|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11256#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 2448 fasta sequence
[ATGATCCGTTGGGTACAAGGAAGAAGAGGATACTACTCTCCAAGTAGCGAAAATCCACAAATTCCCTCTCCGGCTCGCGCGCGCGCTCTCAATTTTTTGGGGGAAGAGAAGATCTCCCCTTGGAGGGAACCCCGCCCAAGAATGGCGGGTCTCGGCGGCGGATGGGGCGGCGGGTACGACGACGACGACGACTGGGGGCTGAGCGCGGAGCAGCTCGACCAGCTCGAGCGGGACGCCTACCGCAAGCTCGCCGAGCGCAAGGCCTCCTCCTCCGCCGCCTCCACCGCCACCTCGCCGCTCCCCTCCGCGGCCTACTCGCCGGTCAAGAACAGCCACCACCACCCGGCATCCAGGGTTTCCCAGGAGTCTTGCTTCGGCAAGGTAGAATCACTTTCTCCTTCTCGGCTTAGTCAACCAAATGCATCGGGAAATGCAGTTAATAATAGTCAGGGCAATATGTCTAAGGTATCAGTACATCTTTTCCTTCATTCTACTGGTGTGATCGCAGCGAAGTTCCAGTACCACCAGAAACTTGTGGATGCAGTTCACAAGATCCCCAAAGCCAGCTGGAACGGGAAGGAGAGGGTATGGATGTTCCCACACTCATCATTATCAGTAGCAGAGGAAGTTCTTAGTACAGTACCTGGAATAGCTGTTGAGGTCCAAAAACTGGATCCGCTGGTTAAGCGCGCACTAACTGCTTCTTTATATGCCGGAGATCTTCGAGATTTGTATGGCAAGATTCCAACTGATGTTGAGTCAAAGCTTATGCCGTTTCAGCGTGAAGGTGTCAGGTTTGCTTTACAGCATGGTGCCAGGACCCTGATAGCAGATGAAATGGGTCTTGGCAAGACATTACAGGCAATTGCTGTTGCTTCTTGCCTTCATGATGCCTGGCCAGTTCTTGTAATCTCTCCATCATCCTTGCGATTACATTGGGCTTCTATGATTCAGCATTGGCTTAACATCCCCACGGAAGATATCTTGGTGGTGCTACCACAAACTGGAGGATCAAATAAAGCAGGATACAGATTGGTATATTCAAATACTAAAGGGGATTTTAATCTGGATGGGGTGTTCAATGTGATATCTTATGATGTTGTTCCCAAGATAAAGGACATGCTTCTGGACTTGGATTTTAAGATTGTTATAGCTGATGAATCACACTTTCTGAAGAATGCCCAAGCAAAGAGAACAATGCATTCACTTCCTGTTCTGCAGAAAGCTAAATATGTGGTTTTGCTAAGTGGCACCCCTGCGTTATCTCGCCCTATCGAGCTGTTTACTCAGCTCCAGGCATTGTATCCAACTGTATACAAGAATGTTAATGAGTATGGTAATAGATATTGCAAAGGTGGCTTTTTTGGGCTTTATCAAGGTGCTAGCAATCATGAGGAGCTTCATAATTTGATGAAAGCAACTGTCATGATCCGCAGGTTGAAGAAAGATGTCCTTTCACAGTTGCCTGTTAAACGCAGACAACAGGCCTTTCTGGATTTAAGTGAGAAAGAGATGAGACATATTCGTGCTCTATTTCATGAGTTGGAGACTGTGAAGATCAAAATCCAGTCCTGTGACTCCCAGGAGACGATGGACTCTCTCAAATTTGCTCAAAAGAATCTTATTAACAAGATCTACAATGATTCAGCTGAAGCCAAAATTCCAGCAGTGCTAGATTACCTGGGTACTATAATTGAGGCCGAGTGCAAATTTTTAATATTTGCACATCATCAATCCATGCTTGAAGCTATTCACCAACATCTCTTGAAAAAGAAAGTTAAGTGCATAAGAATTGATGGTCAAACACCTGTACCTGTAAGACAGACTCTAGTCACAGATTTCCAGAATAAGGATGACATCAAGGCAGCAGTGTTATCCATAAAAGCTGGAGGTGTTGGGTTAACTTTGACAGCAGCAAGTACAGTAATCTTTGCTGAGTTATCATGGACTCCAGGTGACCTTATTCAAGCCGAAGACCGTGCCCATCGTATTGGTCAGGTTTCTTCGGTGAACATATATTACCTTCTTGCAAATGACACTGTGGATGACATTATATGGGACGTTGTTCAAGGCAAACTTGAGAATTTGGGACAGATGCTGGATGGGCAGGAGAAAACGCTGGATGTGTCCCAGAGCGACACTAGGCCCAGCCCTTCCAAGCAGAAGACGCTCGACGCCTACCTCAAGCGATGCAGCAATTCCACAGAAGCTGATCAGCCCAAGCTCAAGAACCCTAGGTTCTGACATTTCTCAGGGTTTTTAGCTCTACTATGTTTTTGTTTGGCAATTGGCATGACCCTCTTGCCTTAAACGAAGGAATGCTGCAGTGTCAGGTAGCTGTGTGTTGGTGTTATGATCACAGCCATGCTGTATTTTGTATTACCCAGCTAAATGCCCGTGCGTTGCAATGAAAATTAAGAATAACTTTGATCCCAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL AK069020 [ATGATCCGTTGGGTACAAGGAAGAAGAGGATACTACTCTCCAAGTAGCGAAAATCCACAAATTCCCTCTCCGGCTCGCGCGCGCGCTCTCAATTTTTTGGGGGAAGAGAAGATCTCCCCTTGGAGGGAACCCCGCCCAAGAATGGCGGGTCTCGGCGGCGGATGGGGCGGCGGGTACGACGACGACGACGACTGGGGGCTGAGCGCGGAGCAGCTCGACCAGCTCGAGCGGGACGCCTACCGCAAGCTCGCCGAGCGCAAGGCCTCCTCCTCCGCCGCCTCCACCGCCACCTCGCCGCTCCCCTCCGCGGCCTACTCGCCGGTCAAGAACAGCCACCACCACCCGGCATCCAGGGTTTCCCAGGAGTCTTGCTTCGGCAAGGTAGAATCACTTTCTCCTTCTCGGCTTAGTCAACCAAATGCATCGGGAAATGCAGTTAATAATAGTCAGGGCAATATGTCTAAGGTATCAGTACATCTTTTCCTTCATTCTACTGGTGTGATCGCAGCGAAGTTCCAGTACCACCAGAAACTTGTGGATGCAGTTCACAAGATCCCCAAAGCCAGCTGGAACGGGAAGGAGAGGGTATGGATGTTCCCACACTCATCATTATCAGTAGCAGAGGAAGTTCTTAGTACAGTACCTGGAATAGCTGTTGAGGTCCAAAAACTGGATCCGCTGGTTAAGCGCGCACTAACTGCTTCTTTATATGCCGGAGATCTTCGAGATTTGTATGGCAAGATTCCAACTGATGTTGAGTCAAAGCTTATGCCGTTTCAGCGTGAAGGTGTCAGGTTTGCTTTACAGCATGGTGCCAGGACCCTGATAGCAGATGAAATGGGTCTTGGCAAGACATTACAGGCAATTGCTGTTGCTTCTTGCCTTCATGATGCCTGGCCAGTTCTTGTAATCTCTCCATCATCCTTGCGATTACATTGGGCTTCTATGATTCAGCATTGGCTTAACATCCCCACGGAAGATATCTTGGTGGTGCTACCACAAACTGGAGGATCAAATAAAGCAGGATACAGATTGGTATATTCAAATACTAAAGGGGATTTTAATCTGGATGGGGTGTTCAATGTGATATCTTATGATGTTGTTCCCAAGATAAAGGACATGCTTCTGGACTTGGATTTTAAGATTGTTATAGCTGATGAATCACACTTTCTGAAGAATGCCCAAGCAAAGAGAACAATGCATTCACTTCCTGTTCTGCAGAAAGCTAAATATGTGGTTTTGCTAAGTGGCACCCCTGCGTTATCTCGCCCTATCGAGCTGTTTACTCAGCTCCAGGCATTGTATCCAACTGTATACAAGAATGTTAATGAGTATGGTAATAGATATTGCAAAGGTGGCTTTTTTGGGCTTTATCAAGGTGCTAGCAATCATGAGGAGCTTCATAATTTGATGAAAGCAACTGTCATGATCCGCAGGTTGAAGAAAGATGTCCTTTCACAGTTGCCTGTTAAACGCAGACAACAGGCCTTTCTGGATTTAAGTGAGAAAGAGATGAGACATATTCGTGCTCTATTTCATGAGTTGGAGACTGTGAAGATCAAAATCCAGTCCTGTGACTCCCAGGAGACGATGGACTCTCTCAAATTTGCTCAGAAGAATCTTATTAACAAGATCTACAATGATTCAGCTGAAGCCAAAATTCCAGCAGTGCTAGATTACCTGGGTACTATAATTGAGGCCGAGTGCAAATTTTTAATATTTGCACATCATCAATCCATGCTTGAAGCTATTCACCAACATCTCTTGAAAAAGAAAGTTAAGTGCATAAGAATTGATGGTCAAACACCTGTACCTGTAAGACAGACTCTAGTCACAGATTTCCAGAATAAGGATGACATCAAGGCAGCAGTGTTATCCATAAAAGCTGGAGGTGTTGGGTTAACTTTGACAGCAGCAAGTACAGTAATCTTTGCTGAGTTATCATGGACTCCAGGTGACCTTATTCAAGCCGAAGACCGTGCCCATCGTATTGGTCAGGTTTCTTCGGTGAACATATATTACCTTCTTGCAAATGACACTGTGGATGACATTATATGGGACGTTGTTCAAGGCAAACTTGAGAATTTGGGACAGATGCTGGATGGGCAGGAGAAAACGCTGGATGTGTCCCAGAGCGACACTAGGCCCAGCCCTTCCAAGCAGAAGACGCTCGACGCCTACCTCAAGCGATGCAGCAATTCCACAGAAGCTGATCAGCCCAAGCTCAAGAACCCTAGGTTCTGACATTTCTCAGGGTTTTTAGCTCTACTATGTTTTTGTTTGGCAATTGGCATGACCCTCTTGCCTTAAACGAAGGAATGCTGCAGTGTCAGGTAGCTGTGTGTTGGTGTTATGATCACAGCCATGCTGTATTTTGTATTACCCAGCTAAATGCCCGTGCGTTGCAATGAAAATTAAGAAT ]
[+] EMBL CB644293 [ ACAGTACCTGGAATAGCTGTTGAGGTCCAAAAACTGGATCCGCTGGTTAAGCGCGCACTAACTGCTTCTTTATATGCCGGAGATCTTCGAGATTTGTATGGCAAGATTCCAACTGATGTTGAGTCAAAGCTTATGCCGTTTCAGCGTGAAGGTGTCAGGTTTGCTTTACAGCATGGTGCCAGGACCCTGATAGCAGATGAAATGGGTCTTGGCAAGACATTACAGGCAATTGCTGTTGCTTCTTGCCTTCATGATGCCTGGCCAGTTCTTGTAATCTCTCCATCATCCTTGCGATTACATTGGGCTTCTATGATTCAGCATTGGCTTAACATCCCCACGGAAGATATCTTGGTGGTGCTACCACAAACTGGAGGATCAAATAAAGCAGGATACAGATTGGTATATTCAAATACTAAAGGGGATTTTAATCTGGATGGGGTGTTCAATGTGATATCTTATGATGTTGTTCCCAAGATAAAGGACATGCTTCTGGACTTGGATTTTAAGATTGTTATAGCTGATGAATCACACTTTCTGAAGAATGCCCAAGCAAAGAGAACAATGCATTCACTTCCTGTTCTGCAGAAAGCTAAATATGTGGTTTTGCTAAGTGGCACCCCTGCGTTATCTCGCCCTATCGAGCTGTTTACTCAGCTCCAGGCATTGTATCCAACTGTATACAAGAATGTTAATGAGTATGGTAATAGATATTGCAAAGGTGGCTTTTTTGGGCTTTATCAAGGTGCTAGCAATCATGAGGAGCTTCATAATTTGATGAAAGCAACTGTC ]
[+] EMBL AK066811 [ GGCAATTGCTGTTGCTTCTTGCCTTCATGATGCCTGGCCAGTTCTTGTAATCTCTCCATCATCCTTGCGATTACATTGGGCTTCTATGATTCAGCATTGGCTTAACATCCCCACGGAAGATATCTTGGTGGTGCTACCACAAACTGGAGGATCAAATAAAGCAGGATACAGATTGGTATATTCAAATACTAAAGGGGATTTTAATCTGGATGGGGTGTTCAATGTGATATCTTATGATGTTGTTCCCAAGATAAAGGACATGCTTCTGGACTTGGATTTTAAGATTGTTATAGCTGATGAATCACACTTTCTGAAGAATGCCCAAGCAAAGAGAACAATGCATTCACTTCCTGTTCTGCAGAAAGCTAAATATGTGGTTTTGCTAAGTGGCACCCCTGCGTTATCTCGCCCTATCGAGCTGTTTACTCAGCTCCAGGCATTGTATCCAACTGTATACAAGAATGTTAATGAGTATGGTAATAGATATTGCAAAGGTGGCTTTTTTGGGCTTTATCAAGGTGCTAGCAATCATGAGGAGCTTCATAATTTGATGAAAGCAACTGTCATGATCCGCAGGTTGAAGAAAGATGTCCTTTCACAGTTGCCTGTTAAACGCAGACAACAGGCCTTTCTGGATTTAAGTGAGAAAGAGATGAGACATATTCGTGCTCTATTTCATGAGTTGGAGACTGTGAAGATCAAAATCCAGTCCTGTGACTCCCAGGAGACGATGGACTCTCTCAAATTTGCTCAAAAGAATCTTATTAACAAGATCTACAATGATTCAGCTGAAGCCAAAATTCCAGCAGTGCTAGATTACCTGGGTACTATAATTGAGGCCGAGTGCAAATTTTTAATATTTGCACATCATCAATCCATGCTTGAAGCTATTCACCAACATCTCTTGAAAAAGAAAGTTAAGTGCATAAGAATTGATGGTCAAACACCTGTACCTGTAAGACAGACTCTAGTCACAGATTTCCAGAATAAGGATGACATCAAGGCAGCAGTGTTATCCATAAAAGCTGGAGGTGTTGGGTTAACTTTGACAGCAGCAAGTACAGTAATCTTTGCTGAGTTATCATGGACTCCAGGTGACCTTATTCAAGCCGAAGACCGTGCCCATCGTATTGGTCAGGTTTCTTCGGTGAACATATATTACCTTCTTGCAAATGACACTGTGGATGACATTATATGGGACGTTGTTCAAGGCAAACTTGAGAATTTGGGACAGATGCTGGATGGGCAGGAGAAAACGCTGGATGTGTCCCAGAGCGACACTAGGCCCAGCCCTTCCAAGCAGAAGACGCTCGACGCCTACCTCAAGCGATGCAGCAATTCCACAGAAGCTGATCAGCCCAAGCTCAAGAACCCTAGGTTCTGACATTTCTCAGGGTTTTTAGCTCTACTATGTTTTTGTTTGGCAATTGGCATGACCCTCTTGCCTTAAACGAAGGAATGCTGCAGTGTCAGGTAGCTGTGTGTTGGTGTTATGATCACAGCCATGCTGTATTTTGTATTACCCAGCTAAATGCCCGTGCGTTGCAATGAAAATTAAGAAT ]
[+] EMBL AK104850 [ TTTCTGAAGAATGCCCAAGCAAAGAGAACAATGCATTCACTTCCTGTTCTGCAGAAAGCTAAATATGTGGTTTTGCTAAGTGGCACCCCTGCGTTATCTCGCCCTATCGAGCTGTTTACTCAGCTCCAGGCATTGTATCCAACTGTATACAAGAATGTTAATGAGTATGGTAATAGATATTGCAAAGGTGGC TTTTTGGGCTTTATCAAGGTGCTAGCAATCATGAGGAGCTTCATAATTTGATGAAAGCAACTGTCATGATCCGCAGGTTGAAGAAAGATGTCCTTTCACAGTTGCCTGTTAAACGCAGACAACAGGCCTTTCTGGATTTAAGTGAGAAAGAGATGAGACATATTCGTGCTCTATTTCATGAGTTGGAGACTGTGAAGATCAAAATCCAGTCCTGTGACTCCCAGGAGACGATGGACTCTCTCAAATTTGCTCAAAAGAATCTTATTAACAAGATCTACAATGATTCAGCTGAAGCCAAAATTCCAGCAGTGCTAGATTACCTGGGTACTATAATTGAGGCCGAGTGCAAATTTTTAATATTTGCACATCATCAATCCATGCTTGAAGCTATTCACCAACATCTCTTGAAAAAGAAAGTTAAGTGCATAAGAATTGATGGTCAAACACCTGTACCTGTAAGACAGACTCTAGTCACAGATTTCCAGAATAAGGATGACATCAAGGCAGCAGTGTTATCCATAAAAGCTGGAGGTGTTGGGTTAACTTTGACAGCAGCAAGTACAGTAATCTTTGCTGAGTTATCATGGACTCCAGGTGACCTTATTCAAGCCGAAGACCGTGCCCATCGTATTGGTCAGGTTTCTTCGGTGAACATATATTACCTTCTTGCAAATGACACTGTGGATGACATTATATGGGACGTTGTTCAAGGCAAACTTGAGAATTTGGGACAGATGCTGGATGGGCAGGAGAAAACGCTGGATGTGTCCCAGAGCGACACTAGGCCCAGCCCTTCCAAGCAGAAGACGCTCGACGCCTACCTCAAGCGATGCAGCAATTCCACAGAAGCTGATCAGCCCAAGCTCAAGAACCCTAGGTTCTGACATTTCTCAGGGTTTTTAGCTCTACTATGTTTTTGTTTGGCAATTGGCATGACCCTCTTGCCTTAAACGAAGGAATGCTGCAGTGTCAGGTAGCTGTGTGTTGGTGTTATGATCACAGCCATGCTGTATTTTGTATTACCCAGCTAAATGCCCGTGCGTTGCAATGAAAATTAAGAAT ]
[-] EMBL CB644294 [ AGCTGAAGCCAAAATTCCAGCAGTGCTAGATTACCTGGGTACTATAATTGAGGCCGAGTGCAAATTTTTAATATTTGCACATCATCAATCCATGCTTGAAGCTATTCACCAACATCTCTTGAAAAAGAAAGTTAAGTGCATAAGAATTGATGGTCAAACACCTGTACCTGTAAGACAGACTCTAGTCACAGATTTCCAGAATAAGGATGACATCAAGGCAGCAGTGTTATCCATAAAAGCTGGAGGTGTTGGGTTAACTTTGACAGCAGCAAGTACAGTAATCTTTGCTGAGTTATCATGGACTCCAGGTGACCTTATTCAAGCCGAAGACCGTGCCCATCGTATTGGTCAGGTTTCTTCGGTGAACATATATTACCTTCTTGCAAATGACACTGTGGATGACATTATATGGGACGTTGTTCAAGGCAAACTTGAGAATTTGGGACAGATGCTGGATGGGCAGGAGAAAACGCTGGATGTGTCCCAGAGCGACACTAGGCCCAGCCCTTCCAAGCAGAAGACGCTCGACGCCTACCTCAAGCGATGCAGCAATTCCACAGAAGCTGATCAGCCCAAGCTCAAGAACCCTAGGTTCTGACATTTCTCAGGGTTTTTAGCTCTACTATGTTTTTGTTTGGCAATTGGCATGACCCTCTTGCCTTAAACGAAGGAATGCTGCAGTGTCAGGTAGCTGTGTGTTGGTGTTATGATCACAGCCATGCTGTATTTTGTATTACCCAGCTAAATGCCCGTGCGTTGCAATGAAAATTAAGAATA ]
[-] EMBL CB651835 [ GAAGCCAAAATTCCAGCAGTGCTAGATTACCTGGGTACTATAATTGAGGCCGAGTGCAAATTTTTAATATTTGCACATCATCAATCCATGCTTGAAGCTATTCACCAACATCTCTTGAAAAAGAAAGTTAAGTGCATAAGAATTGATGGTCAAACACCTGTACCTGTAAGACAGACTCTAGTCACAGATTTCCAGAATAAGGATGACATCAAGGCAGCAGTGTTATCCATAAAAGCTGGAGGTGTTGGGTTAACTTTGACAGCAGCAAGTACAGTAATCTTTGCTGAGTTATCATGGACTCCAGGTGACCTTATTCAAGCCGAAGACCGTGCCCATCGTATTGGTCAGGTTTCTTCGGTGAAC ATATTACCTTCTTGCAAATGACACTGTGGATGACATTATATGGGACGTTGTTCAAGGCAAACTTGAGAATTTGGGACAGATGCTGGATGGGCAGGAGAAAACGCTGGATGTGTCCCAGAGCGACACTAGGCCCAGCCCTTCCAAGCAGAAGACGCTCGACGCCTACCTCAAGCGATGCAGCAATTCCACAGAAGCTGATCAGCCCAAGCTCAAGAACCCTAGGTTCTGACATTTCTCAGGGTTTTTAGCTCTACTATGTTTTTGTTTGGCAATTGGCATGACCCTCTTGCCTTAAACGAAGGAATGCTGCAGTGTCAGGTAGCTGTGTGTTGGTGTTATGATCACAGCCATGCTGTATTTTGTATTACCCAGCTAAATGCCCGTGCGTTGCAATGAAAATTAAGAATAAC ]
[-] EMBL CA758977 [ TAAGTGCATAAGAATTGATGGTCAAACACCTGTACCTGTAAGACAGACTCTAGTCGCAGATTTCCAGAATAAGGATGACATCAAGGCAGCAGTGTTATCCATAAAAGCNGGAGGTGTTGGGTTAACTTTGACAGCAGCAAGTACAGTAATCTNTGCTGAGTTATCATGGACTCTAGGTGACCTTATTCAAGCCGAAGACCGTGCCCATCGTATTGGTCAGGTTTCTTCGGTGAACATATATTACCTTCTTGCAAATGACACTGTGGATGACATTATATGGGACGTTGTTCAAGGCAAACTTGAGAATTTGGGACAGATGCTGGATGGGCAGGAGAAAACGCTGGATGTGTCCCAGAGCGACACTAGGCCCGGCCCTTCCAAGCAGAAGACGCTCGACGCCTACCTCAAGCGATGCAGCAATTCCACAGAAGCTGATCAGCCCAAGCTCAAGAACCCTAGGTTCTGACATTTCTCAGGGTTTTTAGCTTTACTATGTTTTTGTTTGGCAATTGGCATGACCCTCTTGCCTTAAACGAAGGAATGCTGCAGTGTCAGGTAGCTGTGTGTTGGTGTTATGATCACAGCCATGCTGTATTTTGTATTACCCAGCTAAATGCCCGTGCGTTGCAATGAAAATTAAGAATAACTTTGATCCCAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL CB679946 [ CCATAACAGCTGGAGGTGTTGGGTTAACTTTGACAGCAGCAAGTACAGTAATCTTTGCTGAGTTATCATGGACTCCAGGTGACCTTATTCAAGCCGAAGACCGTGCCCATCGTATTGGTCAGGTTTCTTCGGTGAACATATATTACCTTCTTGCAAATGACACTGTGGATGACATTATATGGGACGTTGTTCAAGGCAAACTTGAGAATTTGGGACAGATGCTGGATGGGCAGGAGAAAACGCTGGATGTGTCCCAGAGCGACACTAGGCCCAGCCCTTCCAAGCAGAAGACGCTCGACGCCTACCTCAAGCGATGCAGCAATTCCACAGAAGCTGATCAGCCCAAGCTCAAGAACCCTAGGTTCTGACATTTCTCAGGGTTTTTAGCTCTACTATGTTTTTGTTTGGCAATTGGCATGACCCTCTTGCCTTAAACGAAGGAATGCTGCAGTGTCAGGTAGCTGTGTGTTGGTGTTATGATCACAGCCATGCTGTATTTTGTATTACCCAGCTAAATGCCCGTGCGTTGCAATGAAAATTAAGAATAACTT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||