGGTACAGCGTATCCTGCAAACAAGCACCGGCGGATTAAGTCTTGCGAGCTCCCATTTTC TGAGATGAGCTGAGCTCATGC TTTACAAGACTCTTAAGCCAGGAGTGCTTTCGAGATGTATAAATTGATTTTATGTCCCCAGTCCTATCATTTGTAAGCCAAGAGAGTGGCTCACATTTGAGCTTGAGAAAATGCCCCTGTGAAGGGAGTGGTGTAGATGAGGCCACTCCTTTGATTCCATGGGTGTGCGTTGGTCCATGAT GTAAAATTTTGTTGCTAGCCCGTTTGCCCCCTAGGAAATCCTGTGCTGGAGAATGATATGCAAATGCTGTGCCTGAGTATTTATTGTTGTCAGAATGCAAATGCAG ] [-] EMBL CA882854 [ GGGGCCATGTGTGACCTTCTTTGGTCTGATCCAGAGGATGCTGTAGATGGTTGGGGATTAAGTCCACGAGGTGCAGGATTCCTATTTGGTGGAAATGTTGTTTCTTCTTTTAACCACACAAACAACATAGACTATATTTGCCGTGCTCATCAACTAGTCATGGAAGGGTTTAAGTGGATGTTCAATAACAAGATTGTCACCGTATGGTCTGCTCCTAACTACTGCTACAGGTGTGGCAATGTTGCTGCAATCCTAGAGCTTGATGAGAATTTGAATAAGCAGTT CCGTGTATTTG AAGCTG CCCCA CAT GAAT CAAGAGGTGTTCCTG CAAAGA GGCCAGCGCCAGATTACTTTCTGTGAGGCCGCAGATTCA ] [-] EMBL CA882888 [ GGGGCCATGTGTGACCTTCTTTGGTCTGATCCAGAGGATGCTGTAGATGGTTGGGGATTAAGTCCACGAGGTGCAGGATTCCTATTTGGTGGAAATGTTGTTTCTTCTTTTAACCACACAAACAACATAGACTATATTT CCGTGCTCATCAACTAGTCATGGAAGGGTTTAAGTGGATGTTCAATAACAAGATTGTCACCGTATGGTCTGCTCCTAACTACTGCTACAGGTGTGGCAATGTTGCTGCAATCCTAGAGCTTGATGAGAATTTGAATAAGCAGTT CCGTGTATTTG AAGCTG CCCCA CAT GAAT CAAGAGGTGTTCCTG CAAAGA GGCCAGCGCCAGATTACTTTCTGTGAGGCCGCAGATTCA ] [-] EMBL CF326539 [ TGGATGTTCAATAACAAGATTGTCACTGTATGGTCTGCTCCTAACTACTGCTACAGGTGTGGCAATGTTGCTGCAATCCTAGAGCTTGATGAGAATTTGAATAAGCAGTT CCGTGTATTTG AAGCTG CCCCA CAT GAAT CAAGAGGTGTTCCTG CAAAGA GGCCAGCGCCAGATTACTTTCTGTGAGGCCGCAGATTCAGCAGTGGGTACAGCGTATCCTGCAAACAAGCACCGGCGGATTAAGTCTTGCGAGCTCCCATTTTC TGAGATGAGCTGAGCTCATGC TTTACAAGACTCTTAAGCCAGGAGTGCTTTCGAGATGTATAAATTGATTTTATGTCCCCAGTCCTATCATTTGTAAGCCAAGAGAGTGGCTCACATTTGAGCTTGAGAAAATGCCCCTGTGAAGGGAGTGGTGTAGATGAGGCCACTCCTTTGATTCCATGGGTGTGCGTTGGTCCATGAT GTAAAATTTTGTTGCTAGCCCGTTTGCCCCCTAGGAAATCCTGTGCTGGAGAATGATATGCAAATGCTGTGCCTGAGTATTTATTGTTGTCAGAATGCAAATGCAGGAAGTTTTGTAGTTGGCATTTGTACAAACTGTCCGAAGAATGCATATCCATTCCTGCTAGGAAATGCCAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTGAGACTAGTTCTTCCCTCGTGC] [+] EMBL BQ906919 [ AATGTTGCTGCAATCCTAGAGCTTGATGAGAATTTGAATAAGCAGTT CCGTGTATTTG AAGCTG CCCCA CAT GAAT CAAGAGGTGTTCCTG CAAAGA GGCCAGCGCCAGATTACTTTCTGTGAGGCTGCAGATTCAGCAGTGGGTACAGCGTATCCTGCAAACAAGCACCGGCAGATTAAGTCTTGCGAGCTCCCATTTTCTGAGATGAGATGAGCTGAGCTCATGC TTTACAAGACTCTTAAGCCAGGAGTGCTTTCGAGATGTATAAATTGATTTTATGTCCCCAGTCCTATCATTTGTAAGCCAAGAGAGTGGCTCACATTTGAGCTTGAGAAAATGCCCCTGTGAAGGGAGTGGTGTAGATGAGGCCACTCCTTTGATTCCATGGGTGTGCGTTGGTCCATGAT GTAAAATTTTGTTTCTAGCCCGTTTGCCCCCTAGGAAATCCTGTGCTGGAGAATGATATGCAAATGGTGTGCCTGAGTATTTATTGTTGTCAGAATGCAAATGCAGGAAGTTTTGTAaaaaaaa ] [+] EMBL AK063810 [ TAAGCAGTT CCGTGTATTTG AAGCTG CCCCA CAT GAAT CAAGAGGTGTTCCTG CAAAGA GGCCAGCGCCAGATTACTTTCTGTGAGGCCGCAGATTCAGCAGTGGGTACAGCGTATCCTGCAAACAAGCACCGGCGGATTAAGTCTTGCGAGCTCCCATTTTC TGAGATGAGCTGAGCTCATGC TTTACAAGACTCTTAAGCCAGGAGTGCTTTCGAGATGTATAAATTGATTTTATGTCCCCAGTCCTATCATTTGTAAGCCAAGAGAGTGGCTCACATTTGAGCTTGAGAAAATGCCCCTGTGAAGGGAGTGGTGTAGATGAGGCCACTCCTTTGATTCCATGGGTGTGCGTTGGTCCATGAT GTAAAATTTTGTTGCTAGCCCGTTTGCCCCCTAGGAAATCCTGTGCTGGAGAATGATATGCAAATGCTGTGCCTGAGTATTTATTGTTGTCAGAATGCAAATGCAGGAAGTTTTGTAGTTGGCATTTGTACAAACTGTCCGAAGAATGCATATCCATTCCTGCTAGGAAATGCCAGT ] [+] EMBL BI813190 [ AGTTCCCGTGTATTTGGAAAGCTGCCCCCCACCATGGAATTCCAAGAGGTGTTCCTGCCAAAGAGGGCCAGCGCCAGA TACTTTCTGTGAGGCTCCAGATTCACCAGTGGGTACAGCGTATCCTGCAAACAAGCACCGGCAGATTAAGTCTTGCGAGCTCCCATTTTCTGAGATGAGATGAGCTGAGCTCATGC TTTACAAGACTCTTAAGCCAGGAGTGCTTTCGAGATGTATAAATTGATTTTATGTCCCCAGTCCTATCATTTGTAAGCCAAGAGAGTGGCTCACATTTGAGCTTGAGAAAATGCCCCTGTGAAGGGAGTGGTGTAGATGA GCCACTCCTTTGATTCCATGGGTGTGCGTTGGTCCATGATCCTAAAATTTTGTTTCTAGCCCGTTTGCCCCCTAGGAAATCCTGTGCTGGAGAATGATATGC AATGGTGTGCCTGAGTATTTATTGTTGTCAGAATGC AATGCAGGAAGTTTTGTAGTT GCATTTGTAC AACTGTCCGAAGAATGCATACCCATTCCTGCTAGGAAAaaaaaaaa ] [+] EMBL CA305658 [ AACAAGCACCGGCAGATTAAGTCTTGCGAGCTCCCATTTTCTGAGATGAGATGAGCTGAGCTCATGCTTTTACAAGACTCTTAAGCCAGGAGTGCTTTCGAGATGTATAAATTGATTTTATGTCCCCAGTCCTATCATTTGTAAGCCAAGAGAGTGGCTCACATTTGAGCTTGAGAAAATGCCCCTGTGAAGGGAGTGGTGTAGATGAGGCCACTCCTTTGATTCCATGGGTGTGCGTTGGTCCATGAT GTAAAATTTTGTTTCTAGCCCGNTTGCCCCCTAGGAAATCCTGTGCTGGAGAATGATATGCAAATGGTGTGCCTGAGTATTTATTGTTGNCAGAATGCAAATG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||