These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11971#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1589 fasta sequence [AAACCCTACCCATCCGAATCCGCGAGAGCGGAAGCCACCGAGGCGGAGGCGAGGAGGAGGGCGCAATGGCGGGGAAGGAGGAGGGCCGGATCTTCGTGGGCGGCCTGTCGTTCCACACCGACGAGCGCAAGCTGGCCGACGCGTTCCGCCGCTTCGGCAAGGTCGTCGACGCCCAGATCATGCTGGAGAGACACACCCAACGCCATCGTGGTTTTGGCTTCGTGACATTTTCAGATCCAGAGGCAGTTGATAGCGCTATTAAAGAAATGCACTGTCAAGAATTAGATGGCAGGACTATATCAGTGAACAAGGCTGAGCCTAAGATGAATACAGATGACACAAGGTATGAAAGTGGTGGTGGACGAGGAGAGTATCGTGGTGGTAGAGGTGATGGACCACCCCCAGGCAATTGCTTTGAGTGTGGCCGTGCTGGTCATTGGGCTCGTGATTGCCCTAATCCTGGTGGTGGTCGTTCTGCGCGATACTCTTCTTCTAAGTTCAGCGCTGGTGGCAGAGGAGACCGTTTTTCTGGATCAGATAGGTTTGGAGACCGTTACATGGATGATCGTTATGATGGTGGGTACCGTGAACCTGTT-GATGTCAGAGACAGGTATGGTGGAGGCCGTGACCGATATGCTAATGATCGATACCCATCAGGTGGTGACCGCTATGTTCCAGACAGATATGGAGGTCCCGATCGCTATCAGCCTAGTAGTTATGGCCGGGAACGAGAAAGAAGCTACGAGAGGGATGGAGTGCGTGGCAATGGCGGCTATGATAGGAGTGGCCCAAGGGGTGGTGGAAGCTATGA-CA-GGGATGGCCCAAGGGGTGGTATAAGTGGTGGCTATGACAGGGATGGCCCACGTGGCGGTGGTGTTGACCGTTACGGTGGTGGAGGGCCTGCTCGTTATGATGGAGGAAGCTACAGGGACAGATCTGGGCCGTATGACCGCCCTAGCAGAGGAGGACGCTTTGATGATCGCTTCCA-GTGAAGCCTTTCGCAGAATCAAGTTATGTATTTGCGGTTTAACGCTTGCAGTTTCGCATGGCTGAATGTTTAGTGAATGCTCTGGCACAGTTATATCTATTATGTATTAGAACCTCCAGCACTGTTTTGATTCTGGCAAAAAGT-TTATCTATCAGACTGTTTTGGATTCAAAAATGGCTCGCATTGCACTGAGTGGTTGTCTGCCTGATTCCCTATTTGCTGAATGCTTTCTGTGGTTTGTACATGGTGATTAAGGCTTGCATGGTATCATCAATCTAATCTGCAAGGATTACTACAGAAACAGTGGCTAAATTATGCCGGCCCAGCACATTTGTGAGAAACCTTAGTATGCTTTATCTTCCGTCCAGAAAGCGGTAGCCAGAAAAGCCATTACCATGCTGATGTGTGGTTTTATTTGTTTGTTACCAGTGGCTGATGTGTTCGATCCATGCATTGTGGAAGCAGCATCCTCGTTTCATGTTCTTTTTTTTTCCTATCATTTCTTCTGTAAAAGATGGTACAGATTATCATCAGTTGGATCCCTGAATCAGTAAAACTTCAATATTCTGACATTACTCGTTGCCTTGCTTGAAATATATGC] [+] EMBL CB653259 [AAACCCTACCCATCCGAATCCGCGAGAGCGGAAGCCACCGAGGCGGAGGCGAGGAGGAGGGCGCAATGGCGGGGAAGGAGGAGGGCCGGATCTTCGTGGGCGGCCTGTCGTTCCACACCGACGAGCGCAAGCTGGCCGACGCGTTCCGCCGCTTCGGCAAGGTCGTCGACGCCCAGATCATGCTGGAGAGACACACCCAACGCCATCGTGGTTTTGGCTTCGTGACATTTTCAGATCCAGAGGCAGTTGATAGCGCTATTAAAGAAATGCACTGTCAAGAATTAGATGGCAGGACTATATCAGTGAACAAGGCTGAGCCTAAGATGAATACAGATGACACAAGGTATGAAAGTGGTGGTGGACGAGGAGAGTATCGTGGTGGTAGAGGTGATGGACCACCCCCAGGCAATTGCTTTGAGTGTGGCCGTGCTGGTCATTGGGCTCGTGATTGCCCTAATCCTGGTGGTGGTCGTTCTGCGCGATACTCTTCTTCTAAGTTCAGCGCTGGTGGCAGAGGAGACCGTTTTTCTGGATCAGATAGGTTTGGAGACCGTTACATGGATGATCGTTATGATGGTGGGTACCGTGAACCTGTT GATGTCAGAGACAGGTATGGTGGAGGCCGTGACCGATATGCTAATGATCGATACCCATCAGGTGGTGACCGCTATGTTCCAGACAGATATGGAGGTCCCGATCGCTATCAGCCTAGTAGTTATGGCCGGGAACGAGAAAGAAGCTACGAGAGGGATGGAGTGCGTGGCAAT ] [+] EMBL AK061750 [ CGAATCCGCGAGAGCGGAAGCCACCGAGGCGGAGGCGAGGAGGAGGGCGCAATGGCGGGGAAGGAGGAGGGCCGGATCTTCGTGGGCGGCCTGTCGTTCCACACCGACGAGCGCAAGCTGGCCGACGCGTTCCGCCGCTTCGGCAAGGTCGTCGACGCCCAGATCATGCTGGAGAGACACACCCAACGCCATCGTGGTTTTGGCTTCGTGACATTTTCAGATCCAGAGGCAGTTGATAGCGCTATTAAAGAAATGCACTGTCAAGAATTAGATGGCAGGACTATATCAGTGAACAAGGCTGAGCCTAAGATGAATACAGATGACACAAGGTATGAAAGTGGTGGTGGACGAGGAGAGTATCGTGGTGGTAGAGGTGATGGACCACCCCCAGGCAATTGCTTTGAGTGTGGCCGTGCTGGTCATTGGGCTCGTGATTGCCCTAATCCTGGTGGTGGTCGTTCTGCGCGATACTCTTCTTCTAAGTTCAGCGCTGGTGGCAGAGGAGACCGTTTTTCTGGATCAGATAGGTTTGGAGACCGTTACATGGATGATCGTTATGATGGTGGGTACCGTGAACCTGTT GATGTCAGAGACAGGTATGGTGGAGGCCGTGACCGATATGCTAATGATCGATACCCATCAGGTGGTGACCGCTATGTTCCAGACAGATATGGAGGTCCCGATCGCTATCAGCCTAGTAGTTATGGCCGGGAACGAGAAAGAAGCTACGAGAGGGATGGAGTGCGTGGCAATGGCGGCTATGATAGGAGTGGCCCAAGGGGTGGTGGAAGCTATGA CA GGGATGGCCCAAGGGGTGGTATAAGTGGTGGCTATGACAGGGATGGCCCACGTGGCGGTGGTGTTGACCGTTACGGTGGTGGAGGGCCTGCTCGTTATGATGGAGGAAGCTACAGGGACAGATCTGGGCCGTATGACCGCCCTAGCAGAGGAGGACGCTTTGATGATCGCTTCCA GTGAAGCCTTTCGCAGAATCAAGTTATGTATTTGCGGTTTAACGCTTGCAGTTTCGCATGGCTGAATGTTTAGTGAATGCTCTGGCACAGTTATATCTATTATGTATTAGAACCTCCAGCACTGTTTTGATTCTGGCAAAAAGT TTATCTATCAGACTGTT ] [+] EMBL AK062094 [ AATCCGCGAGAGCGGAAGCCACCGAGGCGGAGGCGAGGAGGAGGGCGCAATGGCGGGGAAGGAGGAGGGCCGGATCTTCGTGGGCGGCCTGTCGTTCCACACCGACGAGCGCAAGCTGGCCGACGCGTTCCGCCGCTTCGGCAAGGTCGTCGACGCCCAGATCATGCTGGAGAGACACACCCAACGCCATCGTGGTTTTGGCTTCGTGACATTTTCAGATCCAGAGGCAGTTGATAGCGCTATTAAAGAAATGCACTGTCAAGAATTAGATGGCAGGACTATATCAGTGAACAAGGCTGAGCCTAAGATGAATACAGATGACACAAGGTATGAAAGTGGTGGTGGACGAGGAGAGTATCGTGGTGGTAGAGGTGATGGACCACCCCCAGGCAATTGCTTTGAGTGTGGCCGTGCTGGTCATTGGGCTCGTGATTGCCCTAATCCTGGTGGTGGTCGTTCTGCGCGATACTCTTCTTCTAAGTTCAGCGCTGGTGGCAGAGGAGACCGTTTTTCTGGATCAGATAGGTTTGGAGACCGTTACATGGATGATCGTTATGATGGTGGGTACCGTGAACCTGTT GATGTCAGAGACAGGTATGGTGGAGGCCGTGACCGATATGCTAATGATCGATACCCATCAGGTGGTGACCGCTATGTTCCAGACAGATATGGAGGTCCCGATCGCTATCAGCCTAGTAGTTATGGCCGGGAACGAGAAAGAAGCTACGAGAGGGATGGAGTGCGTGGCAATGGCGGCTATGATAGGAGTGGCCCAAGGGGTGGTGGAAGCTATGA CA GGGATGGCCCAAGGGGTGGTATAAGTGGTGGCTATGACAGGGATGGCCCACGTGGCGGTGGTGTTGACCGTTACGGTGGTGGAGGGCCTGCTCGTTATGATGGAGGAAGCTACAGGGACAGATCTGGGCCGTATGACCGCCCTAGCAGAGGAGGACGCTTTGATGATCGCTTCCA GTGAAGCCTTTCGCAGAATCAAGTTATGTATTTGCGGTTTAACGCTTGCAGTTTCGCATGGCTGAATGTTTAGTGAATGCTCTGGCACAGTTATATCTATTATGTATTAGAACCTCCAGCACTGTTTTGATTCTGGCAAAAAGT TTATCTATCAGACTGTTTTGGATTCTGAATTGGCTCGCATTGCACTGAGTGGTTGTCTGCCTGATTCCCTATTTGCTGAATGCTTTCTGTGGTTTGTACATGGTGATTAAGGCTTGCATGGTATCATCAATCTAATCTGCAAGGATTACTACAGAAACAGTGGCTAAATTATGCCGGCCCAGCACATTTGTGAGAAACCTTAGTATGCTTTATCTTCCGTCCAGAAAGCGGTAGCCAGAAAAGCCATTACCATGCTGATGTGTGGTTTTATTTGTTTGTTACCAGTGGCTGATGTGTTCGATCCATGCATTGTGGAAGCAGCATCCTCGTTTCATGTTCTTTTTTTTTCCTATCATTTCTTCTGTAAAAGATGGTACAGATTATCATCAGTTGGATCCCTGAATCAGTAAAACTTCAATATTCTGACATTACTCGTTGCCTTGCTTGAAATATATGC] [+] EMBL OS0746A [ ATCCAGAGGCAGTTGATAGCGCTATTAAAGAAATGCACTGTCAAGAATTAGATGGCAGGACTATATCAGTGAACAAGGCTGAGCCTAAGATGAATACAGATGACACAAGGTATGAAAGTGGTGGTGGACGAGGAGAGTATCGTGGTGGTAGAGGTGATGGACCACCCCCAGGCAATTGCTTTGAGTGTGGCCGTGCTGGTCATTGGGCTCGTGATTGCCCTAATCCTGGTGGTGGTCGTTCTGCGCGATACTCTTCTTCTAAGTTCAGCGCTGGTGGCAGAGGAGACCGTTTTTCTGGATCAGATAGGTTTGG ] [-] EMBL CB653260 [ GTGGACGAGGAGAGTATCGTGGTGGTAGAGGTGATGGACCACCCCCAGGCAATTGCTTTGAGTGTGGCCGTGCTGGTCATTGGGCTCGTGATTGCCCTAATCCTGGTGGTGGTCGTTCTGCGCGATACTCTTCTTTTAAGTTCAGCGCTGGTGGCAGAGGAGACCGTTTTTCTGGATCAGATAGGTTTGGAGACCGTTACATGGATGATCGTTATGATGGTGGGTACCGTGAACCTGTT GATGTCAGAGACAGGTATGGTGGAGGCCGTGACCGATATGCTAATGATCGATACCCATCAGGTGGTGACCGCTATGTTCCAGACAGATATGGAGGTCCCGATCGCTATCAGCCTAGTAGTTATGGCCGGGAACGAGAAAGAAGCTACGAGAGGGATGGAGTGCGTGGCAATGGCGGCTATGATAGGAGTGGCCCAAGGGGTGGTGGAAGCTATGA CA GGGATGGCCCAAGGGGTGGTATAAGTGGTGGCTATGACAGGGATGGCCCACGTGGCGGTGGTGTTGACCGTTACGGTGGTGGAGGGCCTGCTCGTTATGATGGAGGAAGCTACAGGGACAGATTTGGGCCGTATGACCGCCCTAGCAGAGGAGGACGCTTTGATGATCGCTTCCA GTGAAGCCTTTCGCAGAATCAAGTTATGTATTTGCGGTTTAACGCTTGCAGTTTCGCATGGCTGAATGTTTAGTGAATGCTCTGGCACAGTTATATCTATTATGTATTAGAACCTCCAGCACTGTTTTGATTCTGGCAAAAATT TAAAGTATCAGACTGTTT ] [+] EMBL BQ909194 [ aaacCCTGTTAGATGTCAGAGACAGGTATGNTGGA GCCGTGACCGATATGCTAATGATCGATACCCATCAGGTGGTGACCGCTATGTTCCAGACAGATATGGAGGTCCCGATCGCTATCAGCCTAGTAGTTATGGCCGGGAACGAGAAAGAAGCTACGAGAGGGATGGAGTGCGTGGCAATGGCGGCTATGATAGGAGTGGCCCAAGGGGTGGTGGAAGCTATGACCACGGGATGGCCCAAGGGGTGGTATAAGTGGTGGCTATGACAGGGATGGCCCACGTGGCGGTGGTGTTGACCGTTACGGTGGTGGAGGGCCTGCTCGTTATGATGGAGGAAGCTACAGGGACAGATCTGGGCCATATGACCGCCCTAGCAGAGGAGGACGCTTTGATGATCGCTTCCACGTGAAGCCTTTCGCAGAATCAAGTTATGTATTTGCGGTTTAATGCTTGCAGTTTCGCATGGCTGAATGTTTAGTGAATGCTCTGGCACAGTTATATCTATTATGTATTAGAACCTCCAGCACTGTTTTGATTCTGGC AAAAGTCTTATCTATCAGACTGTTTTGGATTAAAAA ] [+] EMBL C98127 [ AGAGACAGGTATGGT GAAGCCCTGACCGATATGCTAA GACCGATACCCATCAGNTGGTGNCCGCTATGTTCCAGACAGATATGGAGGTCCCGANCGCTATCAGCCTAGTAGTTATGNCCGGGAACGAGAAAGAAGCTACGAGAGGGATGGAGTNCGTGGCAATGGCGGCTATGATAGGAGTGGCCCAAGGGGTGNTGGAAGCTATGA CA GGGATGGCCCAAGGGGTGGTATAAGTGGTGGCTATGACAGGGATGGCCCACGTGGCGGTGGTGTTGACCGTTACGGTGGTGGAGGGCCTGCTCGTTATGATGGAGGAAGCTACAGGGACAGATCTGGGCCGTATGACCGCCCTAGCAGAGGAGGACGCTTTGATGATCGCTTCCA GTGAAGCCTTTCGCAGAATCAAGTTATGTATTTGCGGTTTAACGCTTGCAGTTTCGCATGGCTGAATGTTTAGTGAATGCTCTGGCACAGTTATATCTATTATGTATTAGAACCTCCAGCACTGTTTTGATTCTGGCAAAAAGT TTATCTATCAGACTGTTTTGGATTCAAAAAa ] [+] EMBL AU164865 [ TGGA TGCGTGGCAATGGCGGCTATGATAGGA TGGCCCAA GGGTGGTAGAAGCTATGA CA GGGATGGCCCAAGGGGTGGTATAAGTGGTGGCTATGACAGGGATGGCCCACGTGGCGGTGGTGTTGACCGTTACGGTGGTGGAGGGCCTGCTCGTTATGATGGAGGAAGCTACAGGGACAGATCTGGGCCGTATGACCGCCCTAGCAGAGGAGGACGCTTTGATGATCGCTTCCA GTGAAGCCTTTCGCAGAATCAAGTTATGTATTTGCGGTTTAACGCTTGCAGTTTCGCATGGCTGAATGTTTAGTGAATGCTCTGGCACAGTTATATCTATTATGTATTAG ACCTCCAGCACTG TTTGATTCTGGCAAAAAGT TTATCTATCAGACTGTTTTGGATTCAAAAA ] [-] EMBL AA750362 [ GTTATGTATTTGCGGTTTAATGCTTGCAGTTTNGCATGGCTGAATGTTTAGTGNATGCTCTGGNNCAGTTATATCTATTATGTATTAGAACCTCCAGC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||