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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_12917#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 1065 fasta sequence
[TACTCCCCTAGTTGTCAAGGGATTTTGTACAGTGAATTAGATAGCTAAGACATATGGTGTGTTAGAAATGTTGGGTTTATTTTAATGTAGCATAAATTAACATATATTTGTATGATAAAATCTGAAGGTAGAAAAATTGTTTTTTGGGGTCAGTTCTTGAAGATTAGTAGAAGTAATGCAAATGAATAATAATCACATAGTCCAATAGAGGAACTAATATAGGACAATATTTATAATA-TAGAAAAATATAAACCGACATACATTAAAGCATATAATTAATGCAATGGAAAAACTAATGAATCAAGTACTATTCAATCAAGTTTCTCTATTTTTTTAAAAAAACAAAATTCAAATCAAACCAAATGAAGATGAAGAAATATAGGATTATATGTATATATGTTGATATATTGGGAAAATAATGTGAGAATGATTTAATGTCCTTGTATGTTGAGCTCTTGAGTATAACAAATTGTAGATTTGCATGTTAAGATGTAATAATCATTAGTGGACGATGATGTAACATGTTTATATATGTTAAGTTTTAGAATATAGTGGGTTGTAATTTTATAGAAGGTATATATTATAGAAATAATGAATATATGAAATATTATACAAATTATGTGGGATGATGATTTGACATTGTTGCATGTTGAGCTACCCATAGCTCGAAGTGCAATTTACTCAAAATATAAAATTTGATTTGAAAGAGAGAAAAAAATTAAGAAAATGGTGATTTGTGCATTCTCCTCCCTTTATTACAATTCACTTGAAAATTTATTTTTTTTAGTTTTCAAAATTAGGTCAAACAAGCGAGGTGCAATATATAGTTATCTAAAATGTG-TTTCTAACATATATATAATCGATAAATCAGGGTCAACTGCAGGATAAGTGCATAAGGATGTGAATAAAGGATAAGGAAAAGTTTAGGAGCATGACATACCCAAAGAGTTTTCCCATTTACTTAAAACCGAAAACCAATTTGTTACTTANGGCATGTTTGACACACATTTTAGATCTGCGGTGAATTTGAAGTTTGTATGTTAAATTATAGTGGTTTAAATTTTT]
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[+] EMBL CB635528 [TACTCCGCGAGTTGTCAAGGGATTTTGTACAGTGAATTAGATAGCTAAGACATATGGTGTGTTAGAAATGTTGGGTTTATTTTAATGTAGCATAAATTAACATATATTTGTATGATAAAATCTGAAGGTAGAAAAATTGTTTTTTGGGGTCAGTTCTTGAAGATTAGTAGAAGTAATGCAAATGAATAATAATCACATAGTCCAATAGAGGAACTAATATAGGACAATATTTATAATA TAGAAAAATATAAACCGACATACATTAAAGCATATAATTAATGCAATGGAAAAACTAATGAATCAAGTACTATTCAATCAAGTTTCTCTATTTTTTTAAAAAAACAAAATTCAAATCAAACCAAATGAAGATGAAGAAATATAGGATTATATGTATATATGTTGATATATTGGGAAAATAATGTGAGAATGATTTAATGTCCTTGTATGTTGAGCTCTTGAGTATAACAAATTGTAGATTTGCATGTTAAGATGTAATAATCATTAGTGGACGATGATGTAACATGTTTATATATGTTAAGTTTTAGAATATAGTGGGTTGTAATTTTATAGAAGGTATATATTATAGAAATAATGAATATATGAAATATTATACAAATTATGTGGGATGATGATTTGACATTGTTGCATGTTGAGCTACCCATAGCTCGAAGTGCAATTTACTCAAAATATAAAATTTGATTTGAAAGAGAGAAAAAAATTAAGAAAATGGTGATTTGTGCATTCTCCTCCCTTTATTACAATTCACTTGAAAATTTA TTTTTTTAGTTTTCAAAATTAGGTCAAACAAGCGAGGTGCAATATATAGTTATCTAAAATGTGTTTTCTAca ]
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[+] EMBL CB630074 [ ATAGGACAATATTTATAATA TAGAAAAATATAAACCGACATACATTAAAGCATATAATTAATGCAATGGAAAAACTAATGAATCAAGTACTATTCAATCAAGTTTCTCTATTTTTTTAAAAAAACAAAATTCAAATCAAACCAAATGAAGATGAAGAAATATAGGATTATATGTATATATGTTGATATATTGGGAAAATAATGTGAGAATGATTTAATGTCCTTGTATGTTGAGCTCTTGAGTATAACAAATTGTAGATTTGCATGTTAAGATGTAATAATCATTAGTGGACGATGATGTAACATGTTTATATATGTTAAGTTTTAGAATATAGTGGGTTGTAATTTTATAGAAGGTATATATTATAGAAATAATGAATATATGAAATATTATACAAATTATGTGGGATGATGATTTGACATTGTTGCATGTTGAGCTACCCATAGCTCGAAGTGCAATTTACTCAAAATATAAAATTTGATTTGAAAGAGAGAAAAAAATTAAGAAAATGGTGATTTGTGCATTCTCCTCCCTTTATTACAATTCACTTGAAAATTTATTTTTTTTAGTTTTCAAAATTAGGTCAAACAAGCGAGGTGCAATATATAGTTATCTAAAATGTG TTTCTAACATATATATAATCGATAAATCAGGGTCAACTGCAGGATAAGTGCATAAGGATGTGAATAAAGGATAAGGAAAAGTTTANGAGCATGACATACCCAAAGAGTTTTCCCATTTACTTAAAACCGAAAACCAATTTGTTACTTANGGCATGTTTG ]
[+] EMBL CB631623 [ ATAATACTCTACCAATATAAACCGACATACATTAAAGCATATAATTAATGCAATGGAAAAACTAATGAATCAAGTACTATTCAATCAAGTTTCTCTATTTTTTTAAAAAAACAAAATTCAAATCAAACCAAATGAAGATGAAGAAATATAGGATTATATGTATATATGTTGATATATTGGGAAAATAATGGGAGAATGATTTAATGTCCTTGTATGTTGAGCTCTTGAGTATAACAAATTGGAGATTTGCATGTTAAGATGTAATAATCATTAGTGGACGATGATGTAACATGTTTATATATGTTAAGTTTTAGAATATAGGGGGGGGGAATTTTATAGAAGGTATATATTATAGAAATAATGAATATATGAAATATTATACAAATTATGTGGGATGATGATTTGACATTGTTGCATGTTGAGCTACCCATAGCTCGAAGTGCAATTTACTCAAAATATAAAATTTGATTTGAAAGAGAGAAAAAAATTAAGAAAATGGTGATTTGTGCATTCTCCTCCCTTTATTACAATTCACTTGAAAATTTATTTTTTTTAGTTTTCAAAATTAGGTCAAACAAGCGAGGTGCAATATATAGGTATCTAAAATGTG TTTCTAACATATATATAATCGATAAATCAGGGTCAACTGCAGGATAAGTGGATAAG ]
[-] EMBL CB627558 [ TGCATAAGGATGTGAATAANGGATAAGGAAAAGTTTAGGAGCATGACATACCCAAAGAGTTTTCCCATTTAC TAAAACCGAAAACCAATTTGTTACTTAGGGCATGTTTGACACACATTTTAGATCTGCGGTGAATTTGAAGTTTGTATGTTAAATTATAGTGGTTTAA ]
[-] EMBL CB627098 [ AAACCGAAAACCAATTTG TACTTAGGGCATGTTTGACACACATTTTAGATCTGCGGTGAATTTGAAGTTTGTATGTTAAATTATAGTGGTTTAA ]
[-] EMBL CB626721 [ TAGATCTGCGGTGAATTTGAAGTTTGTATGTTAAATTATAGTGGTTTAA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||