cluster # 11421

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Oryza sativa
cluster # 11421 cluster # 11421 Sequences # 9 consensus # 1
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consensus_11421#0 length = 1350 sequences # 9
consensusID : consensus_11421#0
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Sequences nbr = 9
consensus length = 1350
fasta sequence
                              [GACACTGACATGGACTGAGGAGTAGAAAATCCATCCGCCGCGCCTCTCTCTCCTTCATCATCAATTCCGGTGAGGATAT-CGCCGGATCGACGCGCCGCCGGCGGGAGCCAG-CCGCAGAGTGGAGCTTGGAATAGGCAGCTTTCTACTGTGAATCAAAAG-CGTGATGAACAAAGATAAAGTTCATGA-CAAGGAGACTCACAGAACGAGCAACGATATAAGTCATAAAACATCTGTGGACAAGGTTAAGGCCCCCAATCTGTTTGAACGAGCCAAGGAAGAGGTTGAGGCTCTCGTTGGAGCTGTTCATGATAAGATGGAGCACAATTCCAGTCCCCATGGAAATAATGC-TGACCTGCATAAGGACTCAAAGGATGAAAGCAAGGTGTCAA-TGAACAAAATAGAGACCCACAAGAATGAAAC-TCATGGTACAAGCGATGATATAAATGAGAATACACCAGTTGAGAGAGTTAAAGGTCCAAATGTGTTTGAGCGTGCCAAGGAAGAGATTGAAGCTA-TTGTTGAAGCCTTCCACCCAAAGAAGGGATCTGACAAGTGAAGATTGAGATGTTCTGTTGCCTCTGTCTGCACTTGATGTGAAAACATTGACATGAGTTATTAATAGATCCAT-GGATGAGTTGTGAGATATCCATCGGCTGGTCTTATTATTGCCAAACTATGGAGTTGTAACTGTTGAATGGTTCATT-GTACCACTGATATATATATGAGCAGAGTGTGTATCATGTGTGACATGAAAGTATTACTGTTCTTCAGTGTTTGATTTTAGTGTATGTTGAACTTAGTCCTTTGCATGATATGGTATTTTACTTGCTACCATACATGCAAAAATCTTTTGAGGTGCATAAATAAAGAGAGAGTCAATTGCTGTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTTTTTTCCCCCCAACAAAAATTATTTTTAAAAAAAAGGGGAAAATTCCGGCCCCAAAAAAAAAACCCCCCTAAAAGGGGGGTAAAAAAAAATTCCGGGCCCCGTTTTAAAAAACGGGGAAAGGGAAAAAACCGGGGGTTACCCAAAAAAAAACCCTTGGAAAAAAACCCCCTTTTCCCAAGGGGGGAAAAAAAAAAAAAGCCCCCCCCAAACCCCCTTTCCAAAAAGTGGCCCCCCTAAAACACCCGGGTTTAAAGGGTTCCCCCCAAAAAAAAAAAAACCCCTTTCCCCCTTTGGGGGAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCCCGGGAAAAAGGG]

[+] EMBL CF320675             [GACACTGACATGGACTGAGGAGTAGAAAATCCATCCGCCGCGCCTCTCTCTCCTTCATCATCAATTCCGGTGAGGATAT CGCCGGATCGACGCGCCGCCGGCGGGAGCCAG CCGCAGAGTGGAGCTTGGAATAGGCAGCTTTCTACTGTGAATCAAAAG CGTGATGAACAAAGATAAAGTTCATGA CAAGGAGACTCACAGAACGAGCAACGATATAAGTCATAAAACATCTGTGGACAAGGTTAAGGCCCCCAATCTGTTTGAACGAGCCAAGGAAGAGGTTGAGGCTCTCGTTGGAGCTGTTCATGATAAGATGGAGCACAATTCCAGTCCCCATGGAAATAATGC TGACCTGCATAAGGACTCAAAGGATGAAAGCAAGGTGTCAA TGAACAAAATAGAGACCCACAAGAATGAAAC TCATGGTACAAGCGATGATATAAATGAGAATACACCAGTTGAGAGAGTTAAAGGTCCAAATGTGTTTGAGCGTGCCAAGGAAGAGATTGAAGCTA TTGTTGAAGCCTTCCACCCCAAGAAGGGATCTGACAAGTGAAGATTGAGATGTTCTGTTGCCTCTGTCTGCACTTGATGTGAAAACATTGACATGAGTTATTAATAGATCCAT GGATGAGTTGTGAGATATCCATCGGCTGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CF293480             [                    cccaatccATCCATCCGCCGCGCCTCTCTCTCCTTCATCATCAATTCCGGTGAGGATAT CGCCGGATCGACGCGCCGCCGGCGGGAGCCAG CCGCAGAGTGGAGCTTGGAATAGGCAGCTTTCTACTGTGAATCAAAAG CGTGATGAACAAAGATAAAGTTCATGA CAAGGAGACTCACAGAACGAGCAACGATATAAGTCATAAAACATCTGTGGACAAGGTTAAGGCCCCCAATCTGTTTGAACGAGCCAAGGAAGAGGTTGAGGCTCTCGTTGGAGCTGTTCATGATAAGATGGAGCACAATTCCAGTCCCCATGGAAATAATGC TGACCTGCATAAGGACTCAAAGGATGAAAGCAAGGTGTCAA TGAACAAAATAGAGACCCACAAGAATGAAAC TCATGGTACAAGCGATGATATAAATGAGAATACACCAGTTGAGAGAGTTAAAGGTCCAAATGTGTTTGAGCGTGCCAAGGAAGAGATTGAAGCTA TTGTTGAAGCCTTCCACCCAAAGAAGGGATCTGACAAGTGAAGATTGAGATGTTCTGTTGCCTCTGTCTGCACTTGATGTGAAAACATTGACATGAGTTATTAATAGATCCATGGGATGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AK103667             [                                    GCCGCGCCTCTCTCTCCTTCATCATCAATTCCGGTGAGGATAT CGCCGGATCGACGCGCCGCCGGCGGGAGCCAG CCGCAGAGTGGAGCTTGGAATAGGCAGCTTTCTACTGTGAATCAAAAG CGTGATGAACAAAGATAAAGTTCATGA CAAGGAGACTCACAGAACGAGCAACGATATAAGTCATAAAACATCTGTGGACAAGGTTAAGGCCCCCAATCTGTTTGAACGAGCCAAGGAAGAGGTTGAGGCTCTCGTTGGAGCTGTTCATGATAAGATGGAGCACAATTCCAGTCCCCATGGAAATAATGC TGACCTGCATAAGGACTCAAAGGATGAAAGCAAGGTGTCAA TGAACAAAATAGAGACCCACAAGAATGAAAC TCATGGTACAAGCGATGATATAAATGAGAATACACCAGTTGAGAGAGTTAAAGGTCCAAATGTGTTTGAGCGTGCCAAGGAAGAGATTGAAGCTA TTGTTGAAGCCTTCCACCCAAAGAAGGGATCTGACAAGTGAAGATTGAGATGTTCTGTTGCCTCTGTCTGCACTTGATGTGAAAACATTGACATGAGTTATTAATAGATCCAT GGATGAGTTGTGAGATATCCATCGGCTGGTCTTATTATTGCCAAACTATGGAGTTGTAACTGTTGAATGGTTCATT GTACCACTGATATATATATGAGCAGAGTGTGTATCATGTGTGACATGAAAGTATTACTGTTCTTCAGTGTTTGATTTTAGTGTATGTTGAACTTAGTCCTTTGCATGATATGGTATTTTACTTGCTACCATACATGCAAAAATCTTTTGAGGTGCATAAATAAAGAGAGAGTCAATTGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AU101389             [                                                       CATCACCAATTCCGGTGAGGATATNCGCCGATTCGACGCCCCGCCGGCGGGTNCCNGCCCGCAGAGTGGACCTTGGAATAGGCAGCTTTCTACTGTGAATCAAAAGCCGTGATG ACCAAGTTAAAGTTCATGACCAAGGAGACTCACAGAACGAGCAACGATATAAGTCATAAAACATCTGTGGACAAGGTTAA GCCCCCAATCTGTTTGAACGAGCCAAGGAAGAGGTTGAGGCTCTCGTTGGAGCTGTTCATGATAAGATGGAGCACAATTCCAGTCCCCATGGAAATAATGC TGACCTGCATAAGGACTCAAAGGATGAAAGCAAGGTGTCAA TGAACAAAATAGAGACCCACAAGAATGAAAC TCATGGTACAAGCGATGATATAAATGAGAATACACCAGTTGAGAGAGTTAAAGGTCCAAATGTGTTTGAGCGTGCCAAGGAAGAGATTGAAGCTA TTGTTGAAGCCTTCCACCCAAAGAAGGGATCTGACAAGTGAAGATTGAGATGTTCTGTTGCCTCTGTCTGCACTTGATGTGAAAACATTGACATGAGTTATTAATAGATCCAT GGATGAGTTGTGAGATATCCATCGGCTGGTCTTATTATTGCCAAACTATGGAGTTGTAACTGTTGAATGGTTCATT GTACCACTGATATATATATGAGCAGAGTGTGTATCATGTGTGACATGAAAaaa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL C73995               [                                                        ATCATCAATTCCGGTGAGGATAT CGCCGGATCGACGCGCCGCCGG GGGAG CAG CCGCAGAGTGGAGCTTGGAATAGGCAGCTTTCTACTGTGAATCAAAAG CGTGATGAACAAAGATAAAGTTCATGA CAAGGAGACTCACAGAACGAGCAACGATATAAGTCATAAAACATCTGTGGACAAGGTTAAGGCCCCCAATCTGTTTGAACGAGCCAAGGAAGAGGTTGAGGCTCTCGTTGGAGCTGTTCATGATAAGATGGAGCACAATTCCAGTCCCCATGGAAATAATGCTTGACCTGCATAAGGACTCAAAGGATGAAAGCAAGGTGTCAATTGACCAAAATGGAGACCCACAAGAATGAAACTTCATGGTACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CF293481             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATAAGATGGAGCACAATTCCAGTCCCCATGGAAATAATGC TGACCTGCATAAGGACTCAAAGGATGAAAGCAAGGTGTCAA TGAACAAAATAGAGACCCACAAGAATGAAAC TCATGGTACAAGCGATGATATAAATGAGAATACACCAGTTGAGAGAGTTAAAGGTCCAAATGTGTTTGAGCGTGCCAAGGAAGAGATTGAAGCTA TTGTTGAAGCCTTCCACCCAAAGAAGGGATCTGACAAGTGAAGATTGAGATGTTCTGTTGCCTCTGTCTGCACTTGATGTGAAAACATTGACATGAGTTATTAATAGATCCAT GGATGAGTTGTGAGATATCCATCGGCTGGTCTTATTATTGCCAAACTATGGAGTTGTAACTGTTGAATGGTTCATT GTACCACTGATATATATATGAGCAGAGTGTGTATCATGTGTGACATGAAAGTATTACTGTTCTTCAGTGTTTGGTTTTAGTGTATGTTGAACTTAGTCCTTTGCATGATATGGTATTTTACTTGCTACCATACATGCAAAAATCTTTTGAGGTGCATAAATAAAGAGAGAGTCAATTGCTGTACAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CF320676             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGATGGAGCACAATTCCAGTCCCCATGGAAATAATGC TGACCTGCATAAGGACTCAAAGGATGAAAGCAAGGTGTCAA TGAACAAAATAGAGACCCACAAGAATGAAAC TCATGGTACAAGCGATGATATAAATGAGAATACACCAGTTGAGAGAGTTAAAGGTCCAAATGTGTTTGAGCGTGCCAAGGAAGAGATTGAAGCTA TTGTTGAAGCCTTCCACCCCAAGAAGGGATCTGACAAGTGAAGATTGAGATGTTCTGTTGCCTCTGTCTGCACTTGATGTGAAAACATTGACATGAGTTATTAATAGATCCAT GGATGAGTTGTGAGATATCCATCGGCTGGTCTTATTATTGCCAAACTATGGAGTTGTAACTGTTGAATGGTTCATT GTACCACTGATATATATATGAGCAGAGTGTGTATCATGTGTGACATGAAAGTATTACTGTTCTTCAGTGTTTGATTTTAGTGTATGTTGAACTTAGTCCTTTGCATGATATGGTATTTTACTTGCTACCATACATGCAAAAATCTTTTGAGGTGCATAAATAAAGAGAGAGTCAATTGCTGTACAATTTTAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL D42484               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGATTGAAGCTAGTTGTTGAAGCCTTCCACCCAAAGAAGGGATCTGACAAGTGAAGATTGAGATGTTCTGTTGCCTCTGTCTGCACTTGATGTGAAAACATTGACAGTAGTTATTAATAGATCCAT GGATGAGTTGTGAGATATCCATCGGCTGGTCTTATTATTGCCAAACTATGGAGTTGTAACTGTTGAATGGTTCATTGGTACCACTGATATATATATGAGCAGAGTGNGNATCATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CF330395             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTTACTTGCTACCATACATGCAAAAATCTTTTGAGGTGCATAAATAAAGAGAGAGTCAATTGCTGTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTTTTTTCCCCCCAACAAAAATTATTTTTAAAAAAAAGGGGAAAATTCCGGCCCCAAAAAAAAAACCCCCCTAAAAGGGGGGTAAAAAAAAATTCCGGGCCCCGTTTTAAAAAACGGGGAAAGGGAAAAAACCGGGGGTTACCCAAAAAAAAACCCTTGGAAAAAAACCCCCTTTTCCCAAGGGGGGAAAAAAAAAAAAAGCCCCCCCCAAACCCCCTTTCCAAAAAGTGGCCCCCCTAAAACACCCGGGTTTAAAGGGTTCCCCCCAAAAAAAAAAAAACCCCTTTCCCCCTTTGGGGGAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCCCGGGAAAAAGGG]




>consensus_11421#0
GACACTGACATGGACTGAGGAGTAGAAAATCCATCCGCCGCGCCTCTCTCTCCTTCATCA
TCAATTCCGGTGAGGATATCGCCGGATCGACGCGCCGCCGGCGGGAGCCAGCCGCAGAGT
GGAGCTTGGAATAGGCAGCTTTCTACTGTGAATCAAAAGCGTGATGAACAAAGATAAAGT
TCATGACAAGGAGACTCACAGAACGAGCAACGATATAAGTCATAAAACATCTGTGGACAA
GGTTAAGGCCCCCAATCTGTTTGAACGAGCCAAGGAAGAGGTTGAGGCTCTCGTTGGAGC
TGTTCATGATAAGATGGAGCACAATTCCAGTCCCCATGGAAATAATGCTGACCTGCATAA
GGACTCAAAGGATGAAAGCAAGGTGTCAATGAACAAAATAGAGACCCACAAGAATGAAAC
TCATGGTACAAGCGATGATATAAATGAGAATACACCAGTTGAGAGAGTTAAAGGTCCAAA
TGTGTTTGAGCGTGCCAAGGAAGAGATTGAAGCTATTGTTGAAGCCTTCCACCCAAAGAA
GGGATCTGACAAGTGAAGATTGAGATGTTCTGTTGCCTCTGTCTGCACTTGATGTGAAAA
CATTGACATGAGTTATTAATAGATCCATGGATGAGTTGTGAGATATCCATCGGCTGGTCT
TATTATTGCCAAACTATGGAGTTGTAACTGTTGAATGGTTCATTGTACCACTGATATATA
TATGAGCAGAGTGTGTATCATGTGTGACATGAAAGTATTACTGTTCTTCAGTGTTTGATT
TTAGTGTATGTTGAACTTAGTCCTTTGCATGATATGGTATTTTACTTGCTACCATACATG
CAAAAATCTTTTGAGGTGCATAAATAAAGAGAGAGTCAATTGCTGTACAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTTTTTTCCC
CCCAACAAAAATTATTTTTAAAAAAAAGGGGAAAATTCCGGCCCCAAAAAAAAAACCCCC
CTAAAAGGGGGGTAAAAAAAAATTCCGGGCCCCGTTTTAAAAAACGGGGAAAGGGAAAAA
ACCGGGGGTTACCCAAAAAAAAACCCTTGGAAAAAAACCCCCTTTTCCCAAGGGGGGAAA
AAAAAAAAAAGCCCCCCCCAAACCCCCTTTCCAAAAAGTGGCCCCCCTAAAACACCCGGG
TTTAAAGGGTTCCCCCCAAAAAAAAAAAAACCCCTTTCCCCCTTTGGGGGAAAAACAAAA
AAAAAAAAAAAAACCCCCCGGGAAAAAGGG
clustalw multiple alignements is not computed in this case