cluster # 115

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Oryza sativa
cluster # 115 cluster # 115 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_115#0 length = 1899 sequences # 2
consensusID : consensus_115#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1899
fasta sequence
                              [CGCTTCTTCGCCGCCGGCTTCCTCCCACCCGCAACCCAACGCCGGCGCGGCGGCCGTGGTTGGTTACCCTACCTACGCTACTACACGCCTCAGGGGCAATGGAGGCTAGAGCGGGGCTGGCGATGCAGTCGCGGGCGGCTGTCGGGGTCGGAGCTGGCCCCGGCGTGGGGCGGCGGGGCCGCGCCGTGATCCGCGTGGGGAAGCGGCCAACCGCGGCGAGCCTGCGGGTCGGAGGCCCCGCCGGACCGGCGGCGGCCAAGCCCCTCGCCCCGCTGTACTGCCTCAAGGCGTCCAGAGGTGATTCATCTGTTTTTTTTTTCTTCTTTTTTTTTTAACTCCCTTGCAGCGGGCGATTCCGGGGTTGTGCTCGTGCGAGCACGGTGTCGTTAGGGTTAACTTTGGCGCGATTTTGTCCGGGATTTTTTTTCTCTTCGAGCGGATGCGGATCCCTCTGGTATGGTATTCAGTGTGGATATATGGGTTCGTCGTGGTAGCCAGATTTTTGCAGTTTTTTAATTGGATTGGGGGAAGTGGTCACTTTCGTGGTGATCTGGAGTAAATGTGACAACTTATGTGTTGGAAATGGAGTTGTTCAGGGTAGGTGATGGCTTTGCTGGGTCAAATAGGAAAGTTGGATGGGGCAATTTCAATGAAGCTCTCTCTCTCTCTTTGTTAGGTGGGTTGGAAGGGGTTAAATTTCAGTTTGTAGAAGTGTGTATTGTTACATGTTTTTCTTGGTATCAACCTGCTATTTACTTCAAAAATGGTCAACATTTTGTAACAAATACACTACTACAAATAACCTCTGATGATCACACCAACGTTGGATTGTCTATGCACCTTGTATCATTTCTTGTTGTGATTTCTTACCCGATGTAGTCTTCTATTTTAGGTAGTTGCCTGACGAGATGTATATGCTAAATTTTGCTTGTGTTCAGCTGAAATAACTTTCTTTGTAATCTTGTATCGTACAGGCCACGACAGCTTGCATAACTCAGTTGATGAAGCCCTCCTGTTAAAGAGGAAATCAGAAGAAGTTCTATTCTACTTGAACGGACGGTGTATTTATTTAGTTGGAATGATGGGCTCAGGGAAGAGTACAGTTGCAAAGATATTAGCCGAAGTTTTGGGTTATTCATTCTTTGACAGTGATAAGTTGGTTGAACAAGCAGTTGGAATGCCTTCTGTTGCCCAAATATTCAAGGAGCACAGTGAAGCGTTTTTCAGAGATAATGAGAGTAGTGTCTTGAGGGACTTGTCCTCAATGCGACGATTAGTTGTTGCAACTGGAGGTGGTGCCGTTATTCGGCCAGTTAACTGGAAATATATGAAGAAAGGTCTATCTGTCTGGCTGGATGTGCCTTTGGATGCACTTGCAAGGCGTATTGCTCAAGTGGGTACTGCCTCTCGTCCTCTTCTGGATCAGCCATCGAGTGATCCATACACAGCGGCCTTCTCAAAACTCAGCATGCTTGCAGAGCAAAGAGGCGATGCTTATGCAAATGCTGATGCTCGAGTTTCTCTTGA-AGAAATTGCAACTAAACAAGGCCATGACGATGTCTCCAAACTAACACCGACCGATATTGCTATTGAGGCCTTACTCAAGATTGAGAATTTCGTCACCGAGCATTCCACATCAAGTGGCCCAGTTGGGGACTTAATAGTTGATT-CCCAGAATC-GAAGGACAAAGGCCTTGTAGAATTTTGCCCTCTTTTTTTCTTCTTTTGGTGTATCCTGTATTTGTAGCATGTGCTGTTTAACATTATATTGATTTATTCTTTATATATCCAAAAGAGAGATAAGGCAAAGCTTGTTCCCCTTGTAAAAATAGAATAACGAATGGAGCTGACGCGAGATGTTCCACAAATTTTCGTTCTGGAAATAAGAATCGTTGCAATA]

[+] EMBL AK109730             [CGCTTCTTCGCCGCCGGCTTCCTCCCACCCGCAACCCAACGCCGGCGCGGCGGCCGTGGTTGGTTACCCTACCTACGCTACTACACGCCTCAGGGGCAATGGAGGCTAGAGCGGGGCTGGCGATGCAGTCGCGGGCGGCTGTCGGGGTCGGAGCTGGCCCCGGCGTGGGGCGGCGGGGCCGCGCCGTGATCCGCGTGGGGAAGCGGCCAACCGCGGCGAGCCTGCGGGTCGGAGGCCCCGCCGGACCGGCGGCGGCCAAGCCCCTCGCCCCGCTGTACTGCCTCAAGGCGTCCAGAGGTGATTCATCTGTTTTTTTTTTCTTCTTTTTTTTTTAACTCCCTTGCAGCGGGCGATTCCGGGGTTGTGCTCGTGCGAGCACGGTGTCGTTAGGGTTAACTTTGGCGCGATTTTGTCCGGGATTTTTTTTCTCTTCGAGCGGATGCGGATCCCTCTGGTATGGTATTCAGTGTGGATATATGGGTTCGTCGTGGTAGCCAGATTTTTGCAGTTTTTTAATTGGATTGGGGGAAGTGGTCACTTTCGTGGTGATCTGGAGTAAATGTGACAACTTATGTGTTGGAAATGGAGTTGTTCAGGGTAGGTGATGGCTTTGCTGGGTCAAATAGGAAAGTTGGATGGGGCAATTTCAATGAAGCTCTCTCTCTCTCTTTGTTAGGTGGGTTGGAAGGGGTTAAATTTCAGTTTGTAGAAGTGTGTATTGTTACATGTTTTTCTTGGTATCAACCTGCTATTTACTTCAAAAATGGTCAACATTTTGTAACAAATACACTACTACAAATAACCTCTGATGATCACACCAACGTTGGATTGTCTATGCACCTTGTATCATTTCTTGTTGTGATTTCTTACCCGATGTAGTCTTCTATTTTAGGTAGTTGCCTGACGAGATGTATATGCTAAATTTTGCTTGTGTTCAGCTGAAATAACTTTCTTTGTAATCTTGTATCGTACAGGCCACGACAGCTTGCATAACTCAGTTGATGAAGCCCTCCTGTTAAAGAGGAAATCAGAAGAAGTTCTATTCTACTTGAACGGACGGTGTATTTATTTAGTTGGAATGATGGGCTCAGGGAAGAGTACAGTTGCAAAGATATTAGCCGAAGTTTTGGGTTATTCATTCTTTGACAGTGATAAGTTGGTTGAACAAGCAGTTGGAATGCCTTCTGTTGCCCAAATATTCAAGGAGCACAGTGAAGCGTTTTTCAGAGATAATGAGAGTAGTGTCTTGAGGGACTTGTCCTCAATGCGACGATTAGTTGTTGCAACTGGAGGTGGTGCCGTTATTCGGCCAGTTAACTGGAAATATATGAAGAAAGGTCTATCTGTCTGGCTGGATGTGCCTTTGGATGCACTTGCAAGGCGTATTGCTCAAGTGGGTACTGCCTCTCGTCCTCTTCTGGATCAGCCATCGAGTGATCCATACACAGCGGCCTTCTCAAAACTCAGCATGCTTGCAGAGCAAAGAGGCGATGCTTATGCAAATGCTGATGCTCGAGTTTCTCTTGA AGAAATTGCAACTAAACAAGGCCATGACGATGTCTCCAAACTAACACCGACCGATATTGCTATTGAGGCCTTACTCAAGATTGAGAATTTCGTCACCGAGCATTCCACATCAAGTGGCCCAGTTGGGGACTTAATAGTTGATT CCCAGAATC GAAGGACAAAGGCCTTGTAGAATTTTGCCCTCTTTTTTTCTTCTTTTGGTGTATCCTGTATTTGTAGCATGTGCTGTTTAACATTATATTGATTTATTCTTTATATATCCAAAAGAGAGATAAGGCAAAGCTTGTTCCCCTTGTAAAAATAGAATAACGAATGGAGCTGACGCGAGATGTTCCACAAATTTTCGTTCTGGAAATAAGAATCGTTGCAATA]
[+] EMBL AU225160             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gccgcTGTGCCTTTGGATGCACTTGCAAGGCGTATTGCTCAAGTGGGTACTGCCTCTCGTCCTCTTCTGGATCAGCCATCGAGTGATCCATACACAGCGGCCTTCTCAAAACTCAGCATGCTTGCAGAGCAAAGAGGCGATGCTTATGCAAATGCTGATGCTCGAGTTTCTCTTGAGAGAAATTGCAGCTAAACAAGGCCATGACGATGTCTCCAAACTAACACCGACCGATATTGCTATTGAGGCCTTACTCAAGATTGAGAATTTCGTCACCGAGCATTCCACATCAAGTGGCCCAGTTGGGGACTTAATAGTTGATTGCCCAGAATCAGAAGGAC                                                                                                                                                                                                                     ]




>consensus_115#0
CGCTTCTTCGCCGCCGGCTTCCTCCCACCCGCAACCCAACGCCGGCGCGGCGGCCGTGGT
TGGTTACCCTACCTACGCTACTACACGCCTCAGGGGCAATGGAGGCTAGAGCGGGGCTGG
CGATGCAGTCGCGGGCGGCTGTCGGGGTCGGAGCTGGCCCCGGCGTGGGGCGGCGGGGCC
GCGCCGTGATCCGCGTGGGGAAGCGGCCAACCGCGGCGAGCCTGCGGGTCGGAGGCCCCG
CCGGACCGGCGGCGGCCAAGCCCCTCGCCCCGCTGTACTGCCTCAAGGCGTCCAGAGGTG
ATTCATCTGTTTTTTTTTTCTTCTTTTTTTTTTAACTCCCTTGCAGCGGGCGATTCCGGG
GTTGTGCTCGTGCGAGCACGGTGTCGTTAGGGTTAACTTTGGCGCGATTTTGTCCGGGAT
TTTTTTTCTCTTCGAGCGGATGCGGATCCCTCTGGTATGGTATTCAGTGTGGATATATGG
GTTCGTCGTGGTAGCCAGATTTTTGCAGTTTTTTAATTGGATTGGGGGAAGTGGTCACTT
TCGTGGTGATCTGGAGTAAATGTGACAACTTATGTGTTGGAAATGGAGTTGTTCAGGGTA
GGTGATGGCTTTGCTGGGTCAAATAGGAAAGTTGGATGGGGCAATTTCAATGAAGCTCTC
TCTCTCTCTTTGTTAGGTGGGTTGGAAGGGGTTAAATTTCAGTTTGTAGAAGTGTGTATT
GTTACATGTTTTTCTTGGTATCAACCTGCTATTTACTTCAAAAATGGTCAACATTTTGTA
ACAAATACACTACTACAAATAACCTCTGATGATCACACCAACGTTGGATTGTCTATGCAC
CTTGTATCATTTCTTGTTGTGATTTCTTACCCGATGTAGTCTTCTATTTTAGGTAGTTGC
CTGACGAGATGTATATGCTAAATTTTGCTTGTGTTCAGCTGAAATAACTTTCTTTGTAAT
CTTGTATCGTACAGGCCACGACAGCTTGCATAACTCAGTTGATGAAGCCCTCCTGTTAAA
GAGGAAATCAGAAGAAGTTCTATTCTACTTGAACGGACGGTGTATTTATTTAGTTGGAAT
GATGGGCTCAGGGAAGAGTACAGTTGCAAAGATATTAGCCGAAGTTTTGGGTTATTCATT
CTTTGACAGTGATAAGTTGGTTGAACAAGCAGTTGGAATGCCTTCTGTTGCCCAAATATT
CAAGGAGCACAGTGAAGCGTTTTTCAGAGATAATGAGAGTAGTGTCTTGAGGGACTTGTC
CTCAATGCGACGATTAGTTGTTGCAACTGGAGGTGGTGCCGTTATTCGGCCAGTTAACTG
GAAATATATGAAGAAAGGTCTATCTGTCTGGCTGGATGTGCCTTTGGATGCACTTGCAAG
GCGTATTGCTCAAGTGGGTACTGCCTCTCGTCCTCTTCTGGATCAGCCATCGAGTGATCC
ATACACAGCGGCCTTCTCAAAACTCAGCATGCTTGCAGAGCAAAGAGGCGATGCTTATGC
AAATGCTGATGCTCGAGTTTCTCTTGAAGAAATTGCAACTAAACAAGGCCATGACGATGT
CTCCAAACTAACACCGACCGATATTGCTATTGAGGCCTTACTCAAGATTGAGAATTTCGT
CACCGAGCATTCCACATCAAGTGGCCCAGTTGGGGACTTAATAGTTGATTCCCAGAATCG
AAGGACAAAGGCCTTGTAGAATTTTGCCCTCTTTTTTTCTTCTTTTGGTGTATCCTGTAT
TTGTAGCATGTGCTGTTTAACATTATATTGATTTATTCTTTATATATCCAAAAGAGAGAT
AAGGCAAAGCTTGTTCCCCTTGTAAAAATAGAATAACGAATGGAGCTGACGCGAGATGTT
CCACAAATTTTCGTTCTGGAAATAAGAATCGTTGCAATA
clustalw multiple alignements is not computed in this case