These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11417#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1012 fasta sequence [GATATCCACACCCAGCAAGGAGGATGCTGAGTTAGCAATGGCCATCAATGCCTCCATCCTGTCAGCTATAGCCGAGGGAGTGCCCGATGTTCAGCCAATAACAACGACTACTGCGACCAATGATTGGGGAAACCCTCCAAGCAACTCCCTCAATGGATGGGGCCCACCAGATACTTCTGCGCCTTCAAAGACAAGTGGCCAAGTACCAGTTGTTACATCAAGCAGTAGCACATACAATGGGTGGGACGTGCCTGGAACAAGCTCTGGCCAAAGTTCGTCCAAACACAACAAAAGCCAGAACAGCACTTTCGTGGTTCCGCAGGAGGCGCTTCCATCTCTTCCAGTCCCAACTGCGCCTCCACTTGCCGTGGGAACCTTCTACGATGGTCCTATTCAGTATCCGTCAATAGATTCCACGCCAGTCGACGTAACCATGCCTTCTGCTGACGGTGGTACAGCGGTAAGCTCTGCAAAACCTGCAGAGAACGAAGGTGATGCAAAACCTGCAGAAAGTGATGCTAATGCAAGCAACAGCGGTAACACTCCACCGGGAACCTGTGTTATTTGTTTGGATGCTCCTGTGGAAGGTGCCTGCATTCCGTGTGGTCACATGGCTGGTTGCATGTCCTGCTTGAAGGATATAGAAT-CAAAGAAATGGGGATGCCCCATTTGTCGAGCCAAG-ATTAACCAGATTATCCGCCTCTATGCAGTTTGAGCAATTCCAACAATCAAATAGTAGACATGGGAATGAACAATGGGTGTTTGTTCTTCGTTACAAGTTCTGATGGAAAAAGAAAAGCTCCATCTGTAAAGTATGTCATGCTGTCAGCTGTGATTTTGATGTTCCAATTGTACTGAAAAAATTATACATTCTGTGTTATGTGCATTACGTGAAGCTATGAACGGTAGTACGATACATTACTATAGGGAACTTGTGTACATATATATCTATGAGAACTATACAGTATACATAAGATTAATTGTTGGCTAAATTCTGCGCAGCTGGTTGTGT] [+] EMBL AK059792 [GATATCCACACCCAGCAAGGAGGATGCTGAGTTAGCAATGGCCATCAATGCCTCCATCCTGTCAGCTATAGCCGAGGGAGTGCCCGATGTTCAGCCAATAACAACGACTACTGCGACCAATGATTGGGGAAACCCTCCAAGCAACTCCCTCAATGGATGGGGCCCACCAGATACTTCTGCGCCTTCAAAGACAAGTGGCCAAGTACCAGTTGTTACATCAAGCAGTAGCACATACAATGGGTGGGACGTGCCTGGAACAAGCTCTGGCCAAAGTTCGTCCAAACACAACAAAAGCCAGAACAGCACTTTCGTGGTTCCGCAGGAGGCGCTTCCATCTCTTCCAGTCCCAACTGCGCCTCCACTTGCCGTGGGAACCTTCTACGATGGTCCTATTCAGTATCCGTCAATAGATTCCACGCCAGTCGACGTAACCATGCCTTCTGCTGACGGTGGTACAGCGGTAAGCTCTGCAAAACCTGCAGAGAACGAAGGTGATGCAAAACCTGCAGAAAGTGATGCTAATGCAAGCAACAGCGGTAACACTCCACCGGGAACCTGTGTTATTTGTTTGGATGCTCCTGTGGAAGGTGCCTGCATTCCGTGTGGTCACATGGCTGGTTGCATGTCCTGCTTGAAGGATATAGAAT CAAAGAAATGGGGATGCCCCATTTGTCGAGCCAAG ATTAACCAGATTATCCGCCTCTATGCAGTTTGAGCAATTCCAACAATCAAATAGTAGACATGGGAATGAACAATGGGTGTTTGTTCTTCGTTACAAGTTCTGATGGAAAAAGAAAAGCTCCATCTGTAAAGTATGTCATGCTGTCAGCTGTGATTTTGATGTTCCAATTGTACTGAAAAAATTATACATTCTGTGTTATGTGCATTACGTGAAGCTATGAACGGTAGTACGATACATTACTATAGGGAACTTGTGTACATATATATCTATGAGAACTATACAGTATACATAAGATTA ] [-] EMBL CB666035 [ GGCCATCAATGCCTCCATCCTGTCAGCTATAGCCGAGGGAGTGCCCGATGTTCAGCCAATAACAACGACTACTGCGACCAATGATTGGGGAAACCCTCCAAGCAACTCCCTCAATGGATGGGGCCCACCAGATACTTCTGCGCCTTCAAAGACAAGTGGCCAAGTACCAGTTGTTACATCAAGCAGTAGCACATACAATGGGTGGGACGTGCCTGGAACAAGCTCTGGCCAAAGTTCGTCCAAACACAACAAAAGCCAGAACAGCACTTTCGTGGTTCCGCAGGAGGCGCTTCCATCTCTTCCAGTCCCAACTGCGCCTCCACTTGCCGTGGGAACCTTCTACGATGGTCCTATTCAGTATCCGTCAATAGATTCCACGCCAGTCGACGTAACCATGCCTTCTGCTGACGGTGGTACAGCGGTAAGCTCTGCAAAACCTGCAGAGAACGAAGGTGATGCAAAACCTGCAGAAAGTGATGCTAATGCAAGCAACAGCGGTAACACTCCACCGGGAACCTGTGTTATTTGTTTGGATGCTCCTGTGGAAGGTGCCTGCATTCCGTGTGGTCACATGGCTGGTTGCATGTCCTGCTTGAAGGATATAGAAT CAAAGAAATGGGGATGCCCCATTTGTCGAGCCAAG ATTAACCAGATTATCCGCCTCTATGCAGTTTGAGCAATTCCAACAATCAAATAGTAGACATGGGAATGAACAATGGGTGTTTGTTCTTCGTTACAAGTTCTGATGGAAAAAGAAAAGCTCCATCTGTAAAGTATGTCATGCTGTCAGCTGTGATTTTGATGTTCCAATTGTACTGAAAAAAT ] [-] EMBL CB628645 [ CAAGTACCAGTTGTTACATCAAGCAGTAGCACATACAATGGGTGGGACGTGCCTGGAACAAGCTCTGGCCAAAGTTCGTCCAAACACAACAAAAGCCAGAACAGCACTTTCGTGGTTCCGCAGGAGGCGCTTCCATCTCTTCCAGTCCCAACTGCGCCTCCACTTGCCGTGGGAACCTTCTACGATGGTCCTATTCAGTATCCGTCAATAGATTCCACGCCAGTCGACGTAACCATGCCTTCTGCTGATGGTGGTACAGCGGTAAGCTCTGCAAAACCTGCAGAGAACGAAGGTGATGCAAAACCTGCAGAAAGTGATGCTAATGCAAGCAACAGCGGTAACACTCCACCGGGAACCTGTGTTATTTGTTTGGATGCTCCTGTGGAAGGTGCCTGCATTCCGTGTGGTCACATGGCTGGTTGCATGTCCTGCTTGAAGGATATAGAAT CAAAGAAATGGGGATGCCCCATTTGTCGAGCCAAG ATTAACCAGATTATCCGCCTCTATGCAGTTTGAGCAATTCCAACAATCAAATAGTAGACATGGGAATGAACAATGGGTGTTTGTTCTTCGTTACAAGTTCTGATGGAAAAAGAAAAGCTCCATCTGTAAAGTATGTCATGCTGTCAGCTGTGATTTTGATGTTCCAATTGTACTGAAAAAATTATACATTCTGTGTTATGTGCATTACGTGAAGCTATGAACGGTAGTACGATACATTACTATAGGGAACTTGTGTACATATATATCTATGAGAACTATATAGTATACATAAGATTAA ] [-] EMBL CB630596 [ AAGTACCAGTTGTTACATCAAGCAGTAGCACATACAATGGGTGGGACGTGCCTGGAACAAGCTCTGGCCAAAGTTCGTCCAAACACAACAAAAGCCAGAACAGCACTTTCGTGGTTCCGCAGGAGGCGCTTCCATCTCTTCCAGTCCCAACTGCGCCTCCACTTGCCGTGGGAACCTTCTACGATGGTCCTATTCAGTATCCGTCAATAGATTCCACGCCAGTCGACGTAACCATGCCTTCTGCTGATGGTGGTACAGCGGTAAGCTCTGCAAAACCTGCAGAGAACGAAGGTGATGCAAAACCTGCAGAAAGTGATGCTAATGCAAGCAACAGCGGTAACACTCCACCGGGAACCTGTGTTATTTGTTTGGATGCTCCTGTGGAAGGTGCCTGCATTCCGTGTGGTCACATGGCTGGTTGCATGTCCTGCTTGAAGGATATAGAAT CAAAGAAATGGGGATGCCCCATTTGTCGAGCCAAG ATTAACCAGATTATCCGCCTCTATGCAGTTTGAGCAATTCCAACAATCAAATAGTAGACATGGGAATGAACAATGGGTGTTTGTTCTTCGTTACAAGTTCTGATGGAAAAAGAAAAGCTCCATCTGTAAAGTATGTCATGCTGTCAGCTGTGATTTTGATGTTCCAATTGTACTGAAAAAATTATACATTCTGTGTTATGTGCATTACGTGAAGCTATGAACGGTAGTACGATACATTACTATAGGGAACTTGTGTACATATATATCTATGAGAACTATATAGTATACATAAGATTAA ] [+] EMBL BP184572 [ AAAGCCAGAACAGCACTTTCGTGGTTCCGCAGGAGGCGCTTCCATCTCTTCCAGTCCCAACTGCGCCTCCACTTGCCGTGGGAACCTTCTACGATGGTCCTATTCAGTATCCGTCAATAGATTCCACGCCAGTCGACGTAACCATGCCTTCTGCTGACGGTGGTACAGCGGTAAGCTCTGCAAAACCTGCAGAGAACGAAGGTGATGCAAAACCTGCAGAAAGTGATGCTAATGCAAGCAACAGCGGTAACACTCCACCGGGAACCTGTGTTATTTGTTTGGATGCTCCTGTGGAAGGTGCCTGCATTCCGTGTGGTCACATGGCTGGTTGCATGTCCTGCTTGAAGGATATAGAAT CAAAGAAATGGGGATGCCCCATTTGTCGAGCCAAG ATTAACCAGATTATCCGCCTCTATGCAGTTTGAGCAATTCCAACAATCAAATAGTAGACATGGGAATGAACAATGGGTGTTTGTTCTTCGTTACAAGTTCTGATGGAAAAAGAAAAGCTCCATCTGTAAAGTATGTCATGCTGTCAGCTGTGATTTTGATGTTCCAATTGTACTGAAAAAATTATACATTCTGTGTTATGTGCATTACGTGAAGCTATGAACGGTAGTACGATACATTACTATAGGGAACTTGTGTACATATATATCTATGAGAACTATACAGTATACATA ] [-] EMBL CB637507 [ AGCTCTGCAAAACTTGCAGAGAACGAAGGTGATGCAAAACCTGCAGAAAGTGATGTTAATGCAAGCAACAGCGGTAACACTCCACCGGGAACCTGTGTTATTTGTTTGGATGCTCCTGTGGAAGGTGCCTGCATTCCGTGTGGTCACATGGCTGGTTGCATGTCCTGCTTGAAGGATATAGAAT CAAAGAAATGGGGATGCCCCATTTGTCGAGCCAAG ATTAACCAGATTATCCGCCTCTATGCAGTTTGAGCAATTCCACCAATCAAATAGTAGACATGGGAATGACCAATGGGTGTTTGTTCTTCGTTACAAGTTCTGATGGAAAAAGAAAAGCTCCATCTGTAAAGTATGTCATGCTGTCAGCTGTGATTTTGATGTTCCAATTGTACTGAAAAAATTATACATTCTGTGTTATGTGCATTACGTGAAGCTATGAACGGTAGTACGATACATTACTATAGGGAACTTGTGTACATATATATCTATGAGAACTATCCAGTATACATAAGATTAATTGTTGGCTAAATTCTGCGCAGCTGGTTGTGT] [+] EMBL CA764073 [ GGTGATGCAAAACCTGCAGAAAGTGATGCTAATGCAAGCAACAGCGGTAACACTCCACCGGGAACCTGTGTTATTTGTTTGGATGCTCCTGTGGAAGGTGCCTGCATTCCGTGTGGTCACATGGCTGGTTGCATGTCCTGCTTGAAGGATATAGAAT CAAAGAAATGGGGATGCCCCATTTGTCGAGCCAAG ATTAACCAGATTATCCGCCTCTATGCAGTTTGAGCAATTCCAACAATCAAATAGTAGACATGGGAATGAACAATGGGTGTTTGTTCTTCGTTACAAGTTCTGATGGAAAAAGAAAAGCTCCATCTGTAAAGTATGTCATGCTGTCAGCTGTGATTTTGATGTTCCAATTGTACTGAAAAAATTATACATTCTGTGTTATGTGCATTACGTGAAGCTATGAACGGTAGTACGATACATTACTATAGGGAACTTGTGTACATATATATCTATGAGAACTATATAGTATACATAAGATTAATTGTTGGC ] [+] EMBL AU055804 [ GGCTGGTTGCATGTCCTGCTTGAAGGATATAGAATCCAAAGAAATGGGGATGCCCCATTTNTCGAGCCAAG ATTAACCAGATTATCCGCCTCTATGCAGTTTGAGCAATTCCAACAATCAAATAGTAGACATGGGAATGAACAATGGGTGTTTGTTCTTCGTTACAAGTTCTGATGGAAAAAGAAAAGCTCCATCTGTAAAGTATGTCATGCTGTCAGCTGTGATTTTGATGTTCCAATTGTACTGAAAAAATTATACATTCTGTGTTATGTGCATTACGTGAAGCTATGAACGGTAGTACGATACATTACTATAGGGAACTTGTGTACATATATATCTATGAGAACTATACAGTATACATAAGATTAATTGTTGGCTAAAaaaaaaa ] [-] EMBL OS38171 [ TTTGTCGAGCCAAGAATTAACCAGATTATCCGCCTCTATGCAGTTTGAGCAATTCCAACAATCAAATAGTAGACAT GGAATGAACAATGGGTGTTTGTTCTTCGTTACAAGTTCTGATGGAAAAAGAAAAGCTCCATCTGTAAAGTATGTCATGCTGTCAGCTGTGATTTTGATGTTCCAATTGTACTGAAAAAATTATACATTCTGTGNTATGTGCATTACGTGAAGCTATGAASGGTAGTACGAT CATTACTATAGGGAACTTGTGTACATATATATCTATGAGAACTATATAGTATACATAAGATTAAT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||