cluster # 117

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Oryza sativa
cluster # 117 cluster # 117 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_117#0 length = 1301 sequences # 2
consensusID : consensus_117#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1301
fasta sequence
                              [CACATTTGGCTTTACACTTTTCTGGTTTGAGGCTCATGCTATGTTCTCAGCCCAACCTGGTTACAACGATTGGTTCATATCTTTCTACAATGTTGCCTTTACATCTCTCCCGGTCATTGCTCTAGGTGTCTTTGATAAAGATGTCTCTTCCCGTGTTTGCCTCGAGGTCCCTTCATTACATCAAGATGGCGTGAATAATTTATTCTTCAGCTGGTCTCGTATACTCAGTTGGATGCTGAACGGAGTTTGCTGTTCAATAATAATATACTTTGGAGCCCTCCATGCTGTCCTCATTCAAGCTGTCCGACAGGATGGCCACGTTGCTGGATTTGACATCCTTGGAGTGACTATGTATACTTGCGTAGTTTGGACTGTCAACTGCCAACTAGCACTCTACATCAGCTACTTCACCTGGATACAGCATTTCGTCATCTGGGGCAGCATACTGATTTGGTACACTTTTCTGGTCATCTACGGCTCGTTTCCTCCAACAATATCAACCAGCGCATATCATGTTTTCTGGGAAGCTTGCGCTTCTAGCCCTTTATACTGGTTATCCACTCTAGTCATTGTTGTGACAGCCTTGATCCCATACTTCCTCTACAAAATCACACAGTCGCTGTTTTGCCCACAGCATTGTGATCAAGTTCAGAGACCTAATTCAAAAGAATTGGTGGCTCAATAATTATGGGACTGAAGGGGCTCAATTGAGAGATTGCTATGGTATCCTAACAACTTTACAGTTCAGTTTATAAACCATGATATTTTAGATGGTGAATATAGTATCAAAACAAAAATAGCTAGTTAATGTGTTAGAGTTAGATTGTGTACATACTTGAGCTCATACCCAAAAAATTAGTGTCGGGCTATAGTGTTGCATGAGTTGATATGGGAATGGAAGTGGCTGCTTCGACAGGCTCATTGTTTCCATTATACTGGTAAAGTACAGTTGCTTCAGCGGGGAACTTGTGTTTTCGGACACAAGGCTGATATTGTTACTGGTCAACAAACCCGTGAGTTCACTCTTGGTCCTCTGATATGGCTCGTCCTTTTTTTTTTGTTTATTAGTAATCATGATTGTAATTTGGTTGCCAGGAGGGATGAGATCTGTTGGCTAGTGCTTTGTACAGCCGAATTAGATGTTTA-TCCCCCTTTTATGCACCATCATTGTAATTAAGTTTAAGCAGATAATGTTGGCGTTTTTTTGTGAGGCCAAATGCTGTTCTTACGTGAGACCAATCTTTCTTAGCCTGCCGTTAAGTGGTAAATCGGATGTTGATGTTCCATAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK108698             [CACATTTGGCTTTACACTTTTCTGGTTTGAGGCTCATGCTATGTTCTCAGCCCAACCTGGTTACAACGATTGGTTCATATCTTTCTACAATGTTGCCTTTACATCTCTCCCGGTCATTGCTCTAGGTGTCTTTGATAAAGATGTCTCTTCCCGTGTTTGCCTCGAGGTCCCTTCATTACATCAAGATGGCGTGAATAATTTATTCTTCAGCTGGTCTCGTATACTCAGTTGGATGCTGAACGGAGTTTGCTGTTCAATAATAATATACTTTGGAGCCCTCCATGCTGTCCTCATTCAAGCTGTCCGACAGGATGGCCACGTTGCTGGATTTGACATCCTTGGAGTGACTATGTATACTTGCGTAGTTTGGACTGTCAACTGCCAACTAGCACTCTACATCAGCTACTTCACCTGGATACAGCATTTCGTCATCTGGGGCAGCATACTGATTTGGTACACTTTTCTGGTCATCTACGGCTCGTTTCCTCCAACAATATCAACCAGCGCATATCATGTTTTCTGGGAAGCTTGCGCTTCTAGCCCTTTATACTGGTTATCCACTCTAGTCATTGTTGTGACAGCCTTGATCCCATACTTCCTCTACAAAATCACACAGTCGCTGTTTTGCCCACAGCATTGTGATCAAGTTCAGAGACCTAATTCAAAAGAATTGGTGGCTCAATAATTATGGGACTGAAGGGGCTCAATTGAGAGATTGCTATGGTATCCTAACAACTTTACAGTTCAGTTTATAAACCATGATATTTTAGATGGTGAATATAGTATCAAAACAAAAATAGCTAGTTAATGTGTTAGAGTTAGATTGTGTACATACTTGAGCTCATACCCAAAAAATTAGTGTCGGGCTATAGTGTTGCATGAGTTGATATGGGAATGGAAGTGGCTGCTTCGACAGGCTCATTGTTTCCATTATACTGGTAAAGTACAGTTGCTTCAGCGGGGAACTTGTGTTTTCGGACACAAGGCTGATATTGTTACTGGTCAACAAACCCGTGAGTTCACTCTTGGTCCTCTGATATGGCTCGTCCTTTTTTTTTTGTTTATTAGTAATCATGATTGTAATTTGGTTGCCAGGAGGGATGAGATCTGTTGGCTAGTGCTTTGTACAGCCGAATTAGATGTTTA TCCCCCTTTTATGCACCATCATTGTAATTAAGTTTAAGCAGATAATGTTGGCGTTTTT                                                                                                 ]
[-] EMBL CA761057             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AATCACACAGTCGCTGTTTTGTCCACAGCATTGTGATCAAGTTCAGAGACCTAACTTAAAAGAATTGGTGGCTCAATAATTATGGGACTGAAGGGGCTCAATTGAGAGATTGCTATGGTATCCTAACAACTTTACAGTTCAGTTTATAAACCATGATATTTTAGATGGTGAATATAGTATCAAAACAAAAATAGCTAGTTAATGCGTTAGAGTTAGATTGTGTACATACTTGAGCTCATACCCAAAAAATTAGAGTCGGGCTATAGTGTTGCATGAGTTGATATGGGAATGGAAGTGGCTGCTTCGACAGGCTCATTGTTTCCATTATACTGGTAAAGTACAGTTGCCTTTGTGGGGAACTTGTGTTTTTGGACACAAGGCTGATTTTTTTGCTGCTCAACAAACCCGTGAGTTCACTCTTGGTCCTCTGATATGGCTCGTCC  TTTTTTTTGTTTATTAGTAATCATGGTTGTAATTTGGTTGCCAGGAGGGATGAGATCTGTCGGCTTGTGCTTTGTACAGCCGAATGAGATGTTTATTCCCCCTTTTATGCACCATCATTGTAATTAAGTTTAAGCAGATAATGTTGGCGTTTTTTTGTGAGGCCAAATGCTGTTCTTACGTGAGACCAATCTTTCTTAGCCTGCCGTTAAGTGGTAAATCGGATGTTGATGTTCCATAAAAAAAAAAAAAA]




>consensus_117#0
CACATTTGGCTTTACACTTTTCTGGTTTGAGGCTCATGCTATGTTCTCAGCCCAACCTGG
TTACAACGATTGGTTCATATCTTTCTACAATGTTGCCTTTACATCTCTCCCGGTCATTGC
TCTAGGTGTCTTTGATAAAGATGTCTCTTCCCGTGTTTGCCTCGAGGTCCCTTCATTACA
TCAAGATGGCGTGAATAATTTATTCTTCAGCTGGTCTCGTATACTCAGTTGGATGCTGAA
CGGAGTTTGCTGTTCAATAATAATATACTTTGGAGCCCTCCATGCTGTCCTCATTCAAGC
TGTCCGACAGGATGGCCACGTTGCTGGATTTGACATCCTTGGAGTGACTATGTATACTTG
CGTAGTTTGGACTGTCAACTGCCAACTAGCACTCTACATCAGCTACTTCACCTGGATACA
GCATTTCGTCATCTGGGGCAGCATACTGATTTGGTACACTTTTCTGGTCATCTACGGCTC
GTTTCCTCCAACAATATCAACCAGCGCATATCATGTTTTCTGGGAAGCTTGCGCTTCTAG
CCCTTTATACTGGTTATCCACTCTAGTCATTGTTGTGACAGCCTTGATCCCATACTTCCT
CTACAAAATCACACAGTCGCTGTTTTGCCCACAGCATTGTGATCAAGTTCAGAGACCTAA
TTCAAAAGAATTGGTGGCTCAATAATTATGGGACTGAAGGGGCTCAATTGAGAGATTGCT
ATGGTATCCTAACAACTTTACAGTTCAGTTTATAAACCATGATATTTTAGATGGTGAATA
TAGTATCAAAACAAAAATAGCTAGTTAATGTGTTAGAGTTAGATTGTGTACATACTTGAG
CTCATACCCAAAAAATTAGTGTCGGGCTATAGTGTTGCATGAGTTGATATGGGAATGGAA
GTGGCTGCTTCGACAGGCTCATTGTTTCCATTATACTGGTAAAGTACAGTTGCTTCAGCG
GGGAACTTGTGTTTTCGGACACAAGGCTGATATTGTTACTGGTCAACAAACCCGTGAGTT
CACTCTTGGTCCTCTGATATGGCTCGTCCTTTTTTTTTTGTTTATTAGTAATCATGATTG
TAATTTGGTTGCCAGGAGGGATGAGATCTGTTGGCTAGTGCTTTGTACAGCCGAATTAGA
TGTTTATCCCCCTTTTATGCACCATCATTGTAATTAAGTTTAAGCAGATAATGTTGGCGT
TTTTTTGTGAGGCCAAATGCTGTTCTTACGTGAGACCAATCTTTCTTAGCCTGCCGTTAA
GTGGTAAATCGGATGTTGATGTTCCATAAAAAAAAAAAAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case