cluster # 12636

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Oryza sativa
cluster # 12636 cluster # 12636 Sequences # 11 consensus # 1
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consensus_12636#0 length = 2138 sequences # 11
consensusID : consensus_12636#0
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Sequences nbr = 11
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fasta sequence
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[+] EMBL CB680290             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AATGTTCCTAGTCACACTTGCACTGTGGATATCTACCGTGAGATGGAAGATAAAGAATCACGGAAGTTAGTATACCATCCCGCCACTCCGGCGGCTGGTCCTCTGCATGGTGTGGCACTGAATAATCCATATCAGCCTTTGAGTGTCATTGATCTCAAACGCTGTTCTGCTAGGAATAATAGAACTACATACTGCTATGATTTTCCACTGGCATTTGAAACTGCAGTGAGGAAGTCATGGTCCTCTAGTACCTCTGGTGCTTCTAAAGGTGTTGAAAATGCCCAATGTTATGTTAAAGCTACAGAGTTGGTATTTGCGGACAAACATGGGTCATGGGGCACTCCTTT AGTTCAAATGGACCGGCCTGCTGGGCTCAATGACATTGGTATGGTAGCTTGGACCTTGAAGATGTCCACTCCTGAATTTCCTAGTGGTAGGGAGATTATTGTTGTTGCAAATGATATTACGTTCAGAGCTGGATCATTTGGCCCAAGGGAAGATGCATTTTTTGAAGCTGTTACCAACCTAGCCTGTGAGAAGAAACTTCCTCTTATTTATTTGGCAGCAAATTCTGGTGCTCGAATTGGCATAGCAGATGAAGTGAAATCTTGCTTCCGTGTTGGGTGGTCTGATGATGGCAGCCCTGAACGTGGGTTTCAGTACATTTATCTAAGCGAAGAAGACTATGCTCGTATTGGCACTTCTGTCATAGCACATAAGATGCAGCTAGACAGTGGTGAAATTANGTGGGTTATTGATTCTGTTGTGGTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CB634341             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAATGGACCGGCCTGCTGGGCTCAATGACATTGGTATGGTAGCTTGGACCTTGAAGATGTCCACTCCTGAATTTCCTAGTGGTAGGGAGATTATTGTTGTTGCAAATGATATTACGTTCAGAGCTGGATCATTTGGCCCAAGGGAAGATGCATTTTTTGAAGCTGTTACCAACCTAGCCTGTGAGAAGAAACTTCCTCTTATTTATTTGGCAGCAAATTCTGGTGCTCGAATTGGCATAGCAGATGAAGTGAAATCTTGCTTCCGTGTTGGGTGGTCTGATGATGGCAGCCCTGAACGTGGGTTTCAGTACATTTATCTAAGCGAAGAAGACTATGCTCGTATTGGCACTTCTGTCATAGCACATAAGATGCAGCTAGACAGTGGTGAAATTAGGTGGGTTATTGATTCTGTTGTGGGCAAGGAAGATGGACTTGGTGTGGAGAATATACATGGAAGTGCTGCTATTGCCAGTGCTTATTCTAGGGCATATAAGGAGACATTTACACTTACATTTGTGACTGGAAGAACTGTTGGAATAGGAGCTTATCTTGCTCGACTTGGCATCCGGTGCATACAGCGTCTTGACCAGCCTATTATTCTTACAGGCTATTCTGCACTGAACAAGCTTCTTGGGCGGGAAGTGTACAGCTCCCACATGCAGTTGGGTGGTCCCAAAATCATGGCAACTAATGGTGTTGTCCATCTTACTGTTTCAGATGACCTTGAAGGCGTTTCTAATATATTGAGGTGGCTCAGTTATGTTCCTGCCTACATTGGTGGACCACTTCCAGTAACAACAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CB965535             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ACCGGCCTGCTGGGCTCAATGACATTGGTATGGTAGCTTGGACCTTGAAGATGTCCACTCCTGAATTTCCTAGTGGTAGGGAGATTATTGTTGTTGCAAATGATATTACGTTCAGAGCTGGATCATTTGGCCCAAGGGAAGATGCATTTTTTGAAGCTGTTACCAACCTAGCCTGTGAGAAGAAACTTCCTCTTATTTATTTGGCAGCAAATTCTGGTGCTCGAATTGGCATAGCAGATGAAGTGAAATCTTGCTTCCGTGTTGGGTGGTCTGATGATGGCAGCCCTGAACGTGGGTTTCAGTACATTTATCTAAGCGAAGAAGACTATGCTCGTATTGGCACTTCTGTCATAGCACATAAGATGCAGCTAGACAGTGGTGAAATTAGGTGGGTTATTGATTCTGTTGTGGGCAAGGAAGATGGACTTGGTGTGGAGAATATACATGGAAGTGCTGCTATTGCCAGTGCTTATTCTAGGGCATATAAGGAGACATTTACACTTACATTTGTGACTGGAAGAACTGTTGGAATAGGAGCTTATCTTGCTCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CB642141             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GCTCGAATTGGCATAGCAGATGAAGTGAAATCTTGCTTCCGTGTTGGGTGGTCTGATGATGGCAGCCCTGAACGTGGGTTTCAGTACATTTATCTAAGCGAAGAAGACTATGCTCGTATTGGCACTTCTGTCATAGCACATAAGATGCAGCTAGACAGTGGTGAAATTAGGTGGGTTATTGATTCTGTTGTGGGCAAGGAAGATGGACTTGGTGTGGAGAATATACATGGAAGTGCTGCTATTGCCAGTGCTTATTCTAGGGCATATAAGGAGACATTTACACTTACATTTGTGACTGGAAGAACTGTTGGAATAGGAGCTTATCTTGCTCGACTTGGCATCCGGTGCATACAGCGTCTTGACCAGCCTATTATTCTTACAGGCTATTCTGCACTGAACAAGCTTCTTGGGCGGGAAGTGTACAGCTCCCACATGCAGTTGGGTGGTCCCAAAATCATGGCAACTAATGGTGTTGTCCATCTTACTGTTTCAGATGACCTTGAAGGCGTTTCTAATATATTGAGGTGGCTCAGTTATGTTCCTGCCTACATTGGTGGACCACTTCCAGTAACAACACCGTTGGACCCACCGGACAGACCTGTTGCATACATTCCTGAGAACTCGTGTGATCCTCGAGCGGCTATCCGTGGTGTTGATGACAGCCAAGGGAAATGGTTAGGT GGTATGTTTGATAAAGACAGCTTTGTGGAAACATTTGAAGGTTGGGCTAAGACAGTGGTTACTGGCAGAGCAAAGCTTGGTGGAATTCCAGTGGGTGTGATAGCTGTGGAGACTCAGACCATGATGCAAACTATCCC                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CF325419             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCTGATGATGGCAGCCCTGAACGTGGGTTTCAGTACATTTATCTAAGCGAAGAAGACTATGCTCGTATTGGCACTTCTGTCATAGCACATAAGATGCAGCTAGACAGTGGTGAAATTAGGTGGGTTATTGATTCTGTTGTGGGCAAGGAAGATGGACTTGGTGTGGAGAATATACATGGAAGTGCTGCTATTGCCAGTGCTTATTCTAGGGCATATAAGGAGACATTTACACTTACATTTGTGACTGGAAGAACTGTTGGAATAGGAGCTTATCTTGCTCGACTTGGCATCCGGTGCATACAGCGTCTTGACCAGCCTATTATTCTTACAGGCTATTCTGCACTGAACAAGCTTCTTGGGCGGGAAGTGTACAGCTCCCACATGCAGTTGGGTGGTCCCAAAATCATGGCAACTAATGGTGTTGTCCATCTTACTGTTTCAGATGACCTTGAAGGCGTTTCTAATATATTGAGGTGGCTCAGTTATGTTCCTGCCTACATTGGTGGACCACTTCCAGTAACAACACCGTTGGACCCACCGGACAGACCTGTTGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL AU225620             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gccgctGATGGACTTGGTGTGGAGAATATACATGGAAGTGCTGCTATTGCCAGTGCTTATTCTAGGGCATATAAGGAGACATTTACACTTACATTTGTGACTGGAAGAACTGTTGGAATAGGAGCTTATCTTGCTCGACTTGGCATCCGGTGCATACAGCGTCTTGACCAGCCTATTATTCTTACAGGCTATTCTGCACTGAACAAGCTTCTTGGGCGGGAAGTGTACAGCTCCCACATGCAGTTGGGTGGTCCCAAAATCATGGCAACTAATGGTGTAGTCCATCTTACTGTTTCAGATGACCTTGAAGGCGTTTCTAATATATTGAGGTGGCTCAGTTATGTTCCTGCCTACA TGGTGGACCACTTCCAGTAACAACACCGTTGGACCCACC GACAGACCTG TGCATACATTCCTGAGAACTCGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CF303813             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTGCTCGACTTGGCATCCGGTGCATACAGCGTCTTGACCAGCCTATTATTCTTACAGGCTATTCTGCACTGAACAAGCTTCTTGGGCGGGAAGTGTACAGCTCCCACATGCAGTTGGGTGGTCCCAAAATCATGGCAACTAATGGTGTTGTCCATTTTATTGTTTCAGATGACCTTGAAGGCGTTTCTAATATATTGAGGTGGCTCAGTTATGTTCCTGCCTACATTGGTGGACCACTTCCAGTAACAACACCGTTGGACCCACCGGACAGACCTGTTGCATACATTCCTGAGAACTCGTGTGATCCTCGAGCGGCTATCCGTGGTGTTGATGACAGCCAAGGGAAATGGTTAGGTNGGTATGTTTGATAAAGACAGCTTTGTGGAAACATTTGAAGGTTGGGCTAAGACAGTGGTTACTGGCAGAGCAAAGCTTGGTGGAATTCCAGTGGGTGTGATAGCTGTGGAGACTCAGACCATGATGCAAACTATCCCTGCTGACCCTGGTCAGCTTGATTCCCGTGAGCAATCTGTTCCTCGTGCTGG                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CF304729             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CGTTTCTAATATATTGAGGTGGCTCAGTTATGTTCCTGCCTACATTGGTGGACCACTTCCAGTAACAACACCGTTGGACCCACCGGACAGACCTGTTGCATACATTCCTGAGAACTCGTGTGATCCTCGAGCGGCTATCCGTGGTGTTGATGACAGCCAAGGGAAATGGTTAGGT GGTATGTTTGATAAAGACAGCTTTGTGGAAACATTTGAAGGTTGGGCTAAGACAGTGGTTACTGGCAGAGCAAAGCTTGGTGGAATTCCAGTGGGTGTGATAGCTGTGGAGACTCAGACCATGATGCAAACTATCCCTGCTGACCCTGGTCAGCTTGATTCCCGTGAGCAATCTGTTCCTCGTGCTGGACAAGTGTGGTTTCCAGATTCTGCAACCAAGACTGCGCAGGCATTGCTGGACTTCAACCGTGAAGGATTACCTCTGTTCATCCTCGCTAACTGGAGAGGCTTCTCTGGTGGACAAAGAGATCTTTTTGAAGGAATTCTTCAGGCTGGCTCGACTATTGTTGAGAACCTTANGACATACAATCAGCCTGCCTTTGTCTACATTCCCATGG]




>consensus_12636#0
TCGTCAATGGCATATCTACACACTTAGAAATACTGAAAACCCCAAAATGTTGCACCGGGT
ATTTTTCCGAACCCTTGTCAGGCAACCCAGTGTATCCAACAAGTTTTCTTCGGGCCAGAT
TGGTGACATGGAAGTTGGGAGTGCTGAAGAACCTCTGTCATTTACATCAACCAGCATATT
AAGATCTTTGATGACTGCTATAGAGGAATTGGAGCTTCACGCAATTAGAACTGGCCATTC
ACACATGTATTTGCATGTATTGAAAGAACAAAAGCTTCTTGATCTTGTTCCAGTTTCAGG
GAATACAGTTTTGGATGTTGGTCAAGATGAAGCTACTGCATATTCACTTTTAAAAGAAAT
GGCTATGAAGATACATGAACTTGTTGGTGCAAGAATGCACCATCTTTCTGTATGCCAATG
GGAAGTGAAACTTAAGTTGGACTGCGATGGTCCTGCCAGTGGTACCTGGAGGATTGTAAC
AACCAATGTTACTAGTCACACTTGCACTGTGGATATCTACCGTGAGATGGAAGATAAAGA
ATCACGGAAGTTAGTATACCATCCCGCCACTCCGGCGGCTGGTCCTCTGCATGGTGTGGC
ACTGAATAATCCATATCAGCCTTTGAGTGTCATTGATCTCAAACGCTGTTCTGCTAGGAA
TAATAGAACTACATACTGCTATGATTTTCCACTGGCATTTGAAACTGCAGTGAGGAAGTC
ATGGTCCTCTAGTACCTCTGGTGCTTCTAAAGGTGTTGAAAATGCCCAATGTTATGTTAA
AGCTACAGAGTTGGTATTTGCGGACAAACATGGGTCATGGGGCACTCCTTTAGTTCAAAT
GGACCGGCCTGCTGGGCTCAATGACATTGGTATGGTAGCTTGGACCTTGAAGATGTCCAC
TCCTGAATTTCCTAGTGGTAGGGAGATTATTGTTGTTGCAAATGATATTACGTTCAGAGC
TGGATCATTTGGCCCAAGGGAAGATGCATTTTTTGAAGCTGTTACCAACCTAGCCTGTGA
GAAGAAACTTCCTCTTATTTATTTGGCAGCAAATTCTGGTGCTCGAATTGGCATAGCAGA
TGAAGTGAAATCTTGCTTCCGTGTTGGGTGGTCTGATGATGGCAGCCCTGAACGTGGGTT
TCAGTACATTTATCTAAGCGAAGAAGACTATGCTCGTATTGGCACTTCTGTCATAGCACA
TAAGATGCAGCTAGACAGTGGTGAAATTAGGTGGGTTATTGATTCTGTTGTGGGCAAGGA
AGATGGACTTGGTGTGGAGAATATACATGGAAGTGCTGCTATTGCCAGTGCTTATTCTAG
GGCATATAAGGAGACATTTACACTTACATTTGTGACTGGAAGAACTGTTGGAATAGGAGC
TTATCTTGCTCGACTTGGCATCCGGTGCATACAGCGTCTTGACCAGCCTATTATTCTTAC
AGGCTATTCTGCACTGAACAAGCTTCTTGGGCGGGAAGTGTACAGCTCCCACATGCAGTT
GGGTGGTCCCAAAATCATGGCAACTAATGGTGTTGTCCATCTTACTGTTTCAGATGACCT
TGAAGGCGTTTCTAATATATTGAGGTGGCTCAGTTATGTTCCTGCCTACATTGGTGGACC
ACTTCCAGTAACAACACCGTTGGACCCACCGGACAGACCTGTTGCATACATTCCTGAGAA
CTCGTGTGATCCTCGAGCGGCTATCCGTGGTGTTGATGACAGCCAAGGGAAATGGTTAGG
TGGTATGTTTGATAAAGACAGCTTTGTGGAAACATTTGAAGGTTGGGCTAAGACAGTGGT
TACTGGCAGAGCAAAGCTTGGTGGAATTCCAGTGGGTGTGATAGCTGTGGAGACTCAGAC
CATGATGCAAACTATCCCTGCTGACCCTGGTCAGCTTGATTCCCGTGAGCAATCTGTTCC
TCGTGCTGGACAAGTGTGGTTTCCAGATTCTGCAACCAAGACTGCGCAGGCATTGCTGGA
CTTCAACCGTGAAGGATTACCTCTGTTCATCCTCGCTAACTGGAGAGGCTTCTCTGGTGG
ACAAAGAGATCTTTTTGAAGGAATTCTTCAGGCTGGCTCGACTATTGTTGAGAACCTTAN
GACATACAATCAGCCTGCCTTTGTCTACATTCCCATGG
clustalw multiple alignements is not computed in this case