cluster # 11941

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Oryza sativa
cluster # 11941 cluster # 11941 Sequences # 9 consensus # 1
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consensus_11941#0 length = 2543 sequences # 9
consensusID : consensus_11941#0
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Sequences nbr = 9
consensus length = 2543
fasta sequence
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[+] EMBL CA767110             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaggggAATGATGCAAGCACTTGGAAAGAGGAAAATAAAGAACTGTTCATGTCACTGAATGAACAAGATGAAGGTCCCAAGGAGTCTGGCTCACAGGGAGCTGCTTTGGAGGGGAAGGAAGACCTATTCTGGCAGCAAGGGCTGCTAATCATTCAANCCNTNTNCCAng                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
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[+] EMBL CF326896             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ACAAAGAGATGGTATCAAGCAAGCTAGAAAGATGTATAAGAGATTTCTGGCTTTACCACGTCCAAGCTTCAAGTTCTTCCAGTACTGCATAGAGTTGGAAACAAACCTTGCATCAATCGGAAACCAAGACAGCCTTGTGAATGCTCGTAAGCTGTATGATGCAGCGCTCGATCTCTATCCCCAGGAAAGAGAACTTTGGAGGAACTACTACAACATGGAGCTGAAGTTGGGAACATCAGAAACAGCAAATGCTATATACTGGCGCGCTCGTAAGGTGCTCGGTGATTCCAGTGCCCTGGACATTCCCCACAGCTAGCAATGTGTGACTTGTGTACCATGCAATATCATTTTTGATCTGATTTGATTACTTTGTTGTTTAAGCGTATCAAGTCAAGTAGCGCGGT GGAAGAAAATTTTGGCTAGTCTATCTGTT GGATTTGCGTTATGAGCCCCTAACTAGGGTTAAAATTTGCATGCTCTGTATGATTGCCGATTAAAAGCTTGTACAGATACGGCGATAGTGGCCGATCCCCGAAA                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL AU101266             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGCTTTACCACGTCCAAGCTTCAAGTTCTTCCAGTACTGCATAGAGTTGGAAACAAACCTTGCATCAATCGGAAACCAAGACAGCCTTGTGAATGCTCGTAAGCTGTATGATGCAGCGCTCGATCTCTATCCCCAGGAAAGAGAACTTTGGAGGAACTACTACAACATGGAGCTGAAGTTGGGAACATCAGAAACAGCAAATGCTATATACTGGCGCGCTCGTAAGGTGCTCGGTGATTCCAGTGCCCTGGACATTCCCCACAGCTAGCAATGTGTGACTTGTGTATCATGCAATATCATTTTTGATCTGATTTGATTACTTTGTTGTTTAAGCGTATCAAGTCAAGTAGCGCGGT GGAAGAAAATTTTGGCTAGTCTATCTGTT GGATTTGTGTTATGAGCCCCTAACTAGGGTTAAAATTTGCATGCTCTGTATGATTGCCGATTAAAAGCTTGTACAGATACGGCGATAGTGGCCGATCCCCGAAACATACTACTAGCTATTGGTGTTTGTGTCAATTTAGTTTGTG                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL C98981               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGCTTTACCACGTCCAAGCTTCAAGTTCTTCCAGTACTGCATAGAGTTGGAAACAAACCTTGCATCAATCGGAAACCAAGACAGCCTTGTGAATGCTCGTAAGCTGTATGATGCAGCGCTCGATCTCTATCCCCAGGAAAGAGAACTTTGGAGGAACTACTACAACATGGAGCTGAAGTTGGGAACATCAGAAACAGCAAATGCTATATACTGGCGCGCTCGTAAGGTGCTCGGTGATTCCAGTGCCCTGGACATTCCCCACAGCTAGCAATGTGTGACTTGTGTATCATGCAATATCATTTTTGATCTGATTTGATTACTTTGTTGTTTAAGCGTATCAAGTCAAGTAGCGCGGTGGGAGGAAAATTTTGGCTAGTCTATCTGTTNGGATTTGTGTTATGAGCCCCTAACTAGGGGTAAAATTTGCATGCT                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AU101267             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGCTTTACCACGTCCAAGCTTCAAGTTCTTCCAGTACTGCATAGAGTTGGAAACAAACCTTGCATCAATCGGAAACCAAGACAGCCTTGTGAATGCTCGTAAGCTGTATGATGCAGCGCTCGATCTCTATCCCCAGGAAAGAGAACTTTGGAGGAACTACTACAACATGGAGCTGAAGTTGGGAACATCAGAAACAGCAAATGCTATATACTGGCGCGCTCGTAAGGTGCTCGGTGATTCCAGTGCCCTGGACATTCCCCACAGCTAGCAATGTGTGACTTGTGTATCATGCAATATCATTTTTGATCTGATTTGATTACTTTGTTGTTTAAGCGTATCAAGTCAAGTAGCGCGGT GGAAGAAAATTTTGGCTAGTCTATCTGTT GGATTTGTGTTATGAGCCCCTAACTAGGGTTAAAATTTGCATGCTCTGTATGATTGCCGATTAAAAGCTTGTACAGATACGGCGATAGTGGCCGATCCCCGAAACATACTACTAGCTATTGGTGTTTGTGTCAATTTAGTTTGTGCCAAGCTTGCCTTGACAAAGAAAAA                                                                                                                         ]
[+] EMBL AU094201             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GCTTTACCACGTCCAAGCTTCAAGTTCTTCCAGTACTGCATAGAGTTGGAAACAAACCTTGCATCAATCGGAAACCAAGACAGCCTTGTGAATGCTCGTAAGCTGTATGATGCAGCGCTCGATCTCTATCCCCAGGAAAGAGAACTTTGGAGGAACTACTACAACATGGAGCTGAAGTTGGGAACATCAGAAACAGCAAATGCTATATACTGGCGCGCTCGTAAGGTGCTCGGTGATTCCAGTGCCCTGGACATTCCCCACAGCTAGCAATGTGTGACTTGTGTATCATGCAATATCATTTTTGATCTGATTTGATTACTTTGTTGTTTAAGCGTATCAAGTCAAGTAGCGCGGT GGAAGAAAATTTTGGCTAGTCTATCTGTT GGATTTGTGTTATGAGCCCCTAACTAGGGTTAAAATTTGCATGCTCTGTATGATTGCCGATTAAAAGCTTGTACAGATACGGCGATAGTGGCCGATCCCCGAAACATACTACTAGCTATTGGTGTTTGTGTCAATTTAGTTTGTGCCAAGCTTGCCTTGACAAAGAAAAA                                                                                                                         ]
[+] EMBL CF317036             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GCTAGTCTATCTGTT GGATTTGTGTTATGAGCCCCTAACTAGGGTTAAAATTTGCATGCTCTGTATGATTGCCGATTAAAAGCTTGTACAGATACGGCGATAGTGGCCGATCCCCGAAACATACTACTAGCTATTGGTGTTTGTGTCAATTTAGTTTGTGCCAAGCTTGCCTTGACAAAGAATTTATCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAGGGAAAAAAA]




>consensus_11941#0
AGGCGCTCACACGCAAAAACCCTAAAACCCCAGTCTACCCTTCCTTCCCCGCCGCCGGCA
GCCGGGACATCACCATGGCGGACGCCGTGCAGTACCGCCTCGAGCGGATGTCCGACGAGC
TCGACGACCTCGAGCGCCGGGGCCTCTTCACCCGCGCCGAGCTCGCCGAGGTCGTCCGCC
GCCGCCGCGACTTCGAGTTCCGCCTCCGACGCCGCTCCCCGCTCCGCTCCGACTTCCTCG
ACTACATCGCCTACGAGCTCCGCCTCGACGCCCTCCGCGACCTCCGCAAGCGCGCCATCA
TACGCGCCACCCCCGACACCACCGACCACGATGCTGACGCCACCGACAACGACAGCAGCA
AGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAACAAGGGCAAGGCCAAGAAGTGGAAGAAGTCCGTCTCCG
ACATCGCCGGAGTCCTCCGCGTCCTCGACATCTACAGGATGGCCACCGTCAGGTACAAGG
GGGACCTCGACCTCTGGTTCCGTTACCTCGAGTTCTGTCGCGACAAGCGCCATGGTCGGA
TGAAGCAGGCTCTGGCACAAGCTATTCGTTACCACCCCAAGGTTCCTGGGCTCTGGATCT
ATGCAGCAGCATGGGAATTTGATCAGAACTTAAATGTTGCTGCAGCACGTGCTCTTATGC
AGACTGGTCTTAGATCTTGTCCAGAATCAGAGGATATGTGGATTGAGTATCTTCGCATGG
AGCTTACCTATCTTAACAAGCTTAAGGCTCGAAAGGTTGCTCTTGGAGAGGATGTGAAGA
CACTGCAAAAGAAGAATAATGATGCAAGCACTTGGAAAGAGGAAAATAAAGAACTGTTCA
TGTCACTGAATGAACAAGATGAAGGTCCCAAGGAGTCTGGCTCACAGGGAGTTGCTTTGG
AGGGGAAGGAAGACCTATTCTGGCAGCAAGGGCTGCTAATCATTCAAACCATATACCATG
GTGCTACAAAAGCTCTTCCTTCAAGCTTAACCTTGCGGAAGAAATTCTTAGAGATATTGA
GTAGTGTTGACCTAGCACATTCTGACGAACTGAAGGTAGAGGTCATGGATGACCTGAAGA
AAGAGTTCTCTGACAGTGAGGACTACTGGGATTGGCTTGCTAGGCTTCAGCTTAGTGACT
CAACTAGTTCCAGTAATTTGAATAGAATGGAAGCTTTATCAAATAAACTGAATAAATCAA
TACAGGTGTATGATGAAGCTGTCAGGAGGTTGCCAACTTCCAGAATGTATTCCCTGTATG
CAAAATTTTGGATGGGTGTTCTGTTTGCTGATACAGAAGATTCCATCTCATTGTTTCATG
GCGGTGAATTTGATGCTTCAGGGTTCACTTCATGTATACTGAAAGTCTATCAAAATGCCG
AATCAAGCGGTTGTCTTACTGAAGATCTTGCTTGCCAATATGTGTCTCTTTATTTGAGAC
TTGGAGGTTTGGAGGAGGCACCTGGAAGATTAGAGGAAGCTAGGAATCTTGCCAAAAAGC
TCTGCAATGGTCCTCTTTCACATGCTGCGGATTTGTGGAACCTGAGAGCATCTATTGAGA
TGAAGTCACTTGCTACTTCTACTGGCATTTCTTCGTTCAGCAAGGAGAACTTGAGTTCTC
TATTTGATCTATTTAATGTTGCACTTCCAAAGTTACCCATACCTGAGGCTGAGGAATTGT
GGCACACGGCCATGAAATTGTTTTCTCATGAGAAGGTTTATTTCGAAAAGCTGGTGAAAT
GTGCAATGTTATCATTAAGTTCTGCTGGTGGAAATGATTGTGGAGCTTCGGTTTCTTCTG
CTATTGTTGGATGGATTTTACAAAGAGATGGTATCAAGCAAGCTAGAAAGATGTATAAGA
GATTTCTGGCTTTACCACGTCCAAGCTTCAAGTTCTTCCAGTACTGCATAGAGTTGGAAA
CAAACCTTGCATCAATCGGAAACCAAGACAGCCTTGTGAATGCTCGTAAGCTGTATGATG
CAGCGCTCGATCTCTATCCCCAGGAAAGAGAACTTTGGAGGAACTACTACAACATGGAGC
TGAAGTTGGGAACATCAGAAACAGCAAATGCTATATACTGGCGCGCTCGTAAGGTGCTCG
GTGATTCCAGTGCCCTGGACATTCCCCACAGCTAGCAATGTGTGACTTGTGTATCATGCA
ATATCATTTTTGATCTGATTTGATTACTTTGTTGTTTAAGCGTATCAAGTCAAGTAGCGC
GGTGGAAGAAAATTTTGGCTAGTCTATCTGTTGGATTTGTGTTATGAGCCCCTAACTAGG
GTTAAAATTTGCATGCTCTGTATGATTGCCGATTAAAAGCTTGTACAGATACGGCGATAG
TGGCCGATCCCCGAAACATACTACTAGCTATTGGTGTTTGTGTCAATTTAGTTTGTGCCA
AGCTTGCCTTGACAAAGAAAAAATCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
GAAAAAAAAAAAAGGGAAAAAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case