cluster # 13030

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Oryza sativa
cluster # 13030 cluster # 13030 Sequences # 12 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_13030#0 length = 2160 sequences # 12
consensusID : consensus_13030#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 2160
fasta sequence
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[+] EMBL AU064331             [                  TTTTCTATCCAAGAACCGCTCAAAAGCTCGAACCTTG CGCAATCTTTTTAAATCCTCCCGACCATTTCCTCCGGGTTTGATTCTGGGCAGAGATNGCGAGGGGAAAGATACGAGCTTTTCTTGGCTTCTTTCCCCTGCATTGGGAAAGATACGAGCTGTTGCTGTTCTTGGGAAGAACANCTTGGGACATTCTTGGGTTGGGGTTTGATTCCCAGGGGAAGAAAGCATGAGGCTATGGTTTCTCATACCTCTTCTTCTCTGTTTCCCTACATTGATTCGATCCGAGGATTACTCGGTATGTGACCATCGTCGTTCGGGGTGCTNAGACGATCGTTTCGACCAGCAACGAGGTTCATTTGCGGCAACCATTGATTTGGTTGCCTCCAGAGAAGTGCAATTATGACCAGTGTCCATGGGGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AU064350             [                  TTTTCTATCCAAGAACCGCTCAAAAGCTCGAACCTTGCCGCAATCTTTTTAAATCCTCCCGACCATTNNCTCCGGGTTTGATTCTGGGCAGAGATTGCGAGGGGAAAGATACGAGCTTTTCTTGGCTTCTTTCCCCTGCATTGGGAAAGATACGAGCTGTTGCTGTTCTTGGGAAGAACAGCTTGGGACATTCTTGGGTTGGGGTTTGATTCCCAGGGGAAGAAAGCATGAGGCTATGGTTTCTCATACCTCTTCTTCTCTGTTTCCCTACATTGATTCGATCCGAGGATTACTCGG ATGTGACCATCGTCGTTCGGGGTGCTGAGACGATCGCTTCGACCAGCAACGA GTTCATTTGC GCCACCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CF303254             [                                              CGAACCTTG CGCAATCTTTTTAAATCCTCCCGACCATTTCCTCCGGGTTTGATTCTGGGCAGAGATTGCGAGGGGAAAGATACGAGCTTTTCTTGGCTTCTTTCCCCTGCATTGGGAAAGATACGAGCTGTTGCTGTTCTTTTTAAGAACAGCTTGGGACATTCTTGGGTTGGGGTTTGATTCCCAGGGGAAGAAAGCATGAGGCTATGGTTTCTCATACCTCTTCTTCTCTGTTTCCCTACATTGATTCGATCCGAGGATTACTCGG ATGTGACCATCGTCGTTCGGGGTGCTGAGACGATCGCTTCGACCAGCAACGA GTTCATTTGC GCCACCATTGA TTGGTGGCCTCCAGAGAAGTGCAATTATGACCAGTGTCCATGGGGGCAAGCTTCTATCTTAAATTTGGACTTGACTAATCCTTTGCTAGCTAAAGCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CB620657             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TAACTTTGGACTTGACTAATCCTTTGCTAGCTAAAGCTATCCAAGCCTTTAGCCCTCTACGTATCAGACTTGGAGGTTCCTTACAAGATCAGGTGGTGTATGGCACGCCGAATTTAGGATCTCCATGCACCCCATTTTCAAAGAGTTCAAGTGGCCTGTTTGGATTTTCTCAAGGATGCATAACCATGGAAAGATGGGATGCTATTAATAAGATCTTTATGGATACAGGTGCAGTTGTTACATTCGGCCTTAACGCGCTTCAAGGGCGACAGCAGATGGGCAGAGGTGTTTGGGGAGGTGCTTGGAATTCCAGTAATGCTCGGGAGTTCATGGAGTACACTGTTTCGATGAACTACCCTATAGACTCATGGGAATTTGGTAATGAGTTGAGTGGAAGTGGAATTGGTGCAAGTGTTGGAGCTGAACAATATGGAAAAGATATAATTGAGCTCAAGAACATCATCAGCCAGTTATATGGAAACTCTAGGAAACCATTGGTGGTTGCCCCAGGAGGATTCTATGACCAAAAATGGTATGCTCAGCTTCTTGATATCTCTGGTCCAAATGTTCTCGACGCAATGACTCATCATATTTACAATCTTGGTGCTGGTAACGATCCGCAAGTTGCAAATAGGATCTTGAATCCACAGTATTTGAGCCAGAGCTCTGATACATTCAGAGATCTCCAAATGACGATACAGCGGCATGGACCATGGTCTGCTCCCTGGGTTGGGGAAGCTGGTGGTGCATATAACAGTGGCAGCCGAAAAGTGTCTAATACTTTCCTGAATAGCTTCTGGTATCTTGATCAGCTTGGTCAGTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CB644663             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TACTACAGTGCCTTGCTGTGGCATCGGCTCATGGGGAAGGGAGTTATTTCCTTAGACACCAGCGGTTCTTCGTACTTGCGTGCCTATGCGCATTGCGGAAAGCAAAAGGGCGGCGTCGCGCTCCTCATGCTCAACCTGAACAAGAACATGGGATTCATGGTCTCAGTCAGAAATGACCTCAACATTAATTTCAGAGAAATG GCAGGGATAAAGAGGGACAACTCCTTTGTCCATGGCCTGAAGAGGACAGTCTCCTGGGTTGGGAGCAAAGCCTCGGATGGGCTGGAGAAGAGGGAGGAGTACCATCTGACTCCACAGGATGGCAACCCTTTTGCCAGGACAGTGCTGCTCAATGGAGCTCCTCTTCAGCTCACTGGAGATGGTGACATCCCTTCACTGCCACCAGTGATGGTCTCAGTCAATTCCCCAATCTATGTCGCCCCGCTGTCGATCGCGTTCGTCGTCTTCCCAGATTTCGAGGCTGAAGGTTGCGAACGATGATTTCGAGTTTAGATAGAAATATCATGAGGTTTTTCTTTTCTGATGTGATGATATAGGTGTTCTCAGGGTTACATCCACTGTAAAGATTTTTCTGTGTTTCTAGTTTTTTCCCCAATTGGGCTATATATAGAATAACTTGATTCCAGTGTTTACTGATCAGTATGTAGCAAGCCTGCAGTTCCATTCCCTTCTATGTTTGGTTGGGTCACAATGAAGCACATTTGATGTAGTGATATCATGCTCATGTTCCGCATACTATATAAAAAATGTACATGTGAAAGAAAAAAAAAA     ]
[-] EMBL CB620658             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GAGTTATTTCCTTAGACACCAGCGGTTTTTTGTACTTGCGTGCCTATGCGCATTGCGGAAAGCAAAAGGGCGGCGTCGCGCTCCTCATGCTCAACCTGAACAAGAACATGGGATTCATGGTCTCAGTCAGAAATGACCTCAACATTAATTTCAGAGAAATG GCAGGGATAAAGAGGGAAAACTCCTTTGTCCATGGCCTGAAGAGGACAGTCTCCTGGGTTGGGAGCAAAGCCTCGGATGGGCTGGAGAAGAGGGAGGAGTACCATCTGACTCCACAGGATGGCAACCCTTTTGCCAGGACAGTGCTGCTCAATGGAGCTCCTCTTCAGCTCACTGGAGATGGTGACATCCCTTCACTGCCACCAGTGATGGTTTCAGTCAATTCCCCGATCTATGTCGCCCCGCTGTCGATCGCGTTCGTTGTCTTCCCAGATTTCGAGGCTGAAGGTTGCGAACGATGATTTCGAGTTTAGATAGAAATATCATGAGGTTTTTTTTTTTTGATGTGATGATATAGGTGTTTTCACGGTTACATCCACTGTAAAGATTTTTCTGTGTTTTTAGTTTTTTCCCCAATTGGGCTATATATAGAATAACTTGATTCCAGTGTTTACTGATCAGTATGTAGCAAGCCTGCAGTTCCATTCCCTTTTATGTTTGGTTGGGTCACAATGAAGCACATTTGATGTAGTGATATCATGCTCATGTTCCGCAGACTATATAAAAAATGTACATGTGAAAAAAAAAAAAAAAAGGA]
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[+] EMBL CB627852             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAATGCGCAGGGATAAAGAGGGAAAACTCCTTTGTCCATGGCCTGAAGAGGACAGTCTCCTGGGTTGGGAGCAAAGCCTCGGATGGGCTGGAGAAGAGGGAGGAGTACCATCTGACTCCACAGGATGGCAACCCTTTTGCCAGGACAGTGCTGCTCAATGGAGCTCCTCTTCAGCTCACTGGAGATGGTGACATCCCTTCACTGCCACCAGTGATGGTCTCAGTCAATTCCCCGATCTATGTCGCCCCGCTGTCGATCGCGTTCGTTGTCTTCCCAGAa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]




>consensus_13030#0
CAAGAATCTCTCCTCTTCTTTTCTATCCAAGAACCGCTCAAAAGCTCGAACCTTGCGCAA
TCTTTTTAAATCCTCCCGACCATTTCCTCCGGGTTTGATTCTGGGCAGAGATTGCGAGGG
GAAAGATACGAGCTTTTCTTGGCTTCTTTCCCCTGCATTGGGAAAGATACGAGCTGTTGC
TGTTCTTGGGAAGAACAGCTTGGGACATTCTTGGGTTGGGGTTTGATTCCCAGGGGAAGA
AAGCATGAGGCTATGGTTTCTCATACCTCTTCTTCTCTGTTTCCCTACATTGATTCGATC
CGAGGATTACTCGGATGTGACCATCGTCGTTCGGGGTGCTGAGACGATCGCTTCGACCAG
CAACGAGTTCATTTGCGCCACCATTGATTGGTGGCCTCCAGAGAAGTGCAATTATGACCA
GTGTCCATGGGGGCAAGCTTCTATCTTAAATTTGGACTTGACTAATCCTTTGCTAGCTAA
AGCTATCCAAGCCTTTAGCCCTCTACGTATCAGACTTGGAGGTTCCTTACAAGATCAGGT
GGTGTATGGCACGCCGAATTTAGGATCTCCATGCACCCCATTTTCAAAGAGTTCAAGTGG
CCTGTTTGGATTTTCTCAAGGATGCATAACCATGGAAAGATGGGATGCTATTAATAAGAT
CTTTATGGATACAGGTGCAGTTGTTACATTCGGCCTTAACGCGCTTCAAGGGCGACAGCA
GATGGGCAGAGGTGTTTGGGGAGGTGCTTGGAATTCCAGTAATGCTCGGGAGTTCATGGA
GTACACTGTTTCGATGAACTACCCTATAGACTCATGGGAATTTGGTAATGAGTTGAGTGG
AAGTGGAATTGGTGCAAGTGTTGGAGCTGAACAATATGGAAAAGATATAATTGAGCTCAA
GAACATCATCAGCCAGTTATATGGAAACTCTAGGAAACCATTGGTGGTTGCCCCAGGAGG
ATTCTATGACCAAAAATGGTATGCTCAGCTTCTTGATATCTCTGGTCCAAATGTTCTCGA
CACAATGACTCATCATATTTACAATCTTGGTGCTGGTAACGATCCGCAAGTTGCAAATAG
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GTGGCATCGGCTCATGGGGAAGGGAGTTATTTCCTTAGACACCAGCGGTTCTTCGTACTT
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GAACAAGAACATGGGATTCATGGTCTCAGTCAGAAATGACCTCAACATTAATTTCAGAGA
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GGTTGGGAGCAAAGCCTCGGATGGGCTGGAGAAGAGGGAGGAGTACCATCTGACTCCACA
GGATGGCAACCCTTTTGCCAGGACAGTGCTGCTCAATGGAGCTCCTCTTCAGCTCACTGG
AGATGGTGACATCCCTTCACTGCCACCAGTGATGGTCTCAGTCAATTCCCCAATCTATGT
CGCCCCGCTGTCGATCGCGTTCGTCGTCTTCCCAGATTTCGAGGCTGAAGGTTGCGAACG
ATGATTTCGAGTTTAGATAGAAATATCATGAGGTTTTTCTTTTCTGATGTGATGATATAG
GTGTTCTCAGGGTTACATCCACTGTAAAGATTTTTCTGTGTTTCTAGTTTTTTCCCCAAT
TGGGCTATATATAGAATAACTTGATTCCAGTGTTTACTGATCAGTATGTAGCAAGCCTGC
AGTTCCATTCCCTTCTATGTTTGGTTGGGTCACAATGAAGCACATTTGATGTAGTGATAT
CATGCTCATGTTCCGCATACTATATAAAAAATGTACATGTGAAAGAAAAAAAAAAAAGGA
clustalw multiple alignements is not computed in this case