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Oryza sativa
cluster # 11195 cluster # 11195       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_11195#0 length = 1578 sequences # 8  

consensusID : consensus_11195#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1578
fasta sequence
                              [ACCTCCCGCCTCCTCCCTTCCTCCGCCTCCGCGCCCTAGAACCTTCCAGAAGCGGCGGCCAAGGCGGCGTGGAAGCTCCAGGTGCGCGCCACCCCGCCCTCCGGAACCTTCTGGAAGCTCTCGGGGAGGGGGGAAGAGGTGGGTGGGTGGGAGGATGGGGACGTCGGATCTGGACCGGCAGATCGAGCAGCTGAAGCGGTGCGAGCCGCTGACGGAGGCGGAGGTCAAGGCGCTCTGCCTCAAGGCCATGGAGATCCTCGTCGAGGAGAGCAACGTCCAGCGCGTCGACGCCCCCGTCACGATATGTGGAGATATTCATGGACAATTCTATGACATGAAAGAACTATTCAAAGTTGGGGGTGACTGCCCAAAGACAAACTACTTGTTCCTTGGGGATTTTGTTGATCGAGGATTTTATTCTGTTGAAACATTTTTGCTTCTGTTGGCCTTAAAGGTTAGATACCCAGATCGTATAACTTTAATACGAGGAAACCATGAGAGCAGACAGATTACACAAGTCTATGGTTTCTATGATGAGTGTCTTCGTAAATACGGCTCAGTGAATGTCTGGAGATATTGCACAGATATATTCGACTATTTAAGTTTGTCTGCACTCATTGAGAACAAGATATTTAGTGTCCATGGAGGCCTTTCTCCTAATATTACAACTCTTGATCAGATAAGAGTAATAGATCGCAAGCAAGAAGTACCTCATGATGGGGCCATGTGTGACCTTCTTTGGTCTGATCCAGAGGATGCTGTAGATGGTTGGGGATTAAGTCCACGAGGTGCAGGATTCCTATTTGGTGGAAATGTTGTTTCTTCTTTTAACCACACAAACAACATAGACTATATTTGCCGTGCTCATCAACTAGTCATGGAAGGGTTTAAGTGGATGTTCAATAACAAGATTGTCACTGTATGGTCTGCTCCTAACTACTGCTACAGGTGTGGCAATGTTGCTGCAATCCTAGAGCTTGATGAGAATTTGAATAAGCAGTT-CCGTGTATTTG--AAGCTG--CCCCA-CAT-GAAT--CAAGAGGTGTTCCTG-CAAAGA-GGCCAGCGCCAGATTACTTTCTGTGAGGCCGCAGATTCAGCAGTGGGTACAGCGTATCCTGCAAACAAGCACCGGCGGATTAAGTCTTGCGAGCTCCCATTTTC-----TGAGATGAGCTGAGCTCATGC-TTTACAAGACTCTTAAGCCAGGAGTGCTTTCGAGATGTATAAATTGATTTTATGTCCCCAGTCCTATCATTTGTAAGCCAAGAGAGTGGCTCACATTTGAGCTTGAGAAAATGCCCCTGTGAAGGGAGTGGTGTAGATGAGGCCACTCCTTTGATTCCATGGGTGTGCGTTGGTCCATGAT-GTAAAATTTTGTTGCTAGCCCGTTTGCCCCCTAGGAAATCCTGTGCTGGAGAATGATATGCAAATGCTGTGCCTGAGTATTTATTGTTGTCAGAATGCAAATGCAGGAAGTTTTGTAGTTGGCATTTGTACAAACTGTCCGAAGAATGCATATCCATTCCTGCTAGGAAATGCCAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTGAGACTAGTTCTTCCCTCGTGC]

[+] EMBL AK073644             [ACCTCCCGCCTCCTCCCTTCCTCCGCCTCCGCGCCCTAGAACCTTCCAGAAGCGGCGGCCAAGGCGGCGTGGAAGCTCCAGGTGCGCGCCACCCCGCCCTCCGGAACCTTCTGGAAGCTCTCGGGGAGGGGGGAAGAGGTGGGTGGGTGGGAGGATGGGGACGTCGGATCTGGACCGGCAGATCGAGCAGCTGAAGCGGTGCGAGCCGCTGACGGAGGCGGAGGTCAAGGCGCTCTGCCTCAAGGCCATGGAGATCCTCGTCGAGGAGAGCAACGTCCAGCGCGTCGACGCCCCCGTCACGATATGTGGAGATATTCATGGACAATTCTATGACATGAAAGAACTATTCAAAGTTGGGGGTGACTGCCCAAAGACAAACTACTTGTTCCTTGGGGATTTTGTTGATCGAGGATTTTATTCTGTTGAAACATTTTTGCTTCTGTTGGCCTTAAAGGTTAGATACCCAGATCGTATAACTTTAATACGAGGAAACCATGAGAGCAGACAGATTACACAAGTCTATGGTTTCTATGATGAGTGTCTTCGTAAATACGGCTCAGTGAATGTCTGGAGATATTGCACAGATATATTCGACTATTTAAGTTTGTCTGCACTCATTGAGAACAAGATATTTAGTGTCCATGGAGGCCTTTCTCCTAATATTACAACTCTTGATCAGATAAGAGTAATAGATCGCAAGCAAGAAGTACCTCATGATGGGGCCATGTGTGACCTTCTTTGGTCTGATCCAGAGGATGCTGTAGATGGTTGGGGATTAAGTCCACGAGGTGCAGGATTCCTATTTGGTGGAAATGTTGTTTCTTCTTTTAACCACACAAACAACATAGACTATATTTGCCGTGCTCATCAACTAGTCATGGAAGGGTTTAAGTGGATGTTCAATAACAAGATTGTCACTGTATGGTCTGCTCCTAACTACTGCTACAGGTGTGGCAATGTTGCTGCAATCCTAGAGCTTGATGAGAATTTGAATAAGCAGTT CCGTGTATTTG  AAGCTG  CCCCA CAT GAAT  CAAGAGGTGTTCCTG CAAAGA GGCCAGCGCCAGATTACTTTCTGTGAGGCCGCAGATTCAGCAGTGGGTACAGCGTATCCTGCAAACAAGCACCGGCGGATTAAGTCTTGCGAGCTCCCATTTTC     TGAGATGAGCTGAGCTCATGC TTTACAAGACTCTTAAGCCAGGAGTGCTTTCGAGATGTATAAATTGATTTTATGTCCCCAGTCCTATCATTTGTAAGCCAAGAGAGTGGCTCACATTTGAGCTTGAGAAAATGCCCCTGTGAAGGGAGTGGTGTAGATGAGGCCACTCCTTTGATTCCATGGGTGTGCGTTGGTCCATGAT GTAAAATTTTGTTGCTAGCCCGTTTGCCCCCTAGGAAATCCTGTGCTGGAGAATGATATGCAAATGCTGTGCCTGAGTATTTATTGTTGTCAGAATGCAAATGCAG                                                                                                                  ]
[-] EMBL CA882854             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GGGGCCATGTGTGACCTTCTTTGGTCTGATCCAGAGGATGCTGTAGATGGTTGGGGATTAAGTCCACGAGGTGCAGGATTCCTATTTGGTGGAAATGTTGTTTCTTCTTTTAACCACACAAACAACATAGACTATATTTGCCGTGCTCATCAACTAGTCATGGAAGGGTTTAAGTGGATGTTCAATAACAAGATTGTCACCGTATGGTCTGCTCCTAACTACTGCTACAGGTGTGGCAATGTTGCTGCAATCCTAGAGCTTGATGAGAATTTGAATAAGCAGTT CCGTGTATTTG  AAGCTG  CCCCA CAT GAAT  CAAGAGGTGTTCCTG CAAAGA GGCCAGCGCCAGATTACTTTCTGTGAGGCCGCAGATTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CA882888             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GGGGCCATGTGTGACCTTCTTTGGTCTGATCCAGAGGATGCTGTAGATGGTTGGGGATTAAGTCCACGAGGTGCAGGATTCCTATTTGGTGGAAATGTTGTTTCTTCTTTTAACCACACAAACAACATAGACTATATTT CCGTGCTCATCAACTAGTCATGGAAGGGTTTAAGTGGATGTTCAATAACAAGATTGTCACCGTATGGTCTGCTCCTAACTACTGCTACAGGTGTGGCAATGTTGCTGCAATCCTAGAGCTTGATGAGAATTTGAATAAGCAGTT CCGTGTATTTG  AAGCTG  CCCCA CAT GAAT  CAAGAGGTGTTCCTG CAAAGA GGCCAGCGCCAGATTACTTTCTGTGAGGCCGCAGATTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CF326539             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGGATGTTCAATAACAAGATTGTCACTGTATGGTCTGCTCCTAACTACTGCTACAGGTGTGGCAATGTTGCTGCAATCCTAGAGCTTGATGAGAATTTGAATAAGCAGTT CCGTGTATTTG  AAGCTG  CCCCA CAT GAAT  CAAGAGGTGTTCCTG CAAAGA GGCCAGCGCCAGATTACTTTCTGTGAGGCCGCAGATTCAGCAGTGGGTACAGCGTATCCTGCAAACAAGCACCGGCGGATTAAGTCTTGCGAGCTCCCATTTTC     TGAGATGAGCTGAGCTCATGC TTTACAAGACTCTTAAGCCAGGAGTGCTTTCGAGATGTATAAATTGATTTTATGTCCCCAGTCCTATCATTTGTAAGCCAAGAGAGTGGCTCACATTTGAGCTTGAGAAAATGCCCCTGTGAAGGGAGTGGTGTAGATGAGGCCACTCCTTTGATTCCATGGGTGTGCGTTGGTCCATGAT GTAAAATTTTGTTGCTAGCCCGTTTGCCCCCTAGGAAATCCTGTGCTGGAGAATGATATGCAAATGCTGTGCCTGAGTATTTATTGTTGTCAGAATGCAAATGCAGGAAGTTTTGTAGTTGGCATTTGTACAAACTGTCCGAAGAATGCATATCCATTCCTGCTAGGAAATGCCAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTGAGACTAGTTCTTCCCTCGTGC]
[+] EMBL BQ906919             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AATGTTGCTGCAATCCTAGAGCTTGATGAGAATTTGAATAAGCAGTT CCGTGTATTTG  AAGCTG  CCCCA CAT GAAT  CAAGAGGTGTTCCTG CAAAGA GGCCAGCGCCAGATTACTTTCTGTGAGGCTGCAGATTCAGCAGTGGGTACAGCGTATCCTGCAAACAAGCACCGGCAGATTAAGTCTTGCGAGCTCCCATTTTCTGAGATGAGATGAGCTGAGCTCATGC TTTACAAGACTCTTAAGCCAGGAGTGCTTTCGAGATGTATAAATTGATTTTATGTCCCCAGTCCTATCATTTGTAAGCCAAGAGAGTGGCTCACATTTGAGCTTGAGAAAATGCCCCTGTGAAGGGAGTGGTGTAGATGAGGCCACTCCTTTGATTCCATGGGTGTGCGTTGGTCCATGAT GTAAAATTTTGTTTCTAGCCCGTTTGCCCCCTAGGAAATCCTGTGCTGGAGAATGATATGCAAATGGTGTGCCTGAGTATTTATTGTTGTCAGAATGCAAATGCAGGAAGTTTTGTAaaaaaaa                                                                                                ]
[+] EMBL AK063810             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TAAGCAGTT CCGTGTATTTG  AAGCTG  CCCCA CAT GAAT  CAAGAGGTGTTCCTG CAAAGA GGCCAGCGCCAGATTACTTTCTGTGAGGCCGCAGATTCAGCAGTGGGTACAGCGTATCCTGCAAACAAGCACCGGCGGATTAAGTCTTGCGAGCTCCCATTTTC     TGAGATGAGCTGAGCTCATGC TTTACAAGACTCTTAAGCCAGGAGTGCTTTCGAGATGTATAAATTGATTTTATGTCCCCAGTCCTATCATTTGTAAGCCAAGAGAGTGGCTCACATTTGAGCTTGAGAAAATGCCCCTGTGAAGGGAGTGGTGTAGATGAGGCCACTCCTTTGATTCCATGGGTGTGCGTTGGTCCATGAT GTAAAATTTTGTTGCTAGCCCGTTTGCCCCCTAGGAAATCCTGTGCTGGAGAATGATATGCAAATGCTGTGCCTGAGTATTTATTGTTGTCAGAATGCAAATGCAGGAAGTTTTGTAGTTGGCATTTGTACAAACTGTCCGAAGAATGCATATCCATTCCTGCTAGGAAATGCCAGT                                           ]
[+] EMBL BI813190             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGTTCCCGTGTATTTGGAAAGCTGCCCCCCACCATGGAATTCCAAGAGGTGTTCCTGCCAAAGAGGGCCAGCGCCAGA TACTTTCTGTGAGGCTCCAGATTCACCAGTGGGTACAGCGTATCCTGCAAACAAGCACCGGCAGATTAAGTCTTGCGAGCTCCCATTTTCTGAGATGAGATGAGCTGAGCTCATGC TTTACAAGACTCTTAAGCCAGGAGTGCTTTCGAGATGTATAAATTGATTTTATGTCCCCAGTCCTATCATTTGTAAGCCAAGAGAGTGGCTCACATTTGAGCTTGAGAAAATGCCCCTGTGAAGGGAGTGGTGTAGATGA GCCACTCCTTTGATTCCATGGGTGTGCGTTGGTCCATGATCCTAAAATTTTGTTTCTAGCCCGTTTGCCCCCTAGGAAATCCTGTGCTGGAGAATGATATGC AATGGTGTGCCTGAGTATTTATTGTTGTCAGAATGC AATGCAGGAAGTTTTGTAGTT GCATTTGTAC AACTGTCCGAAGAATGCATACCCATTCCTGCTAGGAAAaaaaaaaa                                          ]
[+] EMBL CA305658             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AACAAGCACCGGCAGATTAAGTCTTGCGAGCTCCCATTTTCTGAGATGAGATGAGCTGAGCTCATGCTTTTACAAGACTCTTAAGCCAGGAGTGCTTTCGAGATGTATAAATTGATTTTATGTCCCCAGTCCTATCATTTGTAAGCCAAGAGAGTGGCTCACATTTGAGCTTGAGAAAATGCCCCTGTGAAGGGAGTGGTGTAGATGAGGCCACTCCTTTGATTCCATGGGTGTGCGTTGGTCCATGAT GTAAAATTTTGTTTCTAGCCCGNTTGCCCCCTAGGAAATCCTGTGCTGGAGAATGATATGCAAATGGTGTGCCTGAGTATTTATTGTTGNCAGAATGCAAATG                                                                                                                     ]


>consensus_11195#0 ACCTCCCGCCTCCTCCCTTCCTCCGCCTCCGCGCCCTAGAACCTTCCAGAAGCGGCGGCC AAGGCGGCGTGGAAGCTCCAGGTGCGCGCCACCCCGCCCTCCGGAACCTTCTGGAAGCTC TCGGGGAGGGGGGAAGAGGTGGGTGGGTGGGAGGATGGGGACGTCGGATCTGGACCGGCA GATCGAGCAGCTGAAGCGGTGCGAGCCGCTGACGGAGGCGGAGGTCAAGGCGCTCTGCCT CAAGGCCATGGAGATCCTCGTCGAGGAGAGCAACGTCCAGCGCGTCGACGCCCCCGTCAC GATATGTGGAGATATTCATGGACAATTCTATGACATGAAAGAACTATTCAAAGTTGGGGG TGACTGCCCAAAGACAAACTACTTGTTCCTTGGGGATTTTGTTGATCGAGGATTTTATTC TGTTGAAACATTTTTGCTTCTGTTGGCCTTAAAGGTTAGATACCCAGATCGTATAACTTT AATACGAGGAAACCATGAGAGCAGACAGATTACACAAGTCTATGGTTTCTATGATGAGTG TCTTCGTAAATACGGCTCAGTGAATGTCTGGAGATATTGCACAGATATATTCGACTATTT AAGTTTGTCTGCACTCATTGAGAACAAGATATTTAGTGTCCATGGAGGCCTTTCTCCTAA TATTACAACTCTTGATCAGATAAGAGTAATAGATCGCAAGCAAGAAGTACCTCATGATGG GGCCATGTGTGACCTTCTTTGGTCTGATCCAGAGGATGCTGTAGATGGTTGGGGATTAAG TCCACGAGGTGCAGGATTCCTATTTGGTGGAAATGTTGTTTCTTCTTTTAACCACACAAA CAACATAGACTATATTTGCCGTGCTCATCAACTAGTCATGGAAGGGTTTAAGTGGATGTT CAATAACAAGATTGTCACTGTATGGTCTGCTCCTAACTACTGCTACAGGTGTGGCAATGT TGCTGCAATCCTAGAGCTTGATGAGAATTTGAATAAGCAGTTCCGTGTATTTGAAGCTGC CCCACATGAATCAAGAGGTGTTCCTGCAAAGAGGCCAGCGCCAGATTACTTTCTGTGAGG CCGCAGATTCAGCAGTGGGTACAGCGTATCCTGCAAACAAGCACCGGCGGATTAAGTCTT GCGAGCTCCCATTTTCTGAGATGAGCTGAGCTCATGCTTTACAAGACTCTTAAGCCAGGA GTGCTTTCGAGATGTATAAATTGATTTTATGTCCCCAGTCCTATCATTTGTAAGCCAAGA GAGTGGCTCACATTTGAGCTTGAGAAAATGCCCCTGTGAAGGGAGTGGTGTAGATGAGGC CACTCCTTTGATTCCATGGGTGTGCGTTGGTCCATGATGTAAAATTTTGTTGCTAGCCCG TTTGCCCCCTAGGAAATCCTGTGCTGGAGAATGATATGCAAATGCTGTGCCTGAGTATTT ATTGTTGTCAGAATGCAAATGCAGGAAGTTTTGTAGTTGGCATTTGTACAAACTGTCCGA AGAATGCATATCCATTCCTGCTAGGAAATGCCAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTGAGA CTAGTTCTTCCCTCGTGC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)