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Oryza sativa
cluster # 12598 cluster # 12598       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_12598#0 length = 798 sequences # 11  

consensusID : consensus_12598#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 798
fasta sequence
                              [TTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATCAATGAAAAGCTGGATGTTTTAAGTATGGATTGCAATGGGAGAGCATATGAAAAACATAAACCAACCACAACTTCTATGGAAATATTAGTTAAAAAGATACCTTTTGCCTTGGTTCAACCTGATTAGCACGGTTGTTTATGTCATAAACATATATGGTAACAACAGGTGCATCACCATCATTGTAGAACCAATGTGCAACACCAGCTGGGAGTGGAATAATATCTCCTTGTCTAAATTGATAGATCTTTTGGTGCTCGTCCCTAAACTTTTGGCTTTCACTTTGCCATTGAGGCGAAAATTGTTGGAATTGTTGTTGGTAAGTTGCTGGGCAACCGAGGAAAGTTAAGCCCATAGTACCTCTCCCTTGGATGATGTAGGCCATGCTGAGAGTGTTGGTGTATCGAGGTACCAAAAGACCTTGAGGCTGAATGATACGTCGGATGACAAACGTACCAGTGTGCTGGAATAATTCATTCCTCTCATCAACATACTCAGTCACACCACCTTCTGATCTCACTTTCTGAAGTGACTCANATGCTTGTAATCTATCAAATCTATACTCACTAAAACTTCCTTGATGAGGACTATGCCATGGGGTTTGTTCTTGGATAAAATAGTTGGGCCATAGAATCATGAACCAAGAGAAGTACACAAAAGCATATAGAAAACTGAGAGGAAACAGTAGTTGCCATAGCTTTCTGTATATACTAATGGAAACTTAAGCTAATTGATGTCCCCCTTGTCTCGTCCTCT]

[+] EMBL CA760028             [TTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATCAATGAAAAGCTGGATGTTTTAAGTATGGATTGCAATGGGAGAGCATATGAAAAACATAAACCAACCACAACTTCTATGGAAATATTAGTTAAAAAGATACCTTTTGCCTTGGTTCAACCTGATTAGCACGGTTGTTTATGTCATAAACATATATGGTAACAACAGGTGCATCACCATCATTGTAGAACCAATGTGCAACACCAGCTGGGAGTGGAATAATATCTCCTTGTCTAAATTGATAGATCTTTTGGTGCTCGTCCCTAAACTTTTGGCTTTCACTTTGCCATTGAGGCGAAAATTGTTGGAATTGTTGTTGGTAAGTTGCTGGGCAACCGAGGAAAGTTAAGCCCATAGTACCTCTCCCTTGGATGATGTAGGCCATGCTGAGAGTGTTGGTGTATCGAGGTACCAAAAGACCTTGAGGCTGAATGATACGTCGGATGACAAACGTACCAGTGTGCTGGAATAATTCATTCCTCTCATCAACATACTCAGTCACACCACCTTCTGATCTCACTTTCTGAAGTGACTCANATGCTTGTAATCTATCAAATCTATACTCACTAAAACTTCCTTGATGAGGACTATGCCATGGGGTTTGTTCTTGGATAAAATAGTTGGGCCATAGAATCATGAACCAAGAGAAGTACACAAAAGCATATAGAAAACTGAGAGGAAACAGTAGTTGCCATAGCTTTCTGTATATACTAATGGAAACTTAAGCTAATTGATGTCCCCCTTGTCTCGTCCTCT]
[+] EMBL CA760019             [TTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATCAATGAAAAGCTGGATGTTTTAAGTATGGATTGCAATGGGAGAGCATATGAAAAACATAAACCAACCACAACTTCTATGGAAATATTAGTTAAAAAGATACCTTTTGCCTTGGTTCAACCTGATTAGCACGGTTGTTTATGTCATAAACATATATGGTAACAACAGGTGCATCACCATCATTGTAGAACCAATGTGCAACACCAGCTGGGAGTGGAATAATATCTCCTTGTCTAAATTGATAGATCTTTTGGTGCTCGTCCCTAAACTTTTGGCTTTCACTTTGCCATTGAGGCGAAAATTGTTGGAATTGTTGTTGGTAAGTTGCTGGGCAACCGAGGAAAGTTAAGCCCATAGTACCTCTCCCTTGGATGATGTAGGCCATGCTGAGAGTGTTGGTGTATCGAGGTACCAAAAGACCTTGAGGCTGAATGATACGTCGGATGACAAACGTACCAGTGTGCTGGAATAATTCATTCCTCTCATCAACATACTCAGTCACACCACCTTCTGATCTCACTTTCTGAAGTGACTCANATGCTTGTAATCTATCAAATCTATACTCACTAAAACTTCCTTGATGAGGACTATGCCATGGGGTTTGTTCTTGGATAAAATAGTTGGGCCATAGAATCATGAACCAAGAGAAGTACACAAAAGCATATAGAAAACTGAGAGGAAACAGTAGTTGCCATAGCTTTCTGTATATACTAATGGAAACTTAAGCTAATTGATGTCCCCCTTGTCTCGTCCTCT]
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[+] EMBL CA760025             [TTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATCAATGAAAAGCTGGATGTTTTAAGTATGGATTGCAATGGGAGAGCATATGAAAAACATAAACCAACCACAACTTCTATGGAAATATTAGTTAAAAAGATACCTTTTGCCTTGGTTCAACCTGATTAGCACGGTTGTTTATGTCATAAACATATATGGTAACAACAGGTGCATCACCATCATTGTAGAACCAATGTGCAACACCAGCTGGGAGTGGAATAATATCTCCTTGTCTAAATTGATAGATCTTTTGGTGCTCGTCCCTAAACTTTTGGCTTTCACTTTGCCATTGAGGCGAAAATTGTTGGAATTGTTGTTGGTAAGTTGCTGGGCAACCGAGGAAAGTTAAGCCCATAGTACCTCTCCCTTGGATGATGTAGGCCATGCTGAGAGTGTTGGTGTATCGAGGTACCAAAAGACCTTGAGGCTGAATGATACGTCGGATGACAAACGTACCAGTGTGCTGGAATAATTCATTCCTCTCATCAACATACTCAGTCACACCACCTTCTGATCTCACTTTCTGAAGTGACTCANATGCTTGTAATCTATCAAATCTATACTCACTAAAACTTCCTTGATGAGGACTATGCCATGGGGTTTGTTCTTGGATAAAATAGTTGGGCCATAGAATCATGAACCAAGAGAAGTACACAAAAGCATATAGAAAACTGAGAGGAAACAGTAGTTGCCATAGCTTTCTGTATATACTAATGGAAACTTAAGCTAATTGATGTCCCCCTTGTCTCGTCCTCT]
[+] EMBL CA760026             [TTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATCAATGAAAAGCTGGATGTTTTAAGTATGGATTGCAATGGGAGAGCATATGAAAAACATAAACCAACCACAACTTCTATGGAAATATTAGTTAAAAAGATACCTTTTGCCTTGGTTCAACCTGATTAGCACGGTTGTTTATGTCATAAACATATATGGTAACAACAGGTGCATCACCATCATTGTAGAACCAATGTGCAACACCAGCTGGGAGTGGAATAATATCTCCTTGTCTAAATTGATAGATCTTTTGGTGCTCGTCCCTAAACTTTTGGCTTTCACTTTGCCATTGAGGCGAAAATTGTTGGAATTGTTGTTGGTAAGTTGCTGGGCAACCGAGGAAAGTTAAGCCCATAGTACCTCTCCCTTGGATGATGTAGGCCATGCTGAGAGTGTTGGTGTATCGAGGTACCAAAAGACCTTGAGGCTGAATGATACGTCGGATGACAAACGTACCAGTGTGCTGGAATAATTCATTCCTCTCATCAACATACTCAGTCACACCACCTTCTGATCTCACTTTCTGAAGTGACTCANATGCTTGTAATCTATCAAATCTATACTCACTAAAACTTCCTTGATGAGGACTATGCCATGGGGTTTGTTCTTGGATAAAATAGTTGGGCCATAGAATCATGAACCAAGAGAAGTACACAAAAGCATATAGAAAACTGAGAGGAAACAGTAGTTGCCATAGCTTTCTGTATATACTAATGGAAACTTAAGCTAATTGATGTCCCCCTTGTCTCGTCCTCT]
[+] EMBL CA760027             [TTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATCAATGAAAAGCTGGATGTTTTAAGTATGGATTGCAATGGGAGAGCATATGAAAAACATAAACCAACCACAACTTCTATGGAAATATTAGTTAAAAAGATACCTTTTGCCTTGGTTCAACCTGATTAGCACGGTTGTTTATGTCATAAACATATATGGTAACAACAGGTGCATCACCATCATTGTAGAACCAATGTGCAACACCAGCTGGGAGTGGAATAATATCTCCTTGTCTAAATTGATAGATCTTTTGGTGCTCGTCCCTAAACTTTTGGCTTTCACTTTGCCATTGAGGCGAAAATTGTTGGAATTGTTGTTGGTAAGTTGCTGGGCAACCGAGGAAAGTTAAGCCCATAGTACCTCTCCCTTGGATGATGTAGGCCATGCTGAGAGTGTTGGTGTATCGAGGTACCAAAAGACCTTGAGGCTGAATGATACGTCGGATGACAAACGTACCAGTGTGCTGGAATAATTCATTCCTCTCATCAACATACTCAGTCACACCACCTTCTGATCTCACTTTCTGAAGTGACTCANATGCTTGTAATCTATCAAATCTATACTCACTAAAACTTCCTTGATGAGGACTATGCCATGGGGTTTGTTCTTGGATAAAATAGTTGGGCCATAGAATCATGAACCAAGAGAAGTACACAAAAGCATATAGAAAACTGAGAGGAAACAGTAGTTGCCATAGCTTTCTGTATATACTAATGGAAACTTAAGCTAATTGATGTCCCCCTTGTCTCGTCCTCT]
[-] EMBL CB096631             [                                                                    TATGGATTGCAATGTGAGAACATATGAAAAACATAAACCAACCACAACTTCTATGGAAATATTAGTTAAAAAGATACCTTTTGCCTTGGTTCAACCTGATTAGCACGGTTGTTTATGTCATAAACATATATGGTAACAACAGGTGCATCACCATCATTGTAGAACCAATGTGCAACACCAGCTGGGAGTGGAATAATATCTCCTTGTCTAAATTGATAGATCTTTTGGTGCTCGTCCCTAAACTTTTGGCTTTCACTTTGCCATTGAGGCGAAAATTGTTGGAATTGTTGTTGGTAAGTTGCTGGGCAACCGAGGAAAGTTAAGCCCACAGTACCTCTCCCTTGGATGATGTAGACCATGCTGAGAGTGTTGGTGTATCGAGGTACCAAAAGACCTTGAGGCTGAATGATACGTCGGATGACAAACGTACCAGTGTGCTGGAATAATTCATTCCTCTCATCAACATACTCAGTCACACCACCTTCTGATCTCACTTTCTGAAGTNACTCAAATGCTTGTAATCTATCAAATCTATACT                                                                                                                                                                                                ]


>consensus_12598#0 TTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATCAATGAAAAGCTGGAT GTTTTAAGTATGGATTGCAATGGGAGAGCATATGAAAAACATAAACCAACCACAACTTCT ATGGAAATATTAGTTAAAAAGATACCTTTTGCCTTGGTTCAACCTGATTAGCACGGTTGT TTATGTCATAAACATATATGGTAACAACAGGTGCATCACCATCATTGTAGAACCAATGTG CAACACCAGCTGGGAGTGGAATAATATCTCCTTGTCTAAATTGATAGATCTTTTGGTGCT CGTCCCTAAACTTTTGGCTTTCACTTTGCCATTGAGGCGAAAATTGTTGGAATTGTTGTT GGTAAGTTGCTGGGCAACCGAGGAAAGTTAAGCCCATAGTACCTCTCCCTTGGATGATGT AGGCCATGCTGAGAGTGTTGGTGTATCGAGGTACCAAAAGACCTTGAGGCTGAATGATAC GTCGGATGACAAACGTACCAGTGTGCTGGAATAATTCATTCCTCTCATCAACATACTCAG TCACACCACCTTCTGATCTCACTTTCTGAAGTGACTCANATGCTTGTAATCTATCAAATC TATACTCACTAAAACTTCCTTGATGAGGACTATGCCATGGGGTTTGTTCTTGGATAAAAT AGTTGGGCCATAGAATCATGAACCAAGAGAAGTACACAAAAGCATATAGAAAACTGAGAG GAAACAGTAGTTGCCATAGCTTTCTGTATATACTAATGGAAACTTAAGCTAATTGATGTC CCCCTTGTCTCGTCCTCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)